1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.92 0.62 0.47 0.66 0.66 0.56 0.61 0.76 0.7 0.67 0.69 0.64 0.79 0.24 0.32 0.39 0.29 0.68 0.42 0.27 0.02 0.86 0.22 0.27 1.0 0.63
0.81 0.77 0.6 0.61 0.57 0.52 0.67 0.79 0.63 0.68 0.56 0.51 0.68 0.29 0.21 0.22 0.26 0.47 0.36 0.37 0.13 0.83 0.23 0.38 1.0 0.53
0.6 0.38 0.31 0.43 0.42 0.39 0.46 0.45 0.38 0.36 0.37 0.36 0.61 0.32 0.17 0.24 0.19 0.37 0.23 0.23 0.07 1.0 0.15 0.19 0.42 0.38
0.3 0.24 0.28 0.44 0.3 0.16 0.27 0.42 0.27 0.41 0.34 0.31 0.45 0.31 0.18 0.25 0.13 0.23 0.21 0.2 0.13 1.0 0.18 0.2 0.44 0.42
0.94 0.74 0.56 0.63 0.66 0.54 0.59 0.62 0.63 0.72 0.76 0.66 1.0 0.5 0.5 0.5 0.51 0.57 0.49 0.61 0.06 0.97 0.67 0.69 0.65 0.54
0.76 0.52 0.56 0.64 0.95 0.95 0.67 0.65 0.59 0.62 0.63 0.56 0.71 0.26 0.19 0.24 0.26 0.39 0.23 0.4 0.3 1.0 0.49 0.62 0.5 0.55
0.9 0.64 0.63 0.66 0.49 0.38 0.53 0.65 0.51 0.59 0.61 0.64 0.91 0.5 0.39 0.51 0.49 0.49 0.44 0.45 0.18 1.0 0.34 0.36 0.99 0.7
1.0 0.58 0.46 0.82 0.79 0.64 0.71 0.74 0.72 0.72 0.95 0.89 0.95 0.69 0.47 0.47 0.3 0.59 0.36 0.34 0.28 0.9 0.53 0.65 0.79 0.8
0.68 0.44 0.35 0.67 0.38 0.26 0.57 0.67 0.66 0.56 0.69 0.47 0.56 0.17 0.14 0.15 0.08 0.28 0.21 0.16 0.06 0.39 0.18 0.22 1.0 0.45
0.69 0.43 0.33 0.43 0.45 0.37 0.47 0.54 0.5 0.44 0.54 0.53 0.71 0.21 0.24 0.18 0.26 0.37 0.32 0.24 0.02 1.0 0.24 0.3 0.59 0.45
0.79 0.56 0.49 0.83 0.78 0.53 0.68 0.77 0.66 0.67 0.72 0.64 0.74 0.73 0.56 0.62 0.47 0.61 0.54 0.37 0.1 0.9 0.4 0.49 1.0 0.72
0.7 0.54 0.53 0.48 0.34 0.24 0.33 0.39 0.22 0.25 0.27 0.3 0.68 0.24 0.36 0.37 0.3 0.5 0.38 0.3 0.15 1.0 0.28 0.29 0.74 0.5
0.79 0.58 0.5 0.46 0.42 0.4 0.54 0.56 0.44 0.41 0.41 0.42 0.78 0.46 0.35 0.42 0.37 0.47 0.47 0.34 0.06 1.0 0.3 0.26 0.48 0.35
0.72 0.33 0.31 0.76 0.57 0.33 0.37 0.37 0.28 0.28 0.38 0.33 0.74 0.19 0.09 0.14 0.1 0.13 0.07 0.09 0.04 1.0 0.35 0.21 0.42 0.39
0.88 0.67 0.68 0.72 0.67 0.85 0.84 0.85 0.68 0.58 0.58 0.69 0.97 0.64 0.44 0.52 0.45 0.39 0.39 0.39 0.11 0.73 0.58 0.47 1.0 0.81
0.88 0.65 0.61 0.78 0.67 0.46 0.58 0.65 0.59 0.48 0.7 0.8 0.89 0.45 0.39 0.45 0.36 0.55 0.44 0.36 0.09 1.0 0.42 0.27 0.83 0.58
0.76 0.49 0.26 0.29 0.14 0.11 0.16 0.21 0.17 0.27 0.32 0.39 0.72 0.14 0.12 0.13 0.18 0.27 0.21 0.17 0.06 1.0 0.16 0.37 0.51 0.51
1.0 0.42 0.41 0.27 0.2 0.4 0.47 0.61 0.43 0.25 0.42 0.3 0.6 0.27 0.25 0.19 0.23 0.33 0.19 0.2 0.01 0.34 0.39 0.08 0.95 0.45
0.54 0.35 0.35 0.31 0.12 0.06 0.12 0.24 0.15 0.27 0.34 0.47 0.62 0.19 0.11 0.14 0.11 0.14 0.12 0.16 0.02 1.0 0.16 0.27 0.76 0.78
