Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.68 1.0 0.62 0.26 0.66 0.35 0.32 0.48 0.33 0.36 0.54 0.42 0.38 0.27 0.63 0.26 0.24 0.38 0.64 0.45
0.37 0.18 1.0 0.11 0.31 0.18 0.2 0.31 0.16 0.16 0.43 0.05 0.01 0.01 0.53 0.2 0.27 0.26 0.32 0.16
0.49 1.0 0.74 0.25 0.49 0.31 0.39 0.5 0.4 0.42 0.42 0.37 0.21 0.12 0.51 0.21 0.3 0.34 0.27 0.53
0.94 1.0 0.95 0.6 0.93 0.42 0.43 0.44 0.37 0.38 0.61 0.3 0.17 0.13 0.63 0.33 0.32 0.72 0.7 0.59
0.42 0.41 0.53 1.0 0.31 0.13 0.39 0.44 0.49 0.43 0.58 0.45 0.31 0.35 0.5 0.47 0.3 0.3 0.29 0.23
1.0 0.7 0.77 0.75 0.57 0.8 0.42 0.66 0.51 0.65 0.82 0.4 0.59 0.58 0.82 0.64 0.69 0.82 0.82 0.96
0.62 0.29 0.24 0.16 0.88 0.53 0.26 0.37 0.12 0.23 0.31 0.35 0.19 0.29 0.34 0.49 0.53 1.0 0.46 0.4
0.67 0.55 0.87 0.51 0.77 0.7 0.71 0.48 0.38 0.42 0.65 0.37 0.09 0.09 0.71 0.42 0.39 1.0 0.62 0.68
0.33 0.53 0.53 0.69 0.96 0.84 0.15 0.97 0.49 0.47 0.85 0.81 0.57 0.53 0.77 0.55 0.72 1.0 0.34 0.35
0.41 1.0 0.64 0.44 0.74 0.37 0.44 0.54 0.56 0.56 0.49 0.39 0.44 0.39 0.52 0.38 0.46 0.62 0.65 0.45
0.17 0.26 0.12 0.23 0.41 0.54 0.07 0.66 0.28 0.3 0.98 0.37 0.7 0.58 1.0 0.35 0.63 0.54 0.77 0.29
0.56 0.6 0.47 0.46 1.0 0.38 0.4 0.31 0.08 0.17 0.12 0.23 0.25 0.24 0.1 0.17 0.16 0.63 0.48 0.67
0.4 0.13 0.17 0.6 0.97 0.05 0.1 0.58 0.31 0.39 0.27 0.29 0.53 0.99 0.23 0.23 0.35 1.0 0.66 0.09
0.17 0.31 0.09 0.53 1.0 0.05 0.03 0.49 0.25 0.29 0.24 0.48 0.48 0.39 0.18 0.4 0.54 0.8 0.48 0.01
0.27 0.57 0.92 0.05 0.58 0.22 0.7 0.83 0.99 1.0 0.81 0.58 0.22 0.1 0.6 0.31 0.4 0.33 0.01 0.57
0.27 1.0 0.65 0.22 0.42 0.32 0.22 0.27 0.16 0.14 0.17 0.09 0.16 0.14 0.3 0.12 0.12 0.74 0.3 0.22
0.3 0.51 0.63 0.32 0.65 0.47 0.65 0.75 0.45 0.44 0.8 0.6 0.69 0.65 0.82 0.38 0.39 0.87 1.0 0.69
0.3 1.0 0.63 0.45 0.71 0.44 0.13 0.45 0.39 0.43 0.79 0.4 0.37 0.42 0.78 0.19 0.22 0.5 0.66 0.28
0.54 1.0 0.75 0.21 0.77 0.6 0.69 0.64 0.34 0.43 0.54 0.34 0.36 0.29 0.75 0.32 0.39 0.89 0.58 0.7
0.88 1.0 0.66 0.54 0.63 0.93 0.37 0.58 0.39 0.39 0.75 0.33 0.55 0.41 0.81 0.39 0.43 0.54 0.78 0.75
