Heatmap: Cluster_313 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00030	0.7	0.67	0.6	0.77	0.78	0.52	0.53	0.65	0.53	0.5	0.73	0.36	0.54	0.51	0.85	0.41	0.33	0.99	1.0	0.53
Gb_01136	0.75	0.68	0.7	0.45	0.67	1.0	0.4	0.77	0.53	0.47	0.77	0.33	0.79	0.56	0.81	0.35	0.47	0.61	0.95	0.48
Gb_01676	0.72	1.0	0.52	0.57	0.91	0.4	0.38	0.53	0.34	0.33	0.57	0.25	0.61	0.64	0.47	0.31	0.26	0.74	0.65	0.33
Gb_01984	0.8	0.31	0.76	0.69	0.52	0.23	1.0	0.55	0.42	0.41	0.56	0.52	0.3	0.29	0.5	0.24	0.43	0.54	0.84	0.27
Gb_02525	0.63	0.69	0.88	0.75	0.62	0.57	0.48	0.89	0.64	0.6	0.97	0.76	0.96	0.95	1.0	0.54	0.65	0.53	0.83	0.47
Gb_03037	0.03	0.05	0.11	0.08	0.02	1.0	0.26	0.69	0.73	0.5	0.86	0.8	0.97	0.86	0.71	0.26	0.24	0.13	0.71	0.27
Gb_03383	0.63	0.64	0.59	0.29	0.28	0.13	0.24	0.89	0.62	0.57	0.86	0.66	1.0	0.63	0.96	0.33	0.15	0.11	0.32	0.19
Gb_03851	0.52	0.2	0.47	0.65	0.28	0.05	0.08	0.41	0.28	0.23	0.94	0.25	0.5	0.27	1.0	0.2	0.14	0.32	0.02	0.2
Gb_06092	0.71	0.83	0.72	0.7	1.0	0.82	0.39	0.73	0.6	0.57	0.83	0.56	0.88	0.86	0.82	0.59	0.57	0.78	0.51	0.55
Gb_06151	0.5	0.75	0.64	0.7	0.75	0.59	0.46	0.57	0.53	0.56	0.56	0.5	0.55	0.5	0.66	0.53	0.35	0.97	1.0	0.77
Gb_06200	0.62	1.0	0.82	0.88	0.79	0.64	0.42	0.74	0.51	0.42	0.8	0.41	0.79	0.6	0.86	0.85	0.37	0.42	0.56	0.28
Gb_06496	0.5	0.31	0.45	0.71	0.83	0.43	0.21	0.84	0.56	0.59	1.0	0.5	0.77	0.69	0.99	0.51	0.49	0.62	1.0	0.29
Gb_06775	0.16	0.04	0.16	0.36	0.35	0.28	1.0	0.43	0.52	0.57	0.55	0.18	0.68	0.46	0.47	0.13	0.18	0.26	0.78	0.25
Gb_07614	0.46	0.38	0.31	0.4	0.56	0.22	0.38	0.57	0.72	0.73	1.0	0.39	0.92	0.77	0.99	0.52	0.59	0.75	0.98	0.36
Gb_07859	0.58	0.83	0.55	0.6	0.88	0.53	0.51	0.7	0.51	0.45	0.52	0.3	1.0	0.76	0.54	0.4	0.3	0.53	0.71	0.49
Gb_08369	0.5	0.71	0.18	0.62	0.54	0.37	0.34	0.67	0.68	0.85	0.63	0.17	1.0	0.69	0.62	0.52	0.34	0.42	0.48	0.19
Gb_08519	0.66	0.83	0.6	0.52	0.8	0.83	0.67	0.61	0.66	0.74	0.77	0.35	0.83	0.62	0.83	0.37	0.3	0.55	1.0	0.66
Gb_08811	0.52	0.55	0.45	0.47	0.54	0.41	0.65	0.8	0.52	0.48	0.97	0.71	0.9	0.7	1.0	0.52	0.63	0.35	0.44	0.51
Gb_08919	0.14	0.21	0.18	0.16	0.53	0.21	0.14	0.58	0.45	0.57	0.98	0.2	0.29	0.21	1.0	0.3	0.19	0.48	0.26	0.39
Gb_08920	0.17	0.32	0.08	0.27	0.62	0.29	0.1	0.62	0.42	0.55	0.94	0.18	0.61	0.44	1.0	0.25	0.3	0.62	0.39	0.38
Gb_08922	0.08	0.37	0.14	0.29	0.44	0.14	0.14	0.48	0.34	0.28	0.97	0.2	0.22	0.18	1.0	0.32	0.32	0.34	0.32	0.18
