Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.48 0.41 0.16 0.37 0.34 0.17 0.14 0.37 0.43 0.43 0.63 0.17 0.44 0.28 1.0 0.88 0.46 0.41 0.28 0.33
0.28 0.66 0.4 0.28 0.66 0.69 0.63 0.62 0.49 0.48 1.0 0.64 0.66 0.48 0.87 0.63 0.72 0.66 0.22 0.38
0.76 0.1 0.18 0.78 0.78 1.0 0.47 0.66 0.37 0.33 0.56 0.56 0.49 0.38 0.45 0.24 0.39 0.7 0.4 0.51
0.86 0.24 0.41 0.86 1.0 0.02 0.28 0.4 0.65 0.41 0.36 0.48 0.4 0.44 0.61 0.94 0.63 0.2 0.16 0.25
0.29 0.0 0.07 0.24 0.0 0.0 0.09 0.18 0.49 0.32 0.11 0.07 0.18 0.15 0.26 1.0 0.28 0.1 0.21 0.17
0.42 0.32 0.5 0.14 0.59 0.53 0.15 0.6 0.49 0.43 0.35 0.5 0.49 0.46 0.39 0.37 0.34 1.0 0.12 0.19
0.51 0.21 0.17 0.21 0.3 0.24 0.48 0.5 0.48 0.42 0.95 0.29 0.66 0.95 1.0 0.59 0.52 0.42 0.16 0.44
0.78 0.72 0.87 1.0 0.37 0.17 0.31 0.31 0.92 0.67 0.59 0.3 0.29 0.42 0.73 0.61 0.26 0.24 0.16 0.29
0.97 0.33 0.6 0.75 0.44 0.03 0.34 0.31 1.0 0.97 0.54 0.54 0.41 0.54 0.83 0.78 0.35 0.38 0.12 0.24
0.24 0.17 0.15 0.28 0.38 0.24 0.33 0.38 0.71 0.68 1.0 0.4 0.74 0.75 0.88 0.31 0.26 0.34 0.44 0.61
0.24 0.04 0.11 0.23 0.43 0.45 0.42 0.42 0.47 0.43 1.0 0.31 0.51 0.43 0.78 0.59 0.78 0.66 0.06 0.37
0.58 0.56 0.55 0.38 1.0 0.78 0.78 0.71 0.7 0.61 0.71 0.89 0.72 0.61 0.49 0.88 0.68 0.89 0.53 0.62
0.71 0.67 0.7 0.58 0.79 0.69 0.64 0.8 0.8 0.84 0.86 0.83 0.72 0.71 0.76 0.56 0.79 0.97 1.0 0.67
0.74 0.45 0.5 0.49 0.69 0.56 0.64 0.81 0.88 0.88 0.97 0.86 0.62 0.6 1.0 0.62 0.75 0.92 0.99 0.72
0.32 0.71 0.49 0.9 0.76 0.1 0.39 0.58 0.52 0.5 1.0 0.27 0.29 0.18 0.67 0.4 0.44 0.54 0.5 0.24
1.0 0.24 0.26 0.6 0.53 0.58 0.38 0.37 0.22 0.28 0.66 0.32 0.41 0.28 0.62 0.09 0.21 0.6 0.67 0.33
0.47 0.34 0.42 0.45 0.72 0.33 0.59 0.66 0.6 0.51 0.45 0.42 0.94 0.87 0.57 0.49 0.49 0.63 1.0 0.78
0.59 0.34 0.25 0.7 0.68 0.27 0.43 0.66 0.74 0.89 0.84 0.29 0.11 0.18 1.0 0.46 0.43 0.47 0.71 0.28
0.32 0.02 0.02 0.93 0.73 0.54 0.65 0.51 0.48 0.43 0.94 0.45 0.66 0.64 1.0 0.35 0.35 0.76 0.78 0.57
0.74 0.06 0.14 0.18 0.3 0.27 0.67 0.38 0.45 0.41 0.74 0.2 0.5 0.37 0.84 0.28 0.35 0.36 0.24 1.0
