Heatmap: Cluster_326 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.2 0.25 0.15 0.07 0.16 0.58 0.65 0.36 0.33 0.31 0.45 0.2 0.39 0.23 0.42 0.03 0.06 0.12 0.9 1.0
0.48 0.42 0.48 0.63 0.59 0.75 1.0 0.65 0.61 0.65 0.56 0.6 0.86 0.77 0.61 0.3 0.56 0.45 0.83 0.55
0.36 1.0 0.37 0.26 0.46 0.28 0.26 0.27 0.22 0.21 0.27 0.18 0.22 0.21 0.27 0.17 0.17 0.62 0.92 0.74
0.23 0.32 0.43 0.35 0.51 0.6 1.0 0.41 0.3 0.34 0.32 0.34 0.32 0.31 0.3 0.22 0.33 0.5 0.77 0.56
1.0 0.79 0.81 0.65 0.72 0.82 0.72 0.51 0.2 0.28 0.63 0.28 0.32 0.29 0.58 0.38 0.42 0.6 0.97 0.94
0.21 0.2 0.09 0.1 0.26 0.89 1.0 0.38 0.22 0.27 0.27 0.26 0.16 0.14 0.3 0.17 0.29 0.44 0.53 0.91
0.35 0.26 0.36 0.16 0.37 0.49 0.2 0.6 0.3 0.3 0.29 0.9 0.14 0.11 0.3 0.08 0.26 1.0 0.24 1.0
0.12 0.17 0.16 0.01 0.15 0.05 0.07 0.12 0.06 0.06 0.05 0.24 0.02 0.02 0.05 0.12 0.06 0.22 0.33 1.0
0.32 0.52 0.25 0.36 0.56 0.76 1.0 0.39 0.23 0.18 0.24 0.17 0.35 0.25 0.33 0.14 0.11 0.81 0.97 0.32
0.23 0.14 0.23 0.14 0.16 0.92 0.63 0.29 0.13 0.17 0.3 0.1 0.13 0.12 0.34 0.12 0.18 0.51 0.56 1.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.22 1.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.22 1.0
1.0 0.93 0.8 0.6 0.58 0.38 0.53 0.28 0.19 0.19 0.25 0.19 0.17 0.13 0.21 0.16 0.17 0.38 0.5 0.56
0.08 0.04 0.07 0.05 0.04 0.15 0.65 0.13 0.04 0.04 0.06 0.05 0.02 0.02 0.04 0.04 0.07 0.04 0.01 1.0
0.07 0.59 0.16 0.13 0.15 0.43 0.01 0.14 0.05 0.04 0.02 0.08 0.08 0.07 0.02 0.05 0.07 0.51 0.5 1.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.09 0.02 0.08 0.07 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.24 0.16 0.67
0.3 0.24 0.12 0.32 0.36 1.0 0.75 0.68 0.37 0.36 0.37 0.35 0.56 0.56 0.34 0.48 0.45 0.62 0.37 0.94
0.21 0.14 0.28 0.31 0.27 0.22 1.0 0.29 0.22 0.19 0.45 0.2 0.39 0.35 0.37 0.22 0.29 0.2 0.26 0.21
0.51 0.43 0.47 0.1 0.66 0.34 1.0 0.33 0.34 0.31 0.44 0.2 0.41 0.4 0.6 0.37 0.17 0.63 0.25 0.58
0.23 0.5 0.29 0.22 0.34 0.4 0.71 0.42 0.14 0.15 0.31 0.41 0.66 0.49 0.36 0.07 0.17 0.42 1.0 0.38
0.29 0.3 0.24 0.21 0.45 0.47 1.0 0.46 0.22 0.23 0.32 0.56 0.76 0.61 0.38 0.1 0.24 0.52 0.71 0.62
0.32 0.37 0.26 0.23 0.48 0.92 1.0 0.44 0.37 0.43 0.72 0.38 0.47 0.4 0.79 0.22 0.28 0.36 0.82 0.56
0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.16 1.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.14 0.07 0.18
0.99 1.0 0.67 0.7 0.8 0.46 0.4 0.44 0.36 0.36 0.47 0.25 0.13 0.14 0.37 0.44 0.47 0.49 0.76 0.73