0.86 0.45 0.47 0.75 0.74 0.52 0.56 0.58 0.6 0.54 0.64 0.56 0.89 0.39 0.5 0.38 0.35 0.36 0.41 0.31 0.05 1.0 0.23 0.33 0.63 0.4
0.85 0.5 0.49 0.54 0.52 0.43 0.49 0.45 0.3 0.3 0.32 0.38 0.93 0.41 0.35 0.38 0.33 0.5 0.33 0.31 0.32 1.0 0.3 0.28 0.57 0.43
0.77 0.57 0.59 0.75 0.47 0.25 0.36 0.45 0.38 0.39 0.51 0.66 1.0 0.3 0.33 0.3 0.33 0.43 0.32 0.38 0.1 0.89 0.27 0.31 0.54 0.73
0.7 0.44 0.35 0.35 0.38 0.45 0.52 0.51 0.18 0.2 0.14 0.11 0.56 0.25 0.18 0.18 0.18 0.24 0.22 0.23 0.11 1.0 0.17 0.26 0.81 0.26
0.71 0.5 0.39 0.48 0.43 0.41 0.63 0.77 0.69 0.63 0.64 0.53 0.64 0.29 0.2 0.25 0.18 0.37 0.24 0.32 0.14 0.68 0.35 0.37 1.0 0.6
0.6 0.58 0.61 0.73 0.6 0.41 0.5 0.57 0.36 0.44 0.58 0.68 0.72 0.38 0.35 0.36 0.39 0.46 0.37 0.37 0.07 1.0 0.35 0.5 0.67 0.7
0.95 1.0 0.8 0.63 0.27 0.06 0.15 0.23 0.24 0.38 0.45 0.62 0.96 0.05 0.05 0.08 0.27 0.47 0.25 0.54 0.04 0.52 0.08 0.3 0.75 0.67
0.48 0.22 0.24 0.21 0.11 0.05 0.12 0.15 0.06 0.12 0.18 0.3 0.66 0.07 0.06 0.07 0.26 0.13 0.09 0.12 0.16 1.0 0.12 0.11 0.3 0.32
0.82 0.67 0.53 0.89 0.68 0.66 0.63 0.55 0.43 0.36 0.51 0.72 1.0 0.05 0.07 0.08 0.08 0.11 0.11 0.14 0.11 0.81 0.3 0.52 1.0 0.43
0.69 0.41 0.52 0.8 0.77 0.72 0.81 0.7 0.69 0.79 0.88 0.83 0.79 0.77 0.54 0.56 0.3 0.38 0.3 0.4 0.32 0.95 0.53 0.79 1.0 0.74
0.59 0.56 0.52 0.86 0.79 0.63 0.62 0.67 0.59 0.54 0.55 0.59 0.62 0.33 0.34 0.38 0.33 0.48 0.45 0.4 0.1 1.0 0.33 0.4 0.6 0.41
0.77 0.57 0.61 0.65 0.44 0.26 0.33 0.51 0.34 0.43 0.58 0.84 0.83 0.28 0.22 0.18 0.28 0.31 0.29 0.26 0.1 0.99 0.3 0.37 1.0 0.61
0.79 0.79 0.58 0.8 0.9 0.71 0.73 0.66 0.66 0.69 0.61 0.51 0.6 0.51 0.37 0.3 0.38 0.47 0.46 0.39 0.01 1.0 0.23 0.28 0.66 0.32
0.69 0.52 0.59 0.78 0.78 0.71 0.74 0.84 0.81 0.7 0.75 0.74 0.77 0.56 0.57 0.67 0.4 0.51 0.62 0.43 0.12 1.0 0.45 0.39 0.74 0.59
0.6 0.32 0.25 0.26 0.2 0.22 0.21 0.25 0.23 0.28 0.31 0.55 0.68 0.13 0.13 0.23 0.21 0.27 0.22 0.14 0.06 1.0 0.3 0.15 0.35 0.25
0.87 0.71 0.73 0.78 0.81 0.89 0.8 0.74 0.77 0.68 0.77 0.81 0.94 0.26 0.33 0.25 0.23 0.34 0.25 0.21 0.05 1.0 0.17 0.22 0.55 0.41
0.72 0.47 0.37 0.62 0.74 0.56 0.6 0.65 0.63 0.61 0.82 0.59 0.64 0.36 0.39 0.32 0.28 0.29 0.25 0.26 0.04 1.0 0.38 0.52 0.73 0.43
0.97 0.64 0.6 0.85 0.66 0.73 0.7 0.79 0.53 0.57 0.65 0.69 1.0 0.57 0.26 0.34 0.23 0.3 0.23 0.26 0.06 0.5 0.19 0.26 0.72 0.67
0.84 0.71 0.69 0.75 0.75 0.69 0.75 0.77 0.68 0.7 0.66 0.73 0.89 0.62 0.48 0.58 0.53 0.64 0.5 0.6 0.22 1.0 0.56 0.56 0.7 0.63
