Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-0.29 0.8 0.71 0.49 0.68 -0.55 0.21 -6.27 -6.59 -6.01 -6.6 -4.16 -8.5 0.34 -0.07 -0.79 -0.71 -0.39 -1.0 1.05 -0.2 0.33 0.83 -0.2 -1.83 -1.23 -1.51 1.63 -1.82 -2.31 1.07 0.43 0.46 -0.1 1.21 -0.46 -0.7 0.33 -1.82 -4.11 -5.55 -1.57 0.46 1.9 0.54 -0.79 0.39 1.53
0.08 0.15 1.03 0.76 0.43 -1.11 0.47 -2.61 -3.3 -5.54 -5.39 -4.74 -5.22 -0.19 -1.09 -0.68 -0.44 0.09 -0.48 0.54 -0.05 0.05 0.59 -0.43 -1.94 -0.9 -1.64 1.53 0.02 -2.38 0.79 0.34 0.08 -0.2 0.74 -0.14 0.27 0.1 -0.24 0.3 -1.55 -1.05 -0.08 1.29 1.07 0.6 0.32 1.14
0.16 -0.01 1.1 1.25 0.57 -0.97 0.92 -3.9 -3.7 -6.44 -5.28 -4.66 -5.79 0.12 -1.0 -0.9 -0.97 -0.21 -0.93 0.47 -0.26 0.09 0.47 -0.52 -2.27 -1.03 -1.49 1.61 -0.21 -3.18 0.83 0.3 -0.0 -0.35 0.79 -0.55 0.05 0.1 -0.77 0.08 -1.31 -1.49 -0.32 1.36 0.9 0.6 0.82 1.34
-1.02 -0.32 1.34 1.08 0.73 -0.74 0.68 -2.18 -2.69 -4.93 -4.71 -5.6 -4.59 0.2 -0.39 -0.8 -0.68 0.23 -0.83 0.36 -0.06 0.29 0.73 -0.34 -2.06 -0.83 -1.66 1.44 -1.24 -2.58 0.73 0.27 0.1 0.01 0.85 0.06 0.13 0.13 -0.7 -2.1 -2.41 -0.77 -0.14 1.12 0.99 1.19 0.32 1.2
1.2 0.18 0.61 0.62 0.13 -0.95 0.36 -4.24 -4.79 -6.69 -6.39 -10.21 -6.63 0.33 -1.07 -0.89 -0.95 -0.23 -1.42 0.22 -0.42 -0.02 0.39 -0.46 -1.92 -0.78 -1.36 1.12 0.81 -2.2 0.29 0.22 -0.39 0.01 0.39 -0.1 0.56 0.42 0.65 -1.28 -1.02 -0.72 0.36 1.35 0.92 1.33 0.36 1.23
AT1G10840 (TIF3H1)
0.94 0.57 1.17 1.16 0.63 -0.82 0.91 -3.68 -3.52 -4.95 -4.2 -1.15 -3.88 -0.07 0.03 -0.65 -0.72 -0.43 -1.66 0.59 -0.58 -0.04 0.36 -0.33 -1.36 -0.77 -0.72 0.82 -1.2 -1.31 0.44 0.2 -0.65 -0.25 0.47 -0.13 0.1 0.05 0.25 1.11 -2.91 -0.98 -0.03 1.34 0.51 0.59 0.05 0.84
0.3 0.77 1.26 0.96 0.81 0.32 0.8 -1.66 -2.89 -3.57 -3.86 -6.98 -4.18 0.31 0.2 -0.13 0.49 -0.2 -0.92 1.08 0.08 0.41 1.14 -0.36 -2.45 -0.46 -2.81 0.9 -2.61 -3.36 0.58 0.57 -0.16 -0.01 0.51 0.27 -0.19 0.19 -0.72 -2.3 -0.22 -0.56 0.53 1.22 0.44 -1.84 - 0.35
0.05 0.96 1.1 1.33 1.2 1.35 1.38 -0.03 -0.64 -2.25 -1.48 -4.9 -1.13 0.08 0.89 -0.82 -0.61 0.16 -0.95 0.65 -0.31 -0.31 0.01 -0.54 -2.86 -0.77 -1.65 0.18 0.96 -3.01 0.5 -0.02 -0.41 -0.27 0.45 -0.46 -1.5 -0.37 -0.59 -4.0 -0.85 -0.96 -0.21 0.49 -0.34 1.35 - -0.39
AT1G12920 (ERF1-2)
0.93 0.43 1.14 1.24 0.53 -0.75 1.07 -3.6 -4.18 -5.37 -4.9 -13.56 -6.75 0.17 0.46 -0.89 -0.56 -0.11 -1.65 0.49 -0.35 -0.12 0.31 -0.36 -0.99 -0.83 -1.35 0.79 0.01 -1.34 0.51 0.49 -0.25 0.26 0.52 -0.72 -0.18 0.13 -0.33 -2.94 -1.97 -0.66 0.15 1.4 0.84 1.25 -0.94 1.01
