Heatmap: Cluster_157 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.01 0.0 0.01 0.08 0.08 0.9 0.06 0.03 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.08 0.12 0.05 1.0
0.2 0.19 0.2 0.12 0.22 0.97 0.17 0.4 0.18 0.22 0.25 0.34 0.2 0.12 0.2 0.09 0.27 0.33 0.19 1.0
0.21 0.36 0.12 0.26 0.27 1.0 0.18 0.28 0.14 0.13 0.19 0.15 0.45 0.42 0.22 0.1 0.1 0.18 0.17 0.11
0.02 0.0 0.0 0.05 0.1 0.62 0.1 0.43 0.15 0.29 0.52 0.07 0.47 0.23 0.75 0.04 0.12 0.13 0.03 1.0
0.27 0.16 0.22 0.07 0.06 0.45 0.19 0.23 0.12 0.12 0.14 0.28 0.18 0.2 0.11 0.05 0.11 0.12 0.07 1.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.03 0.15
0.03 0.01 0.09 0.03 0.02 1.0 0.0 0.27 0.13 0.32 0.13 0.48 0.34 0.11 0.13 0.03 0.02 0.88 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.05 0.01 0.41
0.02 0.09 0.03 0.18 0.16 1.0 0.19 0.68 0.38 0.35 0.41 0.48 0.34 0.37 0.46 0.16 0.21 0.15 0.61 0.2
0.05 0.19 0.24 0.11 0.26 1.0 0.56 0.65 0.54 0.72 0.41 1.0 0.17 0.1 0.48 0.18 0.08 0.23 0.07 0.19
0.02 0.01 0.04 0.08 0.08 1.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.21 0.31 0.09 0.52
0.38 0.3 0.49 0.12 0.07 1.0 0.27 0.16 0.32 0.44 0.28 0.41 0.19 0.18 0.2 0.36 0.22 0.03 0.09 0.37
0.22 0.19 0.14 0.2 0.33 1.0 0.13 0.17 0.14 0.14 0.49 0.12 0.13 0.16 0.46 0.27 0.28 0.38 0.07 0.46
0.24 0.25 0.27 0.19 0.23 1.0 0.13 0.19 0.14 0.15 0.4 0.09 0.08 0.08 0.37 0.27 0.33 0.33 0.13 0.28
0.59 0.08 0.13 0.25 0.26 1.0 0.07 0.37 0.28 0.2 0.17 0.18 0.27 0.22 0.19 0.12 0.21 0.33 0.13 0.7
0.46 0.16 0.47 0.38 0.58 1.0 0.08 0.34 0.14 0.18 0.13 0.27 0.19 0.13 0.13 0.15 0.45 0.33 0.24 0.68
0.01 0.0 0.01 0.03 0.06 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.19 0.07 0.35
0.21 0.12 0.11 0.21 0.17 1.0 0.13 0.39 0.13 0.12 0.25 0.14 0.33 0.26 0.31 0.16 0.23 0.26 0.32 0.18
0.01 0.04 0.02 0.03 0.13 0.99 0.5 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.15 0.22 0.25 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.57 1.0 0.54 0.88 0.56 0.61 0.33 0.66 0.44 0.38 0.74 0.35 0.96 0.82 0.76 0.47 0.47 0.49 0.68 0.47
0.01 0.02 0.02 0.07 0.11 0.95 0.04 0.17 0.17 0.22 0.16 0.1 0.07 0.07 0.13 0.23 0.31 0.4 0.07 1.0
0.77 0.37 0.31 0.55 0.62 0.57 0.24 0.59 0.55 0.48 1.0 0.33 0.43 0.37 0.68 0.55 0.25 0.64 0.4 0.36
0.7 0.89 0.73 0.68 0.46 0.72 0.35 0.64 0.48 0.52 0.97 0.34 0.43 0.3 1.0 0.53 0.3 0.57 0.51 0.28
