Heatmap: Cluster_260 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00429	0.63	0.83	0.83	0.45	0.71	0.73	1.0	0.53	0.41	0.41	0.44	0.46	0.4	0.38	0.46	0.47	0.61	0.7	0.71	0.74
Gb_02076	0.9	0.46	0.85	1.0	0.91	0.97	0.6	0.74	0.48	0.4	0.47	0.62	0.73	0.61	0.49	0.63	0.66	0.7	0.53	0.45
Gb_02163	0.61	0.58	1.0	0.33	0.54	0.18	0.18	0.33	0.38	0.3	0.25	0.16	0.37	0.33	0.23	0.48	0.38	0.49	0.23	0.37
Gb_02798	0.61	0.96	0.83	0.0	0.68	1.0	0.32	0.19	0.27	0.45	0.1	0.16	0.04	0.03	0.18	0.3	0.06	0.27	0.0	0.12
Gb_04426	0.47	1.0	0.99	0.05	0.5	0.71	0.22	0.25	0.17	0.18	0.1	0.17	0.17	0.21	0.1	0.17	0.2	0.61	0.01	0.32
Gb_05074	0.82	0.71	1.0	0.98	0.74	0.8	0.33	0.63	0.37	0.34	0.51	0.37	0.33	0.31	0.38	0.38	0.48	0.66	0.91	0.41
Gb_05075	0.51	0.78	1.0	0.41	0.57	0.49	0.24	0.38	0.21	0.2	0.35	0.27	0.14	0.17	0.3	0.25	0.36	0.47	0.58	0.35
Gb_05624	0.42	1.0	0.71	0.49	0.41	0.17	0.53	0.31	0.28	0.27	0.41	0.17	0.43	0.4	0.43	0.32	0.24	0.38	0.27	0.25
Gb_06931	0.5	0.95	1.0	0.45	0.55	0.67	0.35	0.34	0.2	0.23	0.13	0.29	0.22	0.21	0.14	0.3	0.41	0.62	0.53	0.36
Gb_06933	0.77	0.51	0.73	0.59	0.77	1.0	0.39	0.4	0.31	0.31	0.19	0.36	0.3	0.34	0.22	0.38	0.47	0.85	0.38	0.5
Gb_07137	0.97	0.78	0.96	0.77	1.0	0.72	0.38	0.53	0.34	0.36	0.45	0.32	0.4	0.34	0.45	0.31	0.38	0.56	0.6	0.23
Gb_07204	0.85	0.39	1.0	0.42	0.72	0.67	0.21	0.46	0.27	0.31	0.34	0.71	0.34	0.3	0.27	0.36	0.68	0.86	0.56	0.42
Gb_07588	0.9	1.0	0.95	0.75	0.75	0.72	0.84	0.46	0.32	0.26	0.2	0.33	0.33	0.28	0.23	0.42	0.43	0.84	0.88	0.54
Gb_09556	0.9	0.76	1.0	0.42	0.6	0.89	0.31	0.23	0.2	0.2	0.1	0.16	0.09	0.1	0.1	0.26	0.21	0.79	0.39	0.43
Gb_10116	0.87	1.0	0.97	0.38	0.84	0.9	0.27	0.46	0.18	0.19	0.19	0.27	0.13	0.13	0.22	0.1	0.26	0.99	0.59	0.6
Gb_11393	0.75	0.4	0.63	0.84	0.76	1.0	0.64	0.64	0.2	0.23	0.33	0.48	0.78	0.8	0.33	0.2	0.38	0.83	0.39	0.68
Gb_11631	1.0	0.89	0.78	0.57	0.72	0.58	0.47	0.49	0.26	0.27	0.23	0.28	0.17	0.16	0.28	0.25	0.32	0.52	0.77	0.36
Gb_13012	0.56	0.58	1.0	0.33	0.89	0.8	0.2	0.47	0.25	0.25	0.32	0.45	0.39	0.34	0.34	0.42	0.54	0.85	0.29	0.49
Gb_13330	0.24	0.66	1.0	0.3	0.16	0.07	0.12	0.11	0.12	0.12	0.07	0.15	0.04	0.04	0.07	0.17	0.14	0.1	0.21	0.07
Gb_13646	0.26	0.34	0.3	0.35	0.48	1.0	0.83	0.3	0.21	0.22	0.17	0.3	0.33	0.5	0.25	0.25	0.5	0.57	0.55	0.45
Gb_14251	0.73	0.6	0.64	0.45	0.92	0.57	0.3	0.42	0.41	0.51	0.29	0.36	0.1	0.09	0.25	0.38	0.5	1.0	0.31	0.76
