Heatmap: Cluster_193 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G04160 (XIB)
-0.89 0.11 -1.6 -0.51 -0.48 0.77 -0.22 1.18 1.78 1.15 1.69 -5.72 2.14 -0.37 0.43 -1.16 -0.54 -1.12 0.97 -0.11 -0.49 -0.1 0.47 -0.62 -3.77 -0.56 -1.44 0.45 -0.21 -4.84 -0.44 -0.21 -1.26 -1.01 -0.28 -0.17 -4.46 -1.0 -3.44 -0.87 -2.07 1.34 0.06 -0.01 0.78 -7.87 -1.8 -0.77
AT1G05630 (5PTASE13)
-0.74 0.5 -0.54 -1.34 -0.41 0.52 -1.0 2.36 2.13 0.07 0.8 -5.85 1.95 -0.14 0.29 -0.65 -0.93 -0.85 1.13 0.34 0.39 0.31 0.8 -0.66 -5.87 -0.77 -2.28 -0.29 -1.28 -8.48 -0.4 -0.61 -0.77 -1.58 -0.12 -0.1 -1.98 -0.31 -0.41 -1.13 -5.16 0.52 -0.02 -0.54 0.02 -1.89 -0.98 -1.45
1.03 1.23 0.17 -0.41 -0.44 -1.15 -0.35 -3.9 -4.76 -4.47 -3.6 0.67 -0.15 0.15 0.62 0.15 0.07 -0.53 -1.34 0.93 -0.02 0.64 0.99 -0.3 -1.15 -0.26 -0.44 0.54 0.09 -0.96 0.67 0.6 -0.46 -0.69 0.27 -0.24 0.0 -0.23 -0.07 1.17 -0.14 -0.29 -0.23 1.48 0.04 - - -0.13
AT1G08060 (MOM)
0.44 1.18 -0.48 0.08 -0.49 -0.5 -0.16 -0.97 -0.83 -1.75 -1.63 0.13 -1.77 0.67 0.6 -0.08 0.14 -0.56 -0.04 0.8 -0.07 0.08 0.39 -0.23 -0.54 -0.18 0.52 1.03 0.54 -0.66 0.85 -0.3 -0.23 -0.52 0.28 -0.32 0.35 -0.08 0.48 -1.15 1.73 -0.51 -0.53 -0.35 -0.29 -3.71 -1.55 -1.36
2.17 0.79 -0.22 0.08 0.07 -0.45 0.05 -1.65 -2.42 -3.55 -3.21 -4.19 -2.29 0.05 0.29 -0.5 -0.92 -0.44 -0.51 0.62 -0.66 -0.17 0.58 -0.72 -0.29 -0.84 -0.05 1.25 1.48 -0.42 0.43 -0.06 -0.43 0.02 0.72 -0.52 0.7 -0.26 0.26 -0.86 -0.53 -0.05 -0.43 0.02 0.11 0.41 -0.54 -0.74
-1.27 -2.77 -2.49 -1.86 -2.93 -5.28 -2.35 -6.03 -9.65 -6.81 -8.08 -2.38 -5.68 -1.56 -0.19 -0.83 -1.76 -1.37 -1.38 -1.78 -2.99 -0.67 -1.57 -1.03 -2.27 -0.68 -0.64 -0.31 -0.98 -5.25 -2.18 -2.29 1.57 0.81 -1.18 0.02 2.08 -0.06 0.97 1.42 1.62 1.78 1.13 -0.23 0.44 3.06 1.28 -0.44
AT1G26110 (DCP5)
1.82 0.46 0.37 0.04 -0.1 -1.11 0.04 -3.79 -4.55 -6.43 -6.2 -6.74 -6.31 -0.06 -0.46 -0.24 -0.14 -0.14 -1.08 0.39 0.1 -0.08 0.29 -0.46 -1.34 -0.43 -0.11 0.54 1.06 -1.47 0.26 0.05 -0.34 0.07 0.34 -0.22 0.14 -0.08 0.62 -0.48 1.8 0.16 0.21 0.66 0.39 0.2 -0.46 0.17
AT1G28490 (OSM1)
0.57 0.06 0.17 0.38 0.41 0.35 0.41 -0.35 -0.59 -1.15 -0.83 -5.37 -2.74 -0.39 1.0 -0.38 0.22 -0.22 -0.87 0.04 -0.1 -0.61 -0.27 -0.19 -1.62 -0.36 -0.34 -0.4 2.87 -1.82 -0.16 -0.16 -0.57 -0.46 -0.34 0.13 -0.04 -0.2 -0.49 -2.18 -3.03 -0.11 0.67 0.09 -0.19 0.49 0.07 -0.15
