1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_182 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.98 0.77 0.87 0.44 0.47 0.6 0.68 0.5 0.23 0.3 0.31 0.78 0.53 0.51 0.45 0.49 0.5 0.43 0.4 0.03 0.05 0.06 0.32 0.59 0.45
0.79 0.67 0.61 0.77 0.57 0.39 0.45 0.55 0.22 0.28 0.44 0.48 0.88 0.28 0.27 0.31 0.39 0.39 0.23 0.22 0.04 0.16 0.5 0.21 1.0 0.55
0.52 0.61 0.49 0.49 0.47 0.46 0.53 0.47 0.23 0.17 0.15 0.16 0.55 0.31 0.32 0.39 0.51 0.5 0.34 0.29 0.01 0.04 0.07 0.07 1.0 0.27
1.0 0.66 0.78 0.96 0.8 0.65 0.6 0.73 0.32 0.31 0.32 0.37 0.96 0.22 0.23 0.23 0.26 0.38 0.32 0.36 0.0 0.36 0.1 0.1 0.73 0.51
0.99 0.56 0.49 0.59 0.43 0.3 0.41 0.52 0.24 0.21 0.18 0.15 1.0 0.18 0.13 0.18 0.13 0.2 0.19 0.3 0.1 0.2 0.37 0.24 0.48 0.77
0.94 0.63 0.53 0.53 0.37 0.28 0.46 0.64 0.33 0.36 0.34 0.33 1.0 0.45 0.39 0.39 0.36 0.6 0.46 0.29 0.01 0.12 0.21 0.2 0.97 0.57
0.67 1.0 0.79 0.62 0.48 0.4 0.3 0.38 0.29 0.13 0.17 0.21 0.72 0.25 0.2 0.33 0.25 0.23 0.25 0.25 0.0 0.12 0.0 0.02 1.0 0.23
0.73 0.52 0.73 0.72 0.44 0.26 0.36 0.49 0.09 0.03 0.04 0.08 0.88 0.08 0.07 0.1 0.13 0.19 0.17 0.21 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.44
0.72 0.85 0.62 0.35 0.17 0.08 0.19 0.31 0.04 0.12 0.07 0.07 0.73 0.05 0.04 0.08 0.06 0.18 0.14 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.21
1.0 0.97 0.81 0.76 0.68 0.78 0.77 0.72 0.39 0.38 0.42 0.45 0.99 0.6 0.53 0.61 0.77 0.6 0.65 0.51 0.15 0.15 0.26 0.27 0.87 0.55
0.8 0.79 0.52 0.37 0.3 0.29 0.26 0.26 0.1 0.14 0.18 0.25 0.81 0.36 0.38 0.35 0.31 0.45 0.5 0.32 0.04 0.32 0.28 0.14 1.0 0.4
0.93 0.78 0.61 0.49 0.26 0.17 0.2 0.33 0.08 0.1 0.14 0.23 1.0 0.12 0.22 0.15 0.14 0.31 0.19 0.22 0.09 0.23 0.13 0.1 0.87 0.3
0.88 0.59 0.53 0.66 0.6 0.52 0.46 0.51 0.32 0.36 0.42 0.54 0.95 0.16 0.19 0.17 0.19 0.27 0.21 0.23 0.01 0.1 0.21 0.25 1.0 0.44
1.0 0.66 0.53 0.63 0.66 0.66 0.58 0.57 0.21 0.18 0.2 0.21 0.73 0.23 0.2 0.21 0.24 0.36 0.33 0.32 0.03 0.44 0.17 0.21 0.9 0.56
0.77 0.61 0.66 0.53 0.41 0.3 0.3 0.43 0.29 0.31 0.35 0.36 0.68 0.29 0.31 0.34 0.45 0.19 0.23 0.3 0.06 0.22 0.16 0.27 1.0 0.51
1.0 0.74 0.6 0.62 0.51 0.36 0.45 0.56 0.29 0.32 0.37 0.4 0.83 0.34 0.36 0.33 0.25 0.44 0.34 0.33 0.03 0.21 0.36 0.23 0.91 0.47
