Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

response to stress

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00039	0.68	1.0	0.62	0.26	0.66	0.35	0.32	0.48	0.33	0.36	0.54	0.42	0.38	0.27	0.63	0.26	0.24	0.38	0.64	0.45
Gb_00224	0.37	0.18	1.0	0.11	0.31	0.18	0.2	0.31	0.16	0.16	0.43	0.05	0.01	0.01	0.53	0.2	0.27	0.26	0.32	0.16
Gb_00291	0.49	1.0	0.74	0.25	0.49	0.31	0.39	0.5	0.4	0.42	0.42	0.37	0.21	0.12	0.51	0.21	0.3	0.34	0.27	0.53
Gb_00497	0.94	1.0	0.95	0.6	0.93	0.42	0.43	0.44	0.37	0.38	0.61	0.3	0.17	0.13	0.63	0.33	0.32	0.72	0.7	0.59
Gb_00509	0.42	0.41	0.53	1.0	0.31	0.13	0.39	0.44	0.49	0.43	0.58	0.45	0.31	0.35	0.5	0.47	0.3	0.3	0.29	0.23
Gb_00608	1.0	0.7	0.77	0.75	0.57	0.8	0.42	0.66	0.51	0.65	0.82	0.4	0.59	0.58	0.82	0.64	0.69	0.82	0.82	0.96
Gb_02473	0.62	0.29	0.24	0.16	0.88	0.53	0.26	0.37	0.12	0.23	0.31	0.35	0.19	0.29	0.34	0.49	0.53	1.0	0.46	0.4
Gb_02492	0.67	0.55	0.87	0.51	0.77	0.7	0.71	0.48	0.38	0.42	0.65	0.37	0.09	0.09	0.71	0.42	0.39	1.0	0.62	0.68
Gb_02508	0.33	0.53	0.53	0.69	0.96	0.84	0.15	0.97	0.49	0.47	0.85	0.81	0.57	0.53	0.77	0.55	0.72	1.0	0.34	0.35
Gb_02560	0.41	1.0	0.64	0.44	0.74	0.37	0.44	0.54	0.56	0.56	0.49	0.39	0.44	0.39	0.52	0.38	0.46	0.62	0.65	0.45
Gb_02682	0.17	0.26	0.12	0.23	0.41	0.54	0.07	0.66	0.28	0.3	0.98	0.37	0.7	0.58	1.0	0.35	0.63	0.54	0.77	0.29
Gb_02813	0.56	0.6	0.47	0.46	1.0	0.38	0.4	0.31	0.08	0.17	0.12	0.23	0.25	0.24	0.1	0.17	0.16	0.63	0.48	0.67
Gb_04410	0.4	0.13	0.17	0.6	0.97	0.05	0.1	0.58	0.31	0.39	0.27	0.29	0.53	0.99	0.23	0.23	0.35	1.0	0.66	0.09
Gb_04423	0.17	0.31	0.09	0.53	1.0	0.05	0.03	0.49	0.25	0.29	0.24	0.48	0.48	0.39	0.18	0.4	0.54	0.8	0.48	0.01
Gb_05515	0.27	0.57	0.92	0.05	0.58	0.22	0.7	0.83	0.99	1.0	0.81	0.58	0.22	0.1	0.6	0.31	0.4	0.33	0.01	0.57
Gb_05824	0.27	1.0	0.65	0.22	0.42	0.32	0.22	0.27	0.16	0.14	0.17	0.09	0.16	0.14	0.3	0.12	0.12	0.74	0.3	0.22
Gb_05870	0.3	0.51	0.63	0.32	0.65	0.47	0.65	0.75	0.45	0.44	0.8	0.6	0.69	0.65	0.82	0.38	0.39	0.87	1.0	0.69
Gb_06217	0.3	1.0	0.63	0.45	0.71	0.44	0.13	0.45	0.39	0.43	0.79	0.4	0.37	0.42	0.78	0.19	0.22	0.5	0.66	0.28
Gb_06409	0.54	1.0	0.75	0.21	0.77	0.6	0.69	0.64	0.34	0.43	0.54	0.34	0.36	0.29	0.75	0.32	0.39	0.89	0.58	0.7