AT1G18080 (ATARCA)
-0.63 0.33 -0.44 -0.59 -0.52 -1.36 -0.85 -4.83 -5.78 -6.99 -7.48 -14.01 -8.63 0.19 0.82 -0.59 -0.96 -0.22 -1.07 0.84 -0.17 0.6 1.08 -0.34 -1.81 -1.11 -1.79 2.12 -0.31 -2.67 0.83 0.69 0.35 -0.4 1.37 -0.31 -0.63 0.27 -1.21 -2.81 -4.72 -1.54 0.19 1.89 1.21 0.04 0.1 1.69
-0.02 0.6 1.44 1.03 1.48 0.71 1.24 -4.67 -3.09 -5.05 -5.02 -8.01 -8.0 -0.26 -1.43 -0.62 -0.83 -0.45 -1.27 0.81 0.3 0.57 1.13 -0.23 -2.1 -1.38 -3.35 0.71 -3.33 -2.95 1.0 1.11 -0.14 -1.04 0.79 0.09 -1.47 -0.08 -2.11 - - -2.45 -0.45 2.05 1.06 - -7.42 1.6
0.73 0.49 0.81 0.46 -0.06 -1.7 0.35 -3.76 -2.57 -2.02 -2.09 -8.01 -2.52 0.09 -0.91 -0.48 -0.46 -0.59 -0.75 0.78 -0.55 0.24 0.7 -0.67 -0.23 -0.84 -0.7 1.31 0.79 -0.21 0.38 0.32 -0.15 0.24 0.72 -0.61 -0.05 0.07 0.16 -0.58 0.14 -0.3 0.07 1.1 0.64 0.81 -0.58 0.41
0.81 0.38 0.88 0.94 0.21 -1.49 0.87 -3.05 -1.9 -1.74 -1.31 -7.08 -2.94 0.19 -0.61 -0.63 -0.46 -0.44 -0.74 0.54 -0.54 -0.13 0.47 -0.78 -0.33 -0.98 -0.6 1.17 0.1 -0.59 0.08 0.12 -0.13 0.19 0.47 -0.71 -0.07 -0.06 0.2 -0.03 0.8 -0.31 -0.02 1.09 0.63 0.78 -0.65 0.45
AT1G29900 (CARB)
-0.19 0.16 1.32 1.15 0.71 -1.03 0.97 -6.59 -6.5 -5.98 -6.09 -11.25 - 0.32 -0.24 -0.31 -0.46 -0.17 -1.14 0.48 -0.1 0.67 1.12 -0.58 -1.31 -0.61 -2.55 2.06 -0.57 -1.64 0.31 0.34 0.29 -0.06 0.61 -0.25 -0.14 0.22 -0.54 -1.45 -2.94 -1.11 -0.59 1.6 1.03 -1.55 -1.56 0.88
-0.29 0.07 0.65 0.85 0.37 -0.33 0.68 -3.12 -3.86 -5.66 -5.42 - -5.81 0.15 1.03 -0.53 -0.5 -0.06 -1.52 0.36 -0.19 0.25 0.95 -0.39 -1.31 -0.68 -0.82 1.25 -0.59 -1.54 0.22 0.72 -0.24 -0.36 0.78 -0.13 0.11 0.21 -0.57 -2.6 -3.8 -0.71 0.26 1.64 1.08 0.16 -0.14 1.42
0.55 0.49 0.89 0.85 0.42 -1.25 0.44 -6.99 -6.56 -6.63 -5.97 - - 0.49 0.45 -0.48 -0.41 -0.02 -1.22 0.71 0.59 0.4 1.07 -0.69 -0.77 -0.92 -1.76 0.56 -0.68 -1.04 0.54 1.14 -0.47 -0.07 0.46 -0.23 0.31 0.16 -0.28 -2.28 0.08 -0.73 -0.4 1.61 1.0 - 0.01 1.06
AT1G55900 (TIM50)
0.97 0.74 1.55 1.64 1.22 -0.76 1.39 -4.16 -4.38 -5.37 -4.49 -5.16 -6.5 -0.08 -0.33 -0.95 -0.7 -0.34 -0.93 0.62 0.6 0.01 0.64 -0.64 -1.69 -1.17 -2.11 0.82 -0.5 -2.14 0.72 0.53 -0.75 -1.16 0.56 -0.93 -0.97 -0.1 -1.63 -3.18 -2.09 -1.16 -0.27 1.64 0.73 -0.94 0.15 1.36
AT1G56070 (LOS1)
