Heatmap: Cluster_216 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.79 0.11 0.1 0.18 0.13 0.1 0.31 0.31 0.17 0.27 0.44 0.51 1.0 0.63 0.07 0.57 0.24 0.19 0.11 0.09 0.02 0.01 0.08 0.02 0.79 0.25
0.48 0.43 0.37 0.64 0.61 0.54 0.46 0.43 0.44 0.46 0.49 0.44 0.48 0.67 0.35 0.47 0.28 0.26 0.3 0.46 0.01 0.35 0.28 0.29 1.0 0.8
0.79 0.57 0.61 0.8 0.8 0.57 0.68 0.79 0.55 0.72 0.78 0.99 1.0 0.91 0.47 0.69 0.41 0.49 0.48 0.36 0.46 0.9 0.4 0.39 0.66 0.63
0.72 0.24 0.17 0.37 0.36 0.31 0.53 0.62 0.44 0.55 0.61 0.48 0.75 0.67 0.11 0.84 0.22 0.36 0.15 0.14 0.21 1.0 0.3 0.14 0.61 0.4
0.98 0.56 0.46 0.66 0.5 0.47 0.65 0.83 0.6 0.66 0.63 0.56 1.0 0.67 0.45 0.52 0.28 0.54 0.48 0.35 0.19 0.46 0.59 0.47 0.8 0.78
0.35 0.15 0.08 0.02 0.08 0.11 0.31 0.24 0.44 0.66 0.61 0.56 0.15 0.33 0.18 0.14 0.15 0.22 0.1 0.14 0.03 0.22 0.15 1.0 0.77 0.37
0.07 0.13 0.19 0.4 0.36 0.33 0.53 0.45 0.61 0.68 0.85 0.8 0.15 0.58 0.13 0.23 0.23 0.2 0.16 0.42 0.03 0.04 0.29 0.29 1.0 0.69
0.6 0.4 0.28 0.25 0.12 0.09 0.14 0.24 0.13 0.2 0.25 0.3 0.51 0.94 0.11 0.16 0.13 0.19 0.2 0.15 0.29 0.38 0.17 0.35 1.0 0.71
0.45 0.62 0.61 0.85 0.96 0.57 0.77 0.63 0.41 0.69 0.88 0.79 0.49 1.0 0.38 0.71 0.38 0.34 0.31 0.65 0.01 0.57 0.1 0.26 0.93 0.9
0.51 0.51 0.38 0.36 0.28 0.27 0.6 0.57 0.67 0.66 0.68 0.57 0.5 0.83 0.49 0.71 0.38 0.6 0.53 0.53 0.07 0.41 0.28 0.58 1.0 0.73
0.86 0.47 0.49 0.45 0.47 0.49 0.58 0.57 0.53 0.71 0.75 0.72 1.0 0.57 0.39 0.53 0.36 0.52 0.35 0.36 0.12 0.53 0.4 0.48 0.78 0.66
0.76 0.49 0.49 0.71 0.45 0.34 0.53 0.59 0.41 0.45 0.45 0.47 1.0 0.49 0.2 0.44 0.27 0.44 0.21 0.2 0.02 0.42 0.2 0.19 0.94 0.71
0.23 0.04 0.12 0.3 0.16 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.18 0.09 0.33 0.15 0.17 0.17 0.19 0.06 0.26 0.04 0.04 0.55 0.09 0.02 1.0 0.26
0.94 0.43 0.3 0.19 0.1 0.05 0.13 0.27 0.26 0.51 0.74 0.73 1.0 0.79 0.08 0.61 0.14 0.22 0.14 0.26 0.31 0.36 0.23 0.22 0.97 0.64
0.77 0.59 0.69 0.82 0.68 0.53 0.77 0.88 0.62 0.71 0.86 0.83 0.98 1.0 0.44 0.96 0.6 0.44 0.36 0.42 0.26 0.92 0.29 0.43 0.87 0.72
0.54 0.47 0.38 0.27 0.21 0.23 0.38 0.47 0.38 0.48 0.53 0.57 0.5 0.51 0.32 0.31 0.33 0.57 0.45 0.35 0.03 0.32 0.27 0.55 1.0 0.55
