Heatmap: Cluster_215 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.3 1.48 1.45 0.68 1.59 1.37 1.48 0.9 0.58 0.84 0.6 0.74 0.4 0.23 0.98 0.69 0.88 1.03 4.06 1.59
0.13 0.05 0.08 0.07 0.02 1.7 1.85 0.23 0.12 0.12 0.02 0.06 0.05 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.71 7.91 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.04
0.68 0.69 0.71 0.76 1.53 50.07 57.8 1.04 0.21 0.16 0.56 1.17 0.25 0.33 0.68 0.43 1.09 1.58 0.22 0.74
0.62 0.12 0.84 1.31 0.93 43.93 53.06 0.78 0.06 0.12 0.55 0.7 0.03 0.01 0.42 0.05 0.37 1.2 0.66 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.24 4.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.57 772.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.21 11.26 12.95 1.67 14.68 3.95 13.19 0.14 0.13 0.2 0.0 0.03 0.19 0.26 0.06 0.13 0.09 0.08 73.46 0.48
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04 0.11 0.0
0.06 0.16 0.12 0.04 0.01 4.36 15.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.42 0.8
0.83 0.13 0.06 0.0 0.41 0.06 4.4 0.23 0.22 0.07 2.12 0.28 0.24 0.37 1.07 0.0 0.0 0.27 0.0 0.15
2.89 3.33 3.05 1.29 2.61 0.1 3.94 0.54 0.45 0.37 0.42 0.18 0.37 0.31 0.57 0.2 0.19 1.97 1.73 0.73
2.15 0.73 1.14 2.07 3.26 1.79 16.39 2.35 1.35 1.76 0.47 0.63 0.59 0.87 0.55 2.35 3.8 7.15 7.6 2.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1038.74 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.09 0.21 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 3.96 4.96 0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.03 0.0
0.12 0.41 0.69 0.05 0.27 0.0 1.7 0.07 0.15 0.09 0.01 0.02 0.03 0.05 0.06 0.02 0.38 0.11 0.46 0.03
0.02 0.0 0.0 0.0 0.2 12.09 28.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.16 0.2 0.2 0.0 0.03 0.37 1.02 0.02 0.02 0.0 0.14 0.04 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 1.15 0.12
17.75 28.99 23.19 13.55 19.93 11.14 35.57 8.76 5.77 6.11 8.72 2.51 5.24 3.37 8.26 8.31 7.48 12.2 4.86 7.28
0.19 0.56 0.08 0.3 1.85 11.52 7.86 2.35 1.44 1.22 1.91 2.24 1.17 1.18 1.7 0.86 0.87 6.73 0.49 3.68
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.17 130.63 101.34 0.57 0.0 0.0 0.39 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.22 0.71 1.57
0.69 0.0 0.04 0.52 0.35 7.02 73.0 1.52 1.26 1.25 1.05 0.92 1.75 1.24 0.7 0.2 1.87 0.21 0.01 0.26
0.34 0.0 0.01 0.0 0.12 0.07 1.06 0.08 0.07 0.05 0.28 0.18 0.14 0.1 0.2 0.0 0.0 0.18 0.0 0.15
0.0 0.0 0.09 0.0 0.14 0.31 3.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.96 0.0
0.2 0.05 0.15 0.2 0.16 0.02 9.29 0.23 0.22 0.3 0.96 0.53 0.1 0.11 1.12 0.33 0.63 1.83 7.92 1.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 8.59 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
5.11 0.55 2.98 0.0 0.07 119.75 81.33 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.03 19.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.01 9.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.46 7.86 1.74 0.15 0.15 29.49 22.82 2.55 0.32 0.31 2.84 3.51 0.38 0.62 1.94 0.04 0.06 0.11 0.17 1.42
0.14 0.48 0.06 0.0 0.03 1.3 1.65 0.42 0.3 0.04 0.91 0.19 0.9 0.73 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
7.11 6.47 7.55 9.49 27.13 5.33 26.35 3.2 0.32 0.4 0.15 0.34 0.04 0.06 0.27 1.63 1.45 37.91 36.2 14.56
8.66 9.37 7.77 8.89 9.7 5.29 13.12 3.42 2.41 2.51 2.32 4.06 4.76 4.28 2.04 2.24 2.16 5.96 15.39 9.3
1.37 0.61 1.7 1.56 2.93 0.49 6.26 0.3 0.11 0.16 0.19 0.29 0.08 0.4 0.42 0.0 0.49 1.44 8.04 3.54
1.76 0.59 2.01 1.72 3.64 1.36 6.21 0.35 0.49 0.46 0.34 0.17 0.21 0.93 0.39 0.0 0.25 1.54 16.36 3.73