Gb_08923	0.15	0.59	0.25	0.17	0.4	0.22	0.25	0.59	0.48	0.48	0.81	0.18	0.27	0.21	1.0	0.33	0.25	0.51	0.42	0.4
Gb_09304	0.44	0.44	0.49	0.69	0.41	0.51	0.27	0.58	0.4	0.45	0.95	0.31	0.31	0.34	1.0	0.64	0.51	0.47	0.54	0.2
Gb_09380	0.3	0.33	0.17	0.32	0.78	0.15	0.26	0.7	0.73	0.91	0.6	0.33	0.64	0.46	0.53	0.19	0.53	0.57	0.79	1.0
Gb_09664	0.9	0.32	0.39	0.96	1.0	0.79	0.31	0.84	0.69	0.7	0.9	0.58	0.68	0.66	0.86	0.83	0.73	0.82	0.42	0.71
Gb_09665	0.87	0.5	0.52	0.82	1.0	0.84	0.27	0.74	0.57	0.53	0.53	0.49	0.8	0.72	0.57	0.79	0.69	0.91	0.54	0.57
Gb_09692	0.33	1.0	0.28	0.6	0.67	0.44	0.14	0.62	0.46	0.45	0.8	0.37	0.71	0.56	0.77	0.25	0.34	0.51	0.67	0.55
Gb_10443	0.68	0.91	0.66	0.5	0.81	0.75	0.62	0.69	0.61	0.64	0.9	0.3	0.82	0.64	0.9	0.41	0.27	0.59	1.0	0.56
Gb_10585	0.04	0.05	0.1	0.08	0.21	0.03	0.12	0.4	0.32	0.24	0.96	0.36	0.31	0.18	1.0	0.1	0.29	0.07	0.11	0.1
Gb_10931	0.54	0.65	0.5	0.24	0.79	0.43	0.23	0.81	0.56	0.51	1.0	0.54	0.87	0.59	0.95	0.77	0.59	0.91	0.65	0.47
Gb_13166	0.81	0.79	0.5	0.98	1.0	0.69	0.36	0.63	0.51	0.46	0.56	0.47	0.77	0.64	0.45	0.46	0.26	0.6	0.56	0.5
Gb_15247	0.33	0.16	0.2	0.43	0.54	0.15	0.29	0.39	0.47	0.38	1.0	0.14	0.77	0.73	0.95	0.23	0.2	0.19	0.68	0.05
Gb_18068	0.51	0.46	0.39	0.28	0.69	0.43	0.23	0.71	0.78	1.0	0.5	0.67	0.98	0.97	0.54	0.45	0.75	0.64	0.57	0.71
Gb_18789	0.09	0.17	0.17	0.19	0.4	0.5	0.46	0.62	0.57	0.51	0.72	0.56	0.53	0.45	0.77	0.47	0.6	0.45	0.69	1.0
Gb_19669	0.68	0.46	0.65	0.46	0.53	0.19	0.31	0.47	0.4	0.31	0.79	0.39	0.21	0.25	0.65	0.6	0.38	0.72	1.0	0.66
Gb_20587	0.7	0.62	0.72	1.0	0.73	0.56	0.44	0.67	0.43	0.36	0.95	0.47	0.53	0.44	0.93	0.41	0.29	0.35	0.47	0.2
Gb_21766	0.36	0.33	0.46	0.29	0.32	0.38	0.52	0.71	0.49	0.49	1.0	0.64	0.86	0.89	0.94	0.39	0.41	0.17	0.11	0.86
Gb_21825	0.48	0.76	0.57	0.44	0.59	0.43	0.41	0.63	0.34	0.26	0.51	0.17	1.0	0.5	0.48	0.14	0.12	0.64	0.94	0.46
Gb_22763	0.49	1.0	0.58	0.58	0.75	0.42	0.43	0.55	0.49	0.48	0.49	0.47	0.67	0.54	0.58	0.18	0.24	0.89	0.88	0.5
Gb_23995	0.35	0.71	0.47	0.46	0.66	0.39	0.17	0.69	0.79	0.63	0.95	0.53	0.73	0.62	1.0	0.45	0.33	0.45	0.62	0.39
Gb_24605	0.55	0.82	0.49	0.56	0.8	0.52	0.75	0.82	0.68	0.62	1.0	0.51	0.58	0.49	0.94	0.5	0.38	0.66	1.0	0.83
Gb_26852	0.47	0.66	0.69	0.4	0.6	0.49	1.0	0.54	0.51	0.49	0.63	0.3	0.38	0.4	0.68	0.24	0.21	0.55	0.88	0.38
