Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00013	0.68	0.41	0.27	0.23	0.82	0.33	0.07	0.52	0.29	0.24	0.42	0.5	0.37	0.43	0.35	0.21	0.26	1.0	0.31	0.26
Gb_00057	0.27	0.49	0.46	0.31	0.63	1.0	0.04	0.96	0.28	0.41	0.3	0.72	0.44	0.34	0.16	0.03	0.85	0.12	0.05	0.27
Gb_02114	0.56	0.79	0.7	0.59	0.64	0.63	0.51	0.74	0.58	0.66	1.0	0.75	0.21	0.21	0.99	0.42	0.43	0.54	0.83	0.49
Gb_02414	0.33	0.29	0.45	0.08	0.05	0.02	0.05	0.14	0.04	0.06	1.0	0.27	0.13	0.07	0.4	0.08	0.09	0.01	0.04	0.33
Gb_03147	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03351	0.2	0.51	0.37	0.23	0.57	0.53	0.72	0.77	0.8	0.84	0.99	0.72	0.44	0.37	1.0	0.57	0.84	0.75	0.81	0.63
Gb_05112	0.39	0.34	0.56	0.5	0.54	1.0	0.3	0.87	0.75	0.92	0.97	0.65	0.24	0.22	0.73	0.58	0.5	0.65	0.76	0.31
Gb_06578	0.52	1.0	0.45	0.54	0.52	0.28	0.2	0.43	0.35	0.36	0.64	0.29	0.34	0.26	0.54	0.25	0.18	0.32	0.28	0.29
Gb_06881	0.8	0.78	0.8	0.71	0.95	0.7	0.46	0.9	0.78	0.72	1.0	0.86	0.6	0.6	0.85	0.53	0.63	0.86	0.97	0.57
Gb_07136	0.79	0.56	0.8	0.69	0.88	0.48	0.38	0.71	0.59	0.54	1.0	0.59	0.25	0.23	0.91	0.42	0.53	0.49	0.55	0.38
Gb_07385	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.76	0.15	0.15	0.15	0.76	0.68	0.52	0.12	0.26	1.0	0.0	0.01	0.09
Gb_07927	0.36	0.67	0.3	0.07	0.68	0.22	0.31	0.8	0.67	0.67	1.0	0.79	0.16	0.2	0.87	0.5	0.79	0.35	0.59	0.52
Gb_08827	0.89	0.2	0.29	0.57	0.66	0.36	0.26	0.61	0.5	0.37	0.99	0.4	0.3	0.26	1.0	0.53	0.62	0.47	0.12	0.66
Gb_08878	0.02	0.01	0.02	0.27	0.46	0.1	0.0	0.71	1.0	0.77	0.35	0.17	0.41	0.5	0.23	0.46	0.59	0.96	0.01	0.0
Gb_09735	0.47	0.16	0.29	0.22	0.47	0.72	0.43	1.0	0.32	0.19	0.57	0.54	0.53	0.52	0.52	0.28	0.14	0.28	0.37	0.45
Gb_09831	0.02	0.12	0.08	0.01	0.05	0.08	0.02	0.13	0.02	0.04	1.0	0.07	0.12	0.05	0.73	0.09	0.02	0.05	0.09	0.15
Gb_10661	0.59	1.0	0.85	0.24	0.46	0.78	0.13	0.63	0.4	0.41	0.61	0.46	0.52	0.28	0.47	0.41	0.37	0.48	0.53	0.01
Gb_10763	0.07	0.23	0.05	0.19	0.48	0.88	0.17	0.8	0.69	0.71	0.88	1.0	0.43	0.43	0.73	0.74	1.0	0.84	0.05	0.11
Gb_10841	0.41	0.62	0.38	0.49	0.6	0.54	1.0	0.66	0.47	0.38	0.49	0.45	0.22	0.26	0.64	0.44	0.29	0.61	0.97	0.61
Gb_10882	0.48	0.54	0.25	0.23	0.74	0.3	0.13	0.55	0.49	0.45	1.0	0.69	0.27	0.23	0.81	0.47	0.56	0.3	0.09	0.18
Gb_11657	0.31	0.12	0.14	0.21	0.44	0.18	0.21	0.41	0.44	0.43	1.0	0.34	0.33	0.24	0.93	0.38	0.31	0.22	0.13	0.5