0.13 0.2 0.18 0.1 0.13 0.2 0.02 0.34 0.26 0.28 0.49 0.37 0.13 0.1 0.51 0.12 0.12 0.29 0.34 1.0
0.2 0.31 0.2 0.18 0.29 0.76 1.0 0.3 0.14 0.15 0.31 0.17 0.12 0.1 0.34 0.12 0.12 0.27 0.6 0.32
0.31 1.0 0.61 0.6 0.59 0.62 0.74 0.34 0.17 0.14 0.2 0.19 0.14 0.14 0.18 0.12 0.15 0.48 0.58 0.28
0.25 0.41 0.24 0.23 0.26 0.47 1.0 0.28 0.19 0.16 0.3 0.17 0.27 0.19 0.34 0.21 0.13 0.28 0.44 0.21
0.32 0.56 0.35 0.41 0.74 0.71 0.3 0.69 0.57 0.44 0.7 0.68 0.44 0.34 0.62 0.34 0.46 0.78 1.0 0.9
0.68 0.51 0.48 0.64 0.72 0.48 0.41 0.51 0.31 0.3 0.57 0.42 0.23 0.21 0.46 0.61 0.72 0.6 0.99 1.0
0.38 0.25 0.24 0.31 0.45 1.0 0.54 0.48 0.35 0.4 0.62 0.38 0.53 0.43 0.69 0.38 0.56 0.56 0.61 0.77
0.01 0.0 0.02 0.02 0.04 0.16 0.16 0.17 0.09 0.06 0.2 0.04 0.18 0.12 0.04 0.07 0.01 0.07 0.09 1.0
0.26 0.03 0.09 0.04 0.11 0.48 0.18 0.18 0.18 0.26 0.15 0.21 0.13 0.1 0.11 0.08 0.06 0.39 0.11 1.0
0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.83 1.0 0.1 0.02 0.02 0.35 0.07 0.06 0.03 0.14 0.45 0.0 0.0 0.01 0.0
0.31 0.25 0.2 0.24 0.45 0.62 0.68 0.44 0.29 0.3 0.51 0.32 0.48 0.36 0.5 0.24 0.29 0.57 1.0 0.15
0.76 0.84 0.6 0.42 0.57 0.92 0.74 0.53 0.37 0.38 0.41 0.34 0.54 0.41 0.41 0.26 0.25 0.59 0.83 1.0
0.28 0.12 0.21 0.19 0.26 0.34 0.22 0.3 0.24 0.24 0.63 0.2 0.14 0.11 0.68 0.14 0.23 0.33 0.58 1.0
0.25 0.64 0.19 0.2 0.54 0.65 0.41 0.45 0.34 0.31 0.51 0.32 0.34 0.31 0.58 0.37 0.27 0.39 1.0 0.61
0.59 0.53 0.57 0.54 0.77 1.0 0.51 0.7 0.45 0.45 0.42 0.68 0.72 0.71 0.46 0.4 0.6 0.72 0.55 0.68
0.31 0.39 0.26 0.38 0.61 1.0 0.79 0.51 0.27 0.3 0.61 0.21 0.41 0.3 0.67 0.3 0.36 0.46 0.9 0.48
0.78 0.65 0.52 0.77 0.81 0.64 1.0 0.6 0.42 0.43 0.63 0.33 0.42 0.4 0.64 0.48 0.28 0.68 0.98 0.43
0.66 0.57 0.29 0.23 0.84 0.61 1.0 0.55 0.61 0.62 0.48 0.36 0.49 0.47 0.73 0.62 0.37 0.71 0.28 0.89
0.47 0.71 0.45 0.55 0.56 0.9 0.82 0.66 0.53 0.52 0.73 0.52 0.79 0.78 0.75 0.57 0.57 0.55 1.0 0.64
0.06 0.22 0.06 0.03 0.05 0.26 0.13 0.13 0.03 0.03 0.03 0.11 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.07 0.41 1.0
0.31 0.79 0.28 0.31 0.55 0.52 0.83 0.55 0.51 0.47 0.52 0.55 0.46 0.46 0.52 0.4 0.39 0.9 1.0 0.53
0.28 0.38 0.36 0.38 0.6 0.67 0.95 0.49 0.47 0.47 0.6 0.35 0.36 0.29 0.61 0.29 0.41 0.5 1.0 0.51
1.0 0.89 0.76 0.71 0.63 0.56 0.59 0.5 0.37 0.32 0.43 0.29 0.42 0.47 0.37 0.41 0.26 0.47 0.57 0.39
1.0 0.77 0.45 0.44 0.57 0.6 0.35 0.31 0.22 0.21 0.29 0.2 0.1 0.1 0.31 0.22 0.2 0.39 0.69 0.59