-0.19 0.01 0.81 1.18 0.11 -1.22 0.79 -3.04 -3.28 -6.29 -5.55 -8.06 -6.65 0.24 -0.82 -0.53 -0.84 -0.09 -0.88 0.66 -0.16 0.35 0.83 -0.45 -1.4 -0.83 -1.03 1.79 -0.5 -2.06 0.87 0.45 -0.22 -0.14 0.91 -0.21 0.33 0.17 -0.26 -2.54 -2.88 -1.1 -0.3 1.28 1.21 0.63 0.09 1.1
0.33 0.44 0.56 0.58 -0.0 -1.03 0.4 -3.47 -4.11 -5.49 -5.38 -0.8 -4.71 0.28 -0.31 -0.85 -0.94 -0.62 -1.68 0.52 -0.51 0.03 0.58 -0.69 -2.25 -1.08 -1.62 1.69 -0.74 -2.42 0.34 0.3 -0.33 -0.18 0.41 -0.65 0.36 0.24 0.02 -1.08 -3.05 -1.41 0.38 1.71 0.97 1.85 0.16 1.39
AT1G74260 (PUR4)
-0.15 0.11 1.26 1.01 0.47 -1.92 0.71 -7.72 -7.15 -6.27 -5.76 -10.06 -5.68 0.1 -0.31 -0.14 -0.95 -0.47 -0.63 0.4 -0.29 0.59 0.89 -0.68 -1.16 -0.64 -1.17 2.04 -0.1 -1.39 0.59 0.43 0.43 -0.37 0.91 -0.54 0.25 -0.05 -0.05 -3.06 -4.25 -1.03 -0.77 1.57 1.05 -1.87 0.42 0.96
-1.56 -0.26 1.26 1.23 1.15 0.31 1.26 -3.89 -3.34 -4.14 -3.32 -1.69 -4.22 -0.15 -0.86 0.02 -0.52 -0.61 -0.99 0.67 -0.43 0.47 0.78 -0.24 -0.56 -0.06 0.19 1.01 -1.45 -1.01 0.16 0.7 0.03 -0.04 0.51 0.15 0.29 -0.06 -0.13 -6.05 -6.67 -0.52 0.02 1.59 0.85 -3.31 -0.66 0.7
0.34 0.24 0.56 0.5 0.69 -0.34 0.44 -4.98 -6.89 -6.11 -7.02 - -7.78 -0.8 -4.17 -0.91 -0.78 -0.28 -1.6 0.8 0.17 0.47 1.34 -0.74 -0.47 -1.89 -4.57 0.53 -3.55 -0.37 0.91 1.66 -0.83 -1.65 1.19 -0.08 -1.21 -0.1 -1.93 -5.91 - -1.36 0.28 2.45 1.9 - -1.87 1.73
AT2G16650 (PRORP2)
-0.79 0.39 1.38 0.99 0.72 -1.93 0.72 -7.1 -4.55 -5.73 -4.78 - -7.93 -0.09 -0.49 -0.68 -2.07 -2.27 -1.7 0.66 -1.34 0.19 0.79 -0.8 -0.57 -1.22 -1.79 1.0 0.3 -1.32 -0.04 1.04 -0.52 -0.29 0.89 -0.33 1.62 0.22 -0.42 -3.06 -4.52 -1.39 0.02 2.67 0.97 -5.35 -8.45 1.19
AT2G17250 (EMB2762)
1.64 0.65 1.68 1.42 1.19 -0.79 1.14 -6.65 -6.83 -6.49 -5.11 - - 0.01 -1.02 -1.32 -1.52 -1.19 -1.53 0.39 -0.69 -0.06 0.83 -0.83 -1.06 -1.61 -1.74 0.86 -1.32 -1.6 0.55 0.77 -1.14 -1.05 0.9 -1.11 -0.61 0.05 -1.38 -3.14 -4.28 -1.51 -0.46 2.01 0.94 - 0.45 1.73
AT2G18020 (EMB2296)
0.58 0.36 0.8 0.81 0.53 -0.66 0.62 -4.76 -5.15 -6.42 -6.1 -7.53 -10.09 0.14 0.07 -0.88 -1.03 -0.25 -1.36 0.74 -0.35 0.25 0.74 -0.35 -2.33 -1.2 -2.27 1.86 -1.69 -3.02 0.85 0.66 0.3 -0.22 1.31 -0.59 -1.38 0.31 -1.72 -4.06 -5.03 -1.68 0.25 1.95 0.9 -0.14 -0.4 1.61
0.02 0.9 0.09 0.25 -0.2 -1.34 0.1 -4.37 -4.56 -5.86 -5.17 -10.08 -5.42 0.21 -0.37 -0.28 -0.34 -0.4 -0.62 1.05 -0.06 0.34 0.73 -0.36 -0.87 -0.56 -0.21 1.5 -0.62 -1.4 0.81 0.18 0.3 0.17 0.78 -0.21 0.36 0.38 0.74 -1.93 -1.68 -0.24 -0.15 1.15 0.34 1.12 0.26 0.57