Gb_12193	0.82	0.5	0.65	0.57	0.6	0.49	0.19	0.73	0.4	0.33	0.97	0.38	0.42	0.34	1.0	0.35	0.58	0.51	0.29	0.59
Gb_13019	0.66	0.99	0.77	0.61	0.94	0.97	0.84	0.87	0.62	0.63	0.54	0.5	0.65	0.51	0.58	0.47	0.46	1.0	0.73	0.71
Gb_13441	0.21	0.55	0.5	0.12	0.44	0.32	0.46	0.42	0.34	0.4	0.82	0.4	0.22	0.17	1.0	0.24	0.32	0.36	0.35	0.46
Gb_13642	0.4	0.52	0.47	0.46	0.54	0.28	0.32	0.52	0.51	0.44	1.0	0.57	0.48	0.58	0.94	0.4	0.53	0.32	0.24	0.54
Gb_13643	0.33	0.64	0.54	0.65	0.41	0.28	0.28	0.5	0.43	0.42	1.0	0.45	0.23	0.22	0.89	0.41	0.34	0.39	0.27	0.33
Gb_14972	0.25	0.53	0.35	0.2	0.37	0.15	0.54	0.61	0.46	0.51	1.0	0.4	0.43	0.34	0.93	0.33	0.29	0.27	0.21	0.49
Gb_15325	0.27	0.27	0.31	0.25	0.22	0.31	0.46	0.44	0.49	0.42	1.0	0.25	0.15	0.05	0.85	0.14	0.0	0.28	0.89	0.38
Gb_15449	0.11	0.18	0.05	0.37	0.47	0.34	0.01	1.0	0.26	0.26	0.23	0.15	0.84	0.56	0.12	0.07	0.14	0.32	0.03	0.04
Gb_16387	0.34	0.43	0.12	0.49	0.4	0.59	0.49	1.0	0.41	0.46	0.79	0.51	0.68	0.49	0.67	0.12	0.25	0.92	0.02	0.07
Gb_16805	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82
Gb_16925	0.93	0.52	0.79	0.85	0.81	0.42	0.08	0.87	0.48	0.41	1.0	0.51	0.86	0.78	0.8	0.22	0.48	0.32	0.61	0.35
Gb_16926	0.84	0.64	1.0	0.77	0.77	0.64	0.08	0.83	0.46	0.53	0.52	0.58	0.72	0.5	0.61	0.17	0.31	0.48	0.74	0.4
Gb_16934	0.75	0.77	1.0	0.7	0.5	0.35	0.1	0.61	0.37	0.38	0.5	0.37	0.17	0.19	0.41	0.07	0.27	0.32	0.75	0.26
Gb_17610	0.39	0.4	0.43	0.41	0.57	0.34	0.12	0.52	0.41	0.49	1.0	0.41	0.3	0.31	0.81	0.54	0.64	0.49	0.3	0.17
Gb_17909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.51	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_17957	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.23	0.49	0.59	1.0	0.28	0.51	0.45	0.78	0.09	0.19	0.02	0.0	0.15
Gb_18433	0.07	0.1	0.17	0.07	0.05	0.03	0.02	0.31	0.69	0.32	1.0	0.17	0.13	0.12	0.66	0.5	0.66	0.1	0.23	0.02
Gb_18712	0.23	0.23	0.23	0.46	0.53	0.54	0.06	0.71	0.76	0.74	1.0	0.81	0.17	0.13	0.94	0.73	0.99	0.5	0.11	0.47
Gb_18715	0.26	0.97	0.53	0.45	0.7	0.44	0.45	1.0	0.83	0.71	0.8	0.6	0.61	0.66	0.85	0.68	0.44	0.85	0.32	0.73
Gb_19013	0.6	0.52	0.27	0.41	0.36	0.49	0.36	0.95	0.71	0.91	0.9	0.52	1.0	0.68	0.74	0.47	0.45	0.2	0.32	0.6
Gb_19014	0.33	0.71	0.25	0.3	0.49	0.63	0.44	0.91	0.77	0.87	0.95	0.64	1.0	0.71	0.82	0.62	0.24	0.33	0.26	0.51
Gb_19015	0.34	0.38	0.2	0.51	0.37	0.33	0.25	0.91	0.79	0.84	1.0	0.49	0.99	0.76	0.89	0.45	0.25	0.21	0.2	0.23