0.95 0.62 0.67 0.59 0.76 0.49 0.83 0.53 0.3 0.29 0.4 0.26 0.45 0.36 0.47 0.28 0.28 0.57 1.0 0.5
0.41 0.19 0.18 0.28 0.39 1.0 0.34 0.28 0.13 0.17 0.29 0.19 0.24 0.21 0.3 0.1 0.15 0.17 0.39 0.31
0.38 0.48 0.26 0.27 0.53 0.74 0.62 0.5 0.36 0.35 0.54 0.35 0.36 0.24 0.58 0.29 0.27 0.62 1.0 0.33
0.41 0.5 0.37 0.29 0.59 0.85 1.0 0.46 0.39 0.33 0.43 0.43 0.14 0.14 0.38 0.71 0.59 0.42 0.61 0.97
0.94 0.75 1.0 0.85 0.57 0.7 0.2 0.4 0.16 0.15 0.26 0.17 0.19 0.16 0.29 0.22 0.23 0.38 0.44 0.54
1.0 0.34 0.55 0.63 0.4 0.55 0.13 0.28 0.07 0.08 0.12 0.07 0.17 0.12 0.16 0.07 0.05 0.31 0.22 0.33
0.14 0.1 0.11 0.14 0.19 0.42 0.43 0.25 0.15 0.13 0.5 0.22 0.09 0.08 0.48 0.28 0.25 0.25 0.53 1.0
0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.83 1.0 0.1 0.02 0.02 0.35 0.07 0.06 0.03 0.14 0.45 0.0 0.0 0.01 0.0
0.21 0.15 0.12 0.11 0.22 0.06 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.4 0.37 0.46
0.08 0.29 0.15 0.01 0.05 0.0 1.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.06 0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.19 0.07
0.03 0.02 0.04 0.01 0.02 0.12 0.75 0.13 0.06 0.08 0.95 0.36 0.13 0.09 0.62 0.12 0.32 0.08 0.16 1.0
0.28 0.21 0.15 0.15 0.2 0.18 0.07 0.16 0.19 0.22 0.48 0.15 0.17 0.19 0.53 0.14 0.1 0.48 0.38 1.0
0.32 0.34 0.18 0.28 0.24 0.19 0.06 0.16 0.14 0.16 0.2 0.14 0.21 0.14 0.39 0.11 0.07 0.49 0.76 1.0
0.58 0.42 0.49 0.53 0.48 0.75 0.26 0.4 0.41 0.33 0.62 0.29 0.39 0.47 0.69 0.24 0.26 0.6 0.81 1.0
0.93 0.32 0.44 0.83 0.72 1.0 0.47 0.51 0.32 0.28 0.39 0.26 0.72 0.64 0.43 0.25 0.25 0.51 0.44 0.73
0.1 0.09 0.06 0.13 0.19 1.0 0.54 0.22 0.12 0.12 0.2 0.12 0.19 0.2 0.23 0.09 0.1 0.15 0.21 0.07
0.14 0.21 0.17 0.07 0.21 0.54 0.11 0.1 0.1 0.08 0.07 0.06 0.06 0.07 0.06 0.04 0.05 0.39 0.42 1.0
0.24 0.3 0.24 0.23 0.26 0.4 0.25 0.25 0.32 0.26 0.51 0.19 0.17 0.14 0.57 0.2 0.19 0.31 0.47 1.0
0.52 0.52 0.27 0.21 0.29 0.25 1.0 0.32 0.22 0.17 0.24 0.24 0.22 0.12 0.22 0.05 0.05 0.52 0.71 0.38
0.49 0.31 0.22 0.44 0.29 0.85 0.81 0.8 0.46 0.46 0.65 0.29 0.61 0.39 0.55 0.11 0.17 0.73 0.27 1.0
0.26 0.48 0.46 0.39 0.69 0.68 1.0 0.62 0.43 0.47 0.57 0.64 0.53 0.58 0.59 0.43 0.86 0.85 0.7 0.97
0.57 0.72 0.78 0.74 0.56 0.57 0.54 0.48 0.37 0.39 0.41 0.43 0.45 0.42 0.43 0.4 0.48 0.53 1.0 0.61
0.05 0.02 0.03 0.02 0.02 0.29 0.55 0.2 0.25 0.25 0.5 0.09 0.21 0.15 0.44 0.02 0.05 0.06 0.46 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)