Heatmap: Cluster_152 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.54 0.74 1.0 0.35 0.45 0.3 0.21 0.21 0.13 0.11 0.13 0.19 0.13 0.12 0.16 0.12 0.16 0.4 0.29 0.12
0.54 0.47 1.0 0.44 0.41 0.1 0.05 0.2 0.08 0.07 0.1 0.1 0.11 0.07 0.1 0.1 0.16 0.29 0.14 0.11
0.84 0.54 1.0 0.41 0.41 0.14 0.12 0.22 0.17 0.16 0.16 0.13 0.06 0.08 0.24 0.14 0.1 0.38 0.26 0.32
1.0 0.2 0.73 0.76 0.79 0.48 0.24 0.32 0.32 0.28 0.33 0.15 0.28 0.36 0.31 0.36 0.3 0.64 0.25 0.58
0.63 0.63 1.0 0.34 0.58 0.28 0.18 0.26 0.18 0.2 0.24 0.28 0.26 0.2 0.24 0.25 0.23 0.41 0.19 0.24
1.0 0.31 0.53 0.5 0.71 0.31 0.22 0.3 0.25 0.2 0.26 0.28 0.29 0.3 0.27 0.22 0.25 0.61 0.19 0.32
1.0 0.42 0.68 0.52 0.59 0.44 0.17 0.31 0.21 0.15 0.25 0.19 0.07 0.07 0.22 0.25 0.18 0.66 0.23 0.42
1.0 0.45 0.59 0.16 0.96 0.24 0.35 0.22 0.16 0.09 0.25 0.15 0.04 0.0 0.24 0.21 0.28 0.48 0.17 0.34
0.69 0.55 1.0 0.69 0.48 0.15 0.3 0.18 0.18 0.15 0.15 0.15 0.06 0.06 0.15 0.22 0.16 0.22 0.21 0.15
0.46 0.55 1.0 0.22 0.36 0.15 0.09 0.13 0.08 0.08 0.06 0.1 0.03 0.03 0.06 0.11 0.15 0.32 0.18 0.14
0.89 0.9 1.0 0.59 0.88 0.31 0.47 0.39 0.41 0.4 0.34 0.35 0.37 0.39 0.28 0.49 0.44 0.64 0.39 0.64
0.83 0.58 1.0 0.65 0.71 0.67 0.48 0.42 0.3 0.29 0.34 0.36 0.13 0.16 0.32 0.48 0.56 0.9 0.51 0.52
0.88 0.75 0.75 0.93 1.0 0.36 0.19 0.31 0.12 0.21 0.23 0.2 0.3 0.26 0.25 0.2 0.12 0.61 0.43 0.33
1.0 0.78 0.96 0.86 0.74 0.69 0.34 0.45 0.23 0.24 0.26 0.37 0.4 0.46 0.27 0.31 0.55 0.76 0.35 0.39
0.63 1.0 1.0 0.63 0.81 0.62 0.38 0.37 0.29 0.25 0.23 0.35 0.22 0.25 0.26 0.2 0.22 0.66 0.4 0.49
1.0 0.59 0.9 0.57 0.67 0.58 0.3 0.46 0.35 0.3 0.37 0.36 0.26 0.24 0.43 0.43 0.41 0.87 0.48 0.41
1.0 0.64 0.83 0.37 0.5 0.19 0.17 0.2 0.1 0.09 0.13 0.12 0.03 0.04 0.12 0.2 0.2 0.41 0.25 0.16
1.0 0.38 0.84 0.53 0.86 0.73 0.38 0.34 0.21 0.19 0.18 0.35 0.26 0.3 0.2 0.26 0.38 0.78 0.21 0.49
0.66 0.67 1.0 0.6 0.27 0.07 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.36 0.0 0.02
0.98 0.62 0.89 0.68 0.78 1.0 0.54 0.49 0.36 0.34 0.3 0.41 0.34 0.39 0.3 0.3 0.45 0.78 0.39 0.47
0.41 0.44 1.0 0.56 0.39 0.06 0.04 0.12 0.05 0.06 0.09 0.05 0.07 0.08 0.08 0.01 0.02 0.19 0.14 0.12
0.84 0.34 0.75 1.0 0.65 0.68 0.23 0.35 0.16 0.16 0.2 0.27 0.14 0.11 0.17 0.17 0.26 0.63 0.28 0.31
0.87 0.65 1.0 0.47 0.86 0.63 0.37 0.47 0.27 0.27 0.21 0.57 0.3 0.25 0.25 0.23 0.43 0.95 0.41 0.5
0.97 0.9 1.0 0.45 0.76 0.38 0.31 0.26 0.2 0.18 0.24 0.18 0.34 0.33 0.3 0.28 0.19 0.7 0.31 0.6
1.0 0.89 0.76 0.51 0.81 0.32 0.32 0.24 0.18 0.21 0.45 0.19 0.12 0.1 0.3 0.08 0.17 0.6 0.54 0.53
0.89 0.41 1.0 0.56 0.53 0.67 0.28 0.36 0.21 0.2 0.13 0.37 0.18 0.12 0.16 0.19 0.25 0.44 0.25 0.32
0.92 0.57 1.0 0.58 0.8 0.64 0.65 0.43 0.24 0.24 0.23 0.33 0.15 0.13 0.27 0.54 0.46 0.75 0.32 0.49
