Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.24 0.11 0.06 0.26 0.26 0.21 0.27 0.3 0.21 0.4 0.47 0.34 0.35 0.01 0.03 0.04 0.02 0.2 0.12 0.01 0.19 0.38 0.73 1.0 0.48 0.57
0.07 0.03 0.01 0.02 0.07 0.16 0.32 0.14 0.32 0.35 0.29 0.24 0.11 0.13 0.0 0.11 0.05 0.04 0.04 0.01 0.04 0.08 1.0 0.32 0.04 0.08
0.25 0.11 0.14 0.28 0.31 0.34 0.29 0.36 0.48 0.57 0.81 0.53 0.23 0.06 0.06 0.05 0.08 0.17 0.07 0.1 0.14 0.25 1.0 0.77 0.43 0.3
0.03 0.05 0.21 0.43 0.36 0.41 0.44 0.45 0.59 0.58 0.62 0.65 0.01 0.22 0.24 0.2 0.26 0.56 0.38 0.29 0.03 0.72 1.0 0.61 0.59 0.42
0.05 0.2 0.27 0.41 0.47 0.49 0.52 0.47 0.71 0.58 0.63 0.5 0.05 0.23 0.26 0.29 0.2 0.26 0.19 0.29 0.29 0.53 1.0 0.53 0.35 0.38
0.04 0.11 0.19 0.21 0.32 0.36 0.4 0.36 0.51 0.48 0.54 0.57 0.05 0.19 0.22 0.21 0.18 0.31 0.24 0.17 0.11 0.65 1.0 0.44 0.3 0.21
0.01 0.21 0.25 0.38 0.63 0.69 0.62 0.48 0.6 0.54 0.51 0.42 0.04 0.13 0.19 0.11 0.24 0.44 0.4 0.35 0.01 0.44 1.0 0.3 0.35 0.24
0.01 0.02 0.09 0.24 0.42 0.61 0.69 0.56 0.83 0.94 0.87 0.64 0.03 0.38 0.52 0.38 0.39 0.38 0.28 0.29 0.24 0.68 1.0 0.76 0.81 0.78
0.11 0.26 0.3 0.35 0.22 0.2 0.31 0.32 0.48 0.51 0.55 0.52 0.16 0.22 0.25 0.17 0.23 0.24 0.25 0.27 0.08 0.51 1.0 0.31 0.35 0.33
0.03 0.06 0.21 0.44 0.6 0.47 0.64 0.61 0.94 0.87 0.96 0.78 0.02 0.36 0.38 0.38 0.36 0.41 0.37 0.29 0.23 0.79 1.0 0.97 0.61 0.86
0.07 0.07 0.12 0.25 0.31 0.26 0.4 0.4 0.5 0.57 0.74 0.57 0.14 0.17 0.17 0.17 0.16 0.24 0.21 0.18 0.04 0.31 1.0 0.61 0.57 0.4
0.27 0.23 0.2 0.26 0.48 0.54 0.61 0.52 0.68 0.52 0.5 0.43 0.24 0.19 0.25 0.14 0.3 0.41 0.42 0.34 0.08 0.37 1.0 0.41 0.37 0.3
0.14 0.25 0.26 0.33 0.41 0.41 0.42 0.5 0.57 0.54 0.62 0.51 0.19 0.4 0.19 0.3 0.23 0.25 0.24 0.19 0.18 0.3 1.0 0.39 0.31 0.3
0.3 0.17 0.14 0.24 0.17 0.09 0.24 0.28 0.35 0.42 0.62 0.56 0.36 0.05 0.03 0.07 0.06 0.14 0.09 0.07 0.06 0.18 1.0 0.4 0.53 0.34
0.02 0.08 0.23 0.33 0.39 0.35 0.53 0.53 0.72 0.82 0.81 0.6 0.01 0.43 0.26 0.31 0.33 0.35 0.21 0.35 0.35 0.71 1.0 0.84 0.81 0.85
0.16 0.14 0.19 0.37 0.41 0.34 0.49 0.57 0.77 0.76 0.95 0.79 0.13 0.29 0.24 0.37 0.35 0.33 0.25 0.3 0.35 0.63 1.0 0.63 0.68 0.52
0.17 0.29 0.32 0.45 0.6 0.53 0.52 0.52 0.63 0.55 0.57 0.55 0.16 0.31 0.32 0.27 0.34 0.45 0.36 0.36 0.08 0.47 1.0 0.45 0.51 0.44
0.08 0.06 0.04 0.26 0.33 0.32 0.41 0.43 0.6 0.56 0.63 0.41 0.08 0.12 0.12 0.15 0.11 0.34 0.25 0.15 0.13 0.31 1.0 0.79 0.62 0.32
0.24 0.1 0.15 0.45 0.35 0.2 0.29 0.35 0.48 0.61 0.64 0.45 0.22 0.17 0.06 0.08 0.12 0.18 0.14 0.1 0.13 0.61 0.99 1.0 0.71 0.47
