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Heatmap: Cluster_186 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.44 0.63 0.76 0.91 1.0 0.93 0.84 0.72 0.62 0.44 0.55 0.53 0.32 0.49 0.49 0.49 0.62 0.58 0.58 0.37 0.05 0.63 0.33 0.41 0.76 0.51
0.53 0.74 0.83 0.95 1.0 0.84 0.88 0.85 0.7 0.76 0.68 0.6 0.51 0.5 0.74 0.67 0.55 0.65 0.55 0.7 0.12 0.57 0.51 0.4 0.55 0.48
1.0 0.54 0.36 0.4 0.67 0.37 0.47 0.37 0.63 0.32 0.57 0.51 0.92 0.13 0.15 0.19 0.19 0.29 0.24 0.17 0.14 0.42 0.6 0.32 0.64 0.42
0.98 1.0 0.6 0.9 0.74 0.4 0.43 0.63 0.46 0.53 0.54 0.55 0.77 0.32 0.17 0.21 0.21 0.27 0.24 0.28 0.0 0.13 0.14 0.12 0.71 0.53
0.78 1.0 0.84 0.88 0.87 0.99 0.91 0.8 0.87 0.85 0.73 0.71 0.55 0.23 0.49 0.35 0.54 0.83 0.82 0.68 0.02 0.19 0.24 0.48 0.46 0.44
0.82 0.77 0.92 0.92 0.98 0.89 0.96 1.0 0.91 0.98 0.86 0.79 0.82 0.46 0.68 0.54 0.67 0.84 0.64 0.83 0.03 0.37 0.26 0.29 0.77 0.61
0.51 0.84 0.76 0.71 0.66 0.45 0.69 0.73 0.63 0.79 0.83 0.64 0.34 0.45 0.46 0.42 0.45 1.0 0.89 0.63 0.0 0.32 0.2 0.46 0.52 0.51
0.67 0.68 0.67 0.8 0.87 0.93 1.0 0.97 0.76 0.71 0.6 0.52 0.65 0.32 0.41 0.37 0.57 0.88 0.67 0.64 0.01 0.63 0.2 0.3 0.86 0.53
0.86 0.69 0.71 0.84 1.0 0.87 0.91 0.86 0.85 0.9 0.89 0.87 0.95 0.61 0.61 0.62 0.75 0.8 0.53 0.72 0.07 0.59 0.87 0.8 0.88 0.81
0.9 0.95 0.98 1.0 0.97 0.85 0.95 0.95 0.77 0.71 0.71 0.65 0.73 0.47 0.44 0.5 0.52 0.71 0.62 0.57 0.04 0.52 0.32 0.55 0.81 0.69
0.58 0.78 0.73 0.95 1.0 0.79 0.76 0.84 0.6 0.59 0.59 0.48 0.48 0.65 0.37 0.41 0.39 0.56 0.42 0.47 0.02 0.1 0.4 0.23 0.73 0.6
0.66 0.54 0.76 0.97 0.8 0.69 0.82 1.0 0.82 0.87 0.84 0.75 0.55 0.54 0.41 0.4 0.48 0.54 0.48 0.67 0.06 0.39 0.59 0.48 0.72 0.84
0.5 0.62 0.64 0.84 0.94 0.71 0.83 1.0 0.91 0.99 0.97 0.74 0.44 0.41 0.48 0.83 0.56 0.8 0.84 0.68 0.0 0.51 0.28 0.3 0.46 0.41
0.68 1.0 0.86 0.6 0.54 0.6 0.54 0.52 0.47 0.41 0.37 0.43 0.75 0.17 0.4 0.24 0.72 0.66 0.59 0.68 0.07 0.06 0.27 0.13 0.25 0.17
0.84 0.72 0.77 1.0 0.82 0.63 0.62 0.7 0.68 0.62 0.69 0.67 0.71 0.49 0.48 0.48 0.4 0.4 0.43 0.49 0.04 0.18 0.79 0.48 0.8 0.7
0.73 0.67 0.59 0.56 0.63 0.62 0.72 1.0 1.0 0.83 0.91 0.87 0.81 0.53 0.34 0.31 0.42 0.49 0.6 0.58 0.0 0.21 0.06 0.23 0.33 0.54