0.08 0.34 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.09 0.43 0.0 0.45 0.29 0.13 0.37 0.17 0.15 0.38 0.0
1.0 0.1 0.19 0.36 0.87 0.97 0.4 0.59 0.37 0.33 0.65 0.4 0.33 0.38 0.75 0.34 0.37 0.49 0.24 0.41
0.08 0.14 0.03 0.08 0.16 0.27 1.0 0.23 0.24 0.27 0.3 0.07 0.34 0.28 0.32 0.27 0.27 0.19 0.54 0.24
0.84 0.12 0.22 0.53 0.73 0.88 0.3 0.72 0.35 0.3 0.69 0.5 0.64 0.63 0.58 0.32 0.52 1.0 0.39 0.73
0.29 0.0 0.07 0.22 0.6 0.98 0.47 0.62 0.4 0.29 0.98 0.47 1.0 0.84 0.78 0.44 0.43 0.65 0.51 0.48
0.92 0.27 0.77 0.58 1.0 0.96 0.71 0.62 0.44 0.42 0.36 0.51 0.43 0.3 0.64 0.13 0.31 0.86 0.37 0.56
0.45 0.26 0.56 1.0 0.86 0.96 0.76 0.7 0.37 0.37 0.48 0.53 0.63 0.66 0.48 0.44 0.53 0.74 0.31 0.46
0.73 0.39 0.49 0.42 1.0 0.47 0.53 0.55 0.54 0.63 0.96 0.41 0.68 0.56 0.82 0.45 0.46 0.6 0.24 0.62
0.72 0.68 0.65 0.36 0.43 1.0 0.57 0.51 0.33 0.23 0.28 0.38 0.42 0.36 0.28 0.17 0.28 0.62 0.4 0.38
0.46 0.35 0.57 0.46 0.96 0.14 0.28 0.42 0.56 0.46 1.0 0.28 0.12 0.13 0.77 0.83 0.46 0.46 0.69 0.15
0.76 0.0 0.03 0.62 0.51 0.3 0.15 0.41 0.41 0.34 0.67 0.32 1.0 0.99 0.65 0.36 0.57 0.61 0.28 0.74
0.52 0.5 0.33 0.58 0.78 0.78 0.37 0.58 0.55 0.44 0.45 0.44 0.73 1.0 0.4 0.51 0.51 1.0 0.29 0.64
0.53 0.25 0.11 0.75 0.4 0.02 0.19 0.36 0.38 0.32 0.53 0.03 0.27 0.48 0.52 1.0 0.47 0.19 0.34 0.09
0.37 0.46 0.44 0.33 0.46 0.63 0.45 0.58 0.5 0.49 0.6 0.61 0.33 0.32 0.63 0.78 0.68 1.0 0.34 0.36
0.49 0.42 0.17 0.78 0.28 0.15 0.31 0.43 0.55 0.47 1.0 0.12 0.15 0.1 0.58 0.17 0.74 0.38 0.84 0.01
0.83 0.4 0.46 0.46 0.93 1.0 0.94 0.8 0.68 0.59 0.98 0.55 0.67 0.63 0.82 0.95 0.82 0.98 0.38 0.74
0.28 0.16 0.27 0.17 0.24 0.47 0.35 0.37 0.29 0.34 0.62 0.24 0.37 0.34 0.58 0.07 0.29 0.56 0.14 1.0
0.99 0.09 0.18 0.72 0.65 0.49 0.23 0.48 0.38 0.28 0.35 0.26 0.24 0.13 0.4 0.36 0.25 0.71 1.0 0.32
0.81 0.22 0.38 0.99 1.0 0.6 0.55 0.72 0.7 0.87 0.98 0.84 0.33 0.28 0.8 0.41 0.81 0.84 0.58 0.34
