Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.84 0.71 0.57 0.7 0.69 0.65 0.33 0.69 0.57 0.45 0.38 0.24 0.85 0.62 0.39 0.55 0.42 1.0 0.91 0.35
0.44 0.34 0.07 1.0 0.54 0.44 0.1 0.59 0.41 0.62 0.25 0.07 0.61 0.64 0.44 0.66 0.52 0.29 0.78 0.09
0.18 0.52 0.13 0.16 0.2 0.31 0.67 0.33 0.61 0.55 0.81 0.15 1.0 0.77 0.76 0.4 0.24 0.24 0.55 0.46
0.84 0.89 0.28 0.45 0.46 0.33 0.15 0.75 0.59 0.64 1.0 0.38 0.77 0.52 0.97 0.52 0.35 0.52 0.73 0.12
0.51 0.49 0.18 0.18 0.34 0.14 0.11 0.57 0.52 0.6 0.93 0.35 1.0 0.71 0.81 0.36 0.32 0.34 0.29 0.06
0.45 0.76 0.64 0.6 1.0 0.83 0.5 0.84 0.65 0.64 0.57 0.58 0.96 0.91 0.67 0.56 0.57 0.82 0.98 0.67
0.56 0.35 0.46 0.66 0.66 0.52 0.22 0.68 0.69 0.58 0.74 0.43 1.0 0.76 0.75 0.59 0.61 0.73 0.55 0.28
0.21 0.39 0.3 0.14 0.23 0.0 0.24 0.53 0.61 0.46 0.55 0.2 1.0 0.81 0.46 0.23 0.23 0.18 0.35 0.48
0.28 0.3 0.14 0.12 0.22 0.07 0.38 0.6 0.68 0.36 1.0 0.25 0.84 0.78 0.65 0.24 0.12 0.26 0.5 0.44
0.46 0.55 0.23 0.27 0.4 0.27 0.43 0.8 0.69 0.79 1.0 0.33 0.8 0.5 0.88 0.21 0.03 0.29 0.66 0.33
0.14 0.22 0.19 0.48 0.92 0.16 0.37 0.53 0.28 0.37 0.41 0.41 1.0 0.44 0.4 0.17 0.27 0.34 0.82 0.25
0.79 0.42 0.46 0.68 0.63 0.23 0.31 0.47 0.5 0.49 0.37 0.16 1.0 0.82 0.4 0.3 0.24 0.44 0.59 0.32
0.6 0.43 0.37 0.36 0.54 0.3 0.37 0.47 0.49 0.44 0.57 0.17 1.0 0.8 0.56 0.32 0.23 0.38 0.54 0.45
0.32 0.3 0.13 0.14 0.28 0.09 0.32 0.32 0.41 0.37 0.44 0.13 1.0 0.72 0.42 0.21 0.12 0.26 0.86 0.62
0.46 0.76 0.3 0.49 0.59 0.36 0.28 0.59 0.7 0.62 0.71 0.29 1.0 0.73 0.7 0.53 0.35 0.48 0.6 0.42
0.92 0.69 0.42 0.76 0.62 0.28 0.04 0.62 0.51 0.42 0.59 0.24 1.0 0.64 0.55 0.18 0.15 0.45 0.83 0.45
0.29 0.46 0.24 0.26 0.38 0.14 0.33 0.34 0.36 0.37 0.3 0.12 1.0 0.88 0.34 0.24 0.13 0.22 0.49 0.13
0.55 0.18 0.18 0.57 0.39 0.1 0.63 0.38 0.53 0.59 1.0 0.27 0.6 0.45 0.97 0.24 0.12 0.14 0.2 0.09
0.27 0.25 0.08 0.32 0.4 0.15 0.46 0.29 0.49 0.42 0.77 0.22 1.0 0.61 0.79 0.72 0.47 0.28 0.07 0.29
0.54 0.5 0.25 0.44 0.63 0.37 0.24 0.6 0.46 0.4 0.75 0.36 0.92 1.0 0.64 0.49 0.35 0.67 0.3 0.39
0.3 0.68 0.31 0.21 0.55 0.37 0.35 0.44 0.5 0.46 0.36 0.12 1.0 0.8 0.37 0.25 0.17 0.61 0.71 0.38
0.32 0.93 0.38 0.21 0.55 0.47 0.36 0.56 0.43 0.41 0.39 0.12 1.0 0.84 0.45 0.26 0.13 0.66 0.92 0.4
0.8 0.6 0.49 0.5 0.52 0.38 0.24 0.56 0.45 0.48 0.75 0.29 1.0 0.75 0.83 0.45 0.43 0.44 0.6 0.3
0.76 0.93 0.55 0.53 0.66 0.75 0.19 0.42 0.41 0.34 0.43 0.24 0.5 0.48 0.42 0.44 0.28 1.0 0.98 0.4
0.17 0.25 0.06 0.09 0.12 0.07 0.24 0.28 0.25 0.35 0.41 0.05 0.59 0.36 0.43 0.18 0.11 0.18 1.0 0.27