0.58 0.67 0.62 0.96 0.53 0.26 0.34 0.46 0.36 0.53 0.61 0.64 0.83 0.29 0.23 0.23 0.16 0.41 0.53 0.22 0.45 0.66 0.97 0.64 0.83 1.0
0.44 0.61 0.58 0.86 0.91 0.9 1.0 0.98 0.8 0.59 0.56 0.43 0.29 0.32 0.28 0.35 0.35 0.4 0.41 0.38 0.02 0.44 0.26 0.35 0.81 0.6
0.68 0.94 0.78 0.94 1.0 0.97 0.9 0.85 0.36 0.49 0.44 0.45 0.61 0.34 0.45 0.35 0.54 0.84 0.63 0.54 0.04 0.23 0.32 0.32 0.85 0.65
0.82 0.95 0.84 0.82 0.92 0.67 0.87 0.85 0.88 1.0 0.79 0.9 0.63 0.54 0.5 0.49 0.63 0.85 0.79 0.78 0.03 0.4 0.34 0.57 0.48 0.56
0.7 0.92 0.93 0.95 1.0 0.97 0.76 0.76 0.86 0.76 0.94 0.77 0.68 0.51 0.55 0.49 0.44 0.61 0.68 0.62 0.01 0.34 0.42 0.57 0.53 0.46
1.0 0.61 0.61 0.89 0.78 0.66 0.55 0.57 0.43 0.41 0.43 0.58 0.78 0.36 0.29 0.29 0.34 0.31 0.26 0.26 0.04 0.21 0.77 0.42 0.66 0.65
0.34 0.47 0.88 1.0 1.0 0.72 0.85 0.79 0.77 0.81 0.72 0.72 0.45 0.52 0.56 0.67 0.62 0.76 0.6 0.66 0.15 0.58 0.68 0.52 0.53 0.55
0.22 0.24 0.07 0.98 0.65 0.06 0.2 0.39 0.17 0.43 0.75 0.29 0.4 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.44 0.83 0.19 0.43 1.0
0.71 0.31 0.16 0.8 0.39 0.06 0.22 0.54 0.21 0.25 0.4 0.2 0.34 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.19 0.08 0.05 0.28 0.5 0.49 0.76 1.0
0.67 0.7 0.74 0.93 0.92 0.87 1.0 0.91 0.64 0.56 0.49 0.43 0.5 0.54 0.63 0.6 0.65 0.58 0.63 0.52 0.04 0.53 0.54 0.18 0.69 0.75
0.87 0.81 0.76 1.0 0.87 0.6 0.72 0.9 0.88 0.84 0.74 0.54 0.73 0.21 0.09 0.16 0.18 0.33 0.32 0.32 0.06 0.24 0.31 0.35 0.66 0.8
0.69 0.89 0.67 0.95 0.86 0.55 0.72 0.76 0.53 0.62 0.5 0.39 0.55 0.23 0.13 0.45 0.19 0.62 0.49 0.59 0.01 0.03 0.25 0.13 1.0 0.46
1.0 0.82 0.77 0.86 0.9 0.95 0.84 0.94 0.87 0.71 0.65 0.55 0.65 0.4 0.57 0.29 0.54 0.96 0.94 0.75 0.2 0.74 0.48 0.47 0.43 0.36
0.49 0.88 0.95 0.98 0.95 1.0 0.95 0.99 0.96 0.79 0.76 0.86 0.45 0.79 0.65 0.81 0.71 0.9 0.77 0.57 0.08 0.59 0.46 0.44 0.51 0.51
0.36 0.67 0.71 0.88 0.9 1.0 0.89 0.79 0.77 0.56 0.5 0.42 0.31 0.42 0.47 0.44 0.39 0.78 0.57 0.45 0.04 0.43 0.39 0.22 0.43 0.5
0.94 0.69 0.83 0.82 0.93 0.83 0.75 0.81 0.7 0.7 0.68 0.68 1.0 0.32 0.53 0.47 0.45 0.72 0.75 0.61 0.03 0.58 0.26 0.28 0.45 0.43
