Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00288	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00797	0.0	0.0	0.0	13.61	0.0	0.71	0.01	0.12	0.33	0.0	0.36	0.02	0.15	0.0	0.21	0.0	0.08	0.0	0.57	0.0
Gb_01284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_02347	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.13	0.0
Gb_02514	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.07	0.09
Gb_02847	0.4	0.58	0.64	1.19	0.86	0.02	0.11	0.38	0.04	0.02	0.29	0.25	0.02	0.11	0.0	0.05	0.66	0.52	0.09	0.0
Gb_03272	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_03415	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_03804	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03863	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0
Gb_04191	0.12	0.37	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.06	0.12	0.04	0.0	0.19	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_04278	0.24	0.27	0.13	4.25	0.24	0.14	3.7	0.65	0.41	1.29	1.7	0.09	0.39	0.13	2.23	1.16	0.46	0.54	0.38	0.0
Gb_04424	0.15	0.0	0.0	0.98	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.09	0.17	0.0
Gb_05451	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05571	0.02	0.38	0.1	0.75	1.04	0.64	0.01	0.28	0.01	0.08	0.02	0.45	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.25	0.44	0.02
Gb_05589	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06136	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_06943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10032	1.53	0.0	0.0	230.59	0.0	0.0	0.01	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10064	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0
Gb_10195	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10253	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10554	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11609	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_12450	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_13337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_13634	0.0	0.0	0.06	0.19	0.06	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13893	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_14325	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14515	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14615	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_15162	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15535	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16145	1.1	1.81	1.56	1.68	2.28	2.08	0.91	0.79	1.01	0.64	0.63	0.95	0.58	1.16	1.08	1.86	2.22	0.94	0.8	0.32
Gb_16590	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16869	0.02	0.11	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.09	0.08	0.0	0.0	0.0	0.08
Gb_17007	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.14	0.0	0.02	0.1	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17617	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.02
Gb_18122	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18332	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18473	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18489	141.7	19.87	95.65	282.76	350.84	58.74	116.45	165.77	63.65	93.17	61.37	144.12	59.02	57.15	53.73	52.74	119.29	212.81	17.5	47.15
Gb_18492	170.37	23.68	123.63	527.11	439.75	117.0	215.64	172.23	65.7	105.91	43.75	184.2	66.08	61.72	41.44	40.26	108.56	289.43	28.69	42.24
Gb_19340	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19473	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19656	0.07	0.11	0.05	0.78	0.19	0.41	0.0	0.11	0.17	0.05	0.09	0.06	0.05	0.05	0.29	0.0	0.0	0.36	0.22	0.88
Gb_20031	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20070	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21113	6.43	52.2	18.75	57.73	98.01	59.93	16.14	19.16	15.04	16.58	11.98	30.27	9.27	12.92	10.51	39.34	70.93	55.38	1.77	36.38
Gb_21230	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21313	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21399	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21836	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22117	0.05	0.0	0.08	0.0	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.11	0.0	0.0
Gb_23312	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24066	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Gb_24139	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24559	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_25351	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25632	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25771	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.11	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_25890	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25980	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26650	0.13	0.03	0.01	0.08	0.03	0.0	0.08	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.05	0.08	0.44
Gb_27358	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28162	2.32	5.0	3.63	4.51	10.93	0.95	0.03	2.9	3.66	2.86	1.0	8.72	0.89	1.73	1.15	4.44	9.89	7.09	0.01	0.04
Gb_28613	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29962	0.12	0.0	0.16	0.0	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.06	0.13	0.0
Gb_30932	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_31954	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32636	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32747	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32953	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.53	0.0
Gb_33033	1.4	0.63	0.34	0.02	1.13	0.89	0.9	1.01	1.68	2.86	0.0	2.08	2.59	1.54	0.0	3.57	2.0	0.04	0.69	2.65
Gb_33622	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_34352	0.03	0.0	0.03	0.13	0.08	0.0	0.03	0.03	0.04	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.06	0.05	0.0	0.13	0.03
Gb_34482	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34818	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.15	0.0
Gb_34919	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34948	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36155	0.08	0.04	0.0	0.88	0.02	0.18	0.09	0.18	0.06	0.0	0.29	0.0	0.24	0.0	0.05	0.35	0.15	0.09	0.79	0.23
Gb_36432	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0
Gb_36639	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36699	0.0	0.0	0.0	0.32	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	1.28	0.9	0.0	0.0	0.0
Gb_36762	0.04	0.0	0.37	0.0	0.11	0.21	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06
Gb_36952	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37049	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37116	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Gb_37279	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40086	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40273	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41485	0.03	0.0	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.12	0.07	0.0	0.0	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)