0.7 0.46 0.43 0.42 0.57 0.74 0.29 0.54 0.48 0.47 0.47 0.25 1.0 0.81 0.49 0.33 0.31 0.6 0.61 0.34
0.76 0.57 0.59 0.93 1.0 0.24 0.64 0.39 0.25 0.21 0.49 0.27 0.34 0.29 0.36 0.25 0.13 0.48 0.53 0.46
0.16 0.39 0.28 0.32 0.49 0.75 0.23 0.83 0.89 1.0 0.64 0.64 0.82 0.72 0.7 0.49 0.3 1.0 0.77 0.17
0.11 0.13 0.21 0.35 0.35 0.52 0.12 0.49 0.72 0.78 0.33 0.66 0.98 1.0 0.39 0.49 0.23 0.73 0.27 0.09
0.51 0.36 0.31 0.59 0.83 0.44 0.28 0.49 0.44 0.39 0.58 0.26 1.0 0.85 0.5 0.34 0.27 0.29 0.33 0.29
0.83 0.49 0.4 0.83 0.4 0.16 0.09 0.58 0.62 0.59 1.0 0.45 0.81 0.76 0.89 0.69 0.5 0.71 0.89 0.18
0.51 1.0 0.35 0.44 0.66 0.27 0.36 0.4 0.31 0.26 0.23 0.17 0.69 0.38 0.28 0.31 0.22 0.41 0.53 0.3
0.47 0.23 0.2 0.36 0.51 0.08 0.16 0.38 0.39 0.34 0.38 0.12 0.98 0.68 0.41 0.33 0.15 0.35 1.0 0.24
0.71 0.65 0.54 0.89 0.72 1.0 0.45 0.7 0.5 0.52 0.62 0.43 0.93 0.77 0.62 0.47 0.36 0.63 0.78 0.24
0.67 0.75 0.2 0.49 0.45 0.35 0.19 0.44 0.54 0.47 0.4 0.06 1.0 0.72 0.36 0.58 0.3 0.45 0.79 0.25
0.44 0.24 0.29 0.31 0.35 0.26 0.09 0.57 0.48 0.5 1.0 0.37 0.88 0.6 0.98 0.2 0.32 0.34 0.31 0.2
0.52 0.14 0.25 0.13 0.39 0.21 0.16 0.64 0.44 0.49 0.81 0.42 0.61 0.4 1.0 0.2 0.37 0.45 0.24 0.22
0.45 0.34 0.32 0.47 0.39 0.22 0.18 0.42 0.5 0.47 0.56 0.15 1.0 0.83 0.53 0.26 0.19 0.3 0.49 0.33
0.13 0.66 0.11 0.38 0.1 0.33 0.0 0.24 0.06 0.07 0.02 0.2 1.0 0.52 0.01 0.02 0.05 0.11 0.02 0.01
0.54 0.35 0.42 0.33 0.46 0.32 0.24 0.46 0.47 0.37 0.55 0.16 1.0 0.72 0.57 0.37 0.26 0.39 0.55 0.23
0.66 0.39 0.39 0.53 1.0 0.13 0.29 0.59 0.35 0.4 0.53 0.24 0.76 0.94 0.38 0.45 0.23 0.62 0.9 0.04
0.27 0.07 0.15 0.76 0.55 0.07 0.18 0.49 0.58 0.44 0.59 0.1 1.0 0.55 0.31 0.57 0.38 0.42 0.34 0.18
0.57 1.0 0.41 0.5 0.43 0.23 0.83 0.55 0.53 0.53 0.91 0.28 0.74 0.73 0.53 0.18 0.23 0.65 0.81 0.21
0.34 0.73 0.44 0.52 0.63 0.48 0.57 0.66 1.0 0.86 0.78 0.45 0.6 0.6 0.81 0.63 0.45 0.69 0.54 0.36
0.41 0.59 0.38 0.25 0.42 0.32 0.38 0.38 0.42 0.43 0.62 0.15 1.0 0.78 0.61 0.22 0.17 0.33 0.62 0.32
0.33 1.0 0.52 0.34 0.51 0.41 0.38 0.44 0.38 0.38 0.37 0.11 0.47 0.31 0.45 0.19 0.12 0.41 0.8 0.28
0.55 0.89 0.5 0.43 0.74 0.41 0.75 0.51 0.54 0.57 0.73 0.18 1.0 0.93 0.71 0.24 0.2 0.56 0.76 0.51
0.35 1.0 0.49 0.35 0.68 0.35 0.46 0.46 0.45 0.45 0.45 0.14 0.43 0.44 0.45 0.16 0.1 0.5 0.82 0.45
0.14 0.22 0.33 0.11 0.18 0.01 0.4 0.22 0.49 0.53 0.31 0.04 0.7 0.76 0.21 0.26 0.16 0.14 1.0 0.11
