Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00288	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00797	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.02	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0
Gb_01284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_02347	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.67	0.0
Gb_02514	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.71	0.94
Gb_02847	0.34	0.48	0.54	1.0	0.72	0.01	0.09	0.31	0.03	0.02	0.24	0.21	0.02	0.09	0.0	0.04	0.56	0.44	0.07	0.0
Gb_03272	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_03415	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0
Gb_03804	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03863	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04191	0.32	1.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.16	0.32	0.1	0.0	0.52	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_04278	0.06	0.06	0.03	1.0	0.06	0.03	0.87	0.15	0.1	0.3	0.4	0.02	0.09	0.03	0.52	0.27	0.11	0.13	0.09	0.0
Gb_04424	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.09	0.17	0.0
Gb_05451	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05571	0.02	0.36	0.09	0.72	1.0	0.61	0.01	0.27	0.01	0.07	0.02	0.43	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.24	0.42	0.02
Gb_05589	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06136	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	1.0	0.0	0.0	0.44	0.0
Gb_06943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10032	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10064	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.01	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0
Gb_10195	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10253	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10554	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11609	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.34	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_12450	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0
Gb_13337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_13634	0.0	0.0	0.31	1.0	0.33	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13893	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0
Gb_14325	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14515	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14615	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_15162	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15535	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16145	0.48	0.79	0.69	0.74	1.0	0.91	0.4	0.35	0.44	0.28	0.28	0.42	0.25	0.51	0.48	0.82	0.98	0.41	0.35	0.14
Gb_16590	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16869	0.22	1.0	0.0	0.0	0.45	0.51	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.17	0.78	0.72	0.0	0.0	0.0	0.75
Gb_17007	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.4	0.0	0.05	0.27	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17617	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16
Gb_18122	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18332	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18473	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18489	0.4	0.06	0.27	0.81	1.0	0.17	0.33	0.47	0.18	0.27	0.17	0.41	0.17	0.16	0.15	0.15	0.34	0.61	0.05	0.13
Gb_18492	0.32	0.04	0.23	1.0	0.83	0.22	0.41	0.33	0.12	0.2	0.08	0.35	0.13	0.12	0.08	0.08	0.21	0.55	0.05	0.08
Gb_19340	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19473	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19656	0.09	0.12	0.06	0.89	0.22	0.47	0.0	0.13	0.2	0.06	0.11	0.07	0.06	0.06	0.33	0.0	0.0	0.41	0.25	1.0
Gb_20031	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20070	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21113	0.07	0.53	0.19	0.59	1.0	0.61	0.16	0.2	0.15	0.17	0.12	0.31	0.09	0.13	0.11	0.4	0.72	0.57	0.02	0.37
Gb_21230	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21313	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21399	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21836	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22117	0.51	0.0	0.78	0.0	0.65	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_23312	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24066	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_24139	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24559	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_25351	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25632	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25771	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.01	0.36	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_25890	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25980	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26650	0.3	0.06	0.03	0.19	0.06	0.0	0.18	0.06	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.12	0.05	0.0	0.1	0.19	1.0
Gb_27358	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28162	0.21	0.46	0.33	0.41	1.0	0.09	0.0	0.27	0.33	0.26	0.09	0.8	0.08	0.16	0.11	0.41	0.91	0.65	0.0	0.0
Gb_28613	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29962	0.62	0.0	0.79	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.32	0.66	0.0
Gb_30932	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0
Gb_31954	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32636	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32747	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32953	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_33033	0.39	0.18	0.1	0.01	0.32	0.25	0.25	0.28	0.47	0.8	0.0	0.58	0.73	0.43	0.0	1.0	0.56	0.01	0.19	0.74
Gb_33622	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.17	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_34352	0.26	0.0	0.26	0.98	0.58	0.0	0.22	0.24	0.28	0.58	0.0	0.0	0.0	0.1	0.45	0.42	0.36	0.0	1.0	0.24
Gb_34482	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34818	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.36	0.0
Gb_34919	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34948	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36155	0.09	0.04	0.0	1.0	0.03	0.2	0.11	0.2	0.07	0.0	0.33	0.0	0.28	0.0	0.06	0.4	0.17	0.11	0.9	0.26
Gb_36432	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_36639	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36699	0.0	0.0	0.0	0.25	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0	0.7	0.0	0.0	0.0
Gb_36762	0.1	0.0	1.0	0.0	0.31	0.57	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.16
Gb_36952	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37049	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37116	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_37279	0.42	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.78	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40086	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40273	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41485	0.23	0.0	0.22	0.0	0.48	0.0	0.0	0.03	0.13	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	1.0	0.63	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)