Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.21 - - - - - 3.41 - - - - - - - - 2.61 - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.25 - - 2.66 2.18 - - - - - 0.8 - - - - - - 0.8 0.68 2.66 0.44 -
0.65 1.44 -0.43 1.3 0.02 0.36 1.35 -0.61 -1.69 0.64 -1.76 0.52 0.12 -1.75 -0.51 -2.86 -2.55 0.34 -1.79 -2.83 0.7 -0.05 0.79 - -1.38 -0.7
- - 0.47 1.55 0.37 0.72 0.48 - - 3.36 0.4 0.56 - -0.12 0.38 - - - - - - - - - - 1.05
-0.37 0.15 -0.21 -0.16 -0.45 -1.06 0.17 - 0.2 -0.74 - 0.88 - 0.59 0.42 1.22 -0.93 0.62 0.75 0.69 0.99 -0.21 0.5 -0.09 -0.51 -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.42 -0.35 -0.34 0.61 0.62 -0.4 1.04 0.56 1.3 -0.1 -0.41 0.35 - -2.72 -0.57 -4.66 0.13 0.74 0.3 0.97 0.33 - -2.16 -0.68 1.36 -3.07
0.96 - - - 2.02 1.35 - 2.62 1.87 - - 1.92 - - - - - - - - - -0.57 1.04 - 0.18 -
- - - - 2.6 1.29 - - - - - -2.77 - - - - - - 2.18 3.03 - 0.67 - - - 1.61
0.0 1.32 - - - -0.45 - 0.33 -0.71 -0.74 2.12 2.72 - - 0.64 - - 0.3 -0.7 - -0.36 -0.02 0.97 - -1.31 -0.24
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.99 - - - - - - 2.9 - - - - - - 2.8 - 1.87 - - - - -
0.95 - 2.96 - 1.15 - - - - - 0.89 3.38 0.86 - - - - - - - - - - - - -
-0.11 -0.7 - - - -0.82 3.37 - -0.71 3.05 - - 1.39 - - -0.81 - -1.58 - - -2.28 - -0.91 - - -1.34
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.98 - - - - - 3.49 1.31 1.41 - - - - - - - - - - - - - 0.78 -
- - - 3.5 1.86 1.97 - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.38
- - - - 0.61 - - - 0.54 1.9 1.42 2.68 1.85 -0.17 - - - -0.17 - - 0.75 0.16 - 1.02 - -
0.3 -1.0 1.92 -0.06 1.04 -1.13 0.52 -1.25 0.85 -0.22 - -0.05 1.85 - - - - -0.11 -0.31 0.09 -0.58 -0.93 - -0.53 1.38 -0.68
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.26 -1.54 -2.13 0.5 -2.23 - -0.02 -0.15 -1.14 1.48 1.68 1.67 1.25 -0.97 -0.63 -1.06 - 0.02 -0.68 -0.92 1.14 - -1.64 - -0.77 0.83
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.31 2.07 3.18 - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.02 1.76 - - - 2.05 - - 2.15 - - - - - - - 1.68 - - - - 1.45 -
- - - 2.09 - 2.02 - - - 1.9 1.98 - - - - - - - 2.0 - - 1.76 - - 1.4 -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.25 - 2.95 - 3.13 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.6 -1.4 -1.53 -1.45 -0.05 1.04 0.53 1.49 - 1.83 1.59 -1.44 -0.14 -0.7 -0.09 -1.55 -0.32 -2.12 -0.89 -1.62 0.29 -1.93 - 0.58 - -
- - - - - - 2.78 - 3.26 - - 2.42 0.77 - - - - - - - - - - - 1.3 -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.05 - - - 2.53 2.69 - - - - - - 1.24 - 1.66 - - - - -
-1.69 0.2 -0.26 0.99 -1.49 -1.14 1.07 1.72 0.95 -0.47 0.56 0.3 -0.22 -0.27 0.36 - - -0.49 -1.74 - 0.71 -0.1 0.56 0.91 -2.0 -
- - - - - - 3.81 - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - -
-0.94 - - - - - 1.85 2.16 2.04 1.59 -0.63 2.63 -0.2 - - - - -1.38 - -1.01 - - - - 0.75 -
- - - - - - - - 3.82 3.57 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.63 - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - -
2.88 - - - - - 3.63 - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - - - - 2.55 - 3.55 - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -3.57 0.89 4.02 2.34 1.28 - - - - -2.5 - -4.3 - - - -4.6 - - -3.65 - - -
- - - - - - - - - - - - 2.7 - 2.21 2.2 - - 1.95 1.93 1.37 - - - - -
- - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 -
- - - 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.65 - - -
- - - - - - - - 3.43 1.6 - - - - - 1.7 - - - - - - - - - 3.16
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.03 - 0.33 0.41 - 0.24 0.54 - - 3.24 - - 1.55 - - 0.48 - -0.21 1.65 - - - 1.0 - - -
- - - - - - - - - - - 4.49 - - - - - 1.81 - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.44 2.26 1.38 - 1.39 - 1.25 - - - - 1.11 - - - - - - 0.97 - - 2.31 0.86
1.54 - - - - - 2.88 - - - 0.77 1.95 0.74 - - 0.74 1.81 0.3 - - -0.14 - - - 0.23 -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.34 -0.15 1.47 1.93 1.86 2.51 0.21 - -0.91 - -0.08 -0.95 -0.64 -0.4 - -1.15 -1.07 0.42 - -0.42 -1.03 - - -0.43 - -
- - - 1.42 1.53 - - - 3.05 - - 1.43 - - - - 1.54 - 1.33 1.25 - - - - 0.72 -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.87 - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.03 - 3.59 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.09 - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.02 - - - - - - - 3.04 3.36 1.78 - - - - - - - - - - - -