Gb_19016	0.24	0.16	0.16	0.17	0.2	0.21	0.17	0.42	0.37	0.46	0.54	0.23	1.0	0.99	0.42	0.22	0.22	0.1	0.08	0.2
Gb_19169	0.55	0.75	0.66	1.0	0.73	0.45	0.35	0.76	0.44	0.46	0.73	0.73	0.81	0.68	0.65	0.3	0.54	0.46	0.79	0.59
Gb_19295	0.02	0.12	0.08	0.01	0.05	0.08	0.02	0.13	0.02	0.04	1.0	0.07	0.12	0.05	0.73	0.09	0.02	0.05	0.09	0.15
Gb_19578	0.46	0.7	0.41	0.38	0.66	0.31	0.27	0.59	0.55	0.51	1.0	0.52	0.55	0.41	0.98	0.41	0.4	0.41	0.34	0.64
Gb_19582	0.69	0.56	0.51	0.49	1.0	0.35	0.14	0.53	0.25	0.24	0.73	0.51	0.26	0.22	0.61	0.21	0.51	0.72	0.09	0.24
Gb_19671	0.54	0.25	0.67	0.69	0.91	0.46	0.21	0.89	0.36	0.49	1.0	0.59	0.56	0.39	0.96	0.15	0.32	0.19	0.08	0.43
Gb_19944	0.38	0.43	0.37	0.26	0.43	0.35	0.59	0.55	0.5	0.37	0.96	0.52	0.47	0.46	1.0	0.36	0.48	0.34	0.44	0.28
Gb_20043	0.69	0.37	0.4	0.82	0.75	0.35	0.04	1.0	0.64	0.61	0.56	0.42	0.62	0.53	0.42	0.55	0.71	0.78	0.86	0.51
Gb_20105	0.0	0.11	0.11	0.0	0.0	0.0	0.09	0.13	0.32	0.17	1.0	0.06	0.09	0.09	0.61	0.16	0.28	0.05	0.14	0.05
Gb_20510	1.0	0.34	0.37	0.13	0.09	0.23	0.05	0.15	0.14	0.21	0.86	0.84	0.06	0.06	0.52	0.29	0.53	0.19	0.01	0.21
Gb_20511	1.0	0.4	0.4	0.02	0.08	0.26	0.06	0.11	0.09	0.15	0.48	0.99	0.02	0.02	0.27	0.28	0.51	0.15	0.14	0.19
Gb_20585	0.56	0.54	0.34	0.57	0.61	0.39	0.3	0.72	0.48	0.37	0.56	0.41	0.22	0.24	0.55	1.0	0.57	0.73	0.55	0.4
Gb_20594	0.27	0.34	0.22	0.47	0.72	0.4	0.32	0.69	0.56	0.46	0.59	0.54	0.54	0.53	0.42	0.75	0.7	1.0	0.23	0.26
Gb_22183	0.09	0.21	0.12	0.11	0.74	0.23	0.0	0.6	0.64	0.63	0.22	0.93	0.93	1.0	0.11	0.73	0.8	0.13	0.0	0.01
Gb_22184	0.06	0.2	0.01	0.11	0.63	0.03	0.0	0.57	0.52	0.51	0.07	1.0	0.72	0.7	0.07	0.58	0.35	0.27	0.0	0.0
Gb_22207	0.34	0.44	0.38	0.43	0.39	0.52	0.17	0.45	0.38	0.35	0.45	0.43	0.25	0.1	0.5	0.16	0.12	0.38	1.0	0.14
Gb_22208	0.62	0.5	0.81	0.51	0.75	0.7	0.47	0.84	0.74	0.73	0.99	0.76	0.8	0.64	1.0	0.55	0.73	0.63	0.76	0.48
Gb_22964	0.98	0.5	0.66	0.48	0.41	0.21	0.29	0.44	0.35	0.41	0.43	0.22	0.29	0.24	0.3	0.22	0.43	0.08	0.02	1.0
Gb_22973	0.85	0.59	1.0	0.25	0.44	0.42	0.15	0.36	0.31	0.37	0.32	0.33	0.08	0.09	0.19	0.29	0.46	0.15	0.03	0.74
Gb_23712	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.43	0.56	0.39	1.0	0.18	0.06	0.06	0.14	0.67	0.09	0.0	0.41	0.0
Gb_23803	0.45	1.0	0.61	0.43	0.88	0.37	0.27	0.9	0.56	0.5	0.52	0.43	0.7	0.53	0.46	0.13	0.17	0.4	0.65	0.82