AT1G32130 (IWS1)
0.47 -0.25 -0.07 0.02 -0.18 -0.55 -0.07 -1.08 -1.37 -2.3 -2.06 -0.29 -2.56 -0.22 0.5 -0.42 -0.06 -0.27 -0.61 -0.11 -0.21 -0.45 -0.08 -0.38 -0.91 -0.41 0.81 -0.39 2.05 -0.89 -0.16 -0.03 -0.59 0.1 -0.26 -0.15 0.52 -0.15 0.89 -1.78 -0.16 0.19 0.1 -0.25 0.45 1.74 0.71 -0.53
-0.4 0.71 -0.22 0.59 -0.13 -0.36 0.37 -1.59 -2.23 -4.92 -4.22 -2.09 -4.18 0.99 0.57 0.01 0.28 0.3 -1.05 0.39 -0.24 0.14 0.5 -0.14 -1.44 0.06 0.77 0.27 1.02 -2.47 0.33 0.08 -0.22 -0.15 0.08 0.44 0.57 0.04 0.27 -1.25 -1.02 0.31 0.56 0.17 0.9 -0.14 0.52 -0.55
AT1G58250 (SAB)
1.68 1.24 -1.38 -1.36 -1.51 -3.41 -1.9 -8.56 -8.67 -7.81 -8.2 - -8.64 0.65 0.37 0.17 0.75 0.47 -0.91 0.91 0.36 0.32 0.64 -0.01 -0.86 0.05 -0.15 0.72 0.98 -1.86 0.83 0.08 -0.1 0.26 0.32 0.39 0.25 0.14 0.26 -0.73 -0.35 0.01 0.39 0.3 0.63 0.48 -2.06 -0.24
AT1G67140 (SWEETIE)
0.81 0.98 0.07 0.5 0.18 0.19 0.18 -1.42 -2.27 -4.0 -4.22 -1.64 -2.6 0.53 0.55 -0.23 0.43 0.18 -1.25 0.68 -0.04 0.23 0.69 -0.22 -1.83 -0.13 -0.49 0.59 0.7 -2.6 0.42 -0.04 -0.51 -0.08 0.13 0.37 0.14 -0.07 0.05 -1.99 -1.36 -0.11 0.89 0.78 0.78 0.79 -4.04 0.12
AT1G73960 (TAF2)
0.36 1.07 -0.84 -0.25 -0.57 -1.04 -0.43 -2.77 -2.8 -3.92 -3.61 -5.82 -2.7 0.51 0.2 0.18 0.19 -0.35 -0.69 0.9 -0.13 0.58 0.72 -0.19 0.29 -0.02 0.51 0.79 0.71 -0.01 0.69 0.25 -0.14 -0.12 0.42 0.15 0.85 0.03 0.7 0.04 0.19 -0.21 -0.4 0.15 -0.08 -1.3 0.42 -0.88
0.7 0.33 -1.05 -0.69 -1.52 -4.07 -0.79 -7.06 -5.28 -7.14 -6.4 -7.52 -5.78 1.82 0.17 0.45 0.44 -0.88 1.03 -0.11 0.09 -0.9 -0.58 -0.64 -0.83 -0.47 2.15 -0.21 1.41 -1.59 -0.34 -0.17 -1.09 -0.12 -0.72 -0.36 0.82 -0.27 1.02 -1.91 0.7 1.19 0.34 0.23 -0.12 0.68 -0.5 -0.63
AT2G03890 (UBDK GAMMA 7)
-0.54 1.03 -0.47 -0.0 -0.36 -0.15 0.16 -2.77 -3.56 -6.16 -5.78 -7.72 -7.21 0.24 0.24 -0.15 -0.12 -0.17 -1.24 1.02 0.37 -0.38 -0.19 0.44 -1.6 0.81 0.06 -0.02 0.22 -2.11 0.47 -0.27 0.21 1.26 -0.33 0.42 1.78 0.7 1.03 -1.57 -1.85 -0.28 0.47 -0.16 0.06 1.42 -15.38 -0.55
AT2G16920 (PFU2)
0.96 0.07 0.52 0.66 0.29 -0.17 0.67 0.08 -0.24 -1.44 -1.12 -12.22 -2.39 0.05 0.77 -0.48 -0.4 -0.33 -0.08 -0.05 -0.41 -0.35 0.15 -0.6 -1.15 -0.64 0.18 0.12 1.84 -1.64 0.15 0.27 -0.34 0.14 -0.02 -0.16 -0.13 -0.33 -0.16 -2.11 -1.63 0.72 0.48 0.24 1.01 -0.06 -1.22 0.03
