Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.25 -0.01 -1.38 -0.15 -0.26 -1.23 -1.52 -0.14 0.08 0.06 0.62 -1.28 0.11 -0.55 1.29 1.11 0.17 0.01 -0.57 -0.31
-1.04 0.2 -0.51 -1.01 0.21 0.27 0.13 0.11 -0.22 -0.26 0.81 0.16 0.21 -0.26 0.6 0.13 0.34 0.21 -1.37 -0.59
0.58 -2.38 -1.53 0.62 0.62 0.98 -0.09 0.39 -0.46 -0.6 0.14 0.15 -0.04 -0.4 -0.17 -1.05 -0.36 0.47 -0.34 0.02
0.85 -1.01 -0.24 0.85 1.06 -4.42 -0.8 -0.28 0.44 -0.21 -0.43 0.01 -0.28 -0.12 0.35 0.98 0.38 -1.28 -1.6 -0.95
0.44 - -1.5 0.21 - - -1.19 -0.19 1.22 0.59 -0.96 -1.56 -0.26 -0.47 0.33 2.25 0.41 -1.08 -0.02 -0.34
0.01 -0.38 0.24 -1.59 0.49 0.34 -1.51 0.5 0.22 0.04 -0.26 0.26 0.23 0.14 -0.1 -0.17 -0.29 1.25 -1.8 -1.14
0.09 -1.15 -1.51 -1.15 -0.68 -1.0 0.02 0.08 0.02 -0.19 1.0 -0.73 0.47 1.0 1.08 0.32 0.14 -0.18 -1.61 -0.1
0.64 0.53 0.8 1.0 -0.44 -1.55 -0.7 -0.67 0.88 0.42 0.23 -0.72 -0.79 -0.25 0.54 0.28 -0.93 -1.05 -1.67 -0.78
0.89 -0.65 0.2 0.51 -0.26 -4.24 -0.64 -0.78 0.93 0.9 0.05 0.05 -0.36 0.05 0.66 0.57 -0.57 -0.46 -2.1 -1.11
-0.93 -1.41 -1.62 -0.74 -0.29 -0.98 -0.5 -0.29 0.62 0.55 1.11 -0.22 0.67 0.69 0.92 -0.6 -0.84 -0.45 -0.09 0.4
-0.88 -3.46 -1.96 -0.92 -0.01 0.05 -0.04 -0.04 0.09 -0.02 1.2 -0.51 0.22 -0.02 0.83 0.44 0.84 0.6 -2.98 -0.25
-0.23 -0.28 -0.32 -0.86 0.55 0.19 0.18 0.05 0.04 -0.18 0.06 0.38 0.07 -0.17 -0.49 0.36 0.0 0.39 -0.37 -0.13
-0.1 -0.16 -0.11 -0.38 0.06 -0.12 -0.24 0.08 0.09 0.16 0.18 0.14 -0.06 -0.08 0.01 -0.42 0.06 0.37 0.41 -0.18
0.0 -0.72 -0.57 -0.57 -0.09 -0.38 -0.19 0.15 0.26 0.26 0.4 0.23 -0.25 -0.29 0.44 -0.24 0.03 0.33 0.44 -0.03
-0.61 0.54 -0.01 0.88 0.63 -2.31 -0.32 0.23 0.08 0.02 1.03 -0.88 -0.74 -1.45 0.45 -0.28 -0.16 0.15 0.03 -1.01
1.21 -0.85 -0.76 0.47 0.3 0.42 -0.17 -0.23 -0.95 -0.65 0.61 -0.42 -0.09 -0.64 0.52 -2.26 -1.02 0.47 0.63 -0.37
-0.32 -0.8 -0.47 -0.39 0.3 -0.83 0.02 0.17 0.04 -0.21 -0.39 -0.47 0.68 0.57 -0.03 -0.25 -0.26 0.1 0.77 0.41
0.19 -0.59 -1.03 0.44 0.4 -0.93 -0.27 0.36 0.53 0.78 0.7 -0.82 -2.19 -1.48 0.95 -0.17 -0.26 -0.13 0.46 -0.9
-0.78 -4.84 -4.93 0.74 0.4 -0.06 0.22 -0.11 -0.21 -0.36 0.76 -0.32 0.24 0.2 0.85 -0.68 -0.65 0.45 0.48 0.03
0.8 -2.71 -1.6 -1.27 -0.5 -0.65 0.67 -0.17 0.09 -0.04 0.8 -1.09 0.24 -0.18 0.98 -0.62 -0.29 -0.22 -0.81 1.24