Gb_24009	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25400	0.2	0.17	0.19	0.0	0.27	0.32	0.02	0.44	0.18	0.19	1.0	0.23	0.04	0.04	0.87	0.08	0.38	0.17	0.01	0.06
Gb_25413	0.48	0.54	0.53	0.44	0.79	0.77	0.45	0.64	0.49	0.48	0.9	0.64	0.32	0.28	1.0	0.51	0.47	0.38	0.39	0.23
Gb_26272	0.01	0.0	0.0	0.0	0.3	0.29	0.0	0.02	0.23	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26307	0.55	0.67	0.5	0.49	0.91	0.6	0.6	0.88	0.68	0.68	0.86	0.65	0.74	0.66	1.0	0.51	0.4	0.99	0.76	0.62
Gb_26333	0.34	0.47	0.53	0.0	0.19	0.27	0.08	0.28	0.12	0.11	0.81	0.14	0.1	0.09	1.0	0.21	0.26	0.54	0.0	0.28
Gb_26607	0.08	0.0	0.1	0.68	0.06	0.07	0.09	0.09	0.05	0.0	1.0	0.05	0.5	0.16	0.32	0.34	0.15	0.05	0.26	0.0
Gb_26638	0.5	0.5	0.47	0.53	0.78	0.32	0.25	0.58	0.62	0.58	0.98	0.57	0.37	0.28	1.0	0.47	0.72	0.49	0.32	0.29
Gb_27203	0.58	0.44	0.58	0.98	0.96	0.39	0.12	0.84	0.56	0.69	0.55	0.52	0.26	0.37	0.44	0.05	0.08	1.0	0.14	0.02
Gb_27528	0.94	0.76	0.75	0.69	0.65	0.54	0.71	0.69	0.64	0.6	1.0	0.45	0.47	0.43	0.95	0.43	0.6	0.47	0.67	0.29
Gb_28339	0.28	0.41	0.3	0.3	0.64	0.64	0.67	0.64	0.44	0.41	0.85	0.61	0.5	0.37	1.0	0.31	0.36	0.64	0.66	0.47
Gb_28472	0.39	0.43	0.28	0.25	0.41	0.34	0.24	0.5	0.34	0.38	1.0	0.38	0.58	0.47	0.88	0.44	0.24	0.38	0.23	0.88
Gb_28829	0.87	0.68	0.56	1.0	0.62	0.31	0.25	0.67	0.45	0.37	0.76	0.41	0.81	0.65	0.67	0.38	0.36	0.64	0.59	0.44
Gb_28830	0.79	0.7	0.61	1.0	0.7	0.41	0.29	0.75	0.54	0.54	0.83	0.37	0.45	0.28	0.72	0.27	0.36	0.66	0.56	0.44
Gb_28831	0.79	0.96	0.81	1.0	0.71	0.35	0.24	0.7	0.5	0.4	0.72	0.42	0.94	0.78	0.71	0.4	0.38	0.73	0.65	0.4
Gb_29416	0.17	0.34	0.24	0.48	0.66	0.47	0.22	0.78	0.92	0.75	0.99	0.62	0.16	0.32	1.0	0.87	0.61	0.55	0.13	0.08
Gb_29556	0.39	0.71	0.33	0.0	0.12	0.32	0.12	0.38	0.22	0.23	0.97	0.16	0.13	0.18	1.0	0.15	0.34	0.24	0.23	0.1
Gb_30148	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.27	0.36	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_30864	0.19	0.1	0.0	0.31	0.1	0.24	0.06	0.26	0.42	0.4	1.0	0.29	0.13	0.19	0.8	0.3	0.18	0.18	0.27	0.13
Gb_30901	0.4	1.0	0.87	0.23	0.16	0.07	0.1	0.31	0.24	0.4	0.24	0.19	0.17	0.07	0.33	0.14	0.24	0.08	0.21	0.67
Gb_31433	0.48	0.18	0.02	0.11	0.21	0.25	0.17	0.38	0.25	0.36	1.0	0.24	0.26	0.35	0.87	0.06	0.01	0.56	0.07	0.19
Gb_32088	0.61	0.89	0.66	0.4	0.69	0.33	0.46	0.66	0.71	0.74	0.97	0.52	0.9	0.68	1.0	0.52	0.46	0.43	0.58	0.78
