Heatmap: Cluster_209 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00296	1.0	0.64	0.97	0.94	0.71	0.41	0.28	0.5	0.49	0.49	0.64	0.42	0.41	0.36	0.71	0.48	0.42	0.54	0.43	0.5
Gb_05959	1.0	0.37	0.61	0.77	0.32	0.06	0.08	0.19	0.35	0.28	0.35	0.08	0.1	0.14	0.31	0.53	0.39	0.31	0.11	0.13
Gb_06395	1.0	0.45	0.94	0.97	0.69	0.14	0.3	0.48	0.62	0.54	0.69	0.38	0.53	0.51	0.6	0.74	0.68	0.49	0.32	0.29
Gb_07052	1.0	0.61	0.84	0.69	0.6	0.23	0.42	0.34	0.35	0.32	0.38	0.26	0.45	0.42	0.42	0.33	0.26	0.4	0.23	0.28
Gb_07210	1.0	0.55	0.65	0.84	0.82	0.32	0.33	0.46	0.37	0.35	0.32	0.36	0.26	0.28	0.29	0.56	0.51	0.82	0.88	0.37
Gb_07348	0.92	1.0	0.64	0.77	0.53	0.12	0.18	0.22	0.25	0.24	0.31	0.14	0.2	0.2	0.3	0.35	0.12	0.24	0.18	0.18
Gb_08975	0.81	0.98	0.62	1.0	0.89	0.32	0.16	0.62	0.63	0.48	0.69	0.44	0.53	0.58	0.67	0.79	0.59	0.92	0.76	0.36
Gb_09419	1.0	0.55	0.7	0.98	0.86	0.48	0.53	0.52	0.42	0.39	0.42	0.43	0.27	0.31	0.46	0.6	0.61	0.71	0.17	0.28
Gb_09705	0.66	0.63	1.0	0.62	0.66	0.06	0.44	0.29	0.35	0.33	0.39	0.26	0.23	0.25	0.3	0.35	0.21	0.38	0.37	0.43
Gb_10258	1.0	0.72	0.82	0.8	0.98	0.17	0.31	0.52	0.45	0.34	0.36	0.37	0.3	0.37	0.33	0.62	0.46	0.76	0.61	0.36
Gb_10387	0.92	0.55	1.0	0.77	0.72	0.46	0.28	0.51	0.39	0.32	0.68	0.35	0.43	0.37	0.69	0.41	0.47	0.51	0.46	0.38
Gb_10906	1.0	0.65	0.86	0.89	0.62	0.02	0.35	0.35	0.35	0.4	0.65	0.23	0.16	0.14	0.59	0.72	0.53	0.58	0.67	0.14
Gb_11103	1.0	0.72	1.0	0.84	0.78	0.28	0.4	0.46	0.57	0.55	0.53	0.33	0.41	0.36	0.53	0.58	0.54	0.63	0.4	0.34
Gb_11410	0.77	0.93	0.95	1.0	0.94	0.29	0.54	0.49	0.63	0.59	0.61	0.51	0.22	0.26	0.57	0.64	0.69	0.61	0.44	0.25
Gb_11912	0.91	0.65	1.0	0.9	0.57	0.23	0.12	0.34	0.3	0.24	0.32	0.22	0.19	0.18	0.31	0.66	0.33	0.51	0.7	0.26
Gb_11913	1.0	0.26	0.56	0.93	0.81	0.3	0.13	0.44	0.38	0.34	0.5	0.3	0.23	0.22	0.43	0.64	0.3	0.59	0.64	0.47
Gb_12074	0.54	0.62	1.0	0.55	0.55	0.26	0.3	0.4	0.48	0.43	0.46	0.36	0.34	0.32	0.46	0.64	0.46	0.46	0.41	0.36
Gb_13440	0.9	0.64	0.69	1.0	0.25	0.11	0.05	0.18	0.33	0.27	0.23	0.1	0.06	0.09	0.26	0.39	0.28	0.29	0.14	0.1
Gb_13766	1.0	0.58	0.51	0.92	0.74	0.26	0.32	0.47	0.68	0.44	0.85	0.31	0.47	0.64	0.65	0.8	0.72	0.64	0.39	0.53