-1.44 0.71 - 2.25 - - - -0.22 -0.52 -1.26 1.03 - 1.08 0.45 -0.68 0.84 -0.34 -0.5 0.87 -
1.06 -2.19 -1.32 -0.4 0.87 1.03 -0.25 0.31 -0.39 -0.52 0.45 -0.26 -0.52 -0.33 0.65 -0.49 -0.38 0.03 -0.99 -0.22
-1.67 -0.9 -3.02 -1.74 -0.73 -0.0 1.91 -0.23 -0.15 0.0 0.17 -1.86 0.35 0.06 0.27 0.02 0.04 -0.48 1.03 -0.17
0.62 -2.23 -1.3 -0.04 0.42 0.68 -0.89 0.39 -0.66 -0.86 0.32 -0.15 0.21 0.2 0.07 -0.8 -0.07 0.86 -0.49 0.41
-0.84 - -2.9 -1.27 0.18 0.89 -0.17 0.23 -0.38 -0.87 0.89 -0.16 0.93 0.68 0.58 -0.25 -0.29 0.31 -0.04 -0.14
0.72 -1.07 0.46 0.06 0.84 0.78 0.34 0.15 -0.33 -0.4 -0.64 -0.13 -0.38 -0.89 0.2 -2.11 -0.84 0.62 -0.59 0.01
-0.37 -1.17 -0.04 0.79 0.58 0.73 0.4 0.27 -0.66 -0.65 -0.26 -0.12 0.13 0.2 -0.27 -0.38 -0.13 0.37 -0.89 -0.34
0.33 -0.58 -0.25 -0.47 0.79 -0.29 -0.12 -0.08 -0.1 0.13 0.74 -0.49 0.23 -0.05 0.51 -0.35 -0.32 0.06 -1.24 0.09
0.66 0.59 0.51 -0.32 -0.07 1.14 0.34 0.17 -0.45 -0.95 -0.69 -0.24 -0.12 -0.34 -0.67 -1.43 -0.7 0.45 -0.18 -0.25
-0.06 -0.47 0.26 -0.06 1.01 -1.74 -0.79 -0.17 0.23 -0.05 1.07 -0.78 -1.98 -1.93 0.68 0.81 -0.04 -0.06 0.53 -1.63
0.65 - -3.95 0.34 0.06 -0.68 -1.71 -0.23 -0.23 -0.5 0.46 -0.62 1.04 1.02 0.42 -0.44 0.23 0.33 -0.81 0.61
-0.14 -0.18 -0.79 0.03 0.45 0.45 -0.61 0.03 -0.04 -0.37 -0.35 -0.39 0.36 0.81 -0.52 -0.16 -0.16 0.81 -0.98 0.16
0.55 -0.56 -1.67 1.05 0.14 -4.11 -0.94 -0.01 0.07 -0.16 0.54 -3.57 -0.42 0.41 0.53 1.47 0.38 -0.94 -0.07 -2.03
-0.5 -0.18 -0.24 -0.64 -0.16 0.28 -0.21 0.16 -0.04 -0.09 0.2 0.25 -0.66 -0.68 0.29 0.58 0.39 0.95 -0.59 -0.53
0.27 0.03 -1.3 0.94 -0.52 -1.4 -0.41 0.06 0.44 0.22 1.29 -1.71 -1.49 -1.96 0.51 -1.24 0.86 -0.08 1.04 -5.03
0.19 -0.85 -0.67 -0.67 0.34 0.45 0.36 0.14 -0.1 -0.3 0.42 -0.41 -0.13 -0.21 0.16 0.38 0.16 0.43 -0.93 0.02
-0.36 -1.15 -0.42 -1.1 -0.59 0.4 -0.02 0.05 -0.29 -0.07 0.8 -0.56 0.05 -0.06 0.69 -2.42 -0.29 0.64 -1.32 1.48
1.22 -2.18 -1.27 0.76 0.62 0.2 -0.89 0.18 -0.18 -0.59 -0.27 -0.71 -0.82 -1.67 -0.09 -0.23 -0.76 0.73 1.23 -0.43
0.32 -1.58 -0.78 0.61 0.61 -0.12 -0.24 0.13 0.1 0.42 0.59 0.37 -0.97 -1.23 0.3 -0.67 0.31 0.36 -0.18 -0.93
1.03 -3.83 -2.36 0.52 0.34 1.44 -0.63 0.14 -0.74 -0.99 0.5 -0.65 -0.11 0.02 -0.07 -0.49 -1.62 0.65 -0.32 0.09
