Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.08 0.06 0.08 0.14 0.22 0.24 0.21 0.2 0.26 0.31 0.32 0.3 0.12 0.2 0.19 0.15 0.15 0.23 0.25 0.13 1.0 0.3 0.61 0.31 0.19 0.26
0.04 0.03 0.03 0.07 0.09 0.06 0.09 0.1 0.13 0.14 0.15 0.1 0.04 0.08 0.07 0.07 0.06 0.15 0.1 0.05 1.0 0.34 0.47 0.27 0.26 0.22
0.03 0.04 0.03 0.07 0.1 0.07 0.07 0.08 0.11 0.12 0.12 0.11 0.03 0.08 0.09 0.08 0.05 0.16 0.08 0.03 1.0 0.39 0.52 0.25 0.15 0.15
0.11 0.14 0.15 0.17 0.19 0.21 0.25 0.25 0.28 0.24 0.26 0.24 0.15 0.23 0.25 0.4 0.17 0.41 0.28 0.12 1.0 0.42 0.88 0.52 0.29 0.31
0.04 0.04 0.05 0.08 0.1 0.08 0.13 0.12 0.14 0.14 0.14 0.1 0.04 0.17 0.08 0.17 0.08 0.14 0.12 0.07 1.0 0.3 0.26 0.29 0.29 0.27
0.04 0.06 0.07 0.09 0.13 0.09 0.15 0.17 0.15 0.18 0.16 0.11 0.04 0.26 0.1 0.26 0.14 0.22 0.2 0.1 1.0 0.24 0.28 0.25 0.29 0.29
0.07 0.09 0.09 0.09 0.1 0.09 0.1 0.09 0.12 0.12 0.13 0.14 0.09 0.15 0.27 0.18 0.16 0.27 0.23 0.11 1.0 0.23 0.51 0.3 0.12 0.12
0.09 0.05 0.05 0.13 0.1 0.06 0.1 0.13 0.15 0.15 0.18 0.15 0.08 0.17 0.07 0.17 0.09 0.13 0.08 0.06 1.0 0.27 0.31 0.22 0.35 0.25
0.09 0.12 0.13 0.16 0.07 0.03 0.04 0.08 0.07 0.09 0.15 0.14 0.14 0.14 0.16 0.18 0.14 0.11 0.1 0.07 1.0 0.12 0.44 0.51 0.3 0.37
0.04 0.09 0.18 0.23 0.24 0.16 0.09 0.08 0.06 0.06 0.07 0.05 0.03 0.17 0.12 0.16 0.07 0.14 0.17 0.23 1.0 0.19 0.5 0.25 0.04 0.19
0.31 0.13 0.1 0.1 0.13 0.15 0.2 0.22 0.25 0.29 0.29 0.29 0.26 0.21 0.1 0.11 0.16 0.27 0.22 0.15 1.0 0.07 0.63 0.25 0.23 0.42
0.3 0.27 0.29 0.33 0.33 0.23 0.35 0.34 0.31 0.36 0.32 0.24 0.19 0.27 0.22 0.26 0.24 0.43 0.37 0.28 1.0 0.2 0.54 0.36 0.47 0.45
0.25 0.3 0.27 0.29 0.3 0.28 0.27 0.34 0.25 0.29 0.27 0.23 0.18 0.19 0.2 0.2 0.17 0.36 0.32 0.22 1.0 0.17 0.54 0.21 0.42 0.46
0.21 0.17 0.13 0.17 0.19 0.15 0.2 0.2 0.24 0.24 0.24 0.2 0.19 0.17 0.13 0.28 0.09 0.3 0.24 0.09 1.0 0.24 0.54 0.32 0.44 0.36
0.15 0.04 0.06 0.13 0.08 0.06 0.07 0.1 0.05 0.08 0.07 0.12 0.08 0.04 0.03 0.07 0.02 0.07 0.07 0.07 1.0 0.01 0.32 0.22 0.06 0.14
0.17 0.14 0.15 0.15 0.13 0.14 0.12 0.13 0.15 0.14 0.12 0.18 0.13 0.21 0.34 0.37 0.16 0.29 0.24 0.13 1.0 0.24 0.83 0.51 0.27 0.36
0.02 0.04 0.07 0.12 0.11 0.1 0.1 0.11 0.11 0.09 0.1 0.07 0.02 0.17 0.22 0.17 0.12 0.25 0.18 0.08 1.0 0.36 0.46 0.24 0.37 0.32
0.11 0.14 0.13 0.17 0.15 0.09 0.16 0.2 0.19 0.22 0.21 0.15 0.1 0.19 0.11 0.13 0.12 0.2 0.16 0.13 1.0 0.27 0.12 0.16 0.25 0.24