0.75 0.03 0.07 0.53 0.47 1.0 0.24 0.41 0.22 0.19 0.52 0.24 0.34 0.38 0.35 0.26 0.12 0.58 0.3 0.39
1.0 0.31 0.49 0.46 0.0 0.18 0.09 0.4 0.63 0.67 0.68 0.04 0.46 0.13 0.69 0.88 0.4 0.06 0.32 0.17
0.71 0.25 0.36 0.73 0.98 0.45 0.46 0.49 0.6 0.59 0.74 0.51 0.73 0.72 0.69 1.0 0.66 0.73 0.39 0.68
0.72 0.0 0.25 0.51 0.83 0.19 0.41 0.5 0.48 0.52 0.74 0.31 0.53 0.62 1.0 0.2 0.14 0.64 0.14 0.78
0.59 0.26 0.12 0.6 0.08 0.0 0.11 0.27 0.41 0.16 0.58 0.01 0.31 0.3 0.59 1.0 0.35 0.15 0.24 0.16
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.53 0.0 0.0 0.76 0.21 0.32 0.31 0.0 1.0 0.89 0.0 0.29 0.0
1.0 0.29 0.39 0.36 0.54 0.16 0.46 0.33 0.29 0.27 0.38 0.21 0.36 0.34 0.66 0.85 0.32 0.27 0.21 0.48
0.77 0.18 0.29 0.38 0.44 0.28 0.24 0.5 0.57 0.46 0.84 0.35 0.29 0.32 0.88 1.0 0.52 0.26 0.32 0.43
0.43 0.11 0.06 0.13 0.36 0.19 0.4 0.42 0.44 0.45 0.94 0.2 0.51 0.54 1.0 0.45 0.32 0.37 0.2 0.16
0.71 0.45 0.37 0.43 0.96 0.3 0.83 0.57 0.66 0.6 0.79 0.31 0.2 0.16 1.0 0.78 0.81 0.79 0.81 0.79
0.76 0.48 0.37 0.18 0.6 1.0 0.46 0.49 0.56 0.39 0.41 0.48 0.08 0.12 0.48 0.67 0.77 0.67 0.2 0.75
0.74 0.11 0.23 0.46 1.0 0.74 0.61 0.57 0.42 0.57 0.41 0.33 0.42 0.36 0.55 0.26 0.38 0.45 0.25 0.61
1.0 0.26 0.42 0.61 0.88 0.47 0.47 0.63 0.5 0.36 0.79 0.46 0.68 0.68 0.81 0.34 0.46 0.59 0.35 0.46
0.11 0.36 0.16 0.18 0.24 0.07 0.89 0.23 0.32 0.4 0.78 0.22 0.19 0.04 1.0 0.37 0.13 0.2 0.24 0.0
0.73 0.19 0.24 0.16 0.96 0.32 0.33 0.29 0.3 0.31 0.58 0.18 0.62 0.58 0.68 0.36 0.21 1.0 0.17 0.62
0.59 0.0 0.23 1.0 0.0 0.27 0.14 0.31 0.36 0.22 0.37 0.06 0.51 0.25 0.42 0.34 0.08 0.21 0.37 0.06
0.31 0.1 0.07 0.19 0.17 0.25 0.71 0.33 0.54 0.63 0.8 0.07 0.25 0.25 1.0 0.46 0.33 0.17 0.47 0.25
0.57 0.0 0.18 0.0 0.29 0.11 0.16 0.36 0.5 0.47 0.8 0.05 0.15 0.0 1.0 0.15 0.2 0.18 0.0 0.68
0.5 0.05 0.16 0.45 0.71 0.39 0.43 0.74 0.46 0.47 0.94 0.52 0.84 0.72 0.82 0.34 0.5 0.75 1.0 0.62
0.25 0.23 0.48 0.44 0.96 0.0 0.02 0.46 0.47 0.88 1.0 0.39 0.19 0.28 0.69 0.32 0.2 0.3 0.72 0.11
0.88 0.08 0.16 0.6 0.93 0.93 0.63 0.64 0.53 0.5 0.7 0.42 0.24 0.23 0.77 0.65 0.65 0.86 0.55 1.0