0.97 0.37 1.17 1.0 0.69 -0.78 0.89 -3.37 -3.84 -6.2 -5.03 - -8.58 0.09 0.05 -0.12 -0.45 -0.06 -1.16 0.85 0.79 0.56 1.19 -0.76 -0.26 -1.28 -2.24 0.32 -0.55 -0.95 0.78 1.3 -0.73 -0.93 0.38 -0.83 0.16 0.06 -0.56 -3.88 -3.96 -1.72 -0.2 1.7 0.97 -8.63 -2.47 1.37
0.81 -0.15 1.5 1.36 1.14 0.19 1.26 -2.63 -2.62 -3.85 -2.63 -0.12 -3.39 0.3 0.58 -0.81 0.15 -0.49 -1.58 0.33 0.36 0.14 0.5 -0.61 -2.27 -1.28 -0.91 0.17 0.61 -3.08 0.11 0.32 -0.88 -0.85 -0.06 -0.29 0.55 -0.13 -1.38 -4.44 -3.43 -1.12 0.24 1.35 0.95 -0.23 -3.74 1.27
1.67 0.17 0.53 0.99 -0.79 -5.08 0.56 - - -8.37 -7.18 - - 0.24 0.03 -0.88 -1.42 -0.93 -2.01 0.7 -0.32 1.1 1.59 -1.31 -1.06 -2.2 -3.18 1.61 -2.06 -0.88 -0.0 1.0 -0.29 -0.44 0.66 -0.89 -0.08 0.28 -1.03 -4.57 -5.84 -1.07 -0.36 2.53 1.04 - -4.15 1.64
AT2G39990 (EIF2)
0.98 0.48 1.27 1.4 0.88 0.05 1.4 -3.05 -2.69 -4.16 -2.85 -1.22 -1.98 -0.18 -0.84 -0.81 -0.71 -0.39 -1.13 0.6 -0.23 -0.06 0.36 -0.41 -1.34 -0.97 -1.41 1.03 -0.47 -1.56 0.66 0.55 -0.65 -0.31 0.58 -0.45 -0.34 0.15 -0.53 -2.52 -2.75 -0.81 0.01 1.41 0.6 0.45 -0.72 0.99
1.49 0.84 1.46 1.35 1.28 -0.5 1.08 -4.96 -5.11 -5.68 -5.29 -10.37 -3.54 0.11 -0.73 -0.84 -0.71 -1.03 -1.24 0.86 0.02 0.02 1.02 -0.94 -1.76 -1.84 -3.13 0.86 -0.09 -1.76 0.6 0.42 -1.35 -1.77 0.63 -1.13 -0.94 0.13 -2.01 -2.99 -6.71 -0.64 1.13 1.89 0.16 - 0.58 1.06
AT2G46280 (TRIP-1)
0.52 0.46 1.48 1.2 1.2 0.1 1.12 -3.23 -3.3 -5.22 -4.57 -4.8 -6.19 0.09 -0.33 -0.83 -1.11 -0.85 -1.61 0.66 -0.43 0.06 0.56 -0.59 -1.25 -0.99 -2.14 1.03 -1.18 -1.22 0.39 0.42 -0.34 0.07 0.53 -0.53 0.41 0.22 0.01 -1.99 -3.5 -0.91 0.25 1.84 0.7 -0.54 -0.42 1.03
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AT3G06720 (IMPA1)
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AT3G11400 (EIF3G1)
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AT3G13920 (RH4)
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AT3G26618 (ERF1-3)
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AT3G57290 (INT6)
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AT4G11240 (TOPP7)
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AT4G19210 (RLI2)
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AT4G20440 (smB)
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AT4G24490 (RGTA1)