0.17 0.19 0.14 0.23 0.22 0.16 0.22 0.3 0.32 0.31 0.32 0.24 0.16 0.15 0.08 0.08 0.08 0.14 0.13 0.1 1.0 0.3 0.15 0.19 0.25 0.28
0.2 0.13 0.13 0.19 0.22 0.25 0.3 0.28 0.27 0.19 0.2 0.16 0.16 0.07 0.1 0.19 0.12 0.12 0.13 0.09 1.0 0.09 0.48 0.16 0.16 0.13
0.07 0.03 0.03 0.07 0.09 0.08 0.09 0.1 0.14 0.15 0.19 0.16 0.06 0.08 0.06 0.05 0.06 0.11 0.11 0.05 1.0 0.32 0.26 0.34 0.25 0.27
0.14 0.1 0.12 0.14 0.16 0.18 0.16 0.16 0.17 0.15 0.15 0.19 0.12 0.11 0.08 0.11 0.1 0.12 0.11 0.08 1.0 0.21 0.55 0.37 0.14 0.13
0.05 0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.07 0.06 0.08 0.08 0.08 0.08 0.05 0.13 0.1 0.13 0.11 0.15 0.18 0.1 1.0 0.03 0.07 0.09 0.09 0.2
0.02 0.06 0.1 0.12 0.12 0.09 0.11 0.12 0.12 0.13 0.15 0.16 0.03 0.16 0.13 0.15 0.09 0.1 0.11 0.08 1.0 0.25 0.39 0.45 0.29 0.31
0.17 0.09 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.1 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 1.0 0.09 0.44 0.92 0.35 0.18
0.05 0.07 0.09 0.12 0.08 0.08 0.09 0.12 0.11 0.1 0.12 0.11 0.06 0.26 0.16 0.3 0.1 0.21 0.19 0.09 1.0 0.1 0.57 0.24 0.11 0.14
0.06 0.08 0.08 0.12 0.13 0.11 0.15 0.14 0.18 0.17 0.16 0.14 0.05 0.26 0.16 0.37 0.2 0.33 0.18 0.13 1.0 0.47 0.6 0.34 0.28 0.28
0.06 0.09 0.13 0.14 0.19 0.25 0.25 0.21 0.2 0.14 0.13 0.1 0.06 0.2 0.23 0.25 0.15 0.24 0.23 0.13 1.0 0.37 0.54 0.21 0.19 0.18
0.29 0.25 0.23 0.18 0.14 0.12 0.2 0.26 0.22 0.27 0.26 0.26 0.34 0.25 0.37 0.31 0.24 0.39 0.34 0.2 1.0 0.34 0.55 0.32 0.25 0.28
0.08 0.07 0.08 0.08 0.04 0.02 0.04 0.07 0.05 0.07 0.11 0.1 0.06 0.08 0.04 0.07 0.04 0.09 0.05 0.03 1.0 0.08 0.48 0.14 0.17 0.13
0.11 0.12 0.13 0.13 0.05 0.04 0.09 0.13 0.07 0.13 0.15 0.16 0.1 0.1 0.06 0.13 0.09 0.11 0.1 0.1 1.0 0.09 0.49 0.21 0.25 0.16
0.04 0.09 0.09 0.17 0.24 0.26 0.29 0.23 0.26 0.25 0.21 0.17 0.02 0.17 0.23 0.2 0.24 0.27 0.32 0.18 1.0 0.35 0.56 0.32 0.26 0.23
0.07 0.13 0.08 0.07 0.03 0.02 0.13 0.11 0.11 0.06 0.11 0.11 0.01 0.12 0.07 0.07 0.02 0.09 0.11 0.02 1.0 0.08 0.47 0.18 0.3 0.24
0.1 0.08 0.1 0.13 0.13 0.12 0.13 0.13 0.17 0.16 0.17 0.14 0.08 0.21 0.12 0.15 0.1 0.2 0.17 0.11 1.0 0.15 0.36 0.24 0.24 0.31
0.14 0.11 0.07 0.07 0.09 0.08 0.11 0.11 0.1 0.1 0.1 0.13 0.09 0.1 0.06 0.12 0.07 0.1 0.08 0.07 1.0 0.29 0.55 0.42 0.25 0.27
0.09 0.09 0.13 0.14 0.14 0.13 0.14 0.14 0.13 0.14 0.14 0.15 0.12 0.25 0.17 0.21 0.14 0.16 0.14 0.12 1.0 0.26 0.56 0.38 0.32 0.32