0.79 0.39 0.37 0.49 0.26 0.14 0.34 0.5 0.33 0.53 0.76 0.71 0.74 0.62 0.21 0.42 0.3 0.37 0.34 0.32 0.04 0.21 0.15 0.32 1.0 0.6
0.67 0.31 0.29 0.41 0.25 0.2 0.38 0.64 0.49 0.55 0.62 0.54 0.78 0.42 0.35 0.33 0.2 0.36 0.24 0.24 0.03 0.67 0.07 0.32 1.0 0.81
0.52 0.47 0.55 0.88 0.98 0.66 0.74 0.85 0.78 0.93 1.0 0.92 0.73 0.75 0.62 0.84 0.65 0.78 0.55 0.49 0.46 0.84 0.55 0.56 1.0 0.67
0.61 0.54 0.42 0.34 0.19 0.14 0.23 0.29 0.23 0.48 0.64 0.7 0.77 0.53 0.44 0.54 0.37 0.48 0.3 0.21 0.11 0.66 0.22 0.66 1.0 0.56
0.53 0.3 0.44 0.57 0.48 0.39 0.54 0.62 0.67 0.73 0.89 1.0 0.59 0.99 0.59 0.89 0.46 0.85 0.7 0.41 0.09 0.6 0.52 0.58 0.98 0.98
0.72 0.33 0.2 0.33 0.27 0.15 0.31 0.36 0.2 0.28 0.38 0.4 0.79 0.52 0.28 0.71 0.26 0.19 0.14 0.11 0.06 0.61 0.24 0.19 1.0 0.54
0.36 0.2 0.22 0.22 0.25 0.18 0.46 0.37 0.4 0.28 0.41 0.44 0.56 0.46 0.32 0.46 0.34 0.33 0.29 0.2 0.13 0.89 0.25 0.32 1.0 0.42
0.56 0.38 0.49 0.63 0.5 0.48 0.76 0.78 0.73 0.85 0.81 0.77 0.63 0.82 0.55 0.86 0.63 1.0 0.7 0.61 0.13 0.5 0.71 0.61 0.95 0.79
0.25 0.37 0.48 0.86 0.95 0.61 0.85 0.87 0.69 0.75 0.92 0.62 0.21 0.62 0.54 0.74 0.37 0.58 0.46 0.57 0.03 0.82 0.27 0.26 1.0 0.97
0.46 0.28 0.26 0.3 0.32 0.35 0.63 0.62 0.5 0.52 0.55 0.47 0.38 0.67 0.3 0.73 0.25 0.33 0.31 0.29 0.03 1.0 0.4 0.34 0.7 0.28
0.9 0.6 0.67 0.78 0.65 0.5 0.65 0.8 0.54 0.51 0.56 0.52 1.0 0.76 0.5 0.66 0.36 0.49 0.43 0.41 0.13 0.74 0.46 0.52 0.95 0.9
0.8 0.66 0.73 0.7 0.56 0.49 0.62 0.69 0.54 0.63 0.63 0.63 0.8 0.85 0.65 0.75 0.57 0.59 0.54 0.52 0.18 0.86 0.44 0.55 0.78 1.0
0.73 0.7 0.8 0.62 0.59 0.69 0.73 0.84 0.64 0.59 0.6 0.58 0.69 0.33 0.3 0.22 0.24 0.4 0.28 0.29 0.15 0.36 0.63 0.62 1.0 0.75
0.79 0.48 0.35 0.36 0.32 0.34 0.56 0.69 0.42 0.31 0.3 0.31 1.0 0.61 0.28 0.64 0.22 0.25 0.26 0.19 0.34 0.28 0.44 0.33 0.71 0.73
0.9 0.44 0.53 0.76 0.44 0.3 0.49 0.75 0.62 0.76 0.94 0.78 0.6 0.79 0.39 0.6 0.3 0.39 0.26 0.25 0.04 0.65 0.12 0.33 0.96 1.0
0.13 0.21 0.37 0.65 0.97 1.0 0.89 0.71 0.56 0.63 0.65 0.43 0.14 0.7 0.17 0.28 0.14 0.11 0.18 0.49 0.04 0.47 0.14 0.13 0.58 0.8
