1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-2.43 -0.06 0.58 -0.13 1.06 0.76 -0.88 -2.17 0.07 0.78 0.65 1.06 -1.45 -0.36 -0.66 0.4 -1.48 0.9 0.13 -0.38 -1.54 -0.82 -2.64 -0.25 0.13 0.38
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -2.48 - - - - 2.69 -2.53 - -1.33 -1.54 -3.03 -1.53 - -2.21 -0.3 -1.11 -2.52 -0.09 -1.76 1.09 - - 3.69
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.62 - - 3.77 - - - - -
-2.21 -3.71 -2.42 -1.41 -0.24 1.54 1.92 0.89 0.93 1.07 0.49 -1.17 -2.93 -1.74 -2.05 -4.45 -4.36 -2.61 -2.04 -2.14 -1.29 -1.23 1.26 -0.0 0.4 1.57
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
2.12 - 1.42 - 0.89 - - - - - 1.2 - 2.61 - 0.94 - - - - - - - - - - 2.77
- 0.38 0.78 0.03 0.0 -0.02 0.39 0.53 0.64 0.0 0.09 -1.91 -2.19 -0.38 -0.47 0.01 0.01 1.0 0.74 0.45 -0.52 -0.43 0.31 -2.11 -1.42 0.35
- - - 2.4 - - - 1.34 - - - - - - - 1.46 - 2.54 0.96 - - 2.6 - - 0.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - 3.38
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
-2.99 0.78 -2.69 -0.04 0.49 0.25 -1.48 -0.02 -2.7 -2.77 -2.72 -0.58 -1.29 0.46 -0.06 0.27 -0.58 1.22 0.16 -0.67 1.31 1.09 -0.07 -1.39 -0.1 1.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - -0.48 - - 2.0 1.1 -0.4 - - - 0.99 - 3.17 - -0.57 - -0.74 -0.87 0.11 -1.1 2.0
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - - - 3.99
-0.9 - -2.18 0.62 0.03 0.46 0.15 1.4 -0.54 1.44 0.6 0.24 -1.78 -0.18 0.26 0.79 -0.47 1.5 0.14 0.62 - -1.57 - -2.28 -1.82 -1.6
1.66 - - - - - - - - - 2.91 - - - - 1.86 - - - - - - - - - 3.54
- - - 2.4 - - - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9
-0.3 - - - - - 0.16 - - - - - - -0.87 1.55 0.65 - 2.41 1.51 1.39 1.59 1.0 1.69 - - -
- - - 0.25 - - -0.82 - - -0.87 1.14 -0.73 - - - 0.64 - 2.16 - - 1.87 2.1 - - 1.69 1.89
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.7 0.3 -0.41 2.65 0.62 0.66 1.23 -0.11 2.27
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - 3.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - -0.41 -0.31 2.35 2.0 -0.9 -1.26 - - - - 2.12 1.42 2.17 - 0.58 - - 0.45 -4.82
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - 4.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - - 3.86 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.18 1.23 1.25 - 0.95 3.79
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.47 - 3.9 - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.46 - - - - - - - - 2.83 - - 2.98 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 - - 3.29 - 1.82 - - 1.98
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - 3.31 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.18 - - 4.08 - - - - -
2.93 - - - - - - 0.37 - - 0.28 1.44 2.22 - - - - -0.19 - - - - - - - 2.93
- -3.5 - -3.12 -3.37 - - -3.05 - - - - - -2.73 -0.84 - -1.97 -0.99 -3.43 -1.52 -2.06 -0.08 1.02 1.49 1.12 3.95
-3.02 - - - - -3.14 - - - -3.27 -3.22 -1.48 -2.72 -2.32 -2.24 - -1.92 -3.9 -2.51 -2.38 -1.4 1.21 0.54 2.09 1.1 3.74
-1.65 -0.0 -0.66 -2.08 0.86 1.24 1.1 0.46 0.94 0.05 -0.26 -0.61 -1.2 -0.35 0.8 0.81 -1.8 0.9 0.69 -1.61 -0.45 -3.43 - -2.14 -0.88 0.33
- - - - - - - - - 3.09 - - - - - - - 4.13 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - 2.71 - - - - - - - 3.21 - - - 2.54 2.14 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - 3.96
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
-1.17 -1.25 -0.71 -2.09 -0.25 -1.08 -1.58 -2.11 0.29 -3.22 0.7 -1.48 0.37 1.2 0.6 1.03 -0.73 1.02 -3.52 -2.39 0.4 1.02 0.6 0.9 -0.26 0.58
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - 2.8 - - 4.25 - - - - - - - -
- - - 0.94 - - - 1.99 - - - 1.96 - 1.28 - 0.76 - 3.21 - 1.52 - - - - - -
1.01 - - - - - - - 1.3 - 2.91 - - - - - - 3.05 - - - - 2.52 - - -
-2.27 - - -0.88 0.32 -1.95 0.17 -1.94 -0.88 -0.06 0.8 0.94 -0.77 - -2.06 - -0.75 -2.71 -0.07 -2.29 -1.93 -1.36 2.06 1.2 0.39 2.59
- - - - - - - - - - - - - - - 2.89 - 3.41 2.99 - - - - - - -
0.69 1.09 - -0.21 0.74 - - - -0.12 - 0.8 - - - - -0.02 0.04 2.94 - 2.32 0.17 -0.56 - - -0.84 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - - 4.17
- - - - - - - - - - - 1.35 3.22 - - - - - - - - - - - - 3.82
- - - - - - - - - - - - 1.27 - - - 2.35 1.79 - - 0.93 - 1.0 - 1.76 2.95
- - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - 3.69 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - 3.38
- - - - - - - 0.55 - - - - - - 0.28 - - 2.26 - - 2.88 - -0.13 2.48 1.18 1.27
- - - - - - 0.36 - 2.16 - - - 2.14 - - - - 0.01 - - - - - 2.76 0.48 2.74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
2.72 - - - - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.02
- - - - 2.43 - - - - - - - - - 2.47 - - 3.13 2.65 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - 0.48 0.6 - 0.61 0.57 1.5 - 0.68 - - - 0.57 1.69 - - 0.26 -0.4 - - 1.19 - 2.75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.28 0.75 - - - - - 3.87
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
-0.03 0.11 - -1.5 -1.14 -3.26 -1.71 - - -0.62 -1.2 - 0.73 0.35 1.5 0.93 1.06 0.33 - -2.48 -0.05 1.28 -2.54 -2.56 1.61 1.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.