0.01 0.01 0.02 0.04 0.15 0.16 0.23 0.25 0.77 0.61 0.51 0.3 0.01 0.18 0.12 0.14 0.19 0.25 0.19 0.18 0.22 0.51 1.0 0.78 0.42 0.38
0.01 0.02 0.06 0.11 0.15 0.18 0.38 0.4 0.57 0.67 0.72 0.56 0.02 0.29 0.18 0.35 0.25 0.26 0.2 0.18 0.34 0.72 1.0 0.85 0.64 0.52
0.26 0.26 0.31 0.44 0.57 0.53 0.58 0.62 0.86 0.87 0.88 0.73 0.34 0.44 0.29 0.37 0.3 0.2 0.27 0.24 0.2 0.44 1.0 0.68 0.69 0.43
0.08 0.03 0.09 0.26 0.31 0.29 0.47 0.53 0.65 0.72 0.72 0.49 0.1 0.19 0.12 0.23 0.15 0.42 0.3 0.22 0.12 0.6 1.0 0.64 0.51 0.46
0.18 0.06 0.06 0.14 0.25 0.29 0.41 0.42 0.57 0.63 0.61 0.43 0.18 0.12 0.12 0.11 0.13 0.26 0.18 0.19 0.17 0.31 1.0 0.63 0.37 0.29
0.0 0.01 0.0 0.08 0.3 0.35 0.32 0.13 0.29 0.38 0.39 0.18 0.05 0.3 0.07 0.17 0.1 0.15 0.11 0.13 0.08 0.47 1.0 0.22 0.12 0.16
0.08 0.12 0.13 0.15 0.15 0.1 0.24 0.27 0.4 0.4 0.46 0.39 0.03 0.09 0.16 0.1 0.12 0.3 0.21 0.18 0.27 0.27 1.0 0.76 0.41 0.41
0.03 0.08 0.17 0.24 0.38 0.31 0.41 0.38 0.43 0.52 0.59 0.43 0.08 0.22 0.36 0.28 0.18 0.33 0.37 0.16 0.09 0.35 1.0 0.67 0.15 0.17
0.05 0.15 0.03 0.45 0.43 0.1 0.21 0.39 0.32 0.49 0.86 0.44 0.17 0.03 0.03 0.01 0.06 0.11 0.13 0.02 0.02 0.59 1.0 0.38 0.54 0.48
0.1 0.13 0.13 0.15 0.22 0.28 0.4 0.37 0.42 0.5 0.58 0.49 0.12 0.13 0.08 0.13 0.18 0.22 0.16 0.26 0.26 0.44 1.0 0.48 0.27 0.25
0.09 0.16 0.18 0.17 0.4 0.44 0.46 0.5 0.62 0.59 0.52 0.52 0.08 0.17 0.19 0.16 0.26 0.45 0.31 0.29 0.12 0.58 1.0 0.44 0.24 0.28
0.04 0.16 0.1 0.2 0.34 0.48 0.59 0.52 0.75 0.58 0.42 0.53 0.08 0.12 0.18 0.1 0.23 0.41 0.27 0.3 0.1 0.31 1.0 0.29 0.35 0.35
0.06 0.05 0.14 0.32 0.43 0.42 0.43 0.5 0.57 0.58 0.57 0.28 0.06 0.12 0.17 0.12 0.24 0.49 0.4 0.31 0.02 0.42 1.0 0.42 0.5 0.36
0.26 0.22 0.19 0.29 0.42 0.36 0.42 0.37 0.53 0.47 0.49 0.44 0.25 0.2 0.17 0.2 0.15 0.29 0.19 0.26 0.27 0.46 1.0 0.56 0.36 0.36
0.48 0.14 0.2 0.33 0.31 0.23 0.43 0.59 0.56 0.55 0.6 0.55 0.36 0.15 0.08 0.13 0.08 0.14 0.19 0.13 0.06 0.19 1.0 0.34 0.59 0.42
0.32 0.07 0.17 0.21 0.21 0.17 0.28 0.38 0.35 0.37 0.4 0.3 0.26 0.08 0.05 0.08 0.07 0.1 0.11 0.14 0.04 0.23 1.0 0.08 0.51 0.34
0.03 0.06 0.07 0.1 0.13 0.33 0.39 0.36 0.75 0.88 0.8 0.57 0.07 0.43 0.34 0.39 0.25 0.28 0.26 0.15 0.19 0.44 0.79 1.0 0.45 0.26
0.25 0.24 0.19 0.22 0.22 0.18 0.3 0.36 0.53 0.43 0.42 0.38 0.19 0.24 0.24 0.19 0.16 0.52 0.36 0.24 0.26 0.45 1.0 0.64 0.56 0.32
0.18 0.1 0.11 0.22 0.42 0.48 0.53 0.4 0.66 0.65 0.63 0.51 0.2 0.33 0.29 0.27 0.23 0.26 0.21 0.16 0.13 0.57 1.0 0.67 0.43 0.4
0.01 0.0 0.01 0.04 0.12 0.13 0.2 0.12 1.0 0.81 0.95 0.63 0.0 0.34 0.06 0.13 0.11 0.07 0.04 0.09 0.15 0.81 0.8 0.95 0.51 0.4