0.92 0.98 0.05 1.0 0.19 0.15 0.15 0.46 0.39 0.38 0.51 0.11 0.58 0.61 0.58 0.96 0.42 0.43 0.17 0.12
0.31 0.0 0.02 0.44 0.15 0.11 0.14 0.44 0.57 0.42 1.0 0.2 0.51 0.37 0.96 0.61 0.36 0.12 0.11 0.07
0.56 0.4 0.32 0.33 0.72 0.38 0.4 0.34 0.52 0.5 1.0 0.23 0.06 0.05 0.86 0.82 0.43 0.44 0.28 0.19
0.36 0.46 0.21 0.1 0.72 0.51 1.0 0.48 0.79 0.7 0.57 0.28 0.3 0.32 0.77 0.6 0.36 0.49 0.3 0.95
0.41 0.24 0.2 0.28 0.44 0.19 0.49 0.51 0.51 0.49 0.81 0.24 0.64 0.6 1.0 0.56 0.55 0.48 0.22 0.18
0.4 0.35 0.53 0.39 0.33 0.4 0.2 0.65 0.5 0.51 0.26 0.55 0.55 0.65 0.32 0.57 0.81 1.0 0.2 0.36
0.96 0.18 0.43 0.9 0.93 0.3 0.26 0.55 0.8 0.51 0.97 0.42 0.43 0.29 1.0 0.52 0.97 0.64 0.2 0.74
1.0 0.16 0.42 0.74 0.84 0.25 0.44 0.55 0.43 0.43 0.3 0.44 0.68 0.5 0.35 0.43 0.4 0.75 0.68 0.52
0.63 0.51 0.52 0.7 1.0 0.91 0.71 0.87 0.54 0.49 0.93 0.81 0.86 0.73 0.89 0.58 0.77 0.85 0.53 0.85
0.68 0.4 0.46 0.24 0.78 0.27 0.43 0.64 0.75 0.7 0.96 0.48 0.74 0.63 0.87 1.0 0.43 0.53 0.66 0.57
0.14 0.1 0.06 0.03 0.12 0.2 1.0 0.33 0.45 0.52 0.54 0.09 0.5 0.51 0.48 0.24 0.28 0.13 0.38 0.46
0.55 0.21 0.37 0.35 0.62 0.36 0.35 0.32 0.24 0.25 0.43 0.26 0.16 0.32 0.37 0.2 0.23 0.66 0.32 1.0
0.44 0.53 0.26 1.0 0.71 0.45 0.46 0.47 0.48 0.38 0.71 0.36 0.64 0.85 0.51 0.58 0.55 0.73 0.32 0.49
0.78 0.69 0.31 1.0 0.0 0.35 0.0 0.34 0.18 0.0 0.0 0.17 0.37 0.12 0.58 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
0.95 0.34 0.42 0.42 1.0 0.63 0.38 0.68 0.56 0.53 0.63 0.48 0.75 0.81 0.71 0.78 0.88 0.96 0.46 0.81
0.48 0.0 0.17 0.15 0.31 1.0 0.21 0.31 0.32 0.26 0.28 0.21 0.27 0.5 0.37 0.61 0.37 0.76 0.15 0.31
0.51 0.24 0.27 0.87 0.97 1.0 0.47 0.54 0.35 0.34 0.7 0.55 0.67 0.78 0.65 0.64 0.67 0.96 0.5 0.71
0.11 0.15 0.07 0.12 0.21 0.33 1.0 0.3 0.3 0.28 0.59 0.25 0.07 0.08 0.52 0.39 0.41 0.32 0.35 0.33
0.41 0.33 0.17 0.21 0.17 0.06 0.14 0.32 0.33 0.45 0.68 0.03 0.52 0.35 0.62 1.0 0.29 0.03 0.17 0.22