1.31 -0.36 0.28 0.18 - -1.19 -2.21 -0.02 0.65 0.74 0.75 -3.4 0.19 -1.65 0.78 1.13 -0.0 -2.71 -0.34 -1.21
0.19 -1.31 -0.8 0.23 0.65 -0.47 -0.44 -0.36 -0.06 -0.08 0.24 -0.28 0.23 0.2 0.15 0.68 0.08 0.23 -0.66 0.13
0.6 - -0.92 0.09 0.81 -1.3 -0.2 0.07 0.02 0.12 0.64 -0.61 0.15 0.39 1.07 -1.25 -1.79 0.43 -1.74 0.7
0.91 -0.26 -1.4 0.93 -1.99 - -1.52 -0.24 0.37 -1.01 0.89 -5.79 -0.02 -0.05 0.92 1.67 0.16 -1.09 -0.39 -0.94
0.68 - - - - - 0.88 1.02 - - 1.55 -0.3 0.31 0.26 - 1.94 1.76 - 0.17 -
1.29 -0.48 -0.06 -0.2 0.41 -1.35 0.18 -0.29 -0.52 -0.62 -0.11 -0.93 -0.19 -0.26 0.69 1.06 -0.34 -0.61 -0.99 0.23
0.72 -1.34 -0.68 -0.29 -0.07 -0.72 -0.95 0.1 0.29 -0.01 0.84 -0.43 -0.7 -0.54 0.93 1.1 0.15 -0.86 -0.53 -0.11
0.16 -1.86 -2.7 -1.58 -0.09 -1.02 0.07 0.12 0.19 0.23 1.29 -0.91 0.41 0.49 1.38 0.23 -0.27 -0.06 -0.91 -1.23
0.21 -0.46 -0.72 -0.51 0.65 -1.03 0.44 -0.11 0.1 -0.04 0.35 -1.01 -1.65 -1.95 0.7 0.34 0.4 0.36 0.39 0.36
0.61 -0.06 -0.41 -1.42 0.28 1.01 -0.11 -0.03 0.16 -0.35 -0.26 -0.06 -2.6 -2.09 -0.03 0.43 0.64 0.44 -1.32 0.59
0.64 -2.16 -1.07 -0.03 1.08 0.65 0.37 0.27 -0.16 0.27 -0.21 -0.52 -0.16 -0.4 0.2 -0.87 -0.32 -0.08 -0.95 0.37
0.83 -1.1 -0.41 0.13 0.65 -0.25 -0.26 0.16 -0.16 -0.65 0.49 -0.3 0.27 0.28 0.53 -0.73 -0.29 0.08 -0.68 -0.29
-1.46 0.24 -0.9 -0.81 -0.37 -2.17 1.54 -0.41 0.06 0.38 1.34 -0.5 -0.65 -3.01 1.71 0.28 -1.19 -0.62 -0.36 -
0.72 -1.21 -0.88 -1.47 1.12 -0.48 -0.42 -0.59 -0.57 -0.53 0.38 -1.27 0.49 0.39 0.63 -0.29 -1.05 1.18 -1.35 0.5
1.03 - -0.34 1.79 - -0.09 -1.08 0.1 0.32 -0.41 0.36 -2.29 0.81 -0.19 0.53 0.24 -1.81 -0.46 0.33 -2.18
-0.24 -1.91 -2.34 -0.96 -1.08 -0.57 0.96 -0.14 0.55 0.77 1.13 -2.45 -0.58 -0.55 1.44 0.31 -0.15 -1.1 0.36 -0.53
0.97 - -0.66 - -0.01 -1.46 -0.88 0.28 0.78 0.69 1.46 -2.62 -0.98 - 1.77 -0.96 -0.55 -0.71 - 1.22
-0.18 -3.48 -1.84 -0.36 0.32 -0.54 -0.39 0.38 -0.3 -0.29 0.72 -0.15 0.56 0.33 0.52 -0.75 -0.19 0.39 0.81 0.11
-0.77 -0.89 0.19 0.07 1.19 - -4.25 0.14 0.16 1.07 1.25 -0.1 -1.17 -0.6 0.72 -0.41 -1.03 -0.47 0.77 -1.93
0.56 -2.97 -1.92 0.0 0.64 0.64 0.09 0.1 -0.16 -0.27 0.23 -0.51 -1.33 -1.41 0.37 0.12 0.13 0.53 -0.12 0.74
1.0 1.1 -3.24 1.13 -1.27 -1.6 -1.6 -0.01 -0.24 -0.29 0.16 -2.01 0.35 0.41 0.33 1.07 -0.12 -0.08 -1.43 -1.95
