Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00114	1.0	0.78	0.87	0.7	0.77	0.51	0.44	0.56	0.6	0.55	0.58	0.42	0.36	0.3	0.53	0.53	0.55	0.86	0.63	0.5
Gb_00761	0.2	0.16	0.15	0.25	0.39	0.15	0.03	0.32	0.45	0.42	0.19	0.16	0.15	0.21	0.22	0.45	0.31	1.0	0.47	0.09
Gb_01230	0.82	0.36	0.62	0.86	0.67	0.72	0.45	0.46	0.38	0.39	0.84	0.34	0.31	0.36	0.8	0.73	0.74	1.0	0.8	0.62
Gb_01601	0.67	0.41	0.38	0.86	0.5	0.18	0.17	0.32	0.12	0.15	0.0	0.13	0.05	0.05	0.0	0.62	0.97	1.0	0.12	0.04
Gb_01717	1.0	0.36	0.71	0.68	0.65	0.12	0.35	0.23	0.3	0.23	0.21	0.17	0.02	0.02	0.2	0.65	0.45	0.56	0.41	0.28
Gb_01987	0.91	0.58	0.77	1.0	0.83	0.47	0.23	0.68	0.58	0.39	0.76	0.47	0.22	0.26	0.73	0.77	0.96	0.7	0.83	0.48
Gb_03416	0.83	0.28	0.43	0.74	0.87	0.7	0.35	0.64	0.77	0.65	0.93	0.54	0.68	0.63	1.0	0.73	0.81	0.77	0.28	0.39
Gb_03590	0.89	0.48	0.61	0.91	0.87	0.39	0.09	0.58	0.52	0.45	0.62	0.4	0.34	0.33	0.66	0.92	0.72	1.0	0.41	0.31
Gb_03966	0.86	0.7	0.6	1.0	0.74	0.47	0.04	0.38	0.38	0.38	0.34	0.2	0.39	0.25	0.42	0.46	0.3	0.73	0.12	0.07
Gb_04089	0.91	0.84	0.9	1.0	0.63	0.3	0.19	0.58	0.78	0.67	0.91	0.62	0.11	0.15	0.89	0.96	0.83	0.85	0.52	0.28
Gb_04092	0.66	0.74	1.0	0.67	0.63	0.35	0.19	0.42	0.81	0.68	0.51	0.46	0.02	0.05	0.57	0.77	0.77	0.94	0.63	0.16
Gb_04641	0.95	0.48	0.56	1.0	0.7	0.38	0.2	0.41	0.34	0.3	0.42	0.31	0.22	0.24	0.44	0.64	0.5	0.96	0.47	0.33
Gb_05522	0.87	1.0	0.6	0.62	0.29	0.03	0.08	0.11	0.05	0.06	0.12	0.25	0.04	0.04	0.1	0.47	0.25	0.13	0.08	0.11
Gb_05526	1.0	0.26	0.55	0.96	0.67	0.19	0.14	0.48	0.44	0.43	0.76	0.31	0.08	0.11	0.71	0.7	0.63	0.57	0.3	0.24
Gb_05886	0.15	0.51	0.43	0.14	1.0	0.1	0.0	0.34	0.55	0.71	0.2	0.25	0.23	0.19	0.17	0.24	0.35	0.91	0.08	0.63
Gb_06120	0.98	0.91	0.87	1.0	0.84	0.39	0.15	0.37	0.31	0.27	0.46	0.24	0.08	0.11	0.52	0.67	0.55	0.79	0.36	0.12
Gb_06367	0.69	0.7	0.5	0.63	0.47	0.03	0.1	0.26	0.36	0.33	0.33	0.41	0.12	0.13	0.24	1.0	0.6	0.62	0.1	0.35
Gb_06402	0.97	0.47	0.6	0.86	0.92	0.61	0.3	0.62	0.65	0.59	1.0	0.37	0.36	0.38	0.87	0.99	0.53	0.85	0.47	0.81
Gb_07708	0.43	1.0	0.35	0.37	0.85	0.36	0.13	0.51	0.61	0.66	0.69	0.51	0.39	0.4	0.73	0.97	0.55	0.85	0.97	0.14
Gb_08742	0.96	0.36	0.66	1.0	0.73	0.85	0.15	0.53	0.24	0.2	0.25	0.32	0.25	0.31	0.22	0.38	0.53	0.61	0.17	0.17
Gb_08952	1.0	0.39	0.87	0.71	0.74	0.46	0.17	0.47	0.31	0.23	0.31	0.3	0.31	0.27	0.31	0.44	0.47	0.81	0.21	0.3
Gb_09253	0.77	0.36	0.59	1.0	0.58	0.58	0.47	0.44	0.3	0.27	0.32	0.29	0.34	0.34	0.3	0.46	0.5	0.55	0.36	0.37
