1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - 3.19 3.27 - - - - - - - - - - 2.85
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 3.7 - - - - - - - - - 3.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - 1.18 - - 3.72 0.31 2.91
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - - 3.47 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
-2.29 -1.4 -0.99 0.05 0.86 0.92 -0.01 -0.25 -1.69 -0.44 -1.64 -1.35 -2.61 1.46 -0.62 -0.15 -1.07 -0.44 0.26 0.92 0.89 -2.22 0.5 -3.01 -0.22 1.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - - 1.7 - 3.61
- 1.83 - - - - - 1.72 - - - - 2.09 - - - - - - - 2.89 2.44 - - 1.02 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- -0.69 - - - -0.69 - - 0.63 -1.06 - - - - -1.19 -0.96 1.5 2.58 -1.01 - 2.85 -1.33 0.84 -1.04 -1.55 1.17
1.15 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 3.96
- - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - - 2.94 - - - - 2.84
- - - - - - 2.78 - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - 3.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
-4.24 -4.8 - -4.98 -3.05 -5.03 -3.69 -5.05 - -4.98 -4.93 - - 2.66 0.96 0.11 -2.77 -1.08 0.01 1.3 -1.7 -1.5 -1.47 1.23 1.48 2.58
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - 3.72 - - 2.3 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.11 - - 3.8 - - - 2.96
- - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.97 3.08
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.24 1.41 0.58 1.25 -0.3 - 0.54 - - -1.01 0.48 - -0.46 0.03 1.22 -0.51 - 0.86 1.2 - -0.07 2.22
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - - - - - - - 4.21
- - - - - - - - - - - - - - - 3.64 - - - - - 3.76 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - 3.66 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.19 - 1.97 - - 4.13
- - - - - 1.77 2.07 - - - - - - - 3.37 - - - - - 3.01 - - - - -
- - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - -
-0.08 -0.0 -0.2 -0.28 0.38 0.53 -0.54 -0.29 -0.64 -0.76 0.22 -0.24 -0.83 -1.13 -0.03 0.56 0.2 -0.09 0.73 0.37 -2.68 -0.83 0.49 -0.34 0.84 0.71
0.43 - - 0.37 - 2.7 - - 1.38 0.18 - 0.41 0.19 - - - - -0.25 - - -0.69 2.29 - - -0.32 1.79
-0.0 2.21 0.72 -1.2 -1.09 -1.03 0.31 -1.26 - -0.38 - -1.19 - - -1.53 - - 0.01 - - 1.32 2.24 - - 1.85 1.19
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
0.46 0.69 - -1.99 - - -1.62 -1.85 - - - - - 1.53 - 1.4 0.72 - -0.09 - 1.55 3.07 - -1.17 -1.74 0.96
1.2 - - - - - - - - - - - - - - - 2.03 0.52 - - 0.12 0.81 0.4 - 2.4 3.13
- - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - 4.02 - - - - - -
0.8 - - - - - - - 2.09 - - - - - - - - 0.35 - - 1.43 2.34 - 1.7 - 2.95
-1.81 -3.36 - 1.03 -1.75 - -2.74 -1.73 -0.06 0.67 0.02 0.61 -0.92 -1.44 - - - -1.37 - -1.73 -1.8 1.75 2.57 0.99 1.98 -0.64
-0.02 1.86 - - - 0.3 0.49 - - - 0.25 - 0.18 - - - 0.49 - 0.28 0.2 - 1.36 - - 0.94 3.03
- - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - -
0.39 1.16 - 0.33 - 0.16 - 0.28 - - - - - 0.99 - - 0.23 2.32 0.18 0.17 2.92 -0.14 - - - -
- - 0.96 - - - -0.35 - - -0.47 - - - - - - -0.39 2.35 - - 1.9 - - - - 3.69
1.41 - 1.34 - - - 0.55 - 0.47 0.26 0.35 0.44 0.74 -0.24 - - - - - - - 0.09 -0.03 - 0.99 2.92
- - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - -
- - - - - - - 1.91 - - 1.71 - - - - - - 0.95 - 2.61 3.03 1.45 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.83 - - - - - - 1.8 - - - - - - 1.73 1.8 1.55 - 3.21 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - 1.92 -0.16 -0.41 - 0.34 - - - - - - - - 1.35 - 1.14 - - - 3.8 - - -0.79 -
- - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97
- - - - - - - - - - -0.04 - - - - - 0.2 1.45 - - 1.14 4.09 0.92 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.52 4.53 - - - -
- - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18
- - 1.12 0.08 -1.3 -0.99 -0.99 - - -1.05 -0.01 - -0.6 1.52 0.33 0.96 1.22 - - -1.38 0.35 2.31 -1.38 - 1.94 -
- - - - - 3.22 - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - 2.81
- - - - - - 2.56 - - - - 2.47 - - - - - 1.77 - - - 1.96 - - - 2.86
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
-0.35 - -1.63 0.04 -0.66 - -0.38 -0.16 0.68 -1.68 -0.66 -1.54 -0.23 0.91 1.2 0.05 - 1.1 0.79 -0.85 1.2 -0.88 0.44 - 0.56 1.34
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.81 0.18 0.4 0.02 1.41 1.75 -1.39 -1.71 - - 0.95 -1.51 -0.43 -2.19 - -1.71 - -2.19 0.66 -1.68 -1.56 -1.85 -0.04 1.81 0.76 0.7
1.62 - 2.15 - - - - 1.81 - - - - - 1.34 - - - - - - 0.94 - - - 1.31 3.01
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - -1.06 -0.27 -1.58 -1.38 - -1.26 -1.24 1.44 -0.34 - - 1.89 0.1 1.39 0.68 -0.88 -1.64 -0.49 0.05 1.35 - 0.32 0.4 1.53
- -2.77 0.91 1.15 -3.12 -2.77 -2.81 0.47 -1.01 1.7 - -0.33 2.37 - - -0.68 0.02 -2.18 -1.02 -3.39 -3.46 - - -0.83 - 2.84
3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - 4.35
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
1.54 1.54 1.63 - 1.11 - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - 3.15 0.74 - - 0.9
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
-3.03 0.5 -3.02 -0.15 -1.14 -2.06 0.68 -0.39 1.55 0.07 0.55 -2.93 -0.18 -1.29 -3.11 -2.0 -0.31 2.04 0.73 -0.95 1.97 -1.04 - - -0.08 -0.51
- - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - 2.58 - - - - 3.06
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - 4.21 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- 1.24 - - - 1.0 - 2.0 - -0.13 - - - - - 0.92 -0.04 - -0.37 - 0.55 2.5 - - 1.63 1.52
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- -0.02 -0.6 -0.52 1.46 - 1.81 0.52 0.52 - -0.59 - - - - 1.36 1.84 0.41 - 0.64 - - -0.26 - 0.77 1.21
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
-0.68 - - - - - - -0.64 0.38 - - 0.44 - - - - - -1.26 - - - 3.17 1.28 - 2.85 1.62
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - - 2.37 4.07
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.51 - - 2.09 4.0
- - - - - - - - - - - - - - 3.36 - - - - - 3.01 - - - - 2.94
- - - - 1.99 - - - - 3.3 - - - 1.21 - - - - - - 1.36 - - - - 2.88
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.