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 3.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07
4.71 1.79 1.74 3.72 4.66 4.44 102.36 6.97 10.32 6.42 19.37 6.3 12.93 19.28 19.9 18.19 12.23 23.09 1.29 0.4
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.62 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.66 0.01
19.72 11.11 44.27 60.96 226.28 38.85 5.92 3.83 0.06 0.03 0.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.24 0.62 34.38 250.25 20.95
0.14 0.0 0.03 0.14 0.13 1.03 22.8 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.41 16.7 2.67
0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 41.17 323.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.25 0.17
0.41 0.19 0.38 0.27 0.16 0.2 5.41 0.1 0.08 0.03 0.08 0.01 0.08 0.05 0.04 0.06 0.02 0.46 6.95 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1361.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16
0.53 0.25 1.13 0.07 0.05 0.35 35.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.01 0.03 0.03 0.05 0.17 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.27 0.11
0.35 0.75 0.45 0.54 1.29 1.57 32.01 0.24 0.04 0.06 0.09 0.04 0.01 0.03 0.06 0.23 0.06 1.12 0.0 1.03
0.09 0.2 0.26 0.0 0.0 0.0 8.14 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
22.44 248.04 77.86 65.48 211.3 110.41 1019.23 81.79 55.47 98.36 93.34 192.89 61.18 87.73 108.31 24.21 40.79 33.64 11.76 110.69
1.26 1.7 1.4 1.32 1.58 0.75 2.91 0.41 0.25 0.38 0.33 0.17 0.09 0.12 0.39 1.04 0.78 3.6 1.67 1.9
55.56 26.89 51.58 20.78 31.43 17.49 111.43 17.98 16.73 19.69 2.61 15.39 4.9 5.37 3.96 26.87 19.24 63.94 22.96 53.01
171.6 87.62 243.84 170.72 76.38 35.41 324.33 32.2 52.4 57.36 11.63 31.3 17.25 25.69 17.47 66.57 44.36 141.72 25.75 191.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.22 4.07 13.18 12.22 24.26 10.58 17.75 6.43 6.24 8.74 8.41 8.76 2.14 3.39 9.13 8.44 11.2 7.64 28.41 19.65
17.96 6.18 14.19 22.02 21.76 11.63 15.57 8.68 5.91 7.76 9.23 8.37 3.2 3.49 10.28 6.67 11.01 6.94 45.32 8.54
0.37 0.48 0.32 0.29 0.24 14.47 21.3 0.05 0.07 0.07 0.04 0.06 0.06 0.07 0.04 0.12 0.05 0.08 0.25 0.02
0.18 0.0 0.15 0.11 0.23 8.71 18.01 0.03 0.01 0.02 0.03 0.02 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.11 0.0
0.24 0.11 0.2 0.08 0.57 0.51 4.82 0.56 0.19 0.43 0.33 0.11 0.47 0.42 0.44 0.12 0.12 2.28 1.25 0.38
0.52 0.68 0.07 0.33 0.51 3.05 9.81 0.23 0.08 0.08 0.26 0.08 0.54 0.14 0.54 0.26 0.07 0.44 3.98 2.3
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.63 1.59 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
0.18 0.5 0.16 0.31 0.46 0.08 3.0 0.15 0.26 0.33 0.4 0.14 0.16 0.12 0.14 0.49 0.18 0.45 1.05 0.42
0.78 0.49 0.71 0.61 1.95 0.25 8.6 0.57 0.75 0.6 0.89 0.53 0.38 0.58 0.71 1.14 0.42 1.57 4.47 2.52
0.66 0.34 0.6 0.62 1.5 0.0 9.26 0.49 0.64 0.78 0.94 0.36 0.1 0.2 0.44 1.04 0.62 1.23 5.58 2.03
12.39 42.65 30.42 9.88 55.36 6.94 267.93 7.83 4.61 4.74 6.51 21.12 2.66 5.9 4.88 6.32 9.59 10.81 2.1 2.85
15.89 38.34 13.9 9.62 32.07 108.21 87.25 28.21 29.24 23.31 59.24 15.81 25.01 33.88 41.85 22.91 11.15 8.59 27.15 5.21
5.67 3.38 5.98 4.1 3.95 39.9 40.41 5.17 1.92 2.06 2.34 6.94 3.73 2.29 1.93 1.93 4.54 0.87 0.31 12.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 10.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.58
0.25 0.1 0.03 0.18 0.0 1.42 41.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.38 0.84 0.43 0.33 0.55 0.16 3.88 0.16 0.13 0.26 0.23 0.15 0.22 0.11 0.31 0.26 0.27 0.68 0.52 1.38