Gb_10317	0.74	0.29	0.42	1.0	0.5	0.11	0.11	0.18	0.12	0.1	0.12	0.08	0.1	0.08	0.09	0.33	0.24	0.24	0.02	0.28
Gb_10639	0.93	0.57	0.78	1.0	0.51	0.58	0.33	0.16	0.06	0.07	0.09	0.05	0.15	0.2	0.09	0.2	0.21	0.42	0.18	0.12
Gb_10670	0.53	0.7	0.59	0.75	0.91	0.71	0.25	0.68	0.74	0.73	0.82	0.62	0.53	0.43	0.94	0.97	0.68	1.0	0.9	0.34
Gb_10866	0.61	1.0	0.81	0.98	0.68	0.0	0.0	0.22	0.32	0.41	0.0	0.06	0.0	0.01	0.0	0.97	0.52	0.06	0.0	0.02
Gb_10868	0.43	0.53	0.78	0.89	1.0	0.0	0.0	0.27	0.29	0.31	0.0	0.11	0.0	0.01	0.0	0.63	0.81	0.21	0.0	0.1
Gb_12979	0.89	0.69	0.9	1.0	0.72	0.43	0.42	0.44	0.41	0.35	0.46	0.22	0.3	0.3	0.48	0.49	0.41	0.65	0.46	0.26
Gb_13585	0.42	0.28	0.37	0.38	0.36	0.25	0.04	0.25	0.15	0.06	0.05	0.11	0.1	0.14	0.04	1.0	0.44	0.51	0.05	0.02
Gb_13588	0.32	0.48	0.44	0.45	0.35	0.18	0.03	0.22	0.16	0.06	0.07	0.14	0.06	0.09	0.04	1.0	0.48	0.46	0.07	0.02
Gb_14211	1.0	0.43	0.79	0.87	0.78	0.27	0.22	0.39	0.31	0.28	0.46	0.25	0.14	0.18	0.46	0.61	0.55	0.81	0.59	0.3
Gb_14703	0.56	0.67	0.57	1.0	0.89	0.48	0.42	0.58	0.53	0.48	0.74	0.47	0.58	0.57	0.77	0.47	0.38	0.8	0.46	0.47
Gb_15100	0.79	0.35	0.59	1.0	0.67	0.46	0.19	0.27	0.17	0.14	0.22	0.21	0.16	0.18	0.23	0.3	0.32	0.57	0.35	0.32
Gb_16107	0.69	0.49	0.62	0.98	1.0	0.46	0.24	0.71	0.37	0.4	0.59	0.54	0.32	0.28	0.57	0.31	0.45	0.98	0.81	0.57
Gb_16139	0.95	0.41	0.54	0.83	0.88	0.28	0.29	0.63	0.64	0.61	0.77	0.56	0.34	0.37	0.8	0.7	0.71	1.0	0.43	0.29
Gb_16313	0.73	0.44	0.53	0.72	0.44	0.52	0.24	0.53	0.69	0.57	0.96	0.44	0.51	0.52	1.0	0.99	0.76	0.59	0.32	0.29
Gb_17632	0.9	0.45	0.56	0.87	0.78	0.41	0.5	0.47	0.48	0.38	0.53	0.38	0.16	0.19	0.53	1.0	0.68	0.67	0.4	0.37
Gb_18320	0.3	0.06	0.18	0.52	0.15	0.02	0.01	0.16	0.31	0.09	0.03	0.13	0.04	0.1	0.02	1.0	0.66	0.27	0.08	0.05
Gb_18460	0.31	0.27	0.38	0.72	0.68	0.12	0.09	0.34	0.33	0.26	0.41	0.09	0.04	0.09	0.5	1.0	0.5	0.99	0.4	0.2
Gb_18644	0.69	0.6	0.46	0.49	0.5	0.26	0.34	0.35	0.27	0.15	0.22	0.23	0.24	0.28	0.21	1.0	0.52	0.54	0.43	0.11
Gb_18972	0.85	0.64	0.66	0.79	1.0	0.59	0.44	0.59	0.61	0.52	0.75	0.43	0.63	0.57	0.7	0.8	0.57	0.77	0.74	0.72
Gb_20104	0.65	0.52	0.9	1.0	0.57	0.21	0.11	0.33	0.26	0.23	0.45	0.35	0.3	0.27	0.44	0.38	0.44	0.6	0.4	0.32
Gb_21319	0.93	0.45	0.7	1.0	0.68	0.29	0.36	0.55	0.61	0.45	0.5	0.36	0.6	0.6	0.49	0.72	0.63	0.5	0.37	0.42
Gb_21445	0.59	0.37	0.59	0.74	0.49	0.14	0.14	0.38	0.29	0.21	0.23	0.23	0.12	0.18	0.2	1.0	0.81	0.45	0.25	0.14