0.62 0.92 0.92 0.56 0.97 0.94 1.0 0.49 0.22 0.25 0.24 0.25 0.6 0.6 0.33 0.18 0.22 0.9 0.79 0.45
0.56 0.24 0.43 0.63 0.89 1.0 0.96 0.37 0.23 0.25 0.31 0.27 0.44 0.51 0.38 0.33 0.26 0.66 0.57 0.43
0.35 0.34 0.54 0.53 0.68 0.36 0.4 0.59 0.34 0.32 0.83 0.51 0.5 0.44 1.0 0.21 0.27 0.84 0.89 0.32
0.04 0.06 0.04 0.12 0.51 0.3 0.17 0.47 0.31 0.3 0.37 0.53 0.16 0.23 0.4 0.18 0.32 1.0 0.49 0.15
0.77 0.41 0.56 0.53 0.7 0.49 0.19 0.47 0.28 0.26 0.42 0.21 0.02 0.0 0.63 0.6 0.42 1.0 0.47 0.44
0.41 0.48 0.41 0.4 0.41 0.37 0.42 0.69 0.54 0.5 0.67 0.55 0.8 0.72 0.65 0.55 0.65 0.68 1.0 0.59
0.38 0.68 0.73 0.87 0.86 0.71 0.66 0.97 0.65 0.6 1.0 0.82 0.88 1.0 0.92 0.61 0.93 0.82 0.83 0.52
0.84 1.0 0.69 0.69 0.72 0.98 0.46 0.6 0.42 0.39 0.79 0.31 0.51 0.6 0.74 0.41 0.34 0.51 0.4 0.32
0.72 0.78 0.69 0.66 0.92 0.66 0.51 0.75 0.66 0.67 1.0 0.57 0.99 0.84 0.95 0.65 0.65 0.81 0.86 0.73
0.23 1.0 0.24 0.32 0.72 0.43 0.14 0.5 0.43 0.41 0.49 0.27 0.52 0.4 0.51 0.26 0.26 0.6 0.63 0.54
0.41 0.89 1.0 0.32 0.7 0.24 0.33 0.3 0.26 0.21 0.24 0.26 0.11 0.11 0.24 0.17 0.2 0.46 0.5 0.34
0.27 0.16 0.24 0.58 0.94 0.56 0.32 0.72 0.37 0.44 0.57 0.95 0.43 0.41 0.6 0.38 1.0 0.81 0.57 0.33
0.86 0.68 0.71 0.45 1.0 0.74 0.41 0.62 0.39 0.45 0.93 0.38 0.38 0.27 0.85 0.3 0.34 0.84 0.62 0.77
0.56 0.74 1.0 0.46 0.62 0.23 0.15 0.19 0.1 0.13 0.06 0.11 0.12 0.11 0.06 0.11 0.3 0.3 0.31 0.19
0.4 0.54 0.72 0.31 1.0 0.42 0.51 0.73 0.56 0.59 0.58 0.59 0.36 0.33 0.61 0.48 0.44 0.75 0.45 0.55
0.48 0.59 0.85 0.23 0.81 0.2 0.81 0.46 0.31 0.3 1.0 0.33 0.36 0.35 0.82 0.41 0.38 0.55 0.78 0.3
0.56 1.0 0.69 0.56 0.67 0.38 0.27 0.5 0.46 0.38 0.46 0.34 0.49 0.44 0.49 0.36 0.33 0.56 0.65 0.51
0.52 0.97 1.0 0.41 0.55 0.15 0.69 0.28 0.2 0.19 0.09 0.14 0.12 0.08 0.17 0.28 0.24 0.6 0.57 0.38
0.27 0.46 0.33 0.2 0.33 1.0 0.25 0.34 0.22 0.28 0.42 0.28 0.07 0.06 0.38 0.26 0.33 0.35 0.33 0.32
0.54 0.36 0.49 0.47 1.0 0.16 0.21 0.18 0.13 0.12 0.03 0.13 0.29 0.14 0.05 0.04 0.07 0.43 0.61 0.21