Gb_28379	0.55	0.28	0.27	1.0	0.53	0.1	0.46	0.27	0.15	0.11	0.07	0.26	0.25	0.26	0.07	0.06	0.07	0.37	0.22	0.05
Gb_28924	0.51	0.72	0.87	0.61	1.0	0.29	0.6	0.62	0.58	0.6	0.79	0.69	0.68	0.68	0.85	0.45	0.42	0.38	0.72	0.45
Gb_29409	0.52	0.29	0.63	0.35	0.51	0.54	1.0	0.6	0.43	0.31	0.25	0.63	0.72	0.77	0.34	0.38	0.48	0.63	0.61	0.07
Gb_29436	0.57	0.54	0.5	0.72	0.71	0.6	0.41	0.72	0.52	0.47	0.63	0.57	1.0	0.76	0.67	0.42	0.44	0.6	0.45	0.4
Gb_30941	0.9	0.88	1.0	0.71	1.0	0.69	0.64	0.78	0.58	0.52	0.44	0.59	0.87	0.7	0.52	0.49	0.48	0.99	0.63	0.4
Gb_31915	0.75	0.54	0.63	0.53	0.65	0.6	0.71	0.79	0.56	0.56	0.85	0.57	0.85	0.69	0.93	0.34	0.57	0.53	1.0	0.53
Gb_32100	0.74	0.99	0.75	0.64	1.0	0.74	0.56	0.65	0.57	0.5	0.57	0.47	0.84	0.79	0.62	0.44	0.33	0.85	0.92	0.74
Gb_32161	0.56	0.72	0.6	0.55	0.89	0.86	1.0	0.71	0.65	0.62	0.91	0.4	0.58	0.65	0.85	0.67	0.5	0.62	0.89	0.38
Gb_32471	0.56	0.58	0.43	0.5	0.85	0.83	0.53	0.82	0.51	0.54	0.89	0.44	0.98	0.76	0.9	0.39	0.58	0.58	1.0	0.42
Gb_33291	0.89	0.28	0.8	0.55	0.54	0.4	0.69	0.77	0.32	0.39	0.33	0.71	0.51	0.46	0.22	0.43	0.43	1.0	0.84	0.59
Gb_33509	0.91	0.54	0.78	0.9	0.63	0.78	0.54	0.85	0.59	0.46	1.0	0.55	0.66	0.51	0.86	0.67	0.76	0.57	0.88	0.55
Gb_33960	0.85	1.0	0.97	0.75	0.73	0.6	0.77	0.66	0.58	0.49	0.43	0.53	0.94	0.95	0.46	0.48	0.4	0.73	0.6	0.72
Gb_34031	1.0	0.7	0.57	0.65	0.7	0.2	0.77	0.34	0.22	0.16	0.07	0.22	0.24	0.26	0.07	0.13	0.19	0.52	0.34	0.05
Gb_34685	0.82	0.32	0.42	0.84	1.0	0.56	0.3	0.71	0.68	0.61	0.88	0.57	0.63	0.59	0.73	0.94	0.81	0.8	0.27	0.66
Gb_35009	0.77	0.58	0.75	0.44	0.73	0.82	0.57	0.78	0.57	0.53	0.87	0.54	0.78	0.63	0.91	0.47	0.46	0.9	1.0	0.83
Gb_36707	0.42	0.41	0.45	0.44	0.42	0.8	0.6	0.85	0.67	0.66	0.86	0.67	0.95	0.86	0.89	0.49	0.56	0.57	1.0	0.82
Gb_36948	0.53	1.0	0.8	0.73	0.69	0.69	0.92	0.85	0.53	0.66	0.77	0.56	0.73	0.54	0.94	0.58	0.46	0.48	0.93	0.56
Gb_37033	0.4	0.5	0.36	0.43	0.53	0.61	0.56	0.66	0.54	0.51	0.75	0.44	1.0	0.85	0.74	0.26	0.29	0.51	0.76	0.53
Gb_39368	0.65	0.4	0.8	0.64	0.8	0.51	0.5	1.0	1.0	0.95	0.91	0.57	0.72	0.81	0.85	0.45	0.42	0.93	0.85	0.52
Gb_39455	0.48	1.0	0.59	0.27	0.66	0.46	0.16	0.88	0.37	0.41	0.81	0.37	0.54	0.43	0.87	0.56	0.37	0.89	0.8	0.46
Gb_41429	1.0	0.61	0.84	0.38	0.72	0.28	0.44	0.68	0.58	0.57	0.63	0.38	0.98	0.91	0.75	0.61	0.75	1.0	0.98	0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)