1.52 1.33 -0.83 -2.12 -0.75 -3.91 -1.87 - - - - -4.43 - 0.81 0.8 0.56 -0.2 -0.72 -1.39 1.34 1.08 1.52 1.59 0.02 -0.51 0.05 -1.28 0.76 0.13 -1.19 1.38 0.96 -0.58 -0.91 0.75 -0.19 0.51 -0.13 -0.75 -0.33 -1.56 -1.83 -1.69 1.25 0.15 - - -0.61
2.82 -5.14 -5.1 -5.68 -4.43 - - -8.21 - - - -8.25 -3.18 -3.2 -4.27 -1.68 -5.2 - -5.27 -4.03 -6.44 -4.7 -4.32 -4.25 -4.56 -3.03 -2.81 -5.55 -3.16 -6.44 -5.95 0.48 0.28 1.22 -2.6 -2.23 0.66 -1.29 1.68 3.1 2.13 3.39 1.5 -2.14 1.13 - - -1.43
AT2G27210 (BSL3)
-0.61 0.2 0.11 -0.06 -0.49 -0.91 -0.27 -0.06 0.17 -0.58 -0.37 -3.04 -2.24 -0.03 -0.4 -0.56 -0.1 -0.28 -0.19 0.33 1.64 -0.2 0.21 -0.64 -0.65 -0.43 0.65 0.75 -0.16 -1.81 -0.12 0.14 -0.18 0.09 0.1 -0.04 0.6 -0.25 0.17 -2.0 0.89 0.05 0.3 0.35 0.54 1.26 -1.09 -0.2
1.88 0.75 0.18 -0.87 -1.38 -2.33 -2.01 1.47 1.9 -0.79 0.99 -7.27 -5.24 0.04 0.6 -0.65 -0.18 0.23 0.44 0.55 -1.67 0.05 0.71 0.09 -3.28 -0.2 0.17 0.21 1.2 -7.52 0.94 0.05 -1.22 -0.92 -0.14 0.86 -1.24 -0.22 -2.69 -3.22 -4.4 0.42 0.41 -1.04 0.17 -2.47 -13.55 -0.61
AT2G28910 (CXIP4)
-1.38 -0.93 -1.34 -1.43 -1.16 -1.35 -1.22 -2.34 -1.81 -1.82 -1.56 -0.46 -2.51 -0.6 -0.24 -0.27 -0.22 -0.4 -1.0 0.02 -0.75 -0.43 -0.23 -0.39 -1.21 -0.04 0.43 -0.65 3.07 -1.36 -1.22 -0.45 -0.61 0.19 -0.28 0.76 1.69 -0.07 1.37 0.5 0.94 -0.14 -0.61 -0.43 -0.39 0.69 0.9 -1.62
2.09 0.71 1.25 1.39 1.34 0.72 1.16 -5.29 -4.92 -5.27 -4.99 - - 0.64 -0.28 0.18 -0.49 -1.14 -1.2 0.98 -0.6 0.1 0.58 0.28 -3.45 0.5 -2.39 0.54 -0.15 -4.54 -0.18 -0.47 -0.2 -0.43 0.26 0.34 0.71 0.06 -0.25 -1.12 -5.49 0.43 -0.62 -0.38 -0.45 -0.84 -0.54 -0.88
AT2G32700 (LUH)
1.54 0.63 0.99 1.06 0.97 0.5 0.98 -2.13 -3.41 -5.06 -4.68 -11.2 -4.01 0.41 0.09 -0.19 0.36 0.11 -1.06 0.2 0.08 -0.33 -0.21 -0.39 -1.57 -0.32 0.33 -0.27 0.49 -2.08 -0.04 -0.47 -0.35 -0.07 -0.69 -0.17 0.1 -0.06 0.6 -0.86 0.37 0.32 0.46 -0.24 0.31 0.98 -2.11 -0.34
AT2G38440 (ITB1)
1.89 1.04 -2.34 -2.83 -2.76 -3.54 -2.9 -4.34 -5.5 -9.82 -7.23 -11.73 -6.9 0.86 0.74 0.17 0.76 0.37 -1.34 0.77 0.23 0.35 0.66 0.04 -1.18 0.19 -0.09 0.88 0.19 -1.64 0.33 0.14 0.14 0.3 0.34 0.12 0.34 0.21 0.27 -1.7 -0.94 0.21 0.76 0.66 0.76 1.02 -1.79 -0.1