0.57 0.76 0.71 0.5 0.84 0.35 0.47 0.32 0.27 0.26 0.18 0.27 0.09 0.12 0.27 0.22 0.32 1.0 0.49 0.44
0.44 1.0 0.8 0.34 0.82 0.42 0.4 0.43 0.22 0.3 0.39 0.38 0.15 0.18 0.22 0.24 0.16 0.73 0.91 0.66
0.71 0.44 0.47 0.44 0.78 0.66 0.38 0.78 0.95 0.89 0.97 0.46 0.4 0.32 1.0 0.72 0.75 0.8 0.97 0.41
0.6 1.0 0.96 0.21 0.52 0.42 0.53 0.84 0.65 0.44 0.55 0.61 0.17 0.13 0.65 0.56 0.54 0.41 0.71 0.48
0.72 0.66 0.86 0.87 0.99 0.23 1.0 0.86 0.92 0.65 0.88 0.78 0.46 0.3 0.97 0.68 0.95 0.9 0.99 0.76
0.53 1.0 0.65 0.3 0.74 0.39 0.76 0.41 0.35 0.4 0.45 0.26 0.33 0.29 0.42 0.37 0.36 0.86 0.59 0.78
0.79 0.52 1.0 0.39 0.71 0.58 0.61 0.44 0.3 0.3 0.36 0.39 0.08 0.08 0.45 0.31 0.41 0.78 0.72 0.56
0.97 0.78 1.0 0.66 0.66 0.28 0.27 0.36 0.24 0.23 0.22 0.25 0.26 0.25 0.25 0.24 0.16 0.66 0.76 0.49
0.62 1.0 0.83 0.49 0.73 0.4 0.32 0.48 0.4 0.36 0.57 0.36 0.44 0.31 0.52 0.54 0.38 0.52 0.56 0.52
0.66 1.0 0.58 0.2 0.61 0.1 0.48 0.37 0.52 0.5 0.82 0.16 0.29 0.25 0.64 0.43 0.4 0.57 0.61 0.41
0.45 0.78 0.82 0.53 0.47 0.46 0.65 0.79 1.0 0.93 0.79 0.72 0.48 0.6 0.64 0.94 0.95 0.64 0.64 0.17
0.59 0.53 0.65 0.54 0.63 0.23 0.44 0.5 0.46 0.43 1.0 0.47 0.55 0.48 0.94 0.42 0.48 0.56 0.46 0.58
0.4 1.0 0.48 0.14 0.6 0.29 0.52 0.29 0.24 0.21 0.5 0.17 0.14 0.18 0.34 0.29 0.28 0.47 0.32 0.42
0.73 0.36 0.71 0.66 0.68 0.59 0.45 0.88 0.43 0.42 0.81 0.5 0.77 0.65 0.74 0.59 0.5 1.0 0.89 0.69
1.0 0.58 0.94 0.62 0.9 0.47 0.41 0.56 0.52 0.53 0.72 0.49 0.4 0.34 0.72 0.47 0.43 0.63 0.75 0.66
0.7 1.0 0.87 0.35 0.88 0.29 0.37 0.33 0.3 0.21 0.46 0.26 0.06 0.02 0.5 0.49 0.27 0.52 0.8 0.72
0.1 0.36 0.39 0.15 1.0 0.06 0.66 0.17 0.18 0.21 0.16 0.13 0.13 0.08 0.14 0.01 0.02 0.19 0.37 0.19
0.9 0.67 0.77 0.71 1.0 0.58 0.51 0.62 0.58 0.61 0.69 0.49 0.38 0.36 0.72 0.6 0.59 0.85 0.71 0.75
0.76 0.43 0.74 0.97 0.62 0.3 0.31 0.5 0.46 0.43 0.74 0.37 0.84 1.0 0.75 0.48 0.42 0.62 0.87 0.71
0.99 0.94 0.92 0.77 0.72 0.63 0.65 0.59 0.44 0.38 0.44 0.61 0.1 0.16 0.44 0.53 0.53 1.0 0.71 0.46
0.3 1.0 0.62 0.15 0.59 0.5 0.62 0.28 0.19 0.2 0.19 0.28 0.08 0.09 0.2 0.33 0.4 0.65 0.59 0.74
