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Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.74 0.83 - -0.4 - -0.11 1.23 0.6 - 0.56 1.97 1.34 1.06 - - - -0.39 0.6 - - -0.32 - - - - 1.16
-1.22 - - - - - -1.0 - - 2.27 2.12 1.21 - 1.19 1.24 2.4 - - -1.28 - -0.18 - - 0.28 -0.24 -1.78
- - - - - - - - - - 2.66 - - - 2.56 - - 2.5 - - 1.71 - 2.27 - - -
- - - 3.65 - 2.88 - - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - -
- - - 3.73 - - - - - - 3.67 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.42 0.34 - 1.44 1.46 0.42 - - 1.55 0.87 - - - 0.67 1.48 1.23 0.11 - - - - - -
- - - 4.26 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - 3.66 - - - - - - -
- - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.16 - - - - - - 2.01 - 3.03 - - - - - - - 2.67 - 1.58 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.82 - - - 3.56 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - 3.4 - - - - - - - -
0.2 -1.09 1.12 1.96 1.47 0.26 -0.14 -1.45 -1.35 1.14 1.65 0.34 1.32 - - -0.36 - -1.93 -0.11 - -0.34 -1.74 - - -1.02 -
- - - - 3.54 - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.83 - - - - - - 1.86 - 2.28 - - - - 1.7 - - - - - - - -
- - 1.47 3.55 - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - -0.05 - - - - 0.47
- - - 4.21 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.94 - - - - 1.6 - - 2.72 - - - 1.63 1.61 1.95 - - 1.34 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.91 - - 4.21 - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.61 -0.85 1.8 - 0.23 - -0.83 1.19 -0.94 0.4 - 0.31 0.26 0.22 - 1.84 0.56 -0.86 -0.2 -0.82 - 1.24 0.37 -1.53 -0.28
- - - - - - 3.49 - - - 3.88 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.12 - - - - - 3.05 3.17 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.03 3.19 -0.08 - - - - - 1.62 0.12 - - - 2.55 - 1.02 -0.33 -0.3 -0.91 - - - - -0.48
- - - - 3.54 - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - -
0.42 - - - 0.62 0.67 - 1.77 2.34 0.31 2.76 2.34 - - - - - - - - - - - - - -
1.31 -2.06 -2.19 -2.6 -2.02 1.3 -0.54 -3.1 0.79 0.04 2.23 1.17 -0.59 -5.52 -4.79 - 0.77 -0.11 -2.06 -0.07 - -2.11 -4.0 0.19 0.12 1.39
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.55 0.66 - - - 0.66 0.62 - - - 3.72 2.11 0.31 - 0.17 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.67 - - - - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.91 - - 2.66 2.23 - - - - - - - - - - -
- - - 3.79 -0.12 - - - - 2.24 - - - - - - 2.7 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.65 0.97 0.36 3.19 1.8 0.7 - - - - - - - - - -0.74 1.31 1.13 0.68 -1.01 - -0.89 - - - -
- - - - - - - - - - 3.65 3.75 - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.18 2.13 - - - - 2.3 - 2.19 2.29 - - - - - 1.43 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.58 - 2.88 - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - -
- 0.69 - - 1.63 - 0.45 0.33 - - 2.45 2.11 - 0.27 0.35 0.33 - - 0.37 0.06 - 0.04 - - -0.18 -0.14
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - 3.35 -
- - - - - - - - - - 3.79 - - - 2.73 - - - 2.46 - - - - - - -
- - - 3.99 - - - - - - -2.05 - - 3.31 - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.