1.0 0.74 0.46 0.52 0.54 0.47 0.47 0.48 0.2 0.22 0.23 0.22 0.72 0.51 0.27 0.41 0.35 0.3 0.31 0.3 0.02 0.26 0.28 0.21 0.83 0.47
1.0 0.73 0.61 0.58 0.38 0.27 0.29 0.35 0.24 0.26 0.32 0.43 0.97 0.23 0.21 0.37 0.21 0.24 0.22 0.23 0.06 0.38 0.32 0.24 0.74 0.51
1.0 0.76 0.82 0.81 0.84 0.69 0.72 0.6 0.43 0.36 0.35 0.42 0.9 0.53 0.57 0.56 0.5 0.65 0.71 0.55 0.06 0.29 0.34 0.5 0.7 0.96
0.68 0.71 0.8 0.68 0.57 0.43 0.35 0.4 0.19 0.23 0.24 0.28 0.69 0.33 0.24 0.29 0.44 0.28 0.27 0.38 0.01 0.44 0.12 0.16 1.0 0.6
1.0 0.84 0.67 0.74 0.58 0.41 0.51 0.61 0.46 0.4 0.43 0.45 0.99 0.27 0.26 0.31 0.29 0.32 0.35 0.26 0.08 0.12 0.25 0.23 0.78 0.43
1.0 0.81 0.86 0.96 0.81 0.87 0.71 0.82 0.7 0.49 0.52 0.57 0.89 0.37 0.38 0.38 0.31 0.38 0.41 0.46 0.14 0.52 0.26 0.37 0.71 0.73
0.95 0.74 0.79 0.89 0.84 0.7 0.65 0.74 0.51 0.53 0.55 0.54 1.0 0.6 0.55 0.59 0.5 0.56 0.68 0.58 0.05 0.39 0.36 0.36 0.78 0.76
0.76 0.67 0.88 0.94 0.72 0.57 0.34 0.64 0.43 0.33 0.45 0.5 1.0 0.17 0.15 0.14 0.19 0.24 0.24 0.52 0.01 0.06 0.07 0.28 0.54 0.76
1.0 0.83 0.76 0.75 0.58 0.51 0.47 0.5 0.24 0.22 0.32 0.37 0.98 0.2 0.31 0.18 0.24 0.24 0.34 0.28 0.06 0.1 0.33 0.14 0.85 0.57
0.7 1.0 0.88 0.78 0.64 0.6 0.52 0.5 0.33 0.25 0.29 0.3 0.59 0.18 0.14 0.19 0.32 0.3 0.29 0.38 0.01 0.08 0.07 0.11 0.76 0.28
0.9 0.57 0.62 0.69 0.55 0.42 0.45 0.47 0.18 0.21 0.22 0.28 1.0 0.31 0.25 0.29 0.24 0.28 0.24 0.3 0.07 0.37 0.12 0.16 0.44 0.44
0.97 0.64 0.67 0.73 0.56 0.48 0.58 0.61 0.37 0.37 0.38 0.38 1.0 0.34 0.11 0.21 0.27 0.31 0.17 0.27 0.04 0.17 0.13 0.06 0.96 0.55
0.83 0.48 0.43 0.42 0.28 0.19 0.3 0.43 0.2 0.28 0.38 0.39 0.94 0.21 0.13 0.23 0.12 0.26 0.17 0.14 0.05 0.1 0.18 0.14 1.0 0.44
0.52 0.59 0.54 0.5 0.5 0.43 0.47 0.57 0.44 0.36 0.36 0.32 0.61 0.3 0.33 0.34 0.31 0.5 0.33 0.31 0.02 0.06 0.2 0.28 1.0 0.35
0.97 0.97 0.96 1.0 0.71 0.44 0.52 0.63 0.32 0.3 0.36 0.43 0.92 0.12 0.17 0.15 0.3 0.44 0.25 0.5 0.09 0.55 0.15 0.23 0.86 0.69
0.93 0.69 0.46 0.34 0.12 0.09 0.21 0.49 0.06 0.05 0.06 0.06 1.0 0.04 0.04 0.05 0.05 0.07 0.07 0.15 0.01 0.14 0.03 0.04 0.93 0.5
0.76 0.75 0.79 0.78 0.75 0.75 0.72 0.72 0.44 0.24 0.2 0.18 0.73 0.39 0.59 0.55 0.45 0.27 0.31 0.33 0.0 0.02 0.12 0.04 1.0 0.3