0.19 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.64 0.06 0.16 0.3 0.11 0.0 0.06 0.04 0.09 0.08 0.0 0.17 1.0 0.0
0.75 0.24 0.43 0.41 0.4 0.23 0.04 0.62 0.25 0.26 0.24 0.17 0.9 0.71 0.21 0.26 0.22 0.74 1.0 0.35
0.68 0.55 0.46 0.77 0.5 0.57 0.4 0.66 0.54 0.42 0.66 0.45 0.65 0.64 0.62 1.0 0.85 0.68 0.59 0.54
0.45 0.14 0.35 0.41 0.94 0.51 0.29 0.61 0.78 0.73 0.7 0.34 0.97 0.7 0.89 0.3 0.39 1.0 0.38 0.71
0.38 0.0 0.49 0.0 0.5 0.99 0.05 0.33 0.2 0.13 0.0 0.17 1.0 0.43 0.04 0.26 0.18 0.72 0.59 0.33
0.5 1.0 0.43 0.35 0.77 0.19 0.43 0.32 0.28 0.29 0.31 0.07 0.61 0.53 0.35 0.34 0.18 0.41 0.43 0.22
0.26 0.28 0.05 0.52 0.2 0.38 0.29 0.41 0.31 0.34 0.37 0.1 0.61 0.42 0.5 0.54 0.15 0.24 1.0 0.18
0.6 1.0 0.6 0.64 0.68 0.23 0.48 0.74 0.75 0.66 0.75 0.44 0.99 0.91 0.75 0.77 0.45 0.62 0.87 0.4
0.51 0.71 0.35 0.58 0.32 0.14 0.23 0.51 0.55 0.7 0.89 0.23 0.52 0.44 1.0 0.42 0.7 0.49 0.69 0.52
0.55 0.62 0.43 0.39 0.7 0.48 0.61 0.63 0.62 0.61 0.73 0.28 1.0 0.77 0.71 0.42 0.29 0.51 0.82 0.48
0.75 0.63 0.7 0.58 0.69 1.0 0.38 0.97 0.77 0.82 0.93 0.78 0.77 0.71 0.86 0.94 0.91 0.79 0.55 0.58
0.79 0.51 0.34 1.0 0.56 0.14 0.1 0.48 0.41 0.38 0.4 0.26 0.55 0.41 0.43 0.53 0.41 0.91 0.97 0.23
0.53 0.5 0.48 0.63 0.6 0.2 0.17 0.63 0.74 0.61 0.7 0.35 1.0 0.89 0.61 0.79 0.57 0.66 0.81 0.27
0.55 0.83 0.31 1.0 0.83 0.13 0.06 0.48 0.09 0.09 0.28 0.44 0.93 0.81 0.16 0.07 0.08 0.27 0.11 0.06
0.58 0.83 0.47 0.58 0.55 0.41 0.76 0.53 0.79 0.87 1.0 0.41 0.51 0.49 0.94 0.35 0.25 0.32 0.32 0.08
0.35 0.13 0.15 0.41 0.5 0.16 0.63 0.43 0.56 0.5 0.79 0.26 1.0 0.98 0.95 0.54 0.31 0.52 0.09 0.53
0.73 0.54 0.43 0.5 0.68 0.45 0.37 0.5 0.45 0.44 0.47 0.15 1.0 0.78 0.44 0.25 0.18 0.48 0.63 0.38
0.52 0.43 0.46 0.5 0.69 0.52 0.37 0.58 0.48 0.49 0.34 0.28 1.0 0.81 0.35 0.27 0.23 0.8 0.59 0.48
0.6 0.47 0.28 0.4 0.54 0.19 0.51 0.44 0.53 0.54 0.63 0.21 1.0 0.77 0.63 0.51 0.28 0.39 0.9 0.4
0.53 0.33 0.26 0.42 0.47 0.13 0.42 0.36 0.45 0.42 0.7 0.16 1.0 0.87 0.65 0.6 0.24 0.27 0.42 0.51
0.56 0.83 0.38 0.39 0.65 0.41 0.56 0.75 0.68 0.67 0.81 0.46 0.95 0.68 1.0 0.52 0.45 0.85 0.73 0.59
0.83 0.73 0.53 0.7 0.84 0.48 0.34 0.68 0.59 0.56 0.41 0.47 1.0 0.93 0.49 0.33 0.46 0.63 0.49 0.41
0.74 0.5 0.75 0.62 0.47 0.08 0.2 0.77 0.55 0.64 0.9 0.39 1.0 0.68 0.91 0.36 0.66 0.25 0.37 0.32
0.59 0.4 0.45 0.45 0.67 0.41 0.25 0.66 0.53 0.56 0.62 0.32 1.0 0.73 0.62 0.32 0.27 0.65 0.49 0.54
0.51 0.38 0.45 0.51 0.62 0.32 0.24 0.57 0.6 0.62 0.63 0.3 1.0 0.83 0.59 0.3 0.28 0.57 0.24 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)