0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.09 0.05 0.09 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.06 0.03 1.0 0.04 0.62 0.21 0.4 0.29
0.19 0.09 0.07 0.17 0.08 0.03 0.05 0.14 0.09 0.08 0.14 0.12 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.04 1.0 0.17 0.52 0.14 0.28 0.22
0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.24 0.11 0.21 0.08 0.05 0.04 0.03 1.0 0.23 0.4 0.36 0.17 0.14
0.04 0.04 0.05 0.05 0.06 0.07 0.07 0.06 0.07 0.05 0.05 0.06 0.04 0.05 0.04 0.05 0.03 0.05 0.06 0.04 1.0 0.13 0.48 0.23 0.05 0.07
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.04 0.03 0.02 1.0 0.13 0.51 0.15 0.04 0.04
0.3 0.3 0.32 0.38 0.3 0.22 0.29 0.32 0.27 0.25 0.27 0.28 0.27 0.22 0.25 0.44 0.17 0.35 0.33 0.22 1.0 0.25 0.74 0.64 0.42 0.5
0.09 0.05 0.05 0.05 0.06 0.07 0.11 0.12 0.14 0.16 0.13 0.11 0.14 0.11 0.11 0.1 0.06 0.18 0.13 0.06 1.0 0.29 0.49 0.32 0.23 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.04
0.03 0.07 0.09 0.09 0.05 0.03 0.08 0.14 0.18 0.15 0.08 0.14 0.04 0.2 0.06 0.05 0.06 0.15 0.08 0.01 1.0 0.16 0.34 0.66 0.2 0.18
0.16 0.15 0.12 0.17 0.2 0.18 0.2 0.17 0.19 0.2 0.23 0.25 0.2 0.25 0.15 0.2 0.15 0.16 0.15 0.09 1.0 0.31 0.48 0.39 0.34 0.27
0.05 0.05 0.03 0.05 0.05 0.03 0.04 0.07 0.07 0.12 0.1 0.05 0.05 0.03 0.05 0.02 0.04 0.03 0.09 0.02 1.0 0.03 0.01 0.02 0.03 0.06
0.13 0.1 0.09 0.08 0.06 0.04 0.06 0.07 0.05 0.07 0.08 0.07 0.13 0.11 0.12 0.12 0.08 0.12 0.1 0.07 1.0 0.11 0.19 0.09 0.22 0.16
0.22 0.16 0.13 0.13 0.15 0.21 0.26 0.28 0.26 0.3 0.27 0.23 0.2 0.1 0.17 0.1 0.13 0.21 0.22 0.17 1.0 0.19 0.38 0.33 0.35 0.21
0.1 0.02 0.04 0.05 0.03 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.08 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.08 0.39 0.33 0.22 0.16
0.15 0.09 0.05 0.1 0.08 0.1 0.11 0.11 0.05 0.09 0.15 0.18 0.08 0.13 0.19 0.2 0.13 0.27 0.22 0.16 1.0 0.21 0.58 0.49 0.19 0.23
0.14 0.2 0.2 0.24 0.15 0.09 0.14 0.21 0.22 0.23 0.29 0.23 0.19 0.14 0.27 0.17 0.24 0.36 0.26 0.16 1.0 0.36 0.61 0.43 0.25 0.28
0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 1.0 0.03 0.05 0.07 0.02 0.03
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.04 0.06 0.05 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.04 0.24 0.0 0.0 0.0
