Heatmap: Cluster_192 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.36 0.51 1.05 0.51 0.28 2.11 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.04 0.06
1.38 5.53 2.55 2.34 1.57 26.98 0.16 2.25 4.48 4.04 0.88 0.91 8.54 4.91 0.87 0.99 1.23 1.43 0.09 1.52
1.59 3.09 1.65 1.23 1.13 14.79 1.33 0.52 0.12 0.18 0.22 0.13 0.56 0.64 0.12 0.0 0.02 0.04 0.0 1.95
2.94 0.17 0.55 0.0 0.0 1.58 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 2.57 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 2.57
0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 3.0
9.67 1.81 5.31 7.03 4.46 95.79 0.11 2.83 0.55 0.75 0.47 2.67 0.1 0.47 0.03 0.53 7.06 6.82 4.25 0.32
17.85 7.85 15.69 2.41 11.39 172.54 1.95 41.79 4.28 5.55 8.84 20.51 7.37 5.68 7.31 1.08 2.91 28.79 11.92 215.29
0.42 0.74 0.72 0.07 0.82 6.12 0.3 1.31 1.16 1.3 0.45 0.88 0.41 0.47 0.32 0.27 0.14 0.45 0.29 4.51
12.5 18.24 9.36 5.78 8.92 410.79 1.56 12.76 2.33 7.13 1.4 4.24 0.28 0.42 2.17 1.11 14.2 53.96 8.9 21.56
0.09 1.31 0.0 0.0 0.07 10.78 10.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.08 0.21 0.02 0.0 0.05 0.05 0.01 0.09 0.13 0.07 0.34 0.01 0.04 0.06 0.34 0.16 0.06 0.11 0.12 0.31
1.63 4.53 1.4 1.16 1.74 9.82 5.3 3.06 0.67 1.02 1.31 1.62 0.4 0.46 0.34 0.56 0.39 0.31 0.51 1.19
24.59 5.95 0.0 0.08 9.48 17.04 35.84 0.25 0.09 0.19 0.27 0.17 0.2 0.17 0.04 0.0 0.08 0.22 0.35 6.21
24.49 14.1 0.07 0.0 10.51 26.73 70.46 0.46 0.44 0.34 0.15 0.1 0.37 0.41 0.07 0.1 0.0 0.81 0.2 8.38
8.34 0.87 0.32 0.09 1.08 61.9 16.72 0.35 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 5.17
29.15 6.01 0.46 0.0 2.05 56.93 0.12 0.29 0.08 0.0 0.0 0.13 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 1.23
10.75 0.88 0.0 0.09 0.32 9.22 21.88 0.22 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.98
27.49 8.27 15.85 5.79 1.95 53.29 0.38 16.29 1.16 0.62 0.27 10.02 4.81 9.98 0.11 5.95 2.01 11.16 0.4 8.38
15.14 4.96 7.34 2.19 2.23 6.86 4.99 2.05 0.83 0.63 0.46 3.55 1.01 1.24 0.38 1.68 1.09 7.23 3.1 6.69
1.36 0.51 1.05 0.51 0.28 2.11 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.04 0.06
1.22 1.94 0.74 0.74 0.25 10.64 0.56 1.24 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.25 0.01 0.28
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.18 0.04 0.12 0.47 0.09 0.11 0.15 0.18 0.06 0.03 0.0 0.0 1.66
0.2 0.23 0.03 0.0 0.0 0.65 0.01 0.35 0.05 0.1 0.81 0.22 0.27 0.23 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 2.6
0.52 0.04 0.04 0.06 0.14 1.01 0.01 0.57 0.19 0.31 1.49 0.36 0.37 0.53 0.38 0.0 0.02 0.09 0.03 5.64
0.71 0.0 0.45 0.04 0.28 0.18 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.06 0.23
1.0 0.2 0.29 0.0 0.35 0.74 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.32 0.06 0.53
6.69 6.67 5.61 16.37 9.17 33.21 0.15 2.76 0.44 0.24 0.22 2.13 0.08 0.14 0.09 4.18 8.41 18.74 2.42 12.54
0.44 0.04 0.06 0.0 0.04 0.0 1.2 0.08 0.01 0.0 0.03 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.41
0.23 0.09 0.09 0.17 0.04 0.44 0.0 0.26 0.12 0.09 0.01 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.34 0.32 0.03 0.68
0.13 0.0 0.0 0.0 0.06 0.86 0.0 0.08 0.01 0.02 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.23
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.0 0.03 0.1 0.05 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.55
0.24 0.18 0.05 0.0 0.43 2.22 0.06 0.07 0.0 0.01 0.06 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 1.33
2.96 1.37 1.27 1.68 1.89 1.95 0.01 0.66 0.2 0.21 0.02 0.22 0.0 0.09 0.0 0.15 0.88 1.41 0.5 2.28
4.67 0.42 0.48 0.0 0.0 1.11 0.41 0.2 0.0 0.11 0.0 0.81 0.0 0.89 0.0 0.15 0.0 0.18 0.0 3.89
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06
0.12 0.41 0.16 0.06 0.0 1.04 0.67 0.23 0.14 0.11 0.37 0.55 0.16 0.27 0.37 0.09 0.14 0.09 0.29 1.25
1.99 1.01 1.63 1.05 1.09 11.26 0.7 5.27 0.45 0.7 1.63 1.75 2.08 1.35 0.98 0.66 0.99 0.93 0.71 4.48
258.61 621.28 814.36 355.38 63.95 280.98 92.4 29.88 0.21 1.71 0.58 20.99 3.41 3.46 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 111.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
1.36 0.51 1.05 0.51 0.28 2.11 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.04 0.06
0.18 0.16 0.0 0.0 0.07 0.24 0.0 0.02 0.12 0.04 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.05
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.03 0.02 0.05 0.13 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.05 0.08 0.0
12.04 75.98 3.54 1.95 12.61 148.43 12.02 10.2 15.99 26.07 4.92 89.93 4.31 8.59 1.74 1.28 1.52 1.04 0.0 7.05
0.16 0.31 0.0 0.3 0.89 4.03 0.04 0.12 0.06 0.09 0.06 1.02 0.0 0.11 0.05 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0
23.51 60.18 18.87 23.67 30.08 27.3 29.68 38.91 27.6 27.27 22.66 27.56 31.56 32.15 25.09 29.03 22.25 16.89 23.52 27.5
5.25 0.4 2.12 2.8 1.48 31.88 3.45 13.27 1.3 1.24 1.52 12.7 2.07 3.37 0.62 0.16 2.56 0.56 0.9 12.01
0.82 1.29 1.44 1.61 1.5 0.92 1.02 1.08 0.22 0.14 0.69 0.36 0.89 0.48 0.25 0.0 0.0 0.15 0.54 0.29
0.7 0.47 0.16 0.11 0.06 0.48 0.05 0.74 0.62 0.64 0.43 0.41 1.16 0.75 0.34 0.0 0.0 0.05 0.01 4.23
0.45 0.18 0.26 0.05 0.65 17.65 0.18 3.03 0.6 0.56 0.78 0.69 0.74 0.68 0.69 0.35 0.53 0.42 0.52 13.84
0.45 0.18 0.26 0.05 0.65 17.65 0.18 3.03 0.6 0.56 0.78 0.69 0.74 0.68 0.69 0.35 0.53 0.42 0.52 13.84

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)