Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
- - - 2.21 - - 1.28 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - 2.88 - 1.58 - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.74 -6.59 -6.4 - - -4.77 -5.24 - - - - - -2.39 -5.32 - - - -6.24 -4.67 - - - 2.6 - 0.28 - - 5.29 - -0.19 -8.39 - - -9.15 - - - -10.28 - - -5.39 - - - - - -
AT1G28460 (AGL59)
- - - - - - -0.13 1.29 - - - - - - - - - - - -1.89 - - - 2.82 - -0.18 - - 5.0 - 0.72 - -0.6 - - - - -4.01 -2.56 - - - - - 0.92 - - -
- -4.7 -5.83 -5.64 -4.46 -4.02 -4.17 - -7.0 -4.93 -5.07 -1.77 -6.33 -3.89 - - - - -7.22 -4.91 -2.56 - -3.44 4.52 -5.0 2.36 - -4.19 4.14 -6.82 -0.28 -3.83 -6.72 -5.21 -4.45 -3.63 -4.73 -5.94 -7.72 - - -5.64 - - -6.55 - - -
AT1G34170 (ARF13)
-0.33 -3.53 - - - - - - - - -1.31 - - - - - - -1.73 - -4.78 - - - 3.31 - 1.98 - - 5.0 - - - - - -4.25 - -1.16 - - - - - - - - - - -
AT1G36000 (LBD5)
-1.1 -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.01 - - - 4.24 - 2.45 - - 4.02 - 1.4 - - 1.27 - - - - -1.3 - - - - - - - - -
- 1.09 - - - - - - - - - - - 0.79 - - - - - -5.91 -3.79 - - 4.48 - 2.05 - - 3.06 - 3.21 -5.43 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -6.46 -2.69 -2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - 0.64 - - 5.24 - -1.76 - - - - - - -10.4 - - - - - - - - - -
AT1G60987 (SCRL5)
0.49 0.59 -2.41 - - - - - - - -2.31 - -2.06 0.27 - -3.45 - - - -1.94 -2.57 - - 4.04 - 1.72 - - 4.33 - 1.45 - - - -4.78 - - -3.8 -5.04 - - - - - - - - -
AT1G66145 (CLE18)
- - - - - - - - - - - - 0.62 0.0 - - - - - - - - - 1.17 - -0.57 - - 5.32 - - - - - - - 1.3 -2.19 - - - - - - - - - -
AT1G67775 (CLE8)
- -2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.73 - - - 3.59 - 1.36 - - 5.02 - -1.02 -6.29 - -3.51 -7.44 -4.65 - -7.44 - - - - - - - - - -
- -1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.73 - 3.33 - - 0.15 - 3.14 - - - - - 0.24 - - - - - - - - - - -
-2.15 -1.9 - - -0.2 0.12 - - - -1.24 0.83 - -0.3 -1.35 - - - - - -2.64 - - 0.38 4.77 - 3.03 - - -1.02 - 1.15 - - -1.37 -0.59 - - -4.07 -3.38 - - - 0.46 - - - - -
- -6.94 - -6.81 -6.82 - - - - - -6.88 -8.3 - -6.12 -6.83 -8.82 -7.1 -7.22 - -7.65 -6.08 -6.57 -5.51 2.62 - 0.73 -8.03 -5.46 5.32 -9.65 -3.76 -7.61 -9.12 -9.66 -9.51 -6.89 - -7.22 -9.8 -6.12 - -5.9 -5.02 -5.64 - - -7.85 -6.69
-3.26 0.25 -6.13 -6.92 -7.1 - -6.91 - - - - -8.23 -6.78 -2.32 - -7.02 - - -6.36 -1.67 -4.24 -5.18 -7.03 3.47 - 1.46 -7.13 - 4.81 - 2.05 -6.58 - - -9.53 -5.01 -7.18 -10.34 -10.76 - - - - - - - - -
- 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.82 - 1.3 - - 3.41 - 1.57 - -0.02 - -0.56 - - 0.03 - - - - - - - - - -