Gb_13776	1.0	0.58	0.77	0.6	0.86	0.18	0.34	0.5	0.6	0.53	0.6	0.2	0.52	0.54	0.53	0.94	0.55	0.69	0.49	0.5
Gb_18109	0.63	1.0	0.8	0.75	0.75	0.42	0.13	0.42	0.38	0.31	0.52	0.24	0.46	0.4	0.48	0.47	0.27	0.57	0.48	0.32
Gb_18502	1.0	0.23	0.65	0.55	0.49	0.13	0.23	0.27	0.3	0.33	0.81	0.22	0.1	0.1	0.81	0.4	0.49	0.33	0.39	0.4
Gb_20182	0.77	1.0	0.98	0.75	0.89	0.45	0.46	0.49	0.6	0.49	0.51	0.33	0.38	0.41	0.49	0.75	0.53	0.66	0.58	0.36
Gb_21889	1.0	0.5	0.98	0.81	0.4	0.03	0.04	0.15	0.11	0.1	0.23	0.06	0.13	0.12	0.26	0.12	0.11	0.17	0.11	0.1
Gb_22926	1.0	0.38	0.65	0.78	0.65	0.27	0.33	0.4	0.48	0.36	0.36	0.34	0.33	0.35	0.39	0.72	0.76	0.56	0.23	0.37
Gb_23258	0.69	0.56	0.75	1.0	0.4	0.21	0.28	0.35	0.41	0.35	0.47	0.34	0.35	0.36	0.51	0.64	0.49	0.34	0.48	0.25
Gb_23377	0.76	0.56	0.63	1.0	0.9	0.71	0.37	0.44	0.38	0.34	0.6	0.32	0.39	0.36	0.7	0.74	0.52	0.65	0.42	0.34
Gb_24494	0.67	1.0	0.85	0.33	0.63	0.3	0.58	0.46	0.3	0.28	0.66	0.37	0.16	0.17	0.56	0.33	0.35	0.75	0.89	0.35
Gb_24727	0.58	0.75	0.74	1.0	0.85	0.25	0.37	0.46	0.51	0.4	0.39	0.4	0.27	0.32	0.31	0.63	0.64	0.76	0.82	0.47
Gb_26207	0.96	0.55	0.99	0.97	1.0	0.45	0.33	0.73	0.57	0.54	0.74	0.57	0.39	0.33	0.76	0.66	0.78	0.83	0.53	0.55
Gb_26778	0.85	1.0	0.65	0.68	0.67	0.42	0.23	0.53	0.48	0.44	0.59	0.34	0.26	0.27	0.6	0.98	0.78	0.43	0.64	0.28
Gb_26850	1.0	0.54	0.82	0.79	0.67	0.15	0.26	0.43	0.48	0.35	0.58	0.39	0.49	0.35	0.52	0.49	0.39	0.45	0.52	0.31
Gb_27353	1.0	0.52	0.92	0.8	0.7	0.25	0.18	0.36	0.4	0.35	0.28	0.25	0.21	0.24	0.25	0.6	0.4	0.67	0.65	0.27
Gb_27510	0.74	0.93	0.76	0.54	0.44	0.12	0.43	0.37	0.62	0.61	0.64	0.23	0.29	0.32	0.55	1.0	0.76	0.4	0.5	0.24
Gb_27853	0.91	0.96	0.94	1.0	0.65	0.23	0.24	0.38	0.51	0.43	0.35	0.29	0.2	0.26	0.4	0.96	0.42	0.57	0.49	0.33
Gb_28265	0.63	0.38	1.0	0.65	0.45	0.03	0.19	0.22	0.29	0.28	0.53	0.17	0.06	0.05	0.54	0.4	0.29	0.26	0.3	0.25
Gb_28369	0.75	0.86	1.0	0.84	0.56	0.15	0.28	0.38	0.53	0.45	0.53	0.35	0.42	0.43	0.48	0.72	0.51	0.37	0.55	0.23
Gb_30121	0.64	0.78	0.66	0.59	0.47	0.08	0.33	0.38	0.63	0.53	0.58	0.26	0.26	0.26	0.58	1.0	0.6	0.56	0.58	0.37
Gb_30621	1.0	0.52	0.73	0.54	0.58	0.16	0.26	0.28	0.28	0.25	0.43	0.16	0.33	0.27	0.37	0.41	0.32	0.41	0.22	0.43