Gb_06581	0.88	1.0	0.66	0.54	0.63	0.93	0.37	0.58	0.39	0.39	0.75	0.33	0.55	0.41	0.81	0.39	0.43	0.54	0.78	0.75
Gb_06654	0.62	0.92	0.92	0.56	0.97	0.94	1.0	0.49	0.22	0.25	0.24	0.25	0.6	0.6	0.33	0.18	0.22	0.9	0.79	0.45
Gb_06655	0.56	0.24	0.43	0.63	0.89	1.0	0.96	0.37	0.23	0.25	0.31	0.27	0.44	0.51	0.38	0.33	0.26	0.66	0.57	0.43
Gb_06915	0.35	0.34	0.54	0.53	0.68	0.36	0.4	0.59	0.34	0.32	0.83	0.51	0.5	0.44	1.0	0.21	0.27	0.84	0.89	0.32
Gb_07306	0.04	0.06	0.04	0.12	0.51	0.3	0.17	0.47	0.31	0.3	0.37	0.53	0.16	0.23	0.4	0.18	0.32	1.0	0.49	0.15
Gb_07855	0.77	0.41	0.56	0.53	0.7	0.49	0.19	0.47	0.28	0.26	0.42	0.21	0.02	0.0	0.63	0.6	0.42	1.0	0.47	0.44
Gb_08442	0.41	0.48	0.41	0.4	0.41	0.37	0.42	0.69	0.54	0.5	0.67	0.55	0.8	0.72	0.65	0.55	0.65	0.68	1.0	0.59
Gb_08503	0.38	0.68	0.73	0.87	0.86	0.71	0.66	0.97	0.65	0.6	1.0	0.82	0.88	1.0	0.92	0.61	0.93	0.82	0.83	0.52
Gb_09101	0.84	1.0	0.69	0.69	0.72	0.98	0.46	0.6	0.42	0.39	0.79	0.31	0.51	0.6	0.74	0.41	0.34	0.51	0.4	0.32
Gb_09584	0.72	0.78	0.69	0.66	0.92	0.66	0.51	0.75	0.66	0.67	1.0	0.57	0.99	0.84	0.95	0.65	0.65	0.81	0.86	0.73
Gb_09693	0.23	1.0	0.24	0.32	0.72	0.43	0.14	0.5	0.43	0.41	0.49	0.27	0.52	0.4	0.51	0.26	0.26	0.6	0.63	0.54
Gb_11281	0.41	0.89	1.0	0.32	0.7	0.24	0.33	0.3	0.26	0.21	0.24	0.26	0.11	0.11	0.24	0.17	0.2	0.46	0.5	0.34
Gb_11829	0.27	0.16	0.24	0.58	0.94	0.56	0.32	0.72	0.37	0.44	0.57	0.95	0.43	0.41	0.6	0.38	1.0	0.81	0.57	0.33
Gb_11916	0.86	0.68	0.71	0.45	1.0	0.74	0.41	0.62	0.39	0.45	0.93	0.38	0.38	0.27	0.85	0.3	0.34	0.84	0.62	0.77
Gb_12114	0.56	0.74	1.0	0.46	0.62	0.23	0.15	0.19	0.1	0.13	0.06	0.11	0.12	0.11	0.06	0.11	0.3	0.3	0.31	0.19
Gb_12637	0.4	0.54	0.72	0.31	1.0	0.42	0.51	0.73	0.56	0.59	0.58	0.59	0.36	0.33	0.61	0.48	0.44	0.75	0.45	0.55
Gb_13287	0.48	0.59	0.85	0.23	0.81	0.2	0.81	0.46	0.31	0.3	1.0	0.33	0.36	0.35	0.82	0.41	0.38	0.55	0.78	0.3
Gb_14072	0.56	1.0	0.69	0.56	0.67	0.38	0.27	0.5	0.46	0.38	0.46	0.34	0.49	0.44	0.49	0.36	0.33	0.56	0.65	0.51
Gb_15086	0.52	0.97	1.0	0.41	0.55	0.15	0.69	0.28	0.2	0.19	0.09	0.14	0.12	0.08	0.17	0.28	0.24	0.6	0.57	0.38
Gb_15103	0.27	0.46	0.33	0.2	0.33	1.0	0.25	0.34	0.22	0.28	0.42	0.28	0.07	0.06	0.38	0.26	0.33	0.35	0.33	0.32
Gb_15185	0.54	0.36	0.49	0.47	1.0	0.16	0.21	0.18	0.13	0.12	0.03	0.13	0.29	0.14	0.05	0.04	0.07	0.43	0.61	0.21