Gb_21483	0.97	0.55	0.72	1.0	0.8	0.44	0.58	0.57	0.47	0.44	0.84	0.31	0.58	0.56	0.83	0.61	0.35	0.69	0.37	0.5
Gb_21904	0.85	0.66	1.0	0.87	0.65	0.29	0.23	0.44	0.34	0.34	0.7	0.32	0.28	0.29	0.71	0.33	0.33	0.7	0.63	0.48
Gb_22883	0.48	0.08	0.35	0.72	0.46	0.01	0.0	0.13	0.07	0.07	0.01	0.29	0.01	0.02	0.01	1.0	0.33	0.12	0.06	0.12
Gb_23054	0.98	0.68	0.5	1.0	0.64	0.53	0.22	0.46	0.38	0.33	0.35	0.28	0.3	0.32	0.35	0.55	0.27	0.51	0.38	0.22
Gb_24525	1.0	0.39	0.67	0.86	0.73	0.25	0.15	0.48	0.38	0.31	0.46	0.3	0.18	0.2	0.36	0.55	0.36	0.76	0.25	0.33
Gb_24583	0.8	0.6	0.68	1.0	0.54	0.38	0.22	0.32	0.2	0.18	0.31	0.25	0.19	0.24	0.27	0.46	0.38	0.43	0.4	0.2
Gb_24637	0.4	0.42	0.5	0.48	0.29	0.18	0.08	0.26	0.21	0.12	0.2	0.19	0.23	0.28	0.17	1.0	0.64	0.15	0.15	0.07
Gb_24669	0.74	0.71	0.83	0.84	1.0	0.65	0.52	0.6	0.56	0.51	0.92	0.48	0.65	0.55	0.92	0.52	0.59	0.77	0.58	0.6
Gb_24903	0.78	0.72	0.88	0.86	1.0	0.31	0.32	0.48	0.3	0.34	0.47	0.26	0.22	0.21	0.56	0.3	0.44	0.94	0.43	0.7
Gb_25576	0.92	0.42	0.5	0.9	0.98	0.18	0.2	0.52	0.42	0.36	0.51	0.44	0.26	0.25	0.58	0.39	0.51	1.0	0.52	0.66
Gb_27651	0.65	0.51	0.68	1.0	0.87	0.37	0.42	0.52	0.46	0.38	0.5	0.36	0.27	0.26	0.5	0.63	0.49	0.55	0.77	0.23
Gb_27826	0.64	0.18	0.53	1.0	0.34	0.02	0.0	0.11	0.09	0.1	0.03	0.06	0.02	0.04	0.03	0.73	0.4	0.16	0.04	0.04
Gb_30473	1.0	0.47	0.6	0.81	0.84	0.56	0.42	0.48	0.45	0.35	0.44	0.34	0.42	0.42	0.4	0.69	0.65	0.58	0.65	0.37
Gb_30973	0.79	0.32	0.54	1.0	0.54	0.57	0.2	0.46	0.31	0.29	0.3	0.33	0.38	0.34	0.29	0.31	0.42	0.54	0.3	0.3
Gb_31270	1.0	0.73	0.63	0.63	0.51	0.34	0.04	0.47	0.45	0.34	0.68	0.35	0.24	0.25	0.6	0.79	0.65	0.72	0.08	0.01
Gb_31610	1.0	0.5	0.72	0.99	0.86	0.38	0.33	0.54	0.31	0.32	0.76	0.38	0.13	0.12	0.68	0.48	0.46	0.74	0.54	0.47
Gb_31928	0.52	0.93	0.52	0.53	0.19	0.01	0.01	0.27	0.49	0.35	0.3	0.19	0.06	0.07	0.31	1.0	0.53	0.0	0.0	0.03
Gb_32254	1.0	0.91	0.86	0.74	0.53	0.39	0.19	0.53	0.68	0.6	0.89	0.42	0.37	0.32	0.86	0.61	0.54	0.77	0.11	0.04
Gb_34265	0.97	0.42	0.6	1.0	0.7	0.6	0.16	0.55	0.46	0.35	0.44	0.39	0.53	0.52	0.42	0.78	0.58	0.65	0.31	0.26
Gb_34575	0.88	0.25	0.39	0.71	0.84	0.29	0.12	0.51	0.56	0.49	0.7	0.35	0.31	0.37	0.73	1.0	0.62	0.76	0.24	0.34
Gb_34727	1.0	0.26	0.61	0.67	0.38	0.11	0.09	0.31	0.28	0.27	0.37	0.25	0.04	0.04	0.39	0.49	0.46	0.38	0.16	0.08
Gb_34964	0.74	0.65	0.98	0.67	0.62	0.37	0.14	0.58	0.57	0.52	1.0	0.56	0.23	0.18	0.8	0.83	0.82	0.78	0.62	0.42