- -1.03 - - - - - - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - -0.42 - - - - 5.32 - -0.16 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.52 3.1 - - - -3.76 - - - -7.29 -4.99 - - 1.5 -2.63 - - - -7.31 0.15 -3.64 - - 3.56 -4.48 1.56 - - 2.86 - 3.52 -7.71 - -4.95 -4.57 -5.71 - - - - - - - - - - - -
AT2G22121 (LCR35)
-4.32 -4.21 - -3.14 - - -3.14 - - - - - -1.93 - - - - - - - -3.36 - - 3.5 - 1.44 - - 4.97 - -1.66 - - -4.21 - - - -7.01 - - - 0.35 - - -2.15 - - -
- -7.83 - - - - - - - - -4.4 - - -2.53 - - - - - -6.37 -5.44 - - 3.67 - 1.02 - - 5.01 - -0.45 - -7.71 -4.79 - -3.71 - -7.21 - - - - - - - - - -
-1.49 2.06 -4.33 - - -3.05 -4.19 -2.73 -2.63 -2.72 - - -1.81 0.58 -0.89 -2.37 -2.82 -3.16 -1.39 -0.72 -4.41 -1.95 -2.66 3.54 -2.65 0.94 0.28 -1.17 3.62 -2.48 2.63 -1.48 -1.85 -1.17 -3.58 -0.96 -2.01 -2.12 -0.67 -2.21 -1.27 -1.29 -2.62 -2.03 -1.87 - -6.23 -4.33
- -3.6 - - -4.38 - - - - - - - - -3.49 - -2.93 -3.11 - -4.69 -3.96 -4.27 - - 4.19 - 2.02 - - 4.52 -5.66 -1.89 0.19 -3.88 -0.88 -5.65 - - -3.89 -7.22 - - - - - - - - -
-6.1 -2.07 - -2.22 - - - - - - - -5.68 - -0.3 - - - - - -0.57 - - - 3.78 - 1.4 - - 4.53 - 2.38 - - -4.44 - - - - - - - -0.19 -1.1 - - - - -
- - - 3.63 1.49 - 2.0 - - - - - - - - - - - 0.02 - - - - 3.94 - 3.35 - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.57 - - - - 1.79 - 1.57 - - - - -0.78 - - 0.86 - - -1.76 - - - 3.01 - 1.19 - - 4.71 - - - 0.33 - -1.76 - - -3.24 - - - - - - - - - -
-3.72 -2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.32 - - - 4.28 - 2.56 - 1.13 4.06 - -0.67 - - - - 1.43 - - - - - - - - - - - -
-1.16 -1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.52 - - - 2.29 - 0.4 - -0.25 5.14 - -0.8 -1.2 - -2.13 - - 0.61 -3.13 -1.47 - - - - 0.31 - - - -1.46
- - -1.8 - - - - - - - - - - -1.28 - - - - -1.36 - - - -0.34 1.52 - -0.24 - - 5.15 - 2.79 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.84 - - - - - - - -2.74 0.25 -0.7 - - - - - - - - - - - 3.86 - 1.54 - - 4.76 - 0.35 - - -2.33 - - - - - - - - - - - - - -
AT3G57270 (BG1)
2.02 0.71 -2.24 0.14 -1.82 -5.63 -0.22 -4.76 - -4.72 - -5.87 -2.95 -0.7 - -5.26 - - - -0.35 - -3.61 -3.18 2.99 -5.66 0.75 - - 4.61 -4.76 1.5 -7.25 -5.85 -6.12 - -5.24 -3.27 -2.47 -0.45 - - - - - - - - -
- 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - 5.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.98 -7.68 -7.39 - - - - - - - - - -4.84 - - - - -10.1 -7.51 -5.66 - -7.5 2.49 - 0.23 - - 5.34 - -1.53 -7.23 - - -10.3 -7.48 - - - - - -6.48 - - - - - -
- 0.06 - - - - - - - - - - - -1.64 -3.52 - - - - -2.9 - - - 2.74 - 0.13 - - 5.12 - 1.87 -3.68 - -7.35 - -5.58 - - - - - - - - - - - -
AT4G15735 (SCRL10)
- -3.89 -4.35 -4.03 -2.49 -3.07 -2.83 -5.25 -3.23 -7.9 -4.97 - -6.33 -0.9 - - - - -5.65 -6.09 -4.56 - -5.59 3.78 -5.99 1.42 - - 4.71 - 1.94 -6.51 - - -9.21 -5.62 - -10.02 - - - - - - - - - -
