Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00294	0.92	0.43	1.0	0.87	0.33	0.39	0.23	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.06	0.09	0.63
Gb_00316	0.58	0.94	1.0	0.83	0.58	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.17	0.1
Gb_00825	1.0	0.82	0.77	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00826	1.0	0.17	0.22	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01091	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02524	1.0	0.18	0.22	0.09	0.36	0.0	0.11	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.11	0.15	0.07	0.09	0.03
Gb_02721	1.0	0.05	0.12	0.1	0.03	0.76	0.17	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.94
Gb_03494	1.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.36	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_03647	1.0	0.2	0.82	0.15	0.0	0.05	0.11	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04
Gb_04529	1.0	0.12	0.14	0.31	0.06	0.06	0.18	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.03	0.07	0.03	0.05	0.16
Gb_04698	0.79	1.0	0.1	0.19	0.34	0.76	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04
Gb_04757	1.0	0.26	0.12	0.16	0.04	0.04	0.01	0.05	0.08	0.09	0.09	0.17	0.15	0.12	0.09	0.05	0.16	0.02	0.17	0.26
Gb_05630	0.73	0.6	1.0	0.35	0.17	0.07	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.03	0.1	0.13	0.01	0.0	0.07	0.05	0.0	0.06
Gb_05810	0.11	0.32	1.0	0.13	0.19	0.0	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.18	0.04	0.09
Gb_06317	1.0	0.21	0.27	0.79	0.04	0.0	0.11	0.53	0.27	0.27	0.57	0.49	0.33	0.26	0.6	0.21	0.37	0.19	0.09	0.34
Gb_06360	1.0	0.06	0.06	0.15	0.08	0.08	0.02	0.1	0.09	0.08	0.04	0.04	0.04	0.04	0.08	0.0	0.05	0.03	0.01	0.11
Gb_06485	0.74	0.58	0.66	1.0	0.73	0.22	0.27	0.06	0.02	0.02	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.1	0.1	0.21	0.08	1.0
Gb_06640	1.0	0.7	0.27	0.33	0.0	0.14	0.43	0.04	0.11	0.16	0.05	0.49	0.05	0.13	0.01	0.03	0.06	0.0	0.0	0.01
Gb_07001	0.19	0.2	1.0	0.0	0.12	0.0	0.03	0.03	0.0	0.12	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.37
Gb_08168	0.62	0.75	1.0	0.28	0.44	0.0	0.0	0.02	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.1
Gb_08214	1.0	0.18	0.2	0.48	0.34	0.03	0.15	0.06	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.13	0.22	0.21
Gb_08216	1.0	0.09	0.1	0.0	0.04	0.07	0.1	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Gb_09311	0.94	0.26	1.0	0.53	0.32	0.02	0.12	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.27	0.14	0.59
Gb_09809	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10115	1.0	0.12	0.55	0.46	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10699	1.0	0.59	0.7	0.38	0.03	0.34	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.04	0.1	0.0	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03
Gb_10796	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10849	0.49	0.74	1.0	1.0	0.26	0.01	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	0.11	0.17
Gb_12294	0.63	0.61	1.0	0.17	0.11	0.03	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.06	0.01	0.19
Gb_12367	1.0	0.25	0.11	0.14	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04
Gb_12430	0.57	0.68	1.0	0.18	0.3	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12438	0.68	0.2	1.0	0.1	0.23	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13123	0.44	1.0	0.61	0.49	0.02	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
Gb_13168	0.44	0.4	1.0	0.37	0.25	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Gb_13739	1.0	0.36	0.31	0.32	0.09	0.01	0.01	0.13	0.2	0.14	0.0	0.03	0.07	0.17	0.02	0.02	0.22	0.17	0.68	0.98
Gb_14316	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14344	1.0	0.69	0.8	0.78	0.58	0.3	0.14	0.32	0.09	0.08	0.23	0.26	0.08	0.06	0.16	0.18	0.24	0.4	0.41	0.51
Gb_14350	1.0	0.8	0.91	0.89	0.53	0.39	0.13	0.25	0.09	0.09	0.11	0.23	0.15	0.14	0.11	0.16	0.23	0.29	0.37	0.42
Gb_14984	0.93	0.98	0.71	0.99	0.74	0.15	0.0	0.12	0.18	0.22	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.14	0.16	0.0	0.0	1.0
Gb_15096	0.52	0.71	1.0	0.32	0.22	0.16	0.09	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.78
Gb_15664	0.38	0.72	1.0	0.33	0.46	0.05	0.0	0.07	0.04	0.03	0.12	0.18	0.04	0.07	0.19	0.02	0.09	0.26	0.03	0.0
Gb_16370	1.0	0.52	0.85	0.78	0.51	0.29	0.27	0.16	0.05	0.03	0.03	0.12	0.07	0.1	0.07	0.12	0.07	0.23	0.08	0.22