Gb_32145	0.64	0.85	0.49	0.69	0.87	0.63	0.46	0.92	0.69	0.59	1.0	0.7	0.71	0.62	0.95	0.68	0.85	0.79	0.93	0.78
Gb_32522	0.55	0.98	0.54	0.32	0.94	0.79	0.52	0.78	0.75	0.68	1.0	0.61	0.76	0.46	0.99	0.45	0.5	0.45	0.76	0.56
Gb_33005	0.01	0.05	0.03	0.01	0.45	0.0	0.0	0.5	0.26	0.27	0.59	1.0	0.06	0.07	0.56	0.52	0.97	0.02	0.0	0.0
Gb_33321	0.29	1.0	0.39	0.31	0.31	0.2	0.05	0.39	0.27	0.36	0.48	0.12	0.55	0.34	0.52	0.27	0.26	0.33	0.2	0.08
Gb_33616	0.21	0.18	0.3	0.44	0.46	0.81	0.01	0.83	0.27	0.3	0.41	0.62	0.25	0.26	0.15	0.06	1.0	0.11	0.02	0.24
Gb_33816	0.08	0.0	0.0	0.26	0.09	0.0	0.0	0.24	0.37	0.05	1.0	0.08	0.0	0.09	0.36	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0
Gb_34051	0.34	0.46	0.28	0.38	0.65	0.15	0.04	0.55	0.69	0.47	0.76	0.49	1.0	0.66	0.59	0.39	0.57	0.29	0.12	0.59
Gb_34082	0.79	0.97	0.78	0.75	0.99	0.59	0.59	0.83	0.51	0.59	0.96	0.53	0.88	0.78	0.95	0.44	0.44	0.8	1.0	0.43
Gb_35090	0.31	0.18	0.27	0.38	0.31	0.2	0.29	0.4	0.35	0.32	1.0	0.56	0.06	0.04	0.78	0.22	0.31	0.23	0.19	0.08
Gb_35406	0.12	0.46	0.22	0.21	0.47	0.4	0.35	0.47	0.71	0.69	0.77	0.66	0.43	0.58	0.71	0.86	1.0	0.48	0.51	0.66
Gb_36592	0.34	0.54	0.31	0.54	0.43	0.37	0.3	0.48	0.48	0.48	0.8	0.44	0.02	0.04	1.0	0.27	0.52	0.6	0.81	0.29
Gb_36598	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36789	0.2	0.08	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.12	0.99	0.0	0.08	0.69	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.08
Gb_37251	0.27	1.0	0.54	0.5	0.34	0.53	0.26	0.53	0.29	0.43	0.76	0.37	0.37	0.16	0.86	0.24	0.33	0.6	0.27	0.46
Gb_37523	0.6	0.7	0.68	0.6	0.69	0.47	0.51	0.64	0.55	0.52	0.97	0.49	0.42	0.37	1.0	0.55	0.5	0.6	0.6	0.42
Gb_38062	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.09	1.0	0.16	0.0	0.11	0.14	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38203	0.42	0.38	0.29	0.37	0.54	0.39	0.35	0.68	0.42	0.42	0.61	0.46	0.76	0.52	0.54	0.29	0.31	0.6	1.0	0.85
Gb_38580	0.27	0.14	0.16	0.2	0.53	0.03	0.0	0.49	0.23	0.24	0.62	0.7	0.14	0.13	0.5	0.18	1.0	0.13	0.05	0.16
Gb_39884	0.59	0.42	0.38	0.24	0.69	0.42	0.04	0.8	0.58	0.46	1.0	0.57	0.34	0.23	0.77	0.61	0.45	0.23	0.07	0.62
Gb_39938	0.12	0.27	0.08	0.06	0.1	0.06	0.2	0.3	0.35	0.35	0.5	0.42	0.25	0.28	0.42	0.45	1.0	0.27	0.22	0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)