- -4.46 - - - - - - - - - - - - - - -2.59 - -3.28 -4.83 -2.64 - - 5.11 - 2.67 - - 2.31 - 0.57 - - - - - - -6.04 - - - - - - -2.43 - - -
AT4G19905 (LCR38)
- -1.0 - - - - - - - - -3.74 - - 0.92 - - - - - -4.08 -2.64 - -4.47 4.47 -4.72 2.24 - - 3.23 - 3.18 -6.45 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.31 2.57 -2.27 -0.25 -1.7 -1.31 0.16 -3.93 -1.42 -6.07 -5.01 -2.06 2.68 -2.09 -1.33 -6.74 - -6.04 -6.5 1.14 -3.96 - - 3.08 - 0.8 - -4.61 2.93 - 2.62 -5.3 -5.41 - -8.7 -4.13 - -7.41 -7.73 - - - - - - - - -
- -0.61 - - - - - - - - - - - 1.61 - - - - - -1.73 - - - 4.15 - 1.07 - - 3.85 - 3.26 -2.13 - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G29273 (LCR23)
- - - - - - - - - - - - - -2.77 - - - - - - - - - 3.63 - 1.59 - - 4.91 - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G29280 (LCR22)
-3.82 -3.98 - -1.99 - - - - - - - - - -1.22 - - - - - -5.24 - - - 4.39 - 2.63 - - 4.05 - 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G29283 (LCR21)
- -4.29 - -1.67 - - - - - - -1.81 - - 0.67 - - - - - -4.8 - - -1.69 4.6 - 2.63 - - 3.42 - 2.09 -3.76 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.4 0.99 -3.59 -2.08 -3.58 - -3.26 - - - - -5.17 - -1.86 - - - - -4.1 -2.06 -4.47 - - 3.61 -2.94 1.16 - - 4.39 -2.89 1.75 - - - -1.97 -2.53 - -5.82 - - - - - -3.44 - - - -
- -7.5 -4.4 - - - - -5.05 - -5.46 -3.93 2.29 -1.61 - - - - - -4.5 -8.28 -3.36 - - 2.76 -5.77 0.03 - - 5.1 - -2.92 -4.93 -5.77 -6.5 -2.18 - - -5.99 - - - - - - - - - -
-5.09 -0.31 - -4.88 - -6.35 -4.78 -5.41 -5.16 -4.48 - - -1.54 0.75 - - - - -8.68 -3.05 - - - 2.88 - 0.31 - - 4.92 -6.62 2.56 - - -5.54 -4.47 -4.86 - -9.77 -9.51 - - - - - - - - -
- -3.27 -3.49 - -2.71 - - -4.39 -1.61 -5.37 -1.04 -0.63 -5.7 0.04 -2.78 -2.39 -5.05 -5.17 -0.43 -3.06 -5.21 -2.25 -1.09 3.79 -5.11 1.9 - -3.73 4.25 -4.31 0.9 -4.86 -3.64 -4.77 1.4 -0.76 -2.87 -1.72 -5.15 - - - - -2.18 -2.17 - - -3.33
AT5G06500 (AGL96)
- -2.4 - -1.18 -0.33 0.46 -1.87 - - -4.39 - - - -4.22 - - - - - -5.44 - - - 3.25 - 1.58 - - 4.79 - -4.2 -3.75 -3.7 - - - -0.48 -3.45 - - - - - 0.73 - - - 0.96
- -4.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.55 - - 5.02 - 2.95 - - 2.68 - 0.19 - - - - - -2.59 - - - - - - - - - - -
AT5G35900 (LBD35)
-4.3 -2.45 0.69 - - - - - - - - - -1.08 -2.17 - - - - -0.65 - - - - 2.72 -1.49 0.95 - - 4.99 - 0.97 - -2.05 - 0.37 -1.22 - -5.64 -1.82 - - - - - - - - -
AT5G39260 (EXP21)
-3.24 -1.27 -4.34 -4.35 -2.53 -2.87 -4.66 -3.37 - -3.05 - -4.44 -3.53 -0.41 -3.06 -3.35 -2.77 -3.31 -3.35 -1.84 -2.63 -4.19 -3.23 4.27 -3.45 2.06 -1.41 -2.14 4.09 -4.5 0.34 -4.28 -3.78 -3.16 -3.1 -3.54 -1.94 -2.27 -1.3 - - -2.91 -2.93 -6.04 -5.04 -0.59 - -4.47
- -5.27 - -1.21 - -4.58 - -4.45 - - -4.77 - - - - - - - - -7.13 -2.97 - - 4.0 -4.61 1.58 - - 4.8 - -1.47 -6.2 - - - - - -5.95 -7.03 - - - - - - - - -