Gb_31323	1.0	0.78	0.88	0.84	0.63	0.34	0.12	0.31	0.29	0.26	0.26	0.17	0.26	0.28	0.23	0.55	0.23	0.44	0.33	0.17
Gb_33225	0.86	0.96	0.97	0.94	0.63	0.13	0.17	0.41	0.52	0.41	0.55	0.27	0.16	0.2	0.52	1.0	0.58	0.49	0.45	0.15
Gb_33230	1.0	0.83	0.8	0.68	0.92	0.52	0.52	0.55	0.68	0.61	0.59	0.34	0.44	0.4	0.64	0.8	0.8	0.82	0.61	0.5
Gb_33417	0.93	0.87	1.0	0.8	0.71	0.21	0.43	0.5	0.67	0.56	0.61	0.47	0.26	0.25	0.64	0.89	0.73	0.53	0.71	0.22
Gb_33560	0.72	0.95	0.96	1.0	0.76	0.26	0.22	0.53	0.55	0.46	0.57	0.32	0.25	0.29	0.62	0.65	0.66	0.72	0.6	0.37
Gb_34030	0.79	0.37	1.0	0.85	0.67	0.19	0.34	0.43	0.43	0.4	0.67	0.43	0.39	0.38	0.53	0.88	0.47	0.52	0.45	0.4
Gb_35334	0.75	0.56	1.0	0.42	0.66	0.2	0.23	0.3	0.57	0.48	0.56	0.28	0.37	0.21	0.43	0.46	0.35	0.52	0.44	0.29
Gb_35335	0.78	0.56	1.0	0.62	0.46	0.17	0.25	0.34	0.59	0.6	0.62	0.26	0.52	0.3	0.51	0.47	0.52	0.44	0.26	0.23
Gb_35614	1.0	0.44	0.85	0.66	0.63	0.22	0.35	0.38	0.43	0.38	0.49	0.29	0.43	0.4	0.48	0.48	0.42	0.42	0.38	0.46
Gb_36825	1.0	0.78	0.88	0.67	0.37	0.01	0.24	0.13	0.16	0.11	0.38	0.1	0.12	0.09	0.34	0.08	0.06	0.14	0.04	0.06
Gb_36997	0.57	0.86	1.0	0.48	0.4	0.1	0.17	0.2	0.16	0.13	0.28	0.09	0.02	0.02	0.4	0.31	0.14	0.26	0.6	0.15
Gb_38142	0.88	0.69	0.81	1.0	0.89	0.29	0.41	0.46	0.29	0.3	0.47	0.22	0.3	0.3	0.41	0.39	0.31	0.89	0.7	0.46
Gb_38487	0.61	0.65	0.74	0.76	0.39	0.13	0.14	0.36	0.53	0.39	0.32	0.16	0.33	0.35	0.29	1.0	0.41	0.37	0.2	0.09
Gb_39095	0.84	0.37	0.83	0.79	0.52	0.11	0.31	0.32	0.54	0.47	0.47	0.35	0.19	0.23	0.46	1.0	0.71	0.31	0.39	0.16
Gb_39344	1.0	0.75	0.9	0.92	0.53	0.21	0.24	0.37	0.52	0.45	0.51	0.25	0.37	0.31	0.54	0.82	0.31	0.33	0.21	0.25
Gb_39470	0.73	0.55	1.0	0.7	0.64	0.04	0.38	0.28	0.4	0.47	0.65	0.21	0.27	0.25	0.72	0.56	0.64	0.36	0.49	0.35
Gb_39691	0.9	0.35	0.8	0.88	0.48	0.2	0.35	0.3	0.33	0.34	0.89	0.2	0.27	0.22	1.0	0.33	0.41	0.42	0.56	0.52
Gb_40272	0.98	0.77	0.83	1.0	0.92	0.53	0.29	0.55	0.48	0.35	0.76	0.4	0.21	0.22	0.84	0.53	0.39	0.68	0.28	0.46
Gb_40938	0.68	0.41	0.58	0.44	0.46	0.14	0.16	0.34	0.47	0.39	0.26	0.25	0.21	0.17	0.33	1.0	0.6	0.37	0.18	0.13
Gb_41394	1.0	0.2	0.83	0.87	0.45	0.02	0.24	0.15	0.24	0.27	0.93	0.14	0.1	0.1	0.99	0.24	0.25	0.26	0.39	0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)