0.75 0.58 0.82 1.0 0.73 0.53 0.66 0.74 0.43 0.42 0.49 0.49 0.66 0.48 0.44 0.54 0.37 0.45 0.32 0.39 0.04 0.36 0.29 0.35 0.99 0.69
0.3 0.17 0.32 0.68 0.82 0.63 0.76 0.57 0.58 0.96 1.0 0.94 0.46 0.78 0.27 0.53 0.16 0.2 0.25 0.46 0.09 0.24 0.12 0.28 0.9 0.89
0.66 0.49 0.36 0.33 0.14 0.13 0.23 0.38 0.55 0.66 0.84 0.78 0.8 0.44 0.18 0.44 0.23 0.48 0.17 0.19 0.16 0.48 0.36 0.8 1.0 0.46
0.66 0.48 0.44 0.69 0.47 0.34 0.46 0.57 0.31 0.37 0.47 0.51 0.97 0.8 0.38 0.68 0.28 0.38 0.33 0.25 0.09 0.42 0.23 0.52 1.0 0.58
1.0 0.64 0.54 0.68 0.61 0.78 0.8 0.87 0.86 0.8 0.76 0.68 0.87 0.6 0.5 0.63 0.3 0.31 0.36 0.31 0.1 0.4 0.9 0.45 0.96 0.76
0.36 0.47 0.62 0.72 0.89 0.63 0.58 0.56 0.5 0.73 0.7 0.77 0.51 0.82 0.5 0.75 0.29 0.56 0.4 0.59 0.0 0.15 0.3 0.27 1.0 0.72
0.59 0.2 0.16 0.48 0.38 0.34 0.4 0.47 0.24 0.33 0.4 0.37 0.7 0.78 0.27 1.0 0.14 0.19 0.12 0.13 0.21 0.1 0.61 0.27 0.79 0.48
0.68 0.63 0.57 0.61 0.61 0.57 0.55 0.6 0.68 0.83 0.92 0.92 0.7 0.99 0.52 0.45 0.54 0.69 0.65 0.5 0.22 0.7 0.31 0.59 1.0 0.93
0.31 0.32 0.37 0.54 0.44 0.39 0.59 0.7 0.51 0.54 0.66 0.56 0.37 0.47 0.27 0.39 0.39 0.24 0.2 0.25 0.01 0.35 0.19 0.26 1.0 0.72
0.57 0.4 0.53 0.57 0.32 0.21 0.4 0.64 0.39 0.44 0.55 0.67 0.58 0.71 0.19 0.25 0.22 0.24 0.22 0.26 0.03 0.42 0.19 0.19 1.0 0.66
0.66 0.47 0.58 1.0 0.68 0.6 0.77 0.77 0.69 0.71 0.72 0.75 0.93 0.92 0.57 0.87 0.45 0.65 0.39 0.43 0.42 0.62 0.48 0.51 0.94 0.85
0.63 0.56 0.75 0.79 0.85 0.75 0.64 0.71 0.61 0.87 0.97 0.95 0.9 1.0 0.49 0.69 0.41 0.44 0.35 0.5 0.24 0.63 0.38 0.27 0.81 0.93
0.81 0.65 0.73 0.77 0.67 0.49 0.64 0.7 0.62 0.69 0.71 0.7 0.85 0.81 0.58 0.75 0.64 0.76 0.49 0.63 0.3 0.84 0.6 0.53 0.91 1.0
0.53 0.49 0.51 0.53 0.35 0.28 0.47 0.66 0.52 0.55 0.64 0.74 1.0 0.71 0.39 0.61 0.38 0.47 0.33 0.23 0.04 0.24 0.18 0.08 0.71 0.49
0.8 0.5 0.45 0.43 0.41 0.33 0.47 0.61 0.36 0.4 0.38 0.34 0.7 0.24 0.3 0.22 0.26 0.38 0.35 0.37 0.0 0.59 0.19 0.34 1.0 0.95
0.33 0.29 0.49 0.74 0.83 0.73 0.7 0.57 0.77 0.77 0.75 0.72 0.38 0.97 0.2 0.68 0.21 0.08 0.12 0.47 0.02 0.38 0.12 0.08 0.79 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)