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Heatmap: Cluster_334 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.34 0.09 -0.27 -0.32 0.12 -0.75 -0.59 0.44 -0.26 -0.41 0.31 -0.3 0.88 0.6 0.2 -1.04 -1.05 -0.11 0.44 0.5
-1.87 -2.59 -1.79 -1.15 -0.39 -0.38 -4.26 0.76 -0.19 0.23 0.63 -0.09 1.31 0.79 0.39 -1.51 -0.66 0.93 -0.46 0.9
-4.35 -3.98 -4.19 -3.56 -2.24 -2.44 -2.58 0.87 1.61 1.33 0.61 1.23 -0.24 0.13 -0.08 -0.14 1.11 -0.57 -6.29 0.35
-0.12 0.86 0.17 -0.07 -0.28 -0.82 0.47 -0.0 -0.15 -0.08 0.46 -1.16 -0.25 -0.8 0.71 -0.75 -1.55 -1.22 1.19 0.05
-3.49 - - -0.54 -1.71 -0.3 - 0.8 1.49 1.59 -3.59 0.19 -3.16 -1.08 -1.48 1.52 2.1 0.12 -5.81 -3.14
-0.13 0.05 -0.76 -0.0 0.66 0.22 0.09 0.16 -0.22 -0.18 0.18 -0.34 -0.26 -0.38 0.11 -0.23 -0.68 0.5 -0.04 0.4
0.72 0.55 0.17 0.44 0.44 0.31 -0.06 0.11 -0.63 -0.52 0.06 -0.65 -0.9 -1.38 -0.03 -1.3 -0.75 0.19 0.55 0.31
0.12 -0.46 -0.39 0.35 -0.09 -0.21 -0.32 0.13 -0.26 -0.36 0.61 -0.68 0.03 -0.21 0.58 -0.43 -0.7 0.14 0.71 0.28
-0.09 0.03 -0.59 0.08 0.2 0.1 -0.17 0.17 -0.31 -0.49 0.26 -0.58 -0.17 -0.58 0.24 -0.36 -0.52 0.22 0.88 0.58
0.02 0.24 -0.11 0.55 0.45 -0.05 -0.96 0.16 -0.27 -0.42 0.19 -0.41 -0.05 -0.34 0.29 -0.75 -0.66 0.21 0.72 -0.06
- - - - - - -8.54 0.94 0.44 0.18 0.56 1.16 1.6 1.75 -0.1 -3.49 2.02 -7.01 -7.43 -1.34
-1.18 -0.98 -1.81 -1.31 -0.95 -4.27 -0.34 -0.31 0.55 0.64 1.07 -0.98 0.09 -0.34 1.25 0.58 0.08 -1.27 1.36 -0.3
-0.51 -0.77 -0.47 -0.02 0.04 0.15 -1.09 0.25 -0.21 -0.26 0.3 -0.31 0.2 0.16 0.34 -0.14 0.33 0.31 0.6 0.03
-0.22 -0.58 -0.5 -0.26 0.09 0.52 -0.56 0.28 -0.12 -0.05 0.33 -0.04 0.18 -0.06 0.22 -0.19 0.09 -0.43 0.34 0.29
-3.01 -4.01 -2.74 -2.85 -2.2 -1.95 -6.19 0.81 0.29 0.49 0.35 0.78 1.3 1.12 0.49 -0.82 0.26 -0.82 1.23 -0.1
0.35 0.67 0.33 0.09 -0.22 -0.14 0.9 0.33 -0.25 -0.06 -1.07 -1.61 0.24 -0.71 -1.09 -0.1 0.08 -0.67 0.61 -0.12
-2.24 1.6 -2.16 -0.09 0.44 -0.27 -3.0 0.19 0.32 0.11 -0.52 1.24 0.29 0.84 -0.43 0.04 0.03 -1.58 -1.03 -3.07