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AT4G28470 (RPN1B)
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AT4G31580 (RSZ22)
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AT4G33250 (EIF3K)
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AT4G35490 (MRPL11)
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AT4G38680 (GRP2)
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1.14 0.18 0.69 0.74 0.46 -0.67 0.39 -5.45 -5.38 -6.59 -6.41 -6.51 -8.2 0.2 0.57 -1.3 -1.55 -0.8 -1.83 0.39 -0.81 -0.05 0.75 -0.75 -3.41 -1.22 -3.39 1.14 -0.42 -3.53 0.28 0.16 -0.31 -0.4 0.51 0.33 -0.23 0.23 -1.51 -2.57 -3.93 -1.52 0.32 1.88 1.16 2.06 0.4 1.48
-0.08 0.51 1.17 1.26 0.69 -0.05 1.02 -3.06 -3.56 -5.46 -4.95 -10.12 -3.42 0.03 0.2 -0.82 -0.68 0.01 -0.84 0.46 -0.17 -0.25 0.46 -0.56 -1.5 -1.04 -1.02 1.26 0.12 -1.6 0.66 0.28 -0.35 -0.11 0.97 -0.56 -0.12 0.03 -0.09 -2.98 -2.83 -0.82 0.11 1.24 0.94 0.79 -0.15 0.94
-0.44 0.35 0.83 0.62 0.86 -0.25 0.26 -4.79 -5.64 -6.12 -6.35 -7.7 -11.3 -0.21 -1.89 -0.54 -0.57 -0.07 -0.83 0.89 0.01 0.65 0.95 -0.09 -1.99 -1.1 -2.34 1.28 -1.85 -3.02 1.25 0.74 0.11 -0.39 1.11 0.04 -0.88 0.06 -2.39 -3.86 -5.07 -1.7 0.45 1.99 1.16 -0.98 -0.35 1.83
AT5G54900 (RBP45A)
0.6 0.41 1.02 0.65 0.11 -1.65 0.33 -6.19 -5.92 -6.57 -6.1 -11.26 -10.9 0.02 0.52 -0.69 -0.25 0.05 -1.02 0.7 -0.13 0.3 1.06 -0.15 -1.97 -0.63 -0.44 1.41 -0.05 -2.57 0.81 0.42 -0.24 -0.4 1.02 -0.2 -0.13 0.21 -1.32 -3.01 -3.76 -0.74 0.26 1.62 1.0 0.27 -1.91 1.38
1.13 -0.3 1.62 1.84 1.06 -0.6 1.38 -4.96 -4.81 -5.92 -4.73 -9.73 -8.62 -0.68 0.42 -1.4 -0.99 -0.76 0.19 -0.09 0.31 -0.7 0.29 -0.54 -2.45 -1.58 -2.45 1.55 -0.14 -2.66 0.15 0.03 -1.35 -1.33 0.46 -0.55 -0.06 -0.16 -3.23 -5.4 -3.1 0.32 0.07 1.65 1.3 - -1.05 1.79
0.73 0.32 1.44 1.6 1.15 -0.2 1.2 -5.34 -5.69 -6.01 -5.22 -10.26 -6.45 -0.29 0.29 -0.97 -0.71 0.06 -0.85 0.59 0.0 0.1 0.98 -0.68 -1.77 -1.34 -2.24 1.27 0.28 -2.39 0.84 0.68 -0.59 -1.13 1.07 -0.91 -1.45 -0.35 -2.1 -5.17 -3.18 -1.45 -0.33 1.54 1.08 - -0.23 1.32
AT5G62190 (PRH75)
0.33 0.26 1.42 1.23 0.39 -2.34 0.97 -7.96 -6.9 -6.53 -5.31 -9.21 -6.53 0.35 -0.51 -0.58 -1.4 -1.54 -1.41 0.81 -0.79 0.53 1.02 -0.74 -0.7 -0.81 -1.57 0.53 -0.44 -0.93 0.14 0.85 -0.86 -0.2 0.73 -0.12 0.73 0.19 0.24 -2.62 -3.22 -2.02 -0.58 2.38 1.18 -7.02 0.23 0.93

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.