- 0.16 - -2.63 - - - -1.14 - -1.72 -3.17 -1.62 -2.45 -3.47 -1.53 - - - - -3.83 -2.73 - -2.53 1.42 - -0.18 - - 5.34 - -2.93 - - -3.26 -4.22 - - -4.34 -6.22 - - - - - - - - -
-2.39 -1.03 -2.18 -2.47 -6.02 -3.84 -3.59 0.54 -1.66 -4.69 -2.17 -5.16 -3.84 -0.28 0.37 - - -6.88 -0.08 -3.83 -3.63 - -6.44 4.2 -5.67 2.14 -4.7 -6.3 3.57 -7.83 1.78 0.35 -2.29 0.47 -9.27 -5.41 -5.59 -6.42 -2.09 - - -3.83 -5.34 - -6.32 - - -
-2.02 1.53 -8.12 -4.33 -8.11 -7.81 - -5.48 -6.69 -9.23 -6.11 -8.2 - -0.6 0.68 -5.7 -6.26 -5.45 0.29 -0.1 -2.2 -7.6 -4.44 3.48 -4.57 1.42 -2.52 - 2.25 -4.61 2.26 3.27 -0.19 2.25 -6.48 -4.32 -3.96 -7.78 -0.29 - - -3.65 -5.98 - -3.56 - - -
AT5G47075 (LCR20)
- 0.0 - - - - - - - - - - - 0.85 - - - - - -1.29 - - - 1.63 - -0.94 - - 5.21 - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.05 0.59 -4.99 -3.47 - - - - - - - -2.0 -3.04 -1.67 -2.13 - - - -3.8 -0.53 - - - 0.86 - -1.5 - -5.67 5.29 - 1.14 -7.79 - - -8.42 - - -5.7 -9.09 - - - - - - - - -
-2.08 -2.29 1.2 2.06 1.76 -0.19 2.27 2.65 -0.7 0.46 -2.03 -2.95 -2.18 -0.44 -2.92 -1.53 - - 1.71 -4.32 -3.12 - - 1.73 - 0.7 -2.12 -0.88 3.5 - 0.43 -4.35 - - - - - -5.63 -6.09 - - - - - - - - -
- 1.52 - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - -4.37 -1.76 - - - 2.82 - 0.71 - -2.64 4.74 - 2.99 -4.75 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.07 0.38 -1.27 -2.86 -1.9 -5.12 -3.54 - -6.07 -8.16 -3.34 -8.67 - -0.09 -4.84 -6.44 - -9.18 -6.51 -1.21 -5.28 -7.67 -6.72 3.43 -6.75 1.25 - -2.36 4.67 -7.9 2.05 -6.03 -8.82 -4.65 -7.67 -6.13 -8.61 -8.66 -8.54 - -8.3 - - - -7.64 - - -8.26
- -0.71 - - - - - - - - - - - -2.51 - - - - -3.14 -4.61 - - -2.39 0.47 - -1.0 - - 5.41 - 1.27 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.81 - 1.74 - -1.62 5.21 - -1.34 - - - - - - -6.16 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.23 - -1.02 - - - -2.97 0.55 - - - -3.07 - - - - 2.92 -1.78 2.09 - - 4.34 - - - - - - - - 2.0 - - - - - - - - - -
- -3.93 -1.82 -0.31 - - -0.3 - - - -1.39 -1.96 - -2.8 - - - - - - -1.47 - - 3.87 - 0.65 - - 4.57 - 2.06 - - - - - - - - - - -0.34 - - - - - -
- 0.41 -4.31 -4.58 - -6.0 - -5.15 -3.44 -5.65 -2.77 -9.32 -2.92 -1.68 - - - - -7.24 -5.35 -4.74 - - 4.43 - 2.03 - - 4.11 -5.14 1.48 -8.04 - - - -5.6 - - - - - - - - - - - -
- -5.55 -3.59 - -2.86 - -3.36 - - - - - - -0.33 - - - - -4.17 -6.88 - - - 2.82 - 0.68 - -2.28 5.11 - 1.8 - - -5.64 - - - - - - - - - - - - - -
- -1.85 - -2.01 - - - - - - - - - 0.59 - - - - - -4.07 - - - 2.02 - -0.8 - - 5.15 - 2.5 - - - - - -3.21 - - - - - - - - - - -
-2.26 -0.0 - - - - - - - - -6.91 - -7.04 -1.41 -1.81 -4.13 - - - -1.52 -4.28 -4.51 -2.08 3.74 - 1.55 - -2.9 4.65 -7.09 1.59 -3.24 -4.2 -3.54 -3.32 -4.02 -6.51 -2.66 -4.62 - - -2.17 -4.69 - -5.25 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.