-0.35 0.17 -0.94 0.33 0.17 -0.1 0.12 0.12 -0.16 -0.34 0.24 -0.47 -1.57 -1.64 0.3 0.03 -0.27 0.3 1.19 0.3
-0.59 -0.27 -0.42 -0.81 -0.6 -1.1 0.21 0.2 -0.21 -0.32 0.12 -0.17 0.59 0.5 0.26 -1.26 -0.94 -0.51 0.7 1.45
-2.86 -4.83 -2.71 -2.39 -2.51 -1.39 -4.65 0.8 0.38 0.88 0.32 1.21 1.63 1.73 0.18 -0.62 0.13 -1.07 -3.04 -0.82
-1.19 -0.1 - 0.44 -0.22 -0.06 1.75 0.35 0.06 - 0.3 -2.24 -0.99 -0.71 0.58 1.02 -1.15 -0.31 0.4 0.17
0.31 -0.15 0.06 -0.15 -0.44 -0.06 -0.13 0.17 -0.32 -0.27 0.36 -1.16 -0.33 -0.8 0.64 -0.99 -0.83 0.25 1.08 0.62
-7.41 -6.5 - - -5.56 -3.38 -8.94 1.27 0.33 0.79 0.65 0.15 0.93 0.85 0.69 -1.33 0.78 -1.58 1.84 -1.21
-1.76 -5.58 -6.2 0.58 1.1 -2.68 -9.55 0.08 0.8 0.64 -0.46 1.13 0.11 -0.06 -0.4 0.73 1.34 0.11 -2.73 -1.42
0.24 0.12 -0.32 -0.36 0.04 0.11 -0.84 0.12 -0.27 -0.27 0.4 -0.42 -0.07 -0.31 0.4 -0.27 -0.62 -0.05 0.74 0.56
-3.42 -4.48 -3.01 -0.91 -0.61 -2.39 -1.15 0.73 1.15 1.48 0.73 0.33 1.35 1.51 1.08 -2.9 -0.81 -4.21 -6.28 -4.41
-0.68 0.5 -0.66 -0.83 -0.09 0.19 -0.43 0.52 -0.42 -0.23 0.2 -0.12 0.97 0.43 0.3 -1.44 -1.73 -0.16 0.61 0.29
-5.47 -5.29 -6.38 0.85 0.14 -0.88 -5.81 -0.06 1.06 1.21 -1.52 0.26 -1.24 -0.49 -1.44 1.68 1.76 -1.56 -3.87 0.11
-0.54 -0.27 -0.94 -0.31 -0.91 -1.22 0.01 0.77 -0.29 -0.04 1.28 0.22 1.14 0.52 1.1 -1.54 -1.34 -2.71 -1.95 0.23
-3.0 -2.58 -2.38 -1.17 -0.89 1.43 -2.85 0.41 -1.32 -1.32 0.52 -0.16 0.85 0.46 0.27 -0.7 0.34 -0.28 1.85 -0.9
0.18 0.26 0.29 -0.58 0.16 0.28 -0.22 0.21 -0.11 -0.45 0.17 -0.45 0.12 0.08 0.2 -0.38 -0.42 -0.3 0.67 -0.53
-3.2 -4.9 -3.59 -4.59 -1.34 0.02 -2.9 1.0 -0.14 0.16 0.26 0.59 0.45 0.15 0.11 -0.08 0.88 0.73 -0.14 1.36
-3.17 -9.07 -5.87 -1.43 -1.5 -2.88 - 1.09 -0.06 -0.28 0.34 0.55 1.14 0.75 0.22 -0.57 1.43 -0.35 1.26 -0.38
- - - - - 0.41 3.03 -2.06 0.63 2.2 0.11 - - - - - - 1.17 -0.35 -
-0.17 -0.6 -0.83 -0.15 0.07 -0.16 -0.55 0.45 -0.64 -0.53 -0.0 0.13 0.42 0.33 0.02 -1.23 -0.58 0.2 1.02 0.74
