1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - 0.45 - - - - - - - - - - 2.41 - 0.08 0.06 -0.0 - 3.36 2.04 -0.18 -0.06
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.01 - - - 3.65 - - - - - - - - - - 2.71 - - - - 1.53
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.61 - 3.17 - 1.61 2.97
- - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - - 2.45 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
-0.15 - 1.16 0.11 - - - - 0.14 - - 1.25 - - - 1.18 0.39 1.68 1.39 -0.22 0.97 - 1.27 - 0.54 1.16
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.95 - - -
- -1.31 - - 0.04 -1.43 -1.44 -1.56 - 0.02 1.83 0.23 - 0.91 0.04 - - -1.11 -1.8 - 0.43 -0.26 2.97 -0.84 1.43 -0.37
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.34 - - - - - - - 3.32 0.76 - - - - 3.56 - - -
- -1.06 - - 1.74 0.49 0.56 - - 0.28 - - -0.21 0.19 -0.89 0.83 0.57 -1.23 - - 1.86 - 2.59 -0.04 -0.32 -1.15
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
1.58 - - - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - 1.51 0.9 1.49 2.51 - 1.27 2.31
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.73 3.75 - - 2.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - 3.46 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 1.35 - - 0.43 - 0.7 1.58 - 3.84 1.36 -0.77 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - 1.34 - - - - - - - - - 2.9 - 4.0 - - -
- -1.51 0.1 -0.08 0.04 0.12 -2.1 1.19 0.57 -0.13 -0.33 0.76 - -3.7 -0.67 -0.8 0.04 0.52 1.25 0.21 0.14 -1.92 0.74 0.12 0.44 0.45
- - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - 4.19 - - -
-1.18 0.34 -1.87 -2.05 -1.7 -0.53 -0.49 0.72 -0.85 -0.96 -0.69 -1.88 0.37 0.15 -1.03 0.83 -0.11 0.17 -0.67 1.68 0.47 0.28 1.46 -0.65 -0.04 -0.13
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - 1.42 - - - 1.3 - - - - - - - - 3.58 - 3.15 -
-0.18 - - - - - - 1.02 - 0.08 0.09 - - 0.48 0.04 - - 2.13 - -0.25 - - 3.56 - - 0.62
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.21 - - -
- - - - - - - - - 2.01 - - - - - - - 1.91 - - - - 3.68 - 2.44 -
- - - - - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - 2.78 - 3.34 - - 1.99
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.97 1.05 - - - - 0.96 - - - - - 0.88 - - 1.22 0.96 0.88 - - 3.59 - - -
0.82 -1.18 -1.86 0.22 0.39 -1.38 0.69 0.38 -1.92 1.05 0.56 0.29 0.14 -0.46 -2.06 - - -3.52 -0.79 -1.71 1.4 -0.91 1.0 1.2 -0.92 0.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - 0.48 3.04 - - - - - - - - - - 1.85 - - 3.67 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.26 - - - - 4.04 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.22 - 3.54 - - 2.34
- - 3.15 - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - 3.16 - - - - -
0.74 - - 1.83 - - 0.76 - - 3.1 - - - - - - - 1.08 - - - - 2.87 - 0.13 -
- - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - 2.9 - 3.51 - - -
- 0.67 - - - - 1.3 0.98 - - - 2.18 - - - - - - 1.74 0.77 0.15 - 1.71 1.69 1.48 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - 2.66 - - 3.61 - - -
- - - - - - - 1.03 - - - - - 0.98 - - - - - 1.06 0.2 1.89 3.76 - - 0.56
- - - - - - - - - - - 2.68 - - 2.5 - - - - - - - 3.8 - - -
- - 2.54 1.17 - - - - - - 1.15 - 1.66 - - - 1.42 - - - - - 3.3 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - 0.82 2.21 - - - 0.79 - - - - - - - - 0.2 - 1.39 1.92 - 2.63 2.04 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.82 3.65 2.82 1.54 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - - - 0.54 - - - 0.46 - 2.01 2.06 - - - - - - 1.73 - 2.69 0.43 1.5 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.