Gb_15381	0.57	0.76	0.71	0.5	0.84	0.35	0.47	0.32	0.27	0.26	0.18	0.27	0.09	0.12	0.27	0.22	0.32	1.0	0.49	0.44
Gb_15737	0.44	1.0	0.8	0.34	0.82	0.42	0.4	0.43	0.22	0.3	0.39	0.38	0.15	0.18	0.22	0.24	0.16	0.73	0.91	0.66
Gb_17773	0.71	0.44	0.47	0.44	0.78	0.66	0.38	0.78	0.95	0.89	0.97	0.46	0.4	0.32	1.0	0.72	0.75	0.8	0.97	0.41
Gb_17879	0.6	1.0	0.96	0.21	0.52	0.42	0.53	0.84	0.65	0.44	0.55	0.61	0.17	0.13	0.65	0.56	0.54	0.41	0.71	0.48
Gb_17928	0.72	0.66	0.86	0.87	0.99	0.23	1.0	0.86	0.92	0.65	0.88	0.78	0.46	0.3	0.97	0.68	0.95	0.9	0.99	0.76
Gb_18242	0.53	1.0	0.65	0.3	0.74	0.39	0.76	0.41	0.35	0.4	0.45	0.26	0.33	0.29	0.42	0.37	0.36	0.86	0.59	0.78
Gb_18455	0.79	0.52	1.0	0.39	0.71	0.58	0.61	0.44	0.3	0.3	0.36	0.39	0.08	0.08	0.45	0.31	0.41	0.78	0.72	0.56
Gb_18556	0.97	0.78	1.0	0.66	0.66	0.28	0.27	0.36	0.24	0.23	0.22	0.25	0.26	0.25	0.25	0.24	0.16	0.66	0.76	0.49
Gb_18973	0.62	1.0	0.83	0.49	0.73	0.4	0.32	0.48	0.4	0.36	0.57	0.36	0.44	0.31	0.52	0.54	0.38	0.52	0.56	0.52
Gb_19160	0.66	1.0	0.58	0.2	0.61	0.1	0.48	0.37	0.52	0.5	0.82	0.16	0.29	0.25	0.64	0.43	0.4	0.57	0.61	0.41
Gb_19688	0.45	0.78	0.82	0.53	0.47	0.46	0.65	0.79	1.0	0.93	0.79	0.72	0.48	0.6	0.64	0.94	0.95	0.64	0.64	0.17
Gb_19801	0.59	0.53	0.65	0.54	0.63	0.23	0.44	0.5	0.46	0.43	1.0	0.47	0.55	0.48	0.94	0.42	0.48	0.56	0.46	0.58
Gb_20042	0.4	1.0	0.48	0.14	0.6	0.29	0.52	0.29	0.24	0.21	0.5	0.17	0.14	0.18	0.34	0.29	0.28	0.47	0.32	0.42
Gb_20271	0.73	0.36	0.71	0.66	0.68	0.59	0.45	0.88	0.43	0.42	0.81	0.5	0.77	0.65	0.74	0.59	0.5	1.0	0.89	0.69
Gb_20319	1.0	0.58	0.94	0.62	0.9	0.47	0.41	0.56	0.52	0.53	0.72	0.49	0.4	0.34	0.72	0.47	0.43	0.63	0.75	0.66
Gb_20530	0.7	1.0	0.87	0.35	0.88	0.29	0.37	0.33	0.3	0.21	0.46	0.26	0.06	0.02	0.5	0.49	0.27	0.52	0.8	0.72
Gb_22181	0.1	0.36	0.39	0.15	1.0	0.06	0.66	0.17	0.18	0.21	0.16	0.13	0.13	0.08	0.14	0.01	0.02	0.19	0.37	0.19
Gb_22600	0.9	0.67	0.77	0.71	1.0	0.58	0.51	0.62	0.58	0.61	0.69	0.49	0.38	0.36	0.72	0.6	0.59	0.85	0.71	0.75
Gb_22796	0.76	0.43	0.74	0.97	0.62	0.3	0.31	0.5	0.46	0.43	0.74	0.37	0.84	1.0	0.75	0.48	0.42	0.62	0.87	0.71
Gb_23190	0.99	0.94	0.92	0.77	0.72	0.63	0.65	0.59	0.44	0.38	0.44	0.61	0.1	0.16	0.44	0.53	0.53	1.0	0.71	0.46
Gb_25487	0.3	1.0	0.62	0.15	0.59	0.5	0.62	0.28	0.19	0.2	0.19	0.28	0.08	0.09	0.2	0.33	0.4	0.65	0.59	0.74