0.09 0.2 0.21 0.24 0.37 0.34 0.32 0.26 0.19 0.2 0.17 0.15 0.09 0.18 0.18 0.16 0.29 0.41 0.45 0.34 1.0 0.53 0.21 0.32 0.44 0.47
0.01 0.03 0.03 0.08 0.09 0.06 0.08 0.06 0.09 0.08 0.13 0.07 0.02 0.08 0.03 0.03 0.03 0.1 0.09 0.06 1.0 0.22 0.34 0.22 0.29 0.2
0.04 0.11 0.13 0.16 0.17 0.17 0.17 0.15 0.2 0.2 0.18 0.19 0.04 0.19 0.22 0.17 0.17 0.31 0.31 0.18 1.0 0.23 0.48 0.25 0.22 0.22
0.13 0.33 0.33 0.47 0.51 0.36 0.46 0.47 0.47 0.55 0.57 0.49 0.17 0.47 0.49 0.46 0.36 0.53 0.39 0.27 1.0 0.76 0.82 0.96 0.42 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.23 0.07 0.05 0.0
0.16 0.15 0.15 0.16 0.16 0.15 0.16 0.17 0.19 0.19 0.21 0.23 0.17 0.2 0.15 0.19 0.21 0.25 0.2 0.26 1.0 0.26 0.54 0.42 0.33 0.32
0.04 0.03 0.05 0.06 0.06 0.06 0.11 0.1 0.1 0.06 0.05 0.03 0.04 0.13 0.17 0.19 0.11 0.2 0.24 0.1 1.0 0.15 0.57 0.2 0.27 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 1.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.09 0.04 0.03 0.05 0.03 0.02 0.04 0.06 0.03 0.05 0.06 0.05 0.06 0.1 0.17 0.08 0.09 0.25 0.16 0.09 1.0 0.12 0.63 0.15 0.31 0.35
0.06 0.02 0.05 0.07 0.0 0.02 0.14 0.07 0.0 0.05 0.03 0.06 0.07 0.08 0.01 0.02 0.0 0.11 0.12 0.01 1.0 0.07 0.35 0.08 0.01 0.06
0.12 0.14 0.18 0.26 0.3 0.28 0.37 0.34 0.36 0.34 0.32 0.25 0.12 0.31 0.26 0.38 0.24 0.43 0.29 0.19 1.0 0.74 0.65 0.36 0.33 0.33
0.14 0.15 0.15 0.17 0.15 0.13 0.17 0.21 0.17 0.15 0.15 0.13 0.12 0.2 0.14 0.11 0.16 0.34 0.3 0.19 1.0 0.21 0.25 0.15 0.31 0.34
0.22 0.18 0.21 0.21 0.22 0.13 0.24 0.29 0.19 0.31 0.3 0.28 0.17 0.29 0.15 0.22 0.31 0.3 0.3 0.26 1.0 0.2 0.29 0.19 0.32 0.26
0.28 0.22 0.2 0.29 0.28 0.19 0.31 0.34 0.28 0.35 0.4 0.33 0.23 0.2 0.11 0.14 0.19 0.17 0.19 0.18 1.0 0.33 0.36 0.28 0.4 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.09 0.34 0.62 0.1 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.17 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.17 0.56 0.59 0.08 0.31
0.06 0.04 0.04 0.09 0.16 0.15 0.11 0.11 0.21 0.15 0.15 0.13 0.05 0.06 0.02 0.03 0.01 0.09 0.05 0.04 1.0 0.08 0.44 0.16 0.3 0.18
0.14 0.16 0.18 0.21 0.23 0.17 0.25 0.28 0.25 0.26 0.26 0.21 0.12 0.24 0.17 0.19 0.19 0.32 0.22 0.2 1.0 0.13 0.23 0.26 0.21 0.32
0.14 0.18 0.19 0.22 0.25 0.25 0.27 0.27 0.27 0.28 0.25 0.21 0.12 0.28 0.22 0.22 0.23 0.29 0.32 0.25 1.0 0.13 0.22 0.25 0.24 0.29
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.1 0.02 0.19