Gb_16734	0.56	0.86	1.0	0.28	0.13	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_17648	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17888	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18105	1.0	0.51	0.87	0.65	0.53	0.03	0.13	0.2	0.24	0.22	0.23	0.09	0.18	0.13	0.21	0.21	0.22	0.11	0.12	0.78
Gb_19442	0.19	0.24	1.0	0.24	0.14	0.03	0.16	0.11	0.1	0.01	0.06	0.17	0.01	0.03	0.01	0.19	0.32	0.11	0.11	0.01
Gb_20156	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.07	0.22	0.08	0.0	0.0	0.0
Gb_20676	1.0	0.41	0.89	0.62	0.27	0.03	0.0	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.24	0.0	0.17
Gb_20773	0.45	1.0	0.94	0.18	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21918	0.14	0.46	1.0	0.48	0.15	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.02
Gb_22508	0.85	0.0	0.38	0.29	0.07	0.52	0.13	0.08	0.05	0.02	0.0	0.01	0.09	0.07	0.0	0.05	0.03	0.09	0.74	1.0
Gb_22885	1.0	0.17	0.68	0.97	0.15	0.12	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.0
Gb_23787	1.0	0.39	0.84	0.43	0.32	0.05	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02
Gb_24017	0.32	1.0	0.94	0.57	0.37	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01
Gb_24065	0.4	0.23	1.0	0.36	0.12	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_24705	0.37	0.75	1.0	0.22	0.3	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
Gb_25485	0.35	0.24	1.0	0.2	0.02	0.0	0.0	0.02	0.09	0.04	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03
Gb_25991	1.0	0.84	0.96	0.86	0.74	0.16	0.06	0.2	0.06	0.07	0.15	0.23	0.16	0.19	0.16	0.02	0.11	0.22	0.0	0.17
Gb_26934	1.0	0.46	0.71	0.12	0.12	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.37
Gb_27302	0.38	0.41	1.0	0.46	0.12	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.18	0.0	0.0
Gb_28215	0.4	0.64	1.0	0.16	0.15	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02	0.02
Gb_28394	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29220	0.9	0.42	1.0	0.27	0.26	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.01
Gb_29359	0.85	0.42	1.0	0.48	0.23	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_30138	0.34	0.9	1.0	0.34	0.18	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_30559	0.19	0.3	0.6	0.3	0.11	0.13	0.04	0.06	0.0	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.08	0.06	1.0
Gb_31200	1.0	0.02	0.17	0.11	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_32547	0.1	0.0	1.0	0.31	0.2	0.06	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16
Gb_34278	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.06	0.0	0.16	0.26	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34879	0.78	1.0	0.67	0.4	0.22	0.02	0.11	0.01	0.05	0.05	0.06	0.01	0.0	0.02	0.06	0.05	0.03	0.01	0.0	0.54
Gb_35284	1.0	0.14	0.29	0.14	0.03	0.06	0.02	0.07	0.06	0.09	0.07	0.02	0.12	0.07	0.06	0.0	0.0	0.02	0.01	0.3
Gb_35343	0.77	0.01	1.0	0.22	0.13	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_35643	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36988	1.0	0.72	0.71	0.58	0.43	0.54	0.44	0.25	0.19	0.17	0.28	0.2	0.16	0.22	0.22	0.34	0.23	0.4	0.06	0.86
Gb_37088	0.07	0.75	1.0	0.0	0.1	0.04	0.3	0.03	0.08	0.06	0.14	0.01	0.04	0.02	0.13	0.0	0.1	0.03	0.02	0.1
Gb_37299	0.45	1.0	0.77	0.4	0.45	0.17	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.02	0.0	0.01	0.03	0.03	0.0	0.16
Gb_37752	1.0	0.29	0.21	0.4	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38228	1.0	0.35	0.93	0.07	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.07
Gb_38479	0.64	0.72	1.0	0.54	0.57	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04
Gb_39092	1.0	0.07	0.08	0.18	0.0	0.25	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.5
Gb_39534	0.98	1.0	0.95	0.55	0.6	0.11	0.15	0.21	0.16	0.18	0.12	0.34	0.26	0.3	0.1	0.09	0.18	0.25	0.01	0.45
Gb_39927	0.94	0.57	0.12	0.93	0.21	0.07	0.26	0.09	0.13	0.14	0.36	0.15	0.1	0.12	0.26	0.2	0.09	0.21	0.06	1.0
Gb_40977	0.13	0.37	1.0	0.14	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41627	1.0	0.11	0.22	0.07	0.02	0.13	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.62
Gb_41634	0.27	0.28	0.0	0.0	0.61	1.0	0.01	0.13	0.09	0.09	0.14	0.19	0.18	0.25	0.21	0.0	0.08	0.15	0.0	0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)