1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.46 - - - - - - - - 1.27 0.72 - - - - - - - - - -0.68 1.72 1.32 - 3.54 0.18
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.56 - - 4.33 -
- - - 3.13 - - - 1.35 - - 1.39 - 2.94 - - - - 0.87 - 1.38 - - - - - -
- - - - 2.05 - - - - - - - 2.75 - - - - - - - 2.36 - - - 3.32 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
-0.64 0.66 -1.31 0.67 0.16 - 0.28 -0.79 -1.27 -0.8 -0.73 -0.63 -1.92 -0.67 -2.4 -0.81 -1.34 -0.06 0.98 - - 0.74 0.91 - 2.6 1.04
- - - - - - - - - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - 3.7 -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
-0.61 1.71 - - - 0.34 - 2.25 - -1.76 - - 2.54 - - -0.73 - - 0.78 - 1.85 - - - - 2.01
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - 3.53 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.2 - - - 1.84 - - - - - - - 1.99 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.33 - - - - - - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - 1.66 - 3.02 -
- - - - 1.68 1.5 - - 1.48 - 1.42 - - 1.33 - - - - - - - - 2.7 - 2.46 -
- - - 0.22 - - 0.15 - - - 0.1 - - -0.03 0.05 - 1.92 2.01 0.13 1.99 0.2 -0.12 - - 2.52 -
- - 3.08 - 3.27 - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.01 - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - - 3.38 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 2.54 - - 4.12 -
- - - - 1.94 - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - 2.37 2.35 3.12 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.38 -0.72 -0.35 -0.46 -0.23 -1.34 -0.53 -0.93 -0.89 -0.01 -0.15 0.49 0.13 -1.11 0.23 -0.01 -0.47 0.24 -1.5 -1.03 -1.69 0.18 0.15 0.66 1.88 0.99
-0.31 - 0.23 -0.63 -0.78 -1.58 -0.48 -0.12 1.01 - 0.73 -1.5 -1.69 -2.17 - - -0.48 -1.15 -0.66 -1.97 -2.03 1.12 0.94 0.02 2.94 0.24
1.06 -0.58 -0.49 -1.94 0.11 -0.48 0.35 0.41 -0.57 -0.24 -1.99 -0.06 0.57 0.03 -0.51 0.61 -1.99 -0.32 0.39 -1.29 0.89 -3.35 0.1 0.5 1.41 -0.84
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
0.71 -0.99 - 0.51 - 0.33 - -0.55 1.0 - 0.39 -0.48 0.83 1.11 - - - -1.16 -0.64 - -0.26 1.11 -0.71 - 2.79 -0.15
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
-0.75 0.34 -0.27 1.43 0.24 -0.27 1.3 0.37 -1.01 -1.11 1.47 -0.1 -0.96 -0.04 0.18 -1.53 -2.78 -0.3 0.84 -3.33 -0.23 -3.41 -1.67 - -0.05 1.11
0.24 - -2.04 - - -1.79 -2.03 - 0.85 -0.54 - - -0.56 - - - - 0.54 -0.81 - -1.39 1.56 0.27 - 3.45 1.77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - 2.94 - - - 1.13 - - - - - 2.6 - 1.03 - - - - - 1.68 - - 1.73 - 0.62
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - 2.18 - - 1.84 - - - - 2.0 2.42 - - - 2.47 1.58
- - - - - - - - - 2.09 - - - 1.62 - - 2.4 2.05 - - - - - - 2.59 1.7
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- -0.25 - - - - - 0.39 0.52 - -0.49 -0.4 - -1.08 0.25 1.57 - - -0.57 2.21 1.9 1.43 - 0.4 1.7 -
- - 2.21 - - - - 2.19 - - 1.94 - - - 1.89 - - - 3.21 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
0.48 0.53 -0.19 -1.87 0.05 0.81 0.51 0.0 -0.29 0.72 1.66 -0.8 - -0.31 -2.98 -0.4 -0.86 0.82 -0.95 - -0.8 -1.25 -1.48 -1.41 0.94 1.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- 1.14 1.79 - 1.27 - - - - - - 1.67 - 0.98 1.47 - - - - 2.37 - - - - 2.27 -
- - - - - 2.64 - - - - 2.56 - 2.53 - - - - - - - - - - - 3.02 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.15 1.94 0.61 - 3.94 -0.31
- -1.89 - -1.77 1.06 1.44 0.99 0.01 0.38 - -2.92 - -0.26 -2.5 1.85 - 2.27 0.24 2.08 -3.23 - -0.92 - - -0.48 -
- 1.34 1.32 - - - - 1.11 1.22 1.99 2.06 - 0.99 - - - - - 1.74 - - - - - - 1.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - 3.57 - - - - - - -
- - - - - 1.33 - 2.64 1.42 1.38 - - 1.32 1.27 - - - - - - - - - - 2.82 -
- - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - 1.9 - 2.33 - - - 2.55 2.04 -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - -0.05 - - - 1.22 0.88 - 4.29 -
- - - 0.63 - -0.44 - - 0.54 -0.54 - - - -0.04 - - - -0.04 - - -0.89 0.15 1.53 - 3.66 1.29
- -0.63 -0.21 - 1.38 0.8 - - -0.22 1.29 -0.2 - - - -0.29 0.73 2.31 - - -0.59 - 0.39 - -0.31 1.5 1.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.89 - - - - - - - 1.9 - - 1.56 - - - - 1.49 2.14 1.56 1.67 - 1.19 -
2.9 - - - - - - - 3.33 - - - 3.09 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.