Gb_16338	0.35	0.64	1.0	0.19	0.37	0.4	0.29	0.32	0.31	0.33	0.44	0.47	0.2	0.19	0.33	0.47	0.39	0.37	0.24	0.28
Gb_17111	0.32	0.59	1.0	0.27	0.3	0.28	0.15	0.22	0.14	0.14	0.19	0.3	0.07	0.07	0.18	0.32	0.45	0.27	0.22	0.21
Gb_17187	0.24	0.53	0.35	0.37	0.4	0.87	1.0	0.38	0.24	0.29	0.4	0.34	0.2	0.2	0.42	0.23	0.38	0.57	0.64	0.87
Gb_18079	0.75	0.51	1.0	0.41	0.65	0.32	0.92	0.52	0.4	0.36	0.45	0.32	0.56	0.46	0.52	0.35	0.35	0.82	0.32	0.68
Gb_18203	0.5	0.55	1.0	0.05	0.58	0.32	0.24	0.4	0.27	0.25	0.16	0.18	0.2	0.23	0.19	0.2	0.41	0.88	0.22	0.46
Gb_18349	0.82	0.89	1.0	0.76	0.74	0.33	0.33	0.35	0.29	0.3	0.33	0.28	0.25	0.17	0.27	0.28	0.28	0.71	0.71	0.41
Gb_19606	0.72	0.34	0.61	0.36	0.75	0.51	0.57	0.5	0.24	0.24	0.39	0.36	0.45	0.41	0.38	0.46	0.38	1.0	0.45	0.58
Gb_20359	0.59	1.0	0.93	0.61	0.5	0.56	0.35	0.33	0.29	0.29	0.25	0.32	0.26	0.25	0.25	0.23	0.27	0.4	0.54	0.36
Gb_20378	0.65	0.76	1.0	0.39	0.34	0.3	0.3	0.45	0.15	0.2	0.8	0.26	0.13	0.3	0.7	0.43	0.24	0.29	0.85	0.55
Gb_21916	0.75	0.56	1.0	0.61	0.54	0.82	0.79	0.4	0.32	0.3	0.29	0.35	0.36	0.31	0.3	0.32	0.51	0.48	0.47	0.49
Gb_22869	0.35	0.64	1.0	0.11	0.42	0.44	0.15	0.25	0.15	0.17	0.17	0.19	0.2	0.16	0.17	0.19	0.29	0.45	0.07	0.23
Gb_24635	0.28	0.39	0.43	0.12	0.34	0.55	0.38	0.38	0.36	0.34	0.84	0.28	0.14	0.14	0.55	0.61	0.76	0.3	1.0	0.36
Gb_25559	0.5	0.83	1.0	0.68	0.42	0.18	0.15	0.24	0.27	0.22	0.19	0.19	0.04	0.04	0.17	0.4	0.31	0.4	0.28	0.15
Gb_25586	1.0	0.81	0.76	0.6	0.75	0.64	0.71	0.61	0.43	0.43	0.6	0.46	0.41	0.34	0.55	0.39	0.51	0.83	0.78	0.52
Gb_25689	0.45	0.47	1.0	0.73	0.25	0.25	0.2	0.3	0.13	0.13	0.22	0.29	0.13	0.14	0.16	0.18	0.32	0.31	0.27	0.21
Gb_26418	0.65	0.77	1.0	0.67	0.63	0.81	0.32	0.46	0.22	0.24	0.37	0.43	0.46	0.44	0.4	0.26	0.33	0.66	0.27	0.52
Gb_27084	0.3	0.48	0.3	0.34	0.21	1.0	0.27	0.27	0.14	0.18	0.14	0.16	0.07	0.01	0.24	0.19	0.27	0.64	0.67	0.3
Gb_27259	1.0	0.59	0.68	0.54	0.68	0.46	0.53	0.4	0.35	0.36	0.57	0.39	0.48	0.35	0.45	0.28	0.23	0.68	0.27	0.42
Gb_27386	0.88	0.43	0.68	0.66	0.73	1.0	0.36	0.54	0.42	0.4	0.3	0.74	0.43	0.34	0.26	0.25	0.52	0.71	0.76	0.49
Gb_27478	0.65	0.97	1.0	0.4	0.86	0.63	0.3	0.41	0.37	0.38	0.24	0.26	0.2	0.23	0.33	0.4	0.38	0.86	0.43	0.3
Gb_27960	0.84	1.0	0.92	0.58	0.91	0.99	0.67	0.5	0.4	0.34	0.36	0.53	0.3	0.27	0.38	0.58	0.51	0.85	0.79	0.74