-0.18 - -4.33 0.36 -1.22 -1.68 -1.25 0.34 0.72 0.27 1.54 -0.81 0.56 0.09 1.48 0.83 0.05 -1.51 -1.68 -2.21
0.35 -0.16 -0.48 -0.4 0.71 -0.21 -0.13 -0.36 0.23 0.17 1.18 -0.93 -2.94 -3.01 0.95 0.9 -0.05 -0.0 -0.66 -1.25
-0.51 -0.16 -1.26 -2.37 0.48 -0.01 0.96 -0.1 0.62 0.44 0.14 -0.87 -0.79 -0.69 0.59 0.23 -0.51 -0.06 -0.76 0.88
-0.14 -0.91 -1.2 -0.68 -0.04 -1.22 0.1 0.16 0.18 0.12 0.83 -0.94 0.49 0.42 1.15 0.31 0.28 0.1 -1.01 -1.33
-0.26 -0.44 0.16 -0.29 -0.55 -0.24 -1.25 0.45 0.08 0.09 -0.87 0.2 0.21 0.46 -0.57 0.26 0.76 1.07 -1.27 -0.41
0.68 -1.76 -0.49 0.59 0.62 -1.02 -1.21 -0.11 0.42 -0.23 0.69 -0.53 -0.49 -1.03 0.74 -0.2 0.69 0.08 -1.55 0.31
0.96 -1.71 -0.3 0.51 0.71 -1.04 -0.23 0.1 -0.26 -0.26 -0.79 -0.23 0.39 -0.04 -0.54 -0.26 -0.35 0.54 0.4 0.0
-0.21 -0.52 -0.51 -0.08 0.45 0.31 -0.06 0.25 -0.45 -0.58 0.34 0.14 0.23 -0.0 0.27 -0.34 0.08 0.21 -0.46 0.21
0.15 -0.62 -0.41 -1.33 0.36 -1.17 -0.49 0.06 0.3 0.2 0.64 -0.35 0.27 0.05 0.51 0.71 -0.52 -0.22 0.11 -0.1
-1.2 -1.67 -2.47 -3.25 -1.42 -0.7 1.6 0.01 0.45 0.65 0.72 -1.81 0.61 0.63 0.55 -0.45 -0.22 -1.32 0.21 0.48
0.54 -0.82 -0.04 -0.11 0.72 -0.07 -0.13 -0.26 -0.63 -0.6 0.18 -0.52 -1.21 -0.24 -0.04 -0.92 -0.71 0.8 -0.27 1.4
-0.3 -0.04 -1.08 0.87 0.37 -0.28 -0.25 -0.2 -0.19 -0.54 0.38 -0.61 0.22 0.64 -0.09 0.08 0.02 0.42 -0.77 -0.16
1.59 1.4 0.23 1.94 - 0.43 - 0.36 -0.55 - - -0.63 0.52 -1.16 1.15 - - - 0.34 -
0.53 -0.96 -0.63 -0.65 0.6 -0.07 -0.8 0.04 -0.23 -0.32 -0.06 -0.46 0.18 0.3 0.1 0.24 0.41 0.55 -0.52 0.3
0.46 - -1.07 -1.26 -0.18 1.5 -0.73 -0.2 -0.15 -0.45 -0.31 -0.75 -0.36 0.51 0.05 0.8 0.07 1.1 -1.23 -0.16
-0.29 -1.34 -1.22 0.48 0.65 0.69 -0.4 -0.19 -0.83 -0.85 0.18 -0.18 0.12 0.33 0.07 0.04 0.11 0.63 -0.32 0.2
-1.54 -1.02 -2.23 -1.4 -0.55 0.12 1.7 -0.04 -0.06 -0.14 0.93 -0.3 -2.08 -1.96 0.75 0.34 0.4 0.05 0.2 0.09
0.33 0.0 -0.95 -0.62 -0.94 -2.5 -1.26 -0.02 0.02 0.47 1.07 -3.28 0.69 0.1 0.94 1.62 -0.18 -3.37 -0.94 -0.55
-0.39 0.98 0.05 -0.79 0.66 -0.07 -1.06 0.35 0.6 0.36 -0.33 0.39 -0.84 -0.58 -0.47 0.09 -0.45 0.88 -0.94 -1.51
-0.94 0.99 0.12 -0.67 0.38 0.61 -1.18 0.36 0.59 0.5 -0.92 0.35 -0.47 -0.2 -1.08 0.17 -0.44 0.84 -0.81 -2.25