AT2G42620 (PPS)
0.0 1.29 -3.43 -3.67 -3.02 -3.46 -3.19 - -6.17 - -8.45 - - 0.33 1.41 0.2 2.01 1.07 -0.43 1.32 1.08 -0.05 -0.42 0.05 -1.48 0.06 -0.46 -0.4 0.99 -1.62 1.13 -0.61 0.56 0.58 0.33 -0.63 0.78 -0.06 1.24 -2.17 0.52 0.02 -0.16 -1.43 -1.07 1.0 -2.96 -1.96
AT2G45080 (cycp3;1)
2.62 0.01 - - - - -6.28 - - - - - - -1.75 0.48 0.29 0.62 -0.88 -2.19 1.52 -3.09 1.88 2.14 -0.19 -3.11 0.38 -5.91 1.77 0.92 -5.16 -2.43 -1.37 -1.77 -1.87 0.91 2.45 -3.04 0.63 -3.08 -6.72 - -0.56 -0.78 0.29 0.11 - -0.74 1.28
0.52 0.87 0.06 -0.15 -0.16 -0.85 -0.17 -2.73 -3.34 -4.35 -4.37 -2.96 -3.17 0.57 0.34 0.25 -0.01 -0.28 -1.06 0.73 0.02 0.65 0.9 -0.12 -0.48 0.06 0.5 0.89 0.75 -0.95 0.6 0.6 0.32 0.44 0.42 -0.23 0.47 0.14 0.65 -1.31 -0.82 0.05 -0.19 0.79 0.38 -1.28 -1.92 -0.11
AT3G01460 (MBD9)
0.2 1.12 0.49 0.49 -0.12 -1.33 0.2 -2.97 -4.02 -5.57 -5.71 -5.0 -2.86 0.77 0.21 -0.03 0.18 0.03 -0.43 0.97 0.45 0.08 0.67 -0.36 -0.8 -0.31 0.42 1.27 1.16 -1.26 0.78 0.02 -0.47 -0.47 0.95 -0.32 0.01 -0.28 -0.09 -1.16 0.17 -0.7 -0.53 0.5 0.34 0.63 -2.13 -0.45
0.5 1.51 0.38 0.82 0.13 -0.98 0.7 -6.3 -4.01 -4.63 -5.77 -1.76 -5.57 0.29 -0.04 -0.38 -0.61 0.15 -1.48 1.31 -0.11 0.76 1.26 -0.64 -3.02 -0.83 -0.79 0.25 0.01 -3.67 0.76 -0.43 -0.69 -0.06 1.68 1.19 -0.01 0.29 -0.24 -1.24 -3.7 0.04 0.85 0.82 0.68 -5.5 -5.11 -0.12
0.75 0.05 1.45 1.91 0.95 -1.31 1.56 -7.08 -7.75 -5.91 -5.05 -7.42 -2.16 -0.2 -1.07 -0.82 -0.39 -0.87 -0.9 0.02 -0.24 -0.66 -0.23 -0.38 1.18 -0.8 -0.03 0.25 1.01 1.33 0.24 0.56 -1.14 -0.99 -0.1 -0.75 0.29 -0.15 -0.11 -1.82 -2.27 -0.03 -0.31 0.7 -0.04 -0.43 -0.34 0.24
AT3G18710 (PUB29)
2.24 0.54 -3.1 -2.98 -2.71 -3.5 -3.75 -4.45 -5.63 -6.1 -7.19 -1.36 -0.9 0.96 1.21 0.81 -1.35 -0.38 -2.14 1.01 0.13 1.35 1.77 1.04 -4.68 1.5 -5.34 -2.21 -0.4 -8.44 -0.64 -2.29 -0.61 -0.27 -1.42 1.82 -2.24 -0.2 -1.46 -3.11 - 1.42 1.3 -2.31 0.11 1.73 - -1.68
AT3G18990 (VRN1)
-0.05 1.3 -0.02 -0.91 -1.14 -4.12 -1.18 -5.67 -5.66 -7.53 -6.1 -4.65 - 0.3 0.06 -0.34 0.45 0.09 -0.55 1.06 -0.24 -0.49 0.01 0.17 -1.93 -0.26 -1.17 0.84 0.42 -1.72 1.04 0.01 -0.45 0.61 0.38 0.08 0.33 0.14 0.27 -1.76 -1.72 1.82 1.43 0.83 0.72 0.76 -0.78 0.37
AT3G21630 (CERK1)