-0.95 0.11 -0.33 1.07 1.34 -1.46 0.89 -0.18 -0.97 -1.05 -0.15 -1.08 0.45 0.31 0.28 -3.62 -1.91 -0.83 -0.96 1.18
-0.19 0.54 -0.48 -0.8 0.35 0.35 -0.67 0.13 -0.32 -0.68 0.44 -0.43 0.14 -0.15 0.47 -0.56 -0.89 -0.52 0.63 0.81
-0.62 -0.77 -0.89 -0.51 -0.08 -0.05 -0.87 0.36 -0.02 0.03 0.57 0.29 -0.83 -1.3 0.19 -0.63 -0.2 -0.15 0.33 1.71
0.38 -0.0 -0.5 -0.05 0.17 -0.53 0.48 0.12 -0.06 -0.01 0.13 -0.9 0.64 0.15 0.28 -0.68 -1.52 -0.14 0.89 -0.89
0.36 0.01 0.02 0.31 0.21 -0.4 -0.09 0.1 -0.17 -0.34 0.31 -0.67 0.04 -0.07 0.35 -0.25 -0.38 0.13 0.31 -0.36
0.35 1.13 -0.06 -0.41 0.37 -0.99 -0.51 0.29 -0.34 0.03 -0.52 0.19 -0.73 -0.98 -0.66 -0.53 0.27 -1.25 1.08 0.35
-0.73 -1.01 -1.08 -0.62 -0.46 -0.13 -0.62 0.09 0.16 0.17 -0.12 -0.1 -0.3 -0.87 0.9 -1.33 -1.78 0.26 2.04 0.16
0.32 0.78 -0.46 -0.27 0.43 -0.0 -0.01 -0.04 -0.36 -0.6 0.1 -0.86 0.11 -0.32 -0.08 -0.3 -1.29 0.3 0.74 0.22
-0.36 -0.58 -0.24 0.51 -0.14 -0.58 -0.82 0.17 -0.59 -0.55 0.35 -0.62 0.2 -0.05 0.28 0.58 0.67 -0.08 0.5 -0.03
-0.04 0.99 0.17 0.26 0.46 -1.01 -0.08 0.07 -0.64 -0.46 -0.29 -0.56 0.22 -0.22 -0.38 -1.98 -1.04 0.38 0.72 0.61
-1.66 -1.54 -2.32 -1.09 -0.47 0.32 -2.15 0.66 0.15 0.21 0.75 -0.18 1.0 0.86 0.86 -0.1 0.06 -0.56 -1.27 0.46
-0.06 -0.24 -0.53 -0.24 0.59 0.42 -0.77 0.11 -0.39 -0.48 0.67 -0.88 -0.45 -0.96 0.74 -0.24 -0.17 0.19 0.31 0.57
0.44 0.44 -0.1 0.01 -0.15 -1.16 0.48 0.04 -0.0 -0.14 0.64 -0.92 0.12 -0.26 0.81 -0.62 -1.22 -1.0 0.34 0.07
0.01 -0.37 -0.83 -0.12 0.41 0.64 0.09 0.21 -0.63 -0.46 0.13 -0.37 -0.28 -0.73 0.21 -1.01 -0.42 0.2 0.71 0.82
-0.19 -0.83 -0.71 -0.57 0.29 -0.3 -2.34 0.51 -0.15 -0.16 0.78 0.28 0.52 0.04 0.72 -0.53 -0.35 -0.51 0.43 0.34
0.83 0.25 0.01 0.56 0.37 0.22 0.11 -0.16 -0.48 -0.52 0.44 -1.0 -0.41 -0.45 0.29 -0.7 -1.09 -0.06 0.02 0.12
0.14 -0.03 -0.29 -0.13 -0.05 -0.0 0.6 -0.12 0.04 0.12 0.32 -0.79 0.01 -0.11 0.4 -0.11 -0.9 -0.38 -0.29 0.64