0.65 0.67 0.72 0.77 0.64 0.45 0.53 0.65 0.27 0.1 0.1 0.1 0.69 0.26 0.31 0.31 0.37 0.28 0.29 0.29 0.01 0.07 0.05 0.04 1.0 0.46
0.92 1.0 0.95 0.78 0.58 0.47 0.48 0.53 0.41 0.43 0.61 0.69 0.96 0.38 0.29 0.45 0.33 0.38 0.38 0.38 0.02 0.09 0.25 0.3 0.78 0.64
0.72 0.77 0.46 0.56 0.36 0.36 0.37 0.38 0.31 0.3 0.33 0.39 0.63 0.34 0.42 0.28 0.28 0.32 0.33 0.35 0.09 0.25 0.26 0.3 1.0 0.46
0.93 0.7 0.6 0.57 0.33 0.27 0.37 0.38 0.1 0.11 0.17 0.27 1.0 0.16 0.12 0.48 0.11 0.19 0.17 0.2 0.02 0.23 0.11 0.15 0.54 0.55
0.95 0.76 0.83 1.0 0.71 0.44 0.4 0.63 0.38 0.33 0.44 0.46 0.85 0.31 0.29 0.25 0.27 0.23 0.34 0.43 0.03 0.22 0.19 0.17 0.68 0.57
0.77 0.78 0.81 0.91 0.88 0.55 0.55 0.66 0.37 0.29 0.31 0.34 0.78 0.22 0.27 0.25 0.32 0.46 0.28 0.38 0.06 0.4 0.15 0.18 1.0 0.61
0.88 0.87 0.91 0.75 0.52 0.28 0.46 0.49 0.3 0.35 0.46 0.45 0.75 0.24 0.31 0.25 0.39 0.59 0.44 0.62 0.04 0.11 0.27 0.28 1.0 0.73
0.96 0.52 0.49 0.53 0.32 0.24 0.37 0.49 0.14 0.16 0.2 0.2 1.0 0.35 0.35 0.32 0.24 0.22 0.22 0.2 0.03 0.21 0.16 0.08 0.84 0.59
0.93 0.66 0.58 0.51 0.43 0.45 0.46 0.53 0.34 0.33 0.36 0.37 1.0 0.25 0.31 0.28 0.39 0.33 0.35 0.4 0.13 0.42 0.28 0.2 0.57 0.37
0.86 0.71 0.44 0.42 0.27 0.21 0.33 0.42 0.32 0.25 0.26 0.35 0.86 0.06 0.11 0.1 0.17 0.33 0.23 0.28 0.0 0.04 0.05 0.1 1.0 0.33
1.0 0.75 0.68 0.66 0.45 0.45 0.37 0.32 0.26 0.27 0.46 0.57 0.85 0.33 0.28 0.36 0.5 0.39 0.38 0.21 0.1 0.38 0.38 0.34 0.82 0.55
1.0 0.85 0.89 0.89 0.65 0.65 0.72 0.81 0.48 0.47 0.43 0.5 0.97 0.47 0.36 0.56 0.54 0.5 0.45 0.47 0.05 0.26 0.23 0.32 0.84 0.65
0.79 1.0 0.98 0.85 0.53 0.22 0.28 0.46 0.37 0.17 0.22 0.28 0.68 0.24 0.29 0.27 0.31 0.34 0.27 0.44 0.02 0.17 0.1 0.1 0.92 0.65
1.0 0.99 0.74 0.83 0.73 0.68 0.64 0.57 0.43 0.43 0.43 0.42 0.75 0.5 0.5 0.4 0.49 0.65 0.63 0.56 0.01 0.08 0.14 0.26 0.65 0.59
1.0 0.71 0.55 0.53 0.33 0.19 0.21 0.24 0.09 0.1 0.11 0.16 0.89 0.25 0.26 0.32 0.24 0.47 0.33 0.22 0.04 0.27 0.1 0.17 0.74 0.55
0.98 0.53 0.63 0.82 0.7 0.68 0.65 0.92 0.72 0.59 0.54 0.46 1.0 0.26 0.27 0.39 0.24 0.36 0.34 0.3 0.07 0.4 0.28 0.28 0.72 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)