0.13 0.12 0.12 0.2 0.18 0.11 0.14 0.13 0.11 0.12 0.16 0.14 0.11 0.19 0.14 0.14 0.14 0.18 0.17 0.12 1.0 0.2 0.38 0.34 0.36 0.35
0.03 0.06 0.09 0.13 0.17 0.09 0.08 0.09 0.07 0.05 0.04 0.07 0.03 0.11 0.07 0.09 0.04 0.07 0.08 0.11 1.0 0.05 0.44 0.11 0.05 0.12
0.02 0.02 0.01 0.08 0.03 0.07 0.07 0.08 0.11 0.07 0.12 0.06 0.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.09 0.07 0.02 1.0 0.3 0.4 0.18 0.18 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.11 0.12 0.2 0.11 0.11 0.17 0.15 0.14 0.15 0.15 0.13 0.04 0.1 0.1 0.12 0.06 0.14 0.08 0.08 1.0 0.15 0.49 0.58 0.38 0.24
0.11 0.18 0.19 0.22 0.22 0.16 0.21 0.22 0.21 0.22 0.18 0.16 0.11 0.25 0.38 0.32 0.27 0.45 0.38 0.26 1.0 0.42 0.72 0.34 0.24 0.25
0.17 0.14 0.07 0.2 0.12 0.08 0.17 0.13 0.12 0.07 0.14 0.19 0.18 0.11 0.06 0.09 0.09 0.14 0.15 0.07 1.0 0.16 0.42 0.38 0.29 0.4
0.18 0.2 0.15 0.16 0.12 0.08 0.12 0.17 0.12 0.16 0.18 0.19 0.22 0.18 0.18 0.24 0.14 0.3 0.18 0.11 1.0 0.17 0.66 0.38 0.28 0.24
0.24 0.18 0.07 0.23 0.17 0.08 0.1 0.18 0.17 0.18 0.3 0.17 0.24 0.17 0.17 0.21 0.11 0.27 0.2 0.08 1.0 0.21 0.5 0.41 0.38 0.28
0.01 0.03 0.02 0.04 0.01 0.05 0.05 0.05 0.02 0.05 0.05 0.03 0.0 0.07 0.05 0.05 0.07 0.07 0.07 0.05 1.0 0.2 0.49 0.22 0.04 0.07
0.01 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.01 1.0 0.22 0.55 0.13 0.07 0.04
0.19 0.32 0.34 0.35 0.44 0.5 0.42 0.41 0.29 0.26 0.22 0.2 0.15 0.24 0.26 0.27 0.35 0.46 0.48 0.43 1.0 0.2 0.2 0.19 0.28 0.36
0.04 0.02 0.05 0.08 0.07 0.15 0.16 0.19 0.15 0.16 0.19 0.15 0.06 0.01 0.02 0.01 0.03 0.06 0.06 0.02 1.0 0.05 0.46 0.12 0.29 0.33
0.15 0.14 0.13 0.16 0.2 0.21 0.29 0.27 0.27 0.32 0.28 0.24 0.17 0.29 0.3 0.31 0.3 0.31 0.25 0.29 1.0 0.24 0.38 0.27 0.33 0.33
0.02 0.04 0.06 0.1 0.09 0.09 0.04 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.03 0.15 0.08 0.01 1.0 0.1 0.2 0.18 0.16 0.21
0.23 0.17 0.18 0.21 0.2 0.17 0.16 0.19 0.2 0.2 0.24 0.23 0.24 0.22 0.27 0.29 0.12 0.24 0.15 0.07 1.0 0.36 0.41 0.34 0.25 0.27
0.11 0.14 0.13 0.15 0.2 0.15 0.15 0.18 0.27 0.27 0.28 0.19 0.06 0.09 0.06 0.09 0.09 0.09 0.13 0.09 1.0 0.46 0.65 0.26 0.22 0.21
0.08 0.08 0.09 0.1 0.05 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05 0.06 0.07 0.07 0.07 0.09 0.08 0.05 0.13 0.09 0.05 1.0 0.29 0.4 0.25 0.19 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)