Gb_25850	0.57	1.0	0.91	0.69	0.85	0.19	0.33	0.18	0.12	0.17	0.22	0.1	0.0	0.03	0.12	0.15	0.11	0.66	0.46	0.22
Gb_26882	0.42	0.63	1.0	0.37	0.62	0.47	0.61	0.42	0.45	0.52	0.74	0.65	0.25	0.35	0.74	0.53	0.55	0.48	0.45	0.45
Gb_27659	0.76	1.0	0.64	0.74	0.68	0.24	0.58	0.5	0.28	0.17	0.47	0.25	0.74	0.52	0.41	0.28	0.39	0.45	0.7	0.32
Gb_29052	1.0	0.85	0.89	0.72	0.79	0.31	0.35	0.54	0.5	0.49	0.61	0.31	0.41	0.36	0.66	0.56	0.38	0.97	0.78	0.69
Gb_29123	0.51	0.41	0.7	0.22	1.0	0.65	0.43	0.4	0.3	0.13	0.47	0.28	0.59	0.52	0.41	0.26	0.52	0.77	0.36	0.48
Gb_29694	0.49	0.67	1.0	0.36	0.55	0.38	0.38	0.28	0.14	0.15	0.22	0.33	0.04	0.05	0.2	0.11	0.16	0.44	0.45	0.2
Gb_30588	0.64	0.59	0.48	0.14	0.52	0.69	1.0	0.42	0.21	0.19	0.33	0.25	0.42	0.32	0.34	0.15	0.17	0.96	0.08	0.68
Gb_31151	0.72	0.44	0.79	0.59	0.64	1.0	0.82	0.53	0.39	0.35	0.79	0.29	0.06	0.05	0.63	0.38	0.54	0.68	0.58	0.81
Gb_31367	0.49	0.97	1.0	0.45	0.9	0.34	0.41	0.5	0.4	0.43	0.48	0.39	0.29	0.27	0.45	0.4	0.55	0.82	0.68	0.59
Gb_31373	0.73	0.64	0.91	0.71	0.91	0.47	0.61	0.82	0.67	0.67	0.94	0.66	0.55	0.46	1.0	0.62	0.69	0.8	0.77	0.68
Gb_31860	0.37	0.33	0.4	0.77	0.58	0.22	0.16	0.66	0.64	0.63	0.41	0.67	0.29	0.29	0.61	0.82	0.71	0.72	1.0	0.11
Gb_32792	0.72	0.59	1.0	0.56	0.85	0.28	0.8	0.57	0.51	0.49	0.9	0.6	0.45	0.37	0.97	0.61	0.57	0.52	0.66	0.55
Gb_32879	0.25	0.25	0.21	0.06	0.44	1.0	0.58	0.17	0.1	0.15	0.12	0.08	0.17	0.17	0.24	0.11	0.12	0.39	0.09	0.5
Gb_33027	0.79	0.79	0.92	0.9	1.0	0.5	0.27	0.27	0.26	0.27	0.41	0.18	0.23	0.22	0.41	0.22	0.18	0.8	0.32	0.32
Gb_33226	0.31	1.0	0.67	0.29	0.75	0.26	0.52	0.35	0.23	0.2	0.44	0.28	0.43	0.33	0.55	0.24	0.22	0.35	0.36	0.34
Gb_33251	0.49	0.76	0.61	0.41	1.0	0.38	0.74	0.37	0.39	0.37	0.52	0.38	0.25	0.2	0.59	0.28	0.31	0.46	0.68	0.52
Gb_33532	0.33	1.0	0.49	0.15	0.23	0.0	0.39	0.14	0.03	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.46	0.44	0.28
Gb_33913	0.51	0.95	0.69	0.6	0.52	1.0	0.39	0.59	0.56	0.45	0.96	0.48	0.27	0.35	0.7	0.69	0.35	0.83	0.51	0.87
Gb_33977	0.49	0.63	0.47	0.24	0.6	0.19	0.53	0.39	0.23	0.37	0.35	0.3	0.29	0.26	0.46	0.32	0.27	0.71	1.0	0.41
Gb_34407	0.61	0.91	0.63	0.24	0.61	0.48	0.78	0.61	0.45	0.44	0.83	0.44	0.12	0.1	1.0	0.46	0.29	0.77	0.87	0.68