- - - 1.39 - - 3.47 - - - - 1.54 - - - - - 2.48 - 1.11 - - - - 0.76 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.3 - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - - - 1.11
- - - - - 3.44 - 2.57 1.57 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.07 1.02 - - - 1.09 1.12 3.97 - - 0.96 - - - - - - - - - - - - -
0.5 - - - - - - - 2.93 - - 2.48 - - - - - - - - 2.42 - 1.72 0.7 0.19 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.39 - 2.79 1.55 - - - - - - - - - - 1.72 1.27 - - - -
- 2.69 - - - 2.69 - 2.65 - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.71 - - - 0.76 - 2.9 - - 0.56 2.79 - - - - 0.87 - 1.15 - 0.14 -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - 3.18 - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.01 0.52 -0.11 1.39 - 2.53 1.88 - -1.15 - - - - 1.13 - - 1.99 0.17 - -2.05 -1.46 - -0.17 - -1.57
- - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.29 3.36 - 2.78 1.3 - 1.18 - - - - 0.75 - - - - - - - -
- 0.23 0.1 - - - 1.89 3.05 0.22 2.59 - 2.19 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.78 - 3.21 - - 1.6 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.47 3.14 - 2.93 - - 1.36 - - - - - - - - - - 2.07 - -
1.39 - - - - 1.27 2.78 1.47 - 2.46 2.54 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.61 2.02 - - - 2.23 - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
1.27 - - 1.13 -1.99 0.12 1.5 1.28 0.14 0.8 -1.96 1.2 -0.05 - -2.14 -2.0 - -2.48 -1.06 -2.22 -0.75 1.12 0.5 -1.29 -2.57 1.23
- - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - 3.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.33 - 1.81 - - - - - - 1.29 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.78 - - - - - - 2.17 - - - - - 1.96 - 1.94 - - - -
- - - - - - 3.94 - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - 3.46 - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.78 - - - - - - - - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.06 2.49 1.36 3.05 1.48 1.24 - - - - - - - 1.2 - - - - - - - -
0.97 - - - - 1.23 2.43 2.2 1.11 0.87 0.91 - - - - - - - 1.94 - 1.0 - - - - -
0.35 - - - - - 3.38 2.55 - - 1.63 - - - 0.41 - - 1.5 - - - - 0.28 - - -
- - - - - - - - 3.78 - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.21 -1.1 -0.35 - - -1.22 2.41 1.27 1.01 0.36 -0.37 0.34 1.24 -0.19 -1.44 0.39 - - 1.0 0.62 -0.63 -1.14 - - -2.97 -0.48
-0.85 - 1.04 -0.47 -0.84 -0.54 -0.54 -0.53 2.86 0.37 -0.58 - - 0.41 0.36 0.43 1.6 0.89 - - - - - - - 0.99
- - - - - - - - - 4.23 - 2.85 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.37 - - - - 3.45 2.25 - - - - - - - - - - - - -
2.05 1.13 1.22 - 2.47 - 1.2 1.01 1.12 - 1.0 - - - - - - - 0.98 - - - - - - 0.41
- - 1.57 1.36 0.53 - 1.79 - - 2.1 - - - -0.25 0.25 - 2.38 - 0.27 1.02 - - - - -0.28 -
- - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.49 - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.36 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41
1.16 -1.57 1.66 - -1.45 -0.06 - - 1.78 - - 0.54 0.33 1.28 -1.24 0.77 1.07 -1.9 0.43 0.18 - -1.55 -1.53 -0.55 0.77 -1.65
- 2.39 - 2.33 - - - - - - - 2.34 2.14 - - - - 1.66 - - - - - - 1.63 -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
-2.16 -1.57 - -0.2 -0.56 - 0.69 - -0.56 -1.25 -0.6 2.03 - - - 2.45 - 1.47 -0.43 -2.24 2.07 - 0.8 0.04 -1.8 -
- - - 3.08 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - 2.14 2.33 - - - -
- - - - 2.72 - - 2.84 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - 2.2 -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.3 - - 3.08 - 2.95 - 1.29 - - - - - - - - - - 2.3 - -
-0.13 0.43 - 2.17 0.08 - 2.0 1.07 0.17 2.07 - 1.85 - - - - - 0.03 - - - - - - 1.11 -
- - - 3.53 - - - - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.86 0.55 - 0.85 0.73 0.83 0.8 - - - 0.68 - - - - - 2.16 - - - 1.45 2.36 -
- 2.61 2.6 - - - 2.82 - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.27 - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.68 1.94 1.69 - - 1.7 - 1.71 - 2.57 1.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.44 - - - - 3.64 - - 2.15 - - - - - - - - - 1.87 - - - - - -
-0.25 - - - - 2.24 1.38 0.26 3.48 - -0.02 - - - - 1.53 - - - - 0.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.67 1.39 - 1.5 - - 1.45 1.42 2.59 - - - - 1.47 - - - - - - - - -
- - - - - - 3.34 3.1 - - - - - - - 2.87 - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.31 - 1.14 - - 1.36 - 1.24 1.33 1.63 1.07 0.98 - - 0.65 - - - - - 1.84 0.62 -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.