0.68 0.45 1.0 0.61 0.34 0.38 0.16 0.22 0.1 0.08 0.13 0.16 0.02 0.02 0.11 0.15 0.18 0.48 0.25 0.26
0.4 0.48 1.0 0.42 0.38 0.12 0.16 0.15 0.12 0.13 0.18 0.16 0.06 0.08 0.16 0.12 0.1 0.28 0.22 0.14
0.61 0.34 1.0 0.12 0.46 0.13 0.17 0.19 0.14 0.15 0.17 0.21 0.15 0.14 0.15 0.16 0.22 0.42 0.08 0.23
0.88 0.59 0.76 0.85 0.74 1.0 0.58 0.48 0.36 0.35 0.37 0.37 0.46 0.43 0.41 0.43 0.51 0.77 0.54 0.5
0.96 0.36 1.0 0.51 0.85 0.24 0.47 0.26 0.28 0.18 0.24 0.18 0.23 0.2 0.31 0.17 0.26 0.4 0.18 0.62
0.47 0.66 1.0 0.48 0.25 0.08 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01
0.59 0.59 1.0 0.91 0.36 0.12 0.16 0.21 0.13 0.15 0.15 0.14 0.2 0.15 0.15 0.18 0.19 0.3 0.28 0.2
1.0 0.36 0.84 0.82 0.79 0.89 0.38 0.39 0.17 0.17 0.15 0.32 0.25 0.33 0.14 0.14 0.26 0.88 0.43 0.36
1.0 0.56 0.9 0.92 0.76 0.95 0.25 0.36 0.17 0.18 0.15 0.27 0.27 0.29 0.19 0.19 0.3 0.73 0.44 0.41
0.59 0.35 1.0 0.69 0.47 0.56 0.04 0.21 0.12 0.13 0.14 0.16 0.17 0.21 0.14 0.27 0.29 0.52 0.18 0.25
1.0 0.54 0.84 0.47 0.52 0.3 0.25 0.27 0.16 0.14 0.24 0.19 0.17 0.11 0.26 0.22 0.4 0.59 0.22 0.32
0.92 0.57 1.0 0.7 0.62 0.25 0.28 0.37 0.27 0.26 0.29 0.37 0.41 0.42 0.29 0.32 0.39 0.56 0.57 0.44
0.79 0.61 1.0 0.32 0.43 0.18 0.26 0.24 0.16 0.16 0.17 0.18 0.18 0.23 0.11 0.11 0.18 0.35 0.06 0.27
0.55 0.55 1.0 0.22 0.37 0.23 0.23 0.21 0.16 0.16 0.14 0.19 0.13 0.11 0.15 0.15 0.13 0.35 0.36 0.26
0.87 0.68 0.77 0.43 1.0 0.48 0.29 0.36 0.22 0.21 0.32 0.2 0.31 0.27 0.28 0.26 0.29 0.65 0.53 0.63
0.99 0.51 1.0 0.71 0.52 0.17 0.26 0.2 0.18 0.17 0.09 0.26 0.17 0.17 0.07 0.24 0.3 0.27 0.24 0.15
1.0 0.62 0.86 0.37 0.48 0.32 0.2 0.35 0.13 0.15 0.19 0.26 0.39 0.35 0.21 0.19 0.17 0.48 0.44 0.34
1.0 0.44 0.53 0.44 0.59 0.06 0.22 0.25 0.23 0.18 0.07 0.15 0.33 0.26 0.3 0.31 0.21 0.5 0.14 0.48
0.6 0.44 1.0 0.69 0.48 0.2 0.39 0.2 0.17 0.18 0.28 0.19 0.06 0.06 0.2 0.16 0.13 0.22 0.31 0.13
0.9 0.86 1.0 0.41 0.72 0.76 0.62 0.48 0.37 0.37 0.59 0.53 0.41 0.42 0.58 0.4 0.49 0.68 0.32 0.38
0.97 0.37 1.0 0.73 0.58 0.26 0.22 0.36 0.25 0.24 0.28 0.31 0.33 0.26 0.27 0.27 0.3 0.54 0.47 0.33
0.99 0.37 1.0 0.93 0.74 0.36 0.3 0.43 0.37 0.34 0.3 0.39 0.35 0.4 0.28 0.36 0.39 0.64 0.26 0.32
0.97 0.64 1.0 0.6 0.59 0.31 0.2 0.26 0.15 0.15 0.17 0.22 0.18 0.17 0.16 0.25 0.3 0.47 0.31 0.32
0.49 0.71 1.0 0.39 0.2 0.06 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.0 0.01
0.81 0.69 0.77 0.61 0.77 1.0 0.46 0.41 0.35 0.35 0.36 0.31 0.45 0.42 0.41 0.43 0.41 0.72 0.38 0.5
0.96 0.51 1.0 0.98 0.86 0.81 0.23 0.36 0.26 0.24 0.18 0.23 0.26 0.31 0.2 0.34 0.33 0.77 0.27 0.5
0.62 0.49 1.0 0.38 0.42 0.26 0.22 0.24 0.19 0.22 0.23 0.25 0.21 0.23 0.21 0.26 0.21 0.56 0.17 0.32
1.0 0.56 0.99 0.89 0.79 0.64 0.35 0.42 0.26 0.25 0.35 0.31 0.37 0.39 0.32 0.4 0.42 0.87 0.33 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)