0.57 1.0 0.91 0.69 0.85 0.19 0.33 0.18 0.12 0.17 0.22 0.1 0.0 0.03 0.12 0.15 0.11 0.66 0.46 0.22
0.42 0.63 1.0 0.37 0.62 0.47 0.61 0.42 0.45 0.52 0.74 0.65 0.25 0.35 0.74 0.53 0.55 0.48 0.45 0.45
0.76 1.0 0.64 0.74 0.68 0.24 0.58 0.5 0.28 0.17 0.47 0.25 0.74 0.52 0.41 0.28 0.39 0.45 0.7 0.32
1.0 0.85 0.89 0.72 0.79 0.31 0.35 0.54 0.5 0.49 0.61 0.31 0.41 0.36 0.66 0.56 0.38 0.97 0.78 0.69
0.51 0.41 0.7 0.22 1.0 0.65 0.43 0.4 0.3 0.13 0.47 0.28 0.59 0.52 0.41 0.26 0.52 0.77 0.36 0.48
0.49 0.67 1.0 0.36 0.55 0.38 0.38 0.28 0.14 0.15 0.22 0.33 0.04 0.05 0.2 0.11 0.16 0.44 0.45 0.2
0.64 0.59 0.48 0.14 0.52 0.69 1.0 0.42 0.21 0.19 0.33 0.25 0.42 0.32 0.34 0.15 0.17 0.96 0.08 0.68
0.72 0.44 0.79 0.59 0.64 1.0 0.82 0.53 0.39 0.35 0.79 0.29 0.06 0.05 0.63 0.38 0.54 0.68 0.58 0.81
0.49 0.97 1.0 0.45 0.9 0.34 0.41 0.5 0.4 0.43 0.48 0.39 0.29 0.27 0.45 0.4 0.55 0.82 0.68 0.59
0.73 0.64 0.91 0.71 0.91 0.47 0.61 0.82 0.67 0.67 0.94 0.66 0.55 0.46 1.0 0.62 0.69 0.8 0.77 0.68
0.37 0.33 0.4 0.77 0.58 0.22 0.16 0.66 0.64 0.63 0.41 0.67 0.29 0.29 0.61 0.82 0.71 0.72 1.0 0.11
0.72 0.59 1.0 0.56 0.85 0.28 0.8 0.57 0.51 0.49 0.9 0.6 0.45 0.37 0.97 0.61 0.57 0.52 0.66 0.55
0.25 0.25 0.21 0.06 0.44 1.0 0.58 0.17 0.1 0.15 0.12 0.08 0.17 0.17 0.24 0.11 0.12 0.39 0.09 0.5
0.79 0.79 0.92 0.9 1.0 0.5 0.27 0.27 0.26 0.27 0.41 0.18 0.23 0.22 0.41 0.22 0.18 0.8 0.32 0.32
0.31 1.0 0.67 0.29 0.75 0.26 0.52 0.35 0.23 0.2 0.44 0.28 0.43 0.33 0.55 0.24 0.22 0.35 0.36 0.34
0.49 0.76 0.61 0.41 1.0 0.38 0.74 0.37 0.39 0.37 0.52 0.38 0.25 0.2 0.59 0.28 0.31 0.46 0.68 0.52
0.33 1.0 0.49 0.15 0.23 0.0 0.39 0.14 0.03 0.03 0.01 0.07 0.01 0.02 0.03 0.03 0.06 0.46 0.44 0.28
0.51 0.95 0.69 0.6 0.52 1.0 0.39 0.59 0.56 0.45 0.96 0.48 0.27 0.35 0.7 0.69 0.35 0.83 0.51 0.87
0.49 0.63 0.47 0.24 0.6 0.19 0.53 0.39 0.23 0.37 0.35 0.3 0.29 0.26 0.46 0.32 0.27 0.71 1.0 0.41
0.61 0.91 0.63 0.24 0.61 0.48 0.78 0.61 0.45 0.44 0.83 0.44 0.12 0.1 1.0 0.46 0.29 0.77 0.87 0.68