0.27 -0.03 -0.24 -0.14 0.11 -0.81 -0.87 -0.23 0.52 0.39 0.22 -0.82 -0.61 -0.73 0.45 0.73 -0.14 0.63 -0.33 0.0
0.06 -1.34 -1.53 -0.39 0.25 -1.45 -0.6 -0.59 0.67 0.65 0.52 -0.31 -0.09 -0.07 0.68 0.73 0.2 0.43 -1.16 0.11
0.23 - -0.33 -0.5 - - 0.68 -0.19 0.86 0.84 1.1 -1.58 -0.41 -0.36 1.69 -1.42 -0.02 -2.2 0.49 0.03
-1.71 0.31 -0.21 0.18 -0.36 0.04 -0.68 0.19 -0.31 -0.39 1.0 -0.36 0.69 -0.08 0.97 -0.64 0.26 0.27 -2.04 -0.42
-0.05 -1.44 -1.17 -0.93 -0.25 -1.04 0.14 -0.32 0.12 0.33 1.14 -0.63 0.71 0.58 1.15 -0.08 -0.43 -0.14 -1.4 -0.06
-0.26 -1.1 -1.79 -0.31 -0.61 -1.73 0.39 -0.14 0.53 0.41 0.27 -1.13 0.68 0.32 0.66 0.64 0.48 0.61 -0.74 -1.04
0.14 -0.72 -1.1 -0.61 -0.36 0.26 0.42 -0.17 -0.19 -0.2 0.69 -0.67 -0.02 -0.1 0.63 -0.18 0.5 -0.15 -1.06 0.86
0.78 - -3.26 - -0.07 1.19 -5.7 1.06 0.77 0.56 -1.53 0.58 -0.52 -1.18 -1.91 -1.12 0.13 0.73 -0.07 1.18
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0.94 -1.74 -0.58 0.02 0.85 0.56 0.02 0.05 -0.46 -0.68 -0.2 -0.7 -0.43 -0.23 0.37 -0.16 -0.3 0.3 -0.26 0.33
-0.09 -0.91 -0.92 -0.5 -0.11 -0.26 -1.22 0.01 0.01 -0.02 1.16 -0.61 0.8 0.61 0.95 0.46 -0.87 -0.1 -0.95 -0.62
0.32 -0.27 -0.4 -0.46 0.73 -0.16 -0.12 -0.02 -0.43 -0.41 0.04 0.09 0.27 0.54 0.19 -0.86 -0.57 0.57 -0.13 -0.04
1.17 0.1 -1.87 0.67 -0.84 -1.21 -0.44 0.87 0.27 0.53 0.43 -2.23 -1.03 -1.25 0.76 0.44 0.2 -2.19 -0.08 -0.41
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1.79 - - 2.28 - - -2.19 0.8 -0.56 -0.7 0.11 -0.97 -2.6 -0.82 0.41 0.6 0.79 - 0.24 -1.51
0.58 -2.55 -0.92 0.27 0.77 -0.03 -0.5 0.26 -0.21 -0.56 0.36 0.21 -0.52 -0.62 0.22 -0.33 0.13 0.94 -0.53 0.03
-0.92 -0.02 -0.55 -0.08 0.21 -0.6 -1.83 -0.68 0.81 0.79 1.28 -0.42 0.8 0.71 1.19 -1.02 -1.56 -0.71 -5.48 -1.46
0.98 - -3.15 -1.17 0.44 -0.85 -0.32 -0.08 0.24 0.3 0.65 -0.39 0.06 -0.32 0.44 -0.31 0.15 0.73 -0.97 0.83
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-0.71 -0.61 -0.44 0.05 0.56 1.17 -0.57 0.74 -0.49 -0.67 0.53 -0.47 -0.67 -0.56 0.34 -0.71 -0.31 0.85 -0.24 -0.4
0.11 -1.79 -1.31 -1.4 0.02 -1.24 0.13 0.06 0.56 0.36 0.84 -0.88 0.1 0.22 1.0 0.55 0.53 0.22 -1.53 -0.89
0.74 -0.91 -1.98 0.85 0.0 -0.39 -1.87 -0.37 -0.51 -0.38 0.45 -5.63 0.74 0.11 -0.24 1.61 0.34 -0.63 -0.21 -0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.