Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.07 0.28 1.68 0.01 0.32 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 29.41 0.08 27.18
0.07 0.0 0.05 1.59 8.73 15.32 20.44 10.59 4.6 4.78 9.24 7.75 2.72 4.14 10.7 2.23 5.0 27.72 14.25 27.5
0.34 0.15 0.93 0.15 0.44 2.83 0.26 9.29 6.19 5.46 4.77 8.19 6.56 5.28 3.58 7.88 18.38 3.06 11.21 45.99
0.0 0.0 0.0 2.21 0.0 0.0 0.0 0.66 0.06 0.0 0.0 0.0 0.33 0.76 0.69 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.35 0.15 0.23 3.0 0.31 0.31 0.16 0.26 0.08 0.08 0.27 0.06 0.15 0.11 0.36 0.0 0.0 0.79 0.0 1.64
0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.35 0.91 0.87 0.2 0.02 0.31 0.15 0.1 0.08 0.07 0.07 0.02 0.05
0.11 0.16 0.0 0.33 0.07 0.06 0.01 0.11 0.18 0.07 0.13 0.05 0.06 0.03 0.07 0.03 0.03 0.2 0.2 0.02
0.02 0.0 0.0 0.03 0.18 0.12 0.0 0.14 0.06 0.08 0.06 0.09 0.03 0.1 0.08 0.15 0.17 2.73 1.28 1.83
0.13 0.17 0.4 0.0 0.09 0.16 3.35 0.17 0.02 0.01 0.06 0.05 0.17 0.19 0.04 0.0 0.0 0.01 0.05 2.7
0.0 0.0 0.03 0.0 0.18 0.18 0.14 0.15 0.25 0.63 0.14 0.0 0.01 0.0 0.39 0.19 0.03 0.2 30.85 0.59
0.8 0.21 0.03 0.17 0.1 0.82 0.0 0.46 0.63 0.6 1.33 0.41 0.22 0.28 1.25 0.22 0.41 2.23 1.7 25.15
0.13 0.02 0.01 0.02 0.15 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.04 0.02 0.25 0.16 0.02 0.01 0.22
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.12 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.02 0.24 0.16 0.06 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.24 1.06 0.63
169.66 138.75 221.92 249.1 393.21 493.78 454.88 271.21 150.13 203.47 202.47 354.83 148.19 163.6 227.97 95.32 178.56 560.46 654.23 459.69
0.04 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.03 0.22 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.92 0.06 0.84 3.54 4.35 6.81 2.16 1.41 1.14 8.13 0.12 0.91 0.47 0.24 9.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.41 0.06 0.81 2.14 2.86 7.32 1.44 0.93 0.94 8.42 0.0 0.4 0.53 0.37 5.47
0.33 0.0 0.0 0.53 0.0 0.41 0.38 0.3 0.29 0.33 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.36 0.04 0.69 3.22 1.49
2.43 2.2 1.61 3.43 5.43 7.37 1.26 3.74 2.38 2.8 5.17 3.48 2.45 3.53 4.67 4.89 3.4 6.05 3.91 16.96
1.71 3.17 1.82 2.91 4.6 5.87 0.94 2.39 1.31 1.86 3.36 3.19 0.89 0.88 4.0 2.52 2.12 3.9 5.61 8.78
2.87 4.06 1.98 3.68 5.92 8.27 1.42 3.53 2.65 3.0 5.06 3.96 3.01 2.46 4.14 6.17 4.43 5.72 7.16 14.35
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
1.0 0.82 1.0 0.38 0.81 0.17 0.55 0.25 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.38 1.43 1.14
0.29 0.0 0.33 0.63 0.23 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.45 0.22
0.0 0.0 0.0 0.62 0.06 0.18 0.04 0.39 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.36 0.0 0.0 0.77 0.0 0.47
3.3 0.27 0.0 8.1 2.99 2.06 0.13 3.2 1.13 1.31 0.69 1.22 0.83 0.8 1.13 3.43 3.45 12.76 16.23 7.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07
0.22 0.13 0.07 0.99 3.82 5.6 0.05 13.14 15.82 19.81 9.51 18.47 10.6 13.64 8.53 7.95 11.69 13.61 20.99 38.97
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.23 0.01 0.48 0.57 0.4 0.43 0.04 0.47 0.5 1.59 0.38 0.06 0.32 0.02 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.16 0.1 0.0 0.03 0.04 0.46 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.3 0.85 0.84 0.0 0.55 0.26 0.14 1.46 1.7 1.75 1.03 0.17 1.72 1.0 1.02 1.16 0.11 3.25 0.69 2.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.56 0.56 0.34 0.18 0.48 0.31 0.49 0.41 0.0 0.0 0.51 4.75 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.68 0.53 0.56 0.28 0.74 0.56 0.85 0.32 0.02 0.19 0.26 4.08 1.61
5.1 2.52 1.29 2.83 6.53 3.9 6.62 4.2 3.89 3.75 2.27 6.52 1.23 2.47 2.21 3.29 2.3 8.86 3.46 19.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.28 0.33 1.54 0.36 1.71 1.22 1.36 0.36 0.21 0.0 1.44 0.06
0.07 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.09 0.03 0.66 0.09 0.01 0.0 0.33 0.0 0.0 0.25 0.01 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 3.78 0.08 30.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.05 0.0 0.0 0.02 0.12 1.49 0.0 1.67 2.26 2.0 6.27 0.6 0.89 0.76 9.3 0.94 0.69 0.31 5.29 11.15
21.15 18.33 17.95 14.18 41.14 16.74 200.16 28.24 18.21 23.54 39.88 69.67 15.95 18.88 43.68 9.68 25.47 32.8 89.31 74.25
0.02 0.0 0.14 0.15 0.26 0.0 0.08 0.08 0.07 0.12 0.0 0.03 0.09 0.06 0.07 0.13 0.0 0.95 3.51 2.74
0.96 0.17 0.24 0.32 0.34 2.28 0.17 1.17 0.65 0.82 0.64 2.06 1.49 1.85 0.21 0.24 0.26 4.25 0.17 5.2
0.3 0.45 0.13 0.15 0.08 0.08 0.1 0.04 0.01 0.02 0.15 0.02 0.06 0.06 0.15 0.08 0.09 0.03 0.19 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.38 0.0 1.41 1.0 0.72 1.18 1.78 2.89 2.67 1.29 0.45 0.5 2.06 3.17 1.96
0.09 0.0 0.0 1.94 4.91 5.31 0.06 6.95 3.88 3.05 2.23 7.47 5.51 4.75 3.94 2.33 6.26 17.14 6.59 22.62
0.01 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06
9.48 7.05 2.32 22.05 52.52 90.7 1.07 56.29 47.31 40.81 31.11 73.74 44.11 96.61 41.39 101.36 72.94 89.24 94.49 133.07
0.09 0.16 0.05 0.08 0.18 0.63 8.33 0.98 0.2 0.11 0.09 0.21 0.74 0.82 0.3 10.23 2.66 18.44 5.77 21.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 8.27
0.0 0.0 0.0 0.02 1.31 2.45 0.02 0.19 0.06 0.1 0.05 0.06 0.03 0.27 0.14 0.11 0.06 4.68 0.51 47.44
0.11 0.0 0.0 1.54 0.25 0.51 0.27 0.11 0.07 0.13 0.43 0.06 0.0 0.08 0.0 0.0 0.24 0.0 3.21 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.22 1.17 0.09 3.1 0.35 0.15 0.08 0.13 0.21 0.02 0.02 0.0 0.0 0.97 0.14 0.18 0.12 0.0 0.0 0.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)