0.82 0.78 0.73 1.0 0.95 0.84 0.68 0.94 0.6 0.56 0.89 0.68 0.8 0.53 0.18 0.28 0.3 0.62 0.69 0.34 0.07 0.28 0.8 0.62 0.96 0.59
0.85 0.72 0.78 0.85 0.98 1.0 0.94 0.89 0.91 0.81 0.82 0.74 0.82 0.72 0.69 0.69 0.65 0.74 0.74 0.58 0.22 0.7 0.74 0.7 0.81 0.7
0.57 0.71 0.63 0.75 0.87 0.96 1.0 0.93 0.86 0.83 0.64 0.62 0.49 0.61 0.73 0.83 0.75 0.97 0.86 0.71 0.02 0.35 0.33 0.44 0.94 0.58
0.6 0.35 0.27 0.59 0.6 0.37 0.44 0.65 0.6 0.54 0.64 0.53 0.37 0.53 0.19 0.37 0.17 0.33 0.35 0.22 0.04 0.51 1.0 0.52 0.96 0.78
0.66 0.6 0.68 0.7 0.74 0.66 0.79 0.73 0.66 0.68 0.77 0.89 0.76 0.56 0.53 0.64 0.54 0.55 0.52 0.54 0.23 0.39 0.94 0.53 1.0 0.55
0.59 0.45 0.39 0.65 0.71 0.89 0.93 1.0 0.17 0.18 0.11 0.05 0.27 0.08 0.09 0.13 0.26 0.39 0.28 0.36 0.0 0.04 0.06 0.05 0.68 0.39
0.53 0.73 0.85 0.99 1.0 0.73 0.74 0.76 0.59 0.75 0.71 0.66 0.42 0.33 0.36 0.38 0.48 0.68 0.58 0.71 0.01 0.49 0.27 0.28 0.42 0.38
0.67 0.84 0.65 0.73 0.89 0.98 1.0 0.94 0.85 0.68 0.63 0.61 0.63 0.53 0.47 0.51 0.49 0.55 0.6 0.48 0.0 0.39 0.4 0.44 0.65 0.46
0.58 0.47 0.67 0.75 0.5 0.11 0.25 0.37 0.23 0.34 0.36 0.36 0.51 0.03 0.04 0.05 0.09 0.29 0.14 0.16 0.04 0.31 1.0 0.86 0.49 0.53
0.99 1.0 0.86 0.81 0.81 0.86 0.8 0.81 0.76 0.65 0.66 0.64 0.75 0.32 0.57 0.4 0.68 0.96 0.9 0.87 0.05 0.35 0.27 0.31 0.48 0.31
0.93 0.74 0.75 0.78 0.93 0.69 0.75 0.82 0.74 0.72 0.76 0.88 1.0 0.51 0.55 0.65 0.48 0.71 0.66 0.66 0.07 0.75 0.32 0.43 0.54 0.65
0.48 0.42 0.29 0.68 1.0 0.73 0.64 0.66 0.08 0.18 0.07 0.06 0.21 0.05 0.08 0.1 0.32 0.38 0.31 0.32 0.01 0.01 0.02 0.26 0.51 0.19
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0.85 1.0 0.89 0.57 0.45 0.41 0.65 0.69 0.58 0.54 0.47 0.4 0.53 0.33 0.57 0.33 0.52 0.99 0.91 0.83 0.01 0.15 0.09 0.07 0.27 0.23
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0.92 0.83 0.78 0.81 0.79 0.7 0.75 0.82 0.58 0.52 0.58 0.6 1.0 0.32 0.4 0.28 0.36 0.63 0.51 0.55 0.01 0.21 0.26 0.27 0.82 0.55
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0.65 0.74 0.69 0.83 1.0 0.91 0.87 0.77 0.8 0.66 0.65 0.65 0.54 0.38 0.47 0.48 0.37 0.61 0.47 0.49 0.03 0.49 0.3 0.26 0.53 0.44
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Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)