0.11 0.09 0.09 0.31 0.24 0.32 0.43 0.41 0.6 0.52 0.51 0.29 0.03 0.26 0.26 0.34 0.28 0.38 0.23 0.23 0.37 0.39 1.0 0.76 0.77 0.47
0.02 0.03 0.1 0.19 0.32 0.33 0.42 0.34 0.51 0.68 0.57 0.41 0.02 0.32 0.17 0.2 0.18 0.23 0.13 0.12 0.04 0.84 1.0 0.64 0.54 0.58
0.06 0.19 0.28 0.35 0.47 0.48 0.41 0.43 0.5 0.36 0.46 0.46 0.08 0.22 0.15 0.18 0.21 0.18 0.24 0.31 0.24 0.43 1.0 0.73 0.27 0.33
0.25 0.08 0.05 0.07 0.11 0.09 0.12 0.16 0.25 0.19 0.23 0.14 0.27 0.07 0.04 0.09 0.07 0.17 0.14 0.15 0.09 0.12 1.0 0.1 0.28 0.32
0.2 0.19 0.18 0.45 0.36 0.38 0.44 0.39 0.52 0.45 0.6 0.4 0.26 0.27 0.21 0.3 0.22 0.39 0.43 0.18 0.29 0.46 1.0 0.64 0.62 0.4
0.06 0.04 0.17 0.31 0.35 0.28 0.5 0.57 0.72 0.64 0.76 0.39 0.12 0.34 0.12 0.33 0.26 0.37 0.1 0.15 0.14 0.71 1.0 0.92 0.92 0.47
0.1 0.25 0.35 0.53 0.64 0.5 0.59 0.61 0.84 0.74 0.64 0.44 0.09 0.17 0.19 0.17 0.3 0.57 0.43 0.35 0.03 0.64 1.0 0.6 0.41 0.39
0.07 0.19 0.23 0.47 0.63 0.56 0.5 0.64 0.75 0.71 0.63 0.46 0.11 0.51 0.29 0.47 0.3 0.38 0.24 0.26 0.1 0.69 1.0 0.92 0.72 0.63
0.05 0.03 0.08 0.14 0.27 0.31 0.28 0.23 0.51 0.42 0.53 0.47 0.04 0.18 0.12 0.16 0.17 0.14 0.13 0.08 0.24 0.47 1.0 0.47 0.22 0.15
0.12 0.03 0.0 0.24 0.22 0.31 0.48 0.47 0.76 0.8 0.7 0.46 0.17 0.11 0.03 0.13 0.07 0.13 0.12 0.04 0.17 0.53 0.93 1.0 0.56 0.54
0.18 0.29 0.26 0.38 0.37 0.33 0.48 0.54 0.82 0.78 0.88 0.7 0.22 0.52 0.61 0.36 0.43 0.45 0.38 0.34 0.15 0.81 1.0 0.81 0.85 0.68
0.03 0.01 0.08 0.11 0.08 0.02 0.14 0.24 0.43 0.69 1.0 0.6 0.02 0.16 0.07 0.19 0.45 0.22 0.12 0.08 0.1 0.78 0.47 0.27 0.68 0.36
0.01 0.05 0.08 0.2 0.3 0.35 0.36 0.42 0.47 0.56 0.57 0.59 0.01 0.24 0.22 0.22 0.3 0.3 0.33 0.25 0.06 0.5 1.0 0.57 0.42 0.31
0.16 0.18 0.18 0.45 0.43 0.3 0.34 0.37 0.47 0.7 0.74 0.63 0.09 0.33 0.19 0.35 0.15 0.36 0.15 0.18 0.25 0.54 0.89 0.97 1.0 0.67
0.07 0.07 0.12 0.25 0.26 0.25 0.45 0.37 0.53 0.54 0.53 0.38 0.06 0.16 0.13 0.33 0.2 0.22 0.29 0.27 0.09 0.31 1.0 0.61 0.44 0.41
0.17 0.33 0.28 0.43 0.47 0.46 0.52 0.51 0.55 0.51 0.55 0.58 0.17 0.35 0.34 0.34 0.36 0.52 0.42 0.3 0.05 0.58 0.92 0.66 1.0 0.5
0.35 0.28 0.31 0.45 0.42 0.39 0.45 0.53 0.63 0.76 0.77 0.62 0.39 0.3 0.48 0.47 0.29 0.61 0.53 0.33 0.45 0.82 1.0 0.74 0.51 0.37
0.44 0.29 0.19 0.37 0.38 0.2 0.27 0.31 0.29 0.35 0.46 0.41 0.38 0.11 0.1 0.1 0.1 0.21 0.15 0.11 0.03 0.13 1.0 0.48 0.3 0.24
0.05 0.09 0.22 0.43 0.29 0.16 0.16 0.21 0.48 0.5 0.64 0.48 0.1 0.28 0.2 0.16 0.15 0.15 0.16 0.12 0.39 0.61 1.0 0.59 0.57 0.35
0.11 0.15 0.15 0.2 0.29 0.21 0.27 0.35 0.42 0.46 0.49 0.35 0.13 0.24 0.15 0.28 0.17 0.29 0.17 0.2 0.16 0.55 1.0 0.48 0.39 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)