0.73 0.77 0.14 -0.21 0.22 -1.78 0.16 -0.07 0.05 0.11 0.39 -0.39 -0.03 -0.73 0.28 -1.43 -1.95 -0.23 0.64 0.16
- - - -5.96 -6.51 - - 1.4 0.81 0.86 -0.16 -1.71 0.64 0.22 0.53 -0.11 2.77 -4.25 -0.95 -3.43
0.31 -0.07 -0.26 0.02 0.35 0.77 -0.38 0.08 -0.23 -0.23 0.26 -0.52 -0.12 -0.5 0.24 -0.42 -0.3 -0.04 0.32 -0.07
-0.54 0.02 -1.63 -1.17 -0.71 0.4 -0.9 0.15 -0.1 0.19 0.4 -0.61 0.62 0.18 0.51 -0.86 -0.36 -0.18 0.28 1.26
-2.02 -1.25 -2.0 -3.45 -2.67 -3.99 0.45 -0.18 0.24 -0.65 1.01 -0.61 0.42 0.56 0.27 -0.15 -0.17 0.31 1.57 1.01
-0.11 -0.04 -0.36 -0.31 0.38 0.45 -0.41 -0.02 -0.21 -0.33 0.3 -0.74 0.05 -0.01 0.49 0.01 -0.04 0.07 -0.0 0.23
0.21 -2.93 -1.09 -1.59 0.22 -2.41 0.65 -0.2 -0.23 0.01 1.42 0.09 -0.23 -0.38 1.29 -4.39 -1.95 0.03 0.29 0.91
0.02 -1.84 -0.31 -1.49 0.01 -2.49 1.12 0.19 -0.23 0.08 0.67 -0.36 0.31 -0.15 0.89 -2.96 -1.76 -0.22 0.93 0.65
-6.66 - - -3.95 -3.98 0.28 - 0.68 0.99 0.46 -1.82 -1.21 1.75 0.12 0.15 -1.95 -3.24 -2.48 -0.16 2.57
-1.85 -1.09 -1.82 -0.51 -0.05 -0.47 -0.84 0.53 0.11 0.17 0.14 0.09 0.48 0.57 0.03 0.19 0.59 0.43 0.16 0.27
- - - - -4.63 0.49 - 1.4 0.39 0.28 -1.39 0.71 1.17 1.21 -1.26 -0.3 1.77 0.97 -2.32 -
-0.34 0.43 -0.48 -0.05 0.43 -0.63 0.18 0.46 -0.16 0.05 -0.08 -0.46 0.34 -0.21 0.1 -1.75 -1.25 0.54 0.7 0.11
-0.82 -0.61 -1.09 -0.51 -0.07 0.56 0.05 0.2 -0.6 -0.64 0.19 -0.33 0.43 0.28 0.24 -0.66 -0.73 0.26 0.7 0.97
0.14 -0.49 0.23 -0.27 -0.63 -1.04 -0.62 0.42 -0.63 -0.61 0.9 -0.51 0.07 -0.42 0.95 -1.57 -1.2 -0.2 1.14 0.68
-6.66 -4.38 -8.59 -1.33 -0.29 -0.17 -5.89 0.59 0.09 0.43 0.74 1.2 0.92 0.78 0.79 -1.23 -0.36 0.24 0.48 -0.27
-6.47 -3.82 -7.7 -0.93 -0.27 0.05 -6.7 0.46 0.35 0.61 0.43 0.98 0.61 0.63 0.37 -1.07 -0.2 0.6 0.95 -0.19
0.68 -0.17 0.25 0.57 -0.02 1.28 0.22 0.13 -0.87 -1.07 -0.02 -0.98 -0.84 -1.15 0.09 -1.07 -1.38 0.03 0.19 0.62
-0.07 -1.01 -0.58 0.15 -0.09 0.39 -0.38 0.25 -0.31 -0.26 1.06 -0.63 -0.27 -0.88 1.16 -0.54 -0.41 -0.73 0.48 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.