0.36 1.0 0.87 0.49 0.54 0.52 0.49 0.35 0.34 0.41 0.68 0.28 0.04 0.03 0.64 0.26 0.32 0.48 0.47 0.53
0.53 0.36 0.32 0.13 0.69 0.74 1.0 0.41 0.37 0.3 0.24 0.29 0.48 0.58 0.28 0.24 0.2 0.75 0.28 0.49
0.66 0.74 1.0 0.54 0.58 0.32 0.46 0.29 0.36 0.39 0.28 0.32 0.15 0.14 0.27 0.33 0.31 0.46 0.5 0.38
0.8 0.1 0.59 0.44 1.0 0.29 0.73 0.26 0.11 0.08 0.45 0.17 0.23 0.19 0.2 0.06 0.17 0.89 0.2 0.18
0.82 1.0 0.69 0.31 0.61 0.89 0.82 0.59 0.39 0.41 0.59 0.55 0.1 0.16 0.68 0.37 0.49 0.63 0.44 0.82
0.46 0.46 0.41 0.35 0.43 0.62 0.25 0.53 0.36 0.43 0.74 0.45 0.49 0.31 0.7 0.27 0.37 1.0 0.59 0.5
0.75 0.76 0.77 0.46 0.88 0.55 0.43 0.63 0.47 0.45 0.74 0.44 0.36 0.35 0.75 0.41 0.52 0.78 0.74 1.0
0.73 0.99 0.84 0.55 1.0 0.37 0.64 0.34 0.27 0.3 0.53 0.2 0.11 0.07 0.51 0.17 0.21 0.5 0.8 0.37
0.38 0.53 0.43 0.4 0.73 0.73 0.33 0.77 0.63 0.64 0.96 0.65 0.77 0.75 0.93 0.63 0.68 0.87 1.0 0.92
0.56 0.24 0.44 0.37 0.86 1.0 0.88 0.33 0.25 0.35 0.39 0.33 0.23 0.21 0.48 0.22 0.37 0.57 0.29 0.83
0.67 0.44 0.47 0.4 0.53 0.97 0.65 0.55 0.45 0.46 0.66 0.48 0.43 0.38 0.73 0.52 0.65 1.0 0.46 0.82
0.53 0.83 0.67 0.37 0.46 1.0 0.52 0.39 0.3 0.3 0.39 0.32 0.11 0.09 0.44 0.4 0.48 0.96 0.53 0.7
0.48 1.0 0.81 0.17 0.85 0.21 0.49 0.24 0.18 0.24 0.19 0.16 0.16 0.25 0.13 0.17 0.14 0.37 0.54 0.24
1.0 0.75 0.95 0.91 0.85 0.35 0.44 0.38 0.44 0.46 0.44 0.35 0.03 0.04 0.51 0.47 0.46 0.98 0.72 0.61
0.49 0.81 1.0 0.59 0.73 0.44 0.49 0.44 0.3 0.29 0.3 0.26 0.35 0.32 0.33 0.32 0.4 0.67 0.77 0.59
0.18 0.54 0.29 0.05 0.35 0.24 0.08 0.64 0.62 0.7 0.6 0.35 0.39 0.28 0.81 0.74 0.45 0.86 1.0 0.76
0.33 0.31 0.43 0.4 0.82 0.66 0.18 0.49 0.34 0.43 0.33 0.45 0.68 0.79 0.4 0.29 0.42 0.93 0.47 1.0
0.46 1.0 0.77 0.34 0.78 0.19 0.44 0.58 0.4 0.33 0.72 0.51 0.47 0.43 0.76 0.61 0.33 0.59 0.58 0.64
0.17 0.08 0.15 0.19 0.37 0.28 0.19 0.54 0.41 0.44 0.8 0.56 0.32 0.26 0.79 0.5 0.56 1.0 0.86 0.58
0.62 0.6 0.77 0.72 0.98 0.6 0.38 0.66 0.45 0.41 0.9 0.53 0.22 0.19 0.87 0.53 0.78 0.92 0.55 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)