0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 18.75 0.15 0.04 0.15 0.07 0.05 0.29 0.42 0.12 0.0 0.0 0.23 0.18 0.06
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21
1.76 1.03 2.37 0.76 0.79 0.07 6.93 0.27 0.08 0.08 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.18 0.36 2.2 0.2 2.63
0.13 0.04 0.04 0.51 1.31 0.11 0.19 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.41 1.86 0.18
0.11 0.05 0.05 0.53 1.32 0.13 1.47 0.04 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.16 4.39 0.01
0.14 0.12 0.06 0.04 0.11 0.92 0.64 0.06 0.07 0.06 0.04 0.04 0.07 0.1 0.05 0.06 0.06 0.09 0.23 0.12
5.5 5.32 5.03 2.99 7.15 0.55 16.67 0.82 0.73 0.94 1.12 1.93 0.28 0.71 0.84 0.54 0.98 2.17 2.87 7.87
11.2 13.61 13.16 13.36 18.99 61.27 155.69 7.19 2.92 2.88 3.05 4.78 4.1 5.89 2.33 2.79 2.54 6.65 14.54 40.66
0.06 0.42 0.24 0.0 0.12 0.0 7.3 0.01 0.01 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 3.13 6866.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.12
0.28 0.11 0.23 0.11 0.28 0.08 1.2 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.11 0.82 0.06
1.64 1.63 2.34 0.76 0.89 0.0 2.82 0.29 0.28 0.38 0.42 1.08 0.18 0.1 0.54 0.41 0.58 0.68 0.58 1.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.3 3.68 1.98 1.07 3.81 7.78 32.24 3.87 6.41 5.64 8.87 3.77 3.57 2.63 9.96 6.26 6.39 6.87 5.96 2.64
2.31 0.3 0.19 1.31 0.1 24.99 40.44 3.34 2.03 1.15 0.51 1.12 2.36 3.35 0.69 1.56 0.22 0.8 6.08 10.87
0.51 0.21 0.43 0.61 0.85 5.51 28.62 0.3 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.26 8.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
93.72 47.6 95.25 41.16 24.57 15.92 1593.15 2.98 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.08 35.39 16.55
2.81 0.97 0.22 0.13 0.03 0.0 33.33 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01
1.67 1.15 0.86 0.89 2.69 0.03 8.61 0.43 0.28 0.48 0.16 0.13 0.14 0.1 0.17 0.33 0.29 0.96 0.39 0.52
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.36 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 1.88 3.38 1.54 6.9 43.53 93.48 14.17 13.04 11.54 8.83 11.15 20.9 26.52 10.36 5.28 17.47 30.11 198.37 68.42
0.48 0.16 0.75 2.09 1.94 2.05 37.88 0.49 0.14 0.17 0.0 0.36 0.11 0.08 0.06 0.7 1.37 7.0 0.98 22.14
0.32 0.54 0.68 0.91 1.11 1.11 12.54 0.27 0.01 0.09 0.0 0.12 0.01 0.05 0.03 0.16 0.68 3.95 1.09 5.25
1.5 0.04 0.02 13.54 12.95 21.13 257.95 2.09 2.65 2.08 0.11 0.58 0.34 3.15 0.09 5.2 11.21 63.73 5.53 16.18
0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.33 4.11 0.02 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.84 0.25
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.29 0.12 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.09 0.0 0.14 0.0 1.15 0.58 0.14
0.66 0.42 1.29 0.0 0.48 1.34 6.42 0.36 0.18 0.25 0.18 0.39 0.12 0.19 0.0 0.43 1.52 1.22 0.68 1.96
0.01 0.04 0.0 0.0 0.29 0.57 56.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 4.0
0.69 0.6 0.67 2.51 1.83 64.12 41.37 1.16 0.74 0.56 0.05 1.74 0.14 0.24 0.12 1.24 4.5 4.04 7.03 9.75
6.54 4.89 6.4 4.28 6.12 1.5 10.56 3.66 4.31 4.16 8.88 2.7 2.67 2.06 7.86 4.57 2.98 5.77 8.13 10.81
0.0 0.08 0.0 0.5 0.18 0.15 2.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.29 0.26 0.0 0.17
0.02 0.0 0.01 0.04 0.07 0.05 0.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.32 0.06
0.26 0.18 0.04 0.65 1.27 0.05 5.31 0.12 0.02 0.03 0.1 0.31 0.01 0.07 0.2 0.1 0.15 0.24 0.02 3.73
0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.36 0.02 0.05 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)