Gb_34823	0.36	1.0	0.87	0.49	0.54	0.52	0.49	0.35	0.34	0.41	0.68	0.28	0.04	0.03	0.64	0.26	0.32	0.48	0.47	0.53
Gb_34841	0.53	0.36	0.32	0.13	0.69	0.74	1.0	0.41	0.37	0.3	0.24	0.29	0.48	0.58	0.28	0.24	0.2	0.75	0.28	0.49
Gb_35115	0.66	0.74	1.0	0.54	0.58	0.32	0.46	0.29	0.36	0.39	0.28	0.32	0.15	0.14	0.27	0.33	0.31	0.46	0.5	0.38
Gb_35841	0.8	0.1	0.59	0.44	1.0	0.29	0.73	0.26	0.11	0.08	0.45	0.17	0.23	0.19	0.2	0.06	0.17	0.89	0.2	0.18
Gb_36042	0.82	1.0	0.69	0.31	0.61	0.89	0.82	0.59	0.39	0.41	0.59	0.55	0.1	0.16	0.68	0.37	0.49	0.63	0.44	0.82
Gb_36979	0.46	0.46	0.41	0.35	0.43	0.62	0.25	0.53	0.36	0.43	0.74	0.45	0.49	0.31	0.7	0.27	0.37	1.0	0.59	0.5
Gb_37130	0.75	0.76	0.77	0.46	0.88	0.55	0.43	0.63	0.47	0.45	0.74	0.44	0.36	0.35	0.75	0.41	0.52	0.78	0.74	1.0
Gb_38218	0.73	0.99	0.84	0.55	1.0	0.37	0.64	0.34	0.27	0.3	0.53	0.2	0.11	0.07	0.51	0.17	0.21	0.5	0.8	0.37
Gb_38734	0.38	0.53	0.43	0.4	0.73	0.73	0.33	0.77	0.63	0.64	0.96	0.65	0.77	0.75	0.93	0.63	0.68	0.87	1.0	0.92
Gb_39041	0.56	0.24	0.44	0.37	0.86	1.0	0.88	0.33	0.25	0.35	0.39	0.33	0.23	0.21	0.48	0.22	0.37	0.57	0.29	0.83
Gb_39451	0.67	0.44	0.47	0.4	0.53	0.97	0.65	0.55	0.45	0.46	0.66	0.48	0.43	0.38	0.73	0.52	0.65	1.0	0.46	0.82
Gb_39452	0.53	0.83	0.67	0.37	0.46	1.0	0.52	0.39	0.3	0.3	0.39	0.32	0.11	0.09	0.44	0.4	0.48	0.96	0.53	0.7
Gb_39734	0.48	1.0	0.81	0.17	0.85	0.21	0.49	0.24	0.18	0.24	0.19	0.16	0.16	0.25	0.13	0.17	0.14	0.37	0.54	0.24
Gb_40107	1.0	0.75	0.95	0.91	0.85	0.35	0.44	0.38	0.44	0.46	0.44	0.35	0.03	0.04	0.51	0.47	0.46	0.98	0.72	0.61
Gb_40686	0.49	0.81	1.0	0.59	0.73	0.44	0.49	0.44	0.3	0.29	0.3	0.26	0.35	0.32	0.33	0.32	0.4	0.67	0.77	0.59
Gb_40771	0.18	0.54	0.29	0.05	0.35	0.24	0.08	0.64	0.62	0.7	0.6	0.35	0.39	0.28	0.81	0.74	0.45	0.86	1.0	0.76
Gb_40856	0.33	0.31	0.43	0.4	0.82	0.66	0.18	0.49	0.34	0.43	0.33	0.45	0.68	0.79	0.4	0.29	0.42	0.93	0.47	1.0
Gb_41189	0.46	1.0	0.77	0.34	0.78	0.19	0.44	0.58	0.4	0.33	0.72	0.51	0.47	0.43	0.76	0.61	0.33	0.59	0.58	0.64
Gb_41199	0.17	0.08	0.15	0.19	0.37	0.28	0.19	0.54	0.41	0.44	0.8	0.56	0.32	0.26	0.79	0.5	0.56	1.0	0.86	0.58
Gb_41456	0.62	0.6	0.77	0.72	0.98	0.6	0.38	0.66	0.45	0.41	0.9	0.53	0.22	0.19	0.87	0.53	0.78	0.92	0.55	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)