0.04 0.05 0.02 0.07 0.12 1.0 0.04 0.4 0.28 0.39 0.18 0.27 0.18 0.15 0.16 0.18 0.38 0.17 0.08 0.03
0.02 0.0 0.01 0.14 0.11 1.0 0.02 0.47 0.19 0.22 0.1 0.22 0.54 0.45 0.15 0.05 0.09 0.04 0.05 0.05
0.24 0.13 0.19 0.27 0.29 1.0 0.11 0.36 0.25 0.26 0.5 0.17 0.29 0.33 0.53 0.27 0.24 0.53 0.28 0.59
0.03 0.05 0.05 0.07 0.13 0.22 0.21 0.4 0.16 0.12 0.28 0.21 0.16 0.06 0.29 0.11 0.15 0.26 0.22 1.0
0.2 0.18 0.22 0.23 0.35 1.0 0.18 0.42 0.18 0.22 0.17 0.46 0.46 0.56 0.16 0.11 0.44 0.26 0.31 0.38
0.01 0.0 0.01 0.11 0.16 0.83 0.01 0.14 0.06 0.06 0.18 0.07 0.07 0.07 0.42 0.04 0.07 0.22 0.16 1.0
0.2 0.0 0.0 0.14 0.04 1.0 0.05 0.12 0.05 0.03 0.01 0.08 0.07 0.21 0.01 0.02 0.3 0.04 0.0 0.68
0.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.13 0.15 0.16 0.15 0.18 0.13 0.13 0.13 0.12 0.17 0.33 0.25 0.19 0.11 1.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.09 0.12 0.23 0.27 0.07 0.16 0.05 0.1 0.1 0.46 0.36 0.16 0.15 1.0
0.45 0.26 0.44 0.27 0.33 0.81 0.13 0.42 0.18 0.16 0.21 0.27 0.4 0.35 0.15 0.09 0.12 0.4 0.16 1.0
0.02 0.01 0.01 0.09 0.09 1.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.1 0.05 0.09
0.38 0.26 0.25 0.33 0.21 1.0 0.18 0.42 0.2 0.21 0.27 0.15 0.23 0.12 0.23 0.15 0.25 0.13 0.1 0.57
0.07 0.03 0.04 0.08 0.11 1.0 0.01 0.19 0.23 0.23 0.2 0.18 0.17 0.18 0.2 0.6 0.42 0.24 0.19 0.27
0.07 0.04 0.08 0.06 0.08 1.0 0.23 0.31 0.06 0.07 0.15 0.08 0.3 0.2 0.11 0.01 0.03 0.12 0.15 0.03
0.06 0.03 0.14 0.03 0.03 1.0 0.0 0.3 0.19 0.37 0.08 0.43 0.76 0.29 0.16 0.01 0.01 0.98 0.0 0.02
0.03 0.01 0.02 0.1 0.15 1.0 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.22 0.05 0.13
0.05 0.03 0.02 0.18 0.19 1.0 0.13 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.29 0.05 0.16
0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 1.0 0.0 0.16 0.02 0.03 0.11 0.16 0.25 0.27 0.1 0.01 0.09 0.02 0.01 0.01
0.34 0.16 0.2 0.23 0.4 1.0 0.09 0.33 0.11 0.11 0.23 0.36 0.27 0.28 0.24 0.16 0.39 0.22 0.1 0.25
0.09 0.05 0.06 0.11 0.12 1.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.16 0.03 0.11
0.05 0.01 0.05 0.59 0.31 1.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.58 0.59 0.39
0.97 0.75 0.43 0.53 0.5 1.0 0.3 0.67 0.49 0.47 0.59 0.45 0.64 0.49 0.47 0.45 0.4 0.49 0.17 0.87
0.09 0.1 0.07 0.15 0.24 1.0 0.2 0.25 0.12 0.16 0.19 0.21 0.32 0.26 0.21 0.16 0.27 0.59 0.29 0.46
0.0 0.01 0.03 0.05 0.12 1.0 0.02 0.1 0.05 0.05 0.25 0.04 0.02 0.04 0.57 0.06 0.28 0.18 0.13 0.75