0.9 0.58 0.49 0.61 0.64 0.54 0.86 0.91 0.53 0.59 0.54 0.43 0.95 0.27 0.18 0.46 0.24 0.34 0.31 0.31 0.02 0.81 0.22 0.37 1.0 0.84
0.41 0.46 0.44 0.71 0.51 0.26 0.35 0.42 0.44 0.55 0.77 0.71 0.41 0.27 0.2 0.19 0.19 0.32 0.25 0.26 0.09 1.0 0.26 0.27 0.54 0.49
0.9 0.59 0.45 1.0 0.73 0.59 0.55 0.78 0.56 0.79 0.84 0.66 0.64 0.5 0.36 0.37 0.34 0.32 0.34 0.27 0.0 0.56 0.32 0.35 0.74 0.81
0.68 0.5 0.58 0.64 0.53 0.43 0.64 0.68 0.61 0.64 0.64 0.58 0.66 0.36 0.27 0.34 0.33 0.54 0.35 0.33 0.08 1.0 0.36 0.35 0.6 0.56
0.67 0.41 0.42 0.6 0.5 0.48 0.52 0.63 0.62 0.52 0.58 0.52 0.58 0.17 0.15 0.16 0.17 0.21 0.19 0.17 0.07 1.0 0.3 0.39 0.63 0.46
1.0 0.6 0.52 0.79 0.42 0.26 0.52 0.68 0.42 0.46 0.5 0.5 0.99 0.15 0.13 0.19 0.17 0.24 0.13 0.22 0.06 0.9 0.14 0.22 0.73 0.49
0.82 0.74 0.69 0.7 0.35 0.15 0.24 0.26 0.37 0.46 0.69 0.91 1.0 0.28 0.16 0.23 0.22 0.35 0.19 0.29 0.1 0.67 0.15 0.37 0.49 0.45
0.27 0.14 0.24 0.58 0.34 0.16 0.15 0.22 0.05 0.09 0.11 0.13 0.48 0.13 0.04 0.07 0.07 0.05 0.05 0.06 0.02 1.0 0.09 0.05 0.43 0.33
0.94 0.58 0.54 1.0 0.51 0.13 0.41 0.63 0.53 0.54 0.76 0.48 0.88 0.04 0.01 0.12 0.07 0.25 0.22 0.16 0.1 0.47 0.34 0.17 0.55 0.33
0.75 0.66 0.49 0.88 0.58 0.2 0.33 0.53 0.39 0.51 0.72 0.55 1.0 0.18 0.15 0.2 0.11 0.22 0.32 0.19 0.04 0.76 0.24 0.36 0.42 0.44
0.94 0.55 0.35 0.76 0.97 0.87 0.88 0.84 0.8 0.62 0.68 0.48 0.83 0.49 0.31 0.32 0.3 0.59 0.61 0.35 0.04 0.59 0.22 0.4 1.0 0.57
0.54 0.35 0.38 0.48 0.42 0.32 0.32 0.31 0.16 0.18 0.23 0.3 0.69 0.25 0.2 0.26 0.18 0.19 0.18 0.17 0.1 1.0 0.13 0.2 0.74 0.41
0.59 0.26 0.23 0.23 0.18 0.13 0.27 0.23 0.28 0.33 0.37 0.4 0.61 0.21 0.15 0.17 0.14 0.39 0.27 0.18 0.04 1.0 0.24 0.28 0.61 0.31
0.7 0.33 0.32 0.34 0.28 0.16 0.19 0.28 0.29 0.26 0.35 0.35 0.72 0.18 0.26 0.18 0.16 0.26 0.2 0.1 0.15 1.0 0.29 0.19 0.39 0.37
0.71 0.31 0.28 0.54 0.45 0.34 0.41 0.38 0.4 0.42 0.41 0.44 0.72 0.32 0.23 0.2 0.19 0.26 0.22 0.14 0.06 1.0 0.17 0.25 0.38 0.36
0.89 0.86 0.84 0.97 0.9 0.85 0.81 0.91 0.9 0.7 0.78 0.83 0.99 0.49 0.5 0.48 0.41 0.56 0.45 0.52 0.37 1.0 0.48 0.53 0.75 0.74
0.53 0.24 0.2 0.37 0.27 0.15 0.26 0.21 0.22 0.31 0.47 0.47 0.55 0.22 0.11 0.14 0.12 0.16 0.1 0.06 0.22 1.0 0.35 0.38 0.45 0.23
0.81 0.59 0.46 0.58 0.53 0.37 0.55 0.69 0.56 0.54 0.58 0.59 0.72 0.21 0.19 0.2 0.38 0.4 0.35 0.27 0.08 1.0 0.51 0.39 0.77 0.54
0.41 0.47 0.26 0.7 0.69 0.29 0.73 0.64 0.62 0.66 0.96 0.7 0.51 0.06 0.17 0.08 0.04 0.27 0.13 0.11 0.0 1.0 0.11 0.12 0.57 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)