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AT3G54010 (DEI1)
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AT4G14220 (RHF1A)
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AT4G26000 (PEP)
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AT4G38600 (KAK)
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AT5G01730 (WAVE3)
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AT5G13390 (NEF1)
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AT5G47230 (ERF5)
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0.38 0.98 0.47 0.15 -0.54 -2.07 -0.43 -2.96 -3.5 -4.19 -3.94 -0.47 -3.06 0.56 -0.28 -0.55 -1.02 -0.94 -0.94 0.99 -0.53 0.57 1.24 -0.54 -0.89 -0.88 -1.61 1.7 0.2 -1.45 0.76 0.45 0.1 0.01 1.02 0.12 0.23 0.34 -0.31 0.16 -0.91 -0.55 -0.32 1.6 0.67 -0.94 -1.49 0.43
AT5G53430 (ATX5)
-0.34 0.48 -0.08 -0.74 -0.01 0.23 -0.5 -0.49 -0.87 -2.01 -2.35 -2.43 -3.95 0.23 0.94 0.11 0.27 -1.08 -0.68 0.39 0.19 0.23 -0.01 -0.63 -0.4 -0.48 0.61 1.18 1.43 -0.9 -0.1 0.51 -0.1 0.05 -0.2 -0.26 0.05 -0.49 0.15 -0.68 -0.02 0.61 0.1 0.27 -0.01 1.74 -4.07 -0.92
1.45 0.84 0.56 0.71 0.07 -0.75 0.59 -4.53 -4.88 -5.38 -5.54 - -3.33 0.51 -0.44 -0.29 -0.46 -0.5 -1.09 0.69 -0.32 0.06 0.5 -0.55 -0.02 -0.38 -0.06 0.69 -0.36 -0.6 0.5 0.24 -0.44 0.09 0.29 -0.2 0.68 0.12 0.79 -0.77 -1.52 0.26 0.21 1.32 0.79 -2.36 -0.13 0.33
-0.34 -0.28 0.11 -0.24 -0.26 -2.18 -0.18 -3.4 -0.65 -0.91 -0.21 -7.7 -2.49 -0.54 -0.53 0.15 0.15 0.37 -0.91 0.63 -0.94 -0.14 0.15 0.21 -1.55 0.68 0.98 -0.56 0.0 -2.12 -1.08 -0.66 -0.33 0.58 -0.16 1.67 1.11 0.22 1.25 -4.17 -6.28 1.76 0.55 -0.06 0.65 0.52 0.21 -0.97
AT5G65460 (KCA2)
1.3 1.01 -0.13 -0.02 -0.25 -0.53 0.08 -2.78 -3.43 -5.14 -5.4 -4.48 -3.38 0.56 0.82 -0.44 -0.02 -0.29 -1.56 0.68 -0.94 0.71 1.0 -0.33 -1.76 -0.35 -0.38 1.04 -0.23 -2.09 0.29 -0.35 0.08 -0.13 0.56 0.5 -0.3 0.19 -0.64 -1.39 -0.29 0.09 0.62 1.15 0.35 1.6 -2.59 -0.05
AT5G67530 (PUB49)
1.58 0.43 0.48 0.88 0.41 -0.01 0.82 -1.63 -2.31 -3.05 -2.6 0.32 -2.33 0.09 0.51 -0.31 -0.11 -0.41 -1.11 0.67 -0.28 -0.23 0.42 -0.26 -0.8 -0.31 -0.35 0.58 0.37 -0.89 0.35 -0.17 -0.65 -0.46 0.44 -0.17 0.31 0.06 0.15 -2.16 -1.37 -0.6 -0.03 0.56 0.19 0.97 -0.37 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.