Gb_28571	1.0	0.37	0.75	0.0	0.58	0.66	0.43	0.25	0.08	0.16	0.24	0.24	0.15	0.04	0.13	0.27	0.24	0.62	0.0	0.22
Gb_29279	0.76	0.78	0.84	1.0	0.62	0.33	0.3	0.34	0.29	0.23	0.26	0.25	0.22	0.2	0.21	0.2	0.14	0.57	0.27	0.28
Gb_29533	0.31	0.46	0.48	0.19	0.37	0.65	0.87	0.43	0.56	0.48	0.48	0.45	0.23	0.16	0.35	0.14	0.2	0.4	1.0	0.43
Gb_29780	0.93	0.84	0.88	0.53	0.73	1.0	0.27	0.43	0.36	0.27	0.26	0.38	0.36	0.37	0.31	0.31	0.27	0.67	0.69	0.48
Gb_30877	0.11	0.25	0.28	0.18	0.27	0.73	0.57	0.32	0.16	0.14	0.26	0.21	0.05	0.02	0.15	0.16	0.33	0.21	1.0	0.34
Gb_31027	0.49	1.0	0.83	0.02	0.37	0.19	0.56	0.18	0.12	0.12	0.14	0.13	0.2	0.16	0.22	0.2	0.13	0.42	0.0	0.23
Gb_32344	0.99	0.46	0.87	0.33	1.0	0.56	0.22	0.55	0.33	0.29	0.54	0.33	0.41	0.55	0.4	0.39	0.55	0.86	0.35	0.62
Gb_35056	1.0	0.42	0.82	0.86	0.7	0.84	0.45	0.64	0.52	0.51	0.55	0.69	0.49	0.44	0.54	0.41	0.63	0.79	0.61	0.64
Gb_35834	1.0	0.13	0.42	0.99	0.65	0.57	0.26	0.27	0.26	0.26	0.35	0.24	0.1	0.05	0.32	0.17	0.24	0.33	0.4	0.57
Gb_35835	0.96	0.62	1.0	0.53	0.61	0.56	0.2	0.32	0.19	0.17	0.3	0.3	0.33	0.4	0.29	0.18	0.25	0.3	0.21	0.57
Gb_36458	0.7	1.0	0.95	0.76	0.85	0.71	0.37	0.53	0.5	0.44	0.49	0.53	0.46	0.44	0.48	0.42	0.33	0.71	0.75	0.47
Gb_37670	0.68	0.79	1.0	0.41	0.57	0.76	0.51	0.44	0.24	0.27	0.28	0.3	0.32	0.29	0.3	0.18	0.3	0.54	0.3	0.39
Gb_37736	0.55	0.88	1.0	0.69	0.56	0.41	0.34	0.37	0.29	0.29	0.44	0.33	0.31	0.27	0.37	0.26	0.33	0.44	0.61	0.46
Gb_37835	0.31	0.61	1.0	0.11	0.3	0.34	0.23	0.23	0.18	0.21	0.19	0.28	0.09	0.09	0.16	0.18	0.3	0.32	0.39	0.24
Gb_38632	0.94	1.0	0.56	0.62	0.62	0.56	0.45	0.39	0.32	0.28	0.29	0.25	0.19	0.15	0.23	0.3	0.23	0.54	0.75	0.51
Gb_38803	1.0	0.61	0.49	0.35	0.85	0.53	0.52	0.53	0.32	0.29	0.64	0.59	0.59	0.38	0.55	0.27	0.25	0.71	0.41	0.69
Gb_38908	0.49	0.62	0.75	0.47	1.0	0.45	0.17	0.3	0.25	0.27	0.27	0.22	0.09	0.09	0.3	0.28	0.29	0.51	0.33	0.41
Gb_39967	0.38	0.72	1.0	0.31	0.29	0.35	0.13	0.25	0.19	0.19	0.18	0.2	0.15	0.13	0.14	0.24	0.31	0.32	0.17	0.25
Gb_40735	0.83	0.57	0.76	0.57	0.67	1.0	0.29	0.31	0.19	0.19	0.19	0.24	0.26	0.3	0.2	0.23	0.25	0.48	0.67	0.31
Gb_40847	0.63	1.0	0.93	0.3	0.5	0.25	0.45	0.37	0.35	0.28	0.31	0.29	0.44	0.37	0.38	0.19	0.22	0.47	0.34	0.23
Gb_40989	1.0	0.88	0.86	0.56	0.86	0.63	0.28	0.23	0.15	0.15	0.1	0.15	0.01	0.01	0.07	0.4	0.23	0.45	0.57	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)