Gb_35353	1.0	0.6	0.02	0.98	0.61	0.27	0.1	0.22	0.23	0.15	0.16	0.16	0.17	0.21	0.15	0.56	0.36	0.32	0.15	0.37
Gb_35372	0.66	0.62	0.55	0.59	0.79	0.52	0.31	0.6	0.55	0.49	0.52	0.49	0.63	0.5	0.48	0.52	0.51	1.0	0.68	0.48
Gb_35648	0.52	0.09	0.21	0.18	0.48	0.1	0.07	0.27	0.2	0.27	0.33	0.14	0.27	0.23	0.28	0.24	0.21	1.0	0.21	0.18
Gb_35658	0.75	0.31	0.35	0.52	0.51	0.18	0.07	0.37	0.25	0.28	0.65	0.19	0.18	0.12	0.53	0.23	0.23	1.0	0.38	0.16
Gb_35703	0.77	0.38	0.8	1.0	0.47	0.49	0.29	0.26	0.23	0.2	0.21	0.16	0.1	0.12	0.19	0.59	0.42	0.55	0.27	0.21
Gb_36595	0.79	0.56	0.75	0.9	0.78	0.68	0.33	0.54	0.39	0.32	0.46	0.43	0.36	0.44	0.45	1.0	0.72	1.0	0.64	0.58
Gb_36624	0.65	0.52	0.7	1.0	0.63	0.28	0.48	0.44	0.36	0.3	0.53	0.38	0.4	0.3	0.49	0.5	0.3	0.52	0.46	0.45
Gb_37231	0.51	0.51	0.5	0.6	0.82	0.3	0.11	0.46	0.36	0.34	0.66	0.27	0.3	0.24	0.68	0.51	0.44	1.0	0.39	0.17
Gb_38521	0.68	1.0	0.42	0.48	0.45	0.45	0.07	0.23	0.23	0.18	0.17	0.12	0.21	0.27	0.17	0.33	0.18	0.29	0.15	0.13
Gb_38522	1.0	0.59	0.47	0.77	0.72	0.45	0.1	0.3	0.3	0.21	0.15	0.17	0.3	0.32	0.2	0.33	0.17	0.56	0.27	0.26
Gb_38525	1.0	0.73	0.46	0.96	0.54	0.41	0.1	0.33	0.3	0.2	0.21	0.16	0.18	0.15	0.21	0.39	0.2	0.44	0.27	0.27
Gb_38526	1.0	0.46	0.33	0.7	0.69	0.41	0.12	0.33	0.32	0.21	0.19	0.21	0.15	0.17	0.13	0.43	0.21	0.48	0.29	0.52
Gb_38527	0.94	0.6	0.44	1.0	0.63	0.42	0.12	0.39	0.35	0.24	0.3	0.23	0.38	0.41	0.26	0.51	0.25	0.46	0.27	0.58
Gb_39010	0.18	0.12	0.08	0.24	1.0	0.22	0.0	0.31	0.1	0.13	0.05	0.06	0.02	0.03	0.0	0.38	0.07	0.23	0.05	0.04
Gb_39011	0.55	0.0	0.07	1.0	0.11	0.0	0.02	0.64	0.22	0.15	0.0	0.14	0.0	0.04	0.0	0.6	0.42	0.6	0.0	0.0
Gb_39013	0.06	0.2	0.32	0.19	1.0	0.48	0.0	0.15	0.24	0.24	0.02	0.03	0.01	0.0	0.04	0.37	0.24	0.14	0.05	0.07
Gb_39014	1.0	0.4	0.32	0.33	0.39	0.42	0.05	0.75	0.34	0.25	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.3	0.28	0.27	0.0	0.0
Gb_39975	0.74	0.29	0.57	0.77	0.93	0.68	0.2	0.55	0.38	0.54	0.11	0.38	0.16	0.15	0.11	0.53	0.72	1.0	0.28	0.64
Gb_40748	0.72	0.44	0.54	1.0	0.75	0.44	0.51	0.45	0.26	0.25	0.48	0.31	0.31	0.27	0.42	0.28	0.45	0.74	0.25	0.4
Gb_40810	0.54	1.0	0.37	0.66	0.53	0.15	0.07	0.37	0.47	0.33	0.52	0.35	0.13	0.18	0.48	0.78	0.64	0.46	0.27	0.15
Gb_41075	0.76	0.6	0.68	0.98	1.0	0.39	0.29	0.62	0.61	0.57	0.81	0.5	0.49	0.49	0.74	0.58	0.61	0.84	0.46	0.88

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)