0.45 0.26 0.28 0.31 0.28 1.0 0.27 0.32 0.27 0.25 0.51 0.22 0.32 0.4 0.51 0.29 0.28 0.25 0.19 0.94
0.51 0.42 0.44 0.35 0.36 1.0 0.25 0.37 0.31 0.31 0.54 0.36 0.4 0.52 0.45 0.27 0.34 0.27 0.41 0.66
0.51 0.28 0.36 0.43 0.41 1.0 0.26 0.32 0.33 0.33 0.48 0.3 0.35 0.42 0.44 0.3 0.35 0.3 0.35 0.71
0.5 0.25 0.32 0.48 0.46 1.0 0.36 0.36 0.35 0.34 0.52 0.37 0.45 0.73 0.45 0.38 0.43 0.35 0.31 0.91
0.01 0.0 0.01 0.06 0.28 0.29 0.13 0.08 0.04 0.05 0.02 0.12 0.02 0.02 0.04 0.19 0.21 1.0 0.05 0.24
0.27 0.12 0.13 0.44 0.38 1.0 0.09 0.53 0.24 0.26 0.23 0.4 0.59 0.61 0.2 0.18 0.32 0.55 0.11 0.72
0.01 0.06 0.09 0.46 0.17 1.0 0.01 0.14 0.03 0.02 0.03 0.05 0.03 0.01 0.05 0.19 0.25 0.86 0.15 0.58
0.05 0.31 0.1 0.13 0.12 1.0 0.07 0.57 0.36 0.29 0.19 0.92 0.14 0.14 0.18 0.2 0.17 0.06 0.11 0.15
0.03 0.02 0.01 0.09 0.49 0.91 0.0 0.57 0.25 0.21 0.26 1.0 0.18 0.22 0.17 0.23 0.36 0.08 0.17 0.28
0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 1.0 0.01 0.06 0.01 0.01 0.01 0.06 0.08 0.12 0.02 0.14 0.09 0.04 0.0 0.08
0.11 0.03 0.04 0.13 0.16 1.0 0.19 0.06 0.01 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.0 0.04 0.1 0.24 0.09 0.29
0.21 0.12 0.11 0.24 0.24 0.88 0.01 1.0 0.56 0.61 0.49 0.51 0.6 0.41 0.46 0.41 0.55 0.4 0.24 0.31
0.09 0.13 0.16 0.17 0.23 1.0 0.07 0.45 0.26 0.29 0.31 0.39 0.42 0.44 0.25 0.19 0.45 0.32 0.14 0.76
0.14 0.12 0.14 0.16 0.33 1.0 0.3 0.48 0.27 0.34 0.43 0.27 0.37 0.32 0.42 0.18 0.38 0.27 0.17 0.59
0.13 0.05 0.1 0.19 0.41 1.0 0.41 0.44 0.27 0.32 0.5 0.26 0.26 0.26 0.51 0.24 0.42 0.27 0.17 0.73
0.28 0.29 0.19 0.36 0.49 1.0 0.17 0.5 0.33 0.31 0.39 0.31 0.5 0.39 0.39 0.35 0.37 0.56 0.13 0.34
0.33 0.0 0.12 0.26 0.44 1.0 0.3 0.5 0.11 0.1 0.12 0.25 0.54 0.52 0.19 0.1 0.1 0.37 0.32 0.19
0.16 0.18 0.12 0.23 0.33 1.0 0.07 0.2 0.07 0.1 0.09 0.29 0.11 0.15 0.07 0.12 0.24 0.39 0.15 0.39
0.27 0.21 0.14 0.35 0.38 1.0 0.1 0.36 0.15 0.19 0.18 0.45 0.2 0.26 0.16 0.2 0.4 0.43 0.12 0.52
0.22 0.53 0.25 0.12 0.26 1.0 0.13 0.11 0.07 0.06 0.08 0.1 0.03 0.04 0.07 0.1 0.13 0.3 0.14 0.41
0.1 0.11 0.31 0.14 0.25 1.0 0.1 0.4 0.19 0.21 0.23 0.35 0.33 0.29 0.16 0.07 0.19 0.14 0.02 0.17
0.14 0.04 0.04 0.12 0.03 1.0 0.02 0.3 0.08 0.15 0.05 0.29 0.16 0.32 0.0 0.08 0.56 0.07 0.01 0.28
0.37 0.2 0.19 0.39 0.37 1.0 0.18 0.36 0.18 0.18 0.25 0.37 0.29 0.31 0.24 0.17 0.33 0.36 0.18 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)