0.39 1.0 0.53 0.29 0.8 0.49 0.24 0.65 0.77 0.65 0.41 0.66 0.28 0.34 0.37 0.54 0.37 0.94 0.27 0.18
0.26 1.0 0.54 0.32 0.65 0.77 0.22 0.64 0.75 0.71 0.27 0.64 0.36 0.44 0.24 0.57 0.37 0.9 0.29 0.11
0.73 0.59 0.51 0.54 0.65 0.34 0.33 0.51 0.86 0.79 0.7 0.34 0.39 0.36 0.82 1.0 0.55 0.93 0.48 0.6
0.63 0.24 0.21 0.46 0.72 0.22 0.4 0.4 0.96 0.95 0.86 0.49 0.57 0.58 0.97 1.0 0.7 0.81 0.27 0.65
0.36 0.0 0.25 0.22 0.0 0.0 0.5 0.27 0.56 0.55 0.67 0.1 0.23 0.24 1.0 0.12 0.31 0.07 0.44 0.32
0.15 0.62 0.43 0.57 0.39 0.52 0.31 0.57 0.4 0.38 1.0 0.39 0.81 0.47 0.98 0.32 0.6 0.6 0.12 0.38
0.43 0.17 0.2 0.24 0.38 0.22 0.49 0.36 0.49 0.57 0.99 0.29 0.73 0.67 1.0 0.43 0.33 0.41 0.17 0.43
0.52 0.29 0.18 0.5 0.41 0.19 0.82 0.56 0.9 0.83 0.75 0.29 1.0 0.77 0.98 0.97 0.87 0.95 0.37 0.3
0.61 0.33 0.26 0.36 0.43 0.66 0.74 0.49 0.48 0.48 0.89 0.35 0.54 0.51 0.85 0.49 0.78 0.49 0.26 1.0
0.75 0.0 0.05 0.0 0.42 1.0 0.01 0.91 0.75 0.64 0.15 0.65 0.31 0.19 0.12 0.2 0.48 0.73 0.42 0.99
0.35 0.0 0.03 0.0 0.32 0.34 0.06 0.17 0.34 0.19 0.34 0.05 0.16 0.24 0.38 0.19 0.14 0.19 0.15 1.0
0.35 0.15 0.22 0.3 0.84 0.81 0.36 0.65 0.56 0.54 0.91 0.66 1.0 0.93 0.81 0.42 0.69 0.82 0.27 0.79
1.0 0.16 0.35 0.53 0.94 0.77 0.53 0.54 0.38 0.33 0.45 0.32 0.39 0.44 0.67 0.46 0.42 0.64 0.43 0.66
0.42 0.24 0.24 0.32 0.42 0.37 0.19 0.45 0.45 0.44 1.0 0.29 0.78 0.68 0.86 0.61 0.24 0.42 0.23 0.29
0.75 0.5 0.46 0.44 1.0 0.54 0.55 0.59 0.45 0.45 0.62 0.64 0.73 0.87 0.69 0.33 0.41 0.89 0.55 0.58
1.0 0.47 0.12 0.7 0.25 0.19 0.33 0.81 0.54 0.64 0.6 0.09 0.22 0.19 0.75 0.6 0.51 0.1 0.42 0.33
0.55 0.52 0.41 0.24 1.0 0.27 0.43 0.3 0.43 0.47 0.53 0.29 0.35 0.4 0.32 0.32 0.25 0.46 0.26 0.34
0.27 0.15 0.24 0.26 0.27 0.23 0.36 0.45 0.65 0.6 1.0 0.26 0.55 0.53 0.8 0.57 0.5 0.21 0.32 0.26
0.71 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.05 0.36 0.14 0.13 0.22 0.11 0.03 0.12 0.27 0.31 0.36 0.0 0.24 0.07
0.78 0.09 0.27 0.63 0.89 0.51 0.37 0.62 0.45 0.35 0.67 0.6 0.36 0.34 0.61 0.41 0.57 1.0 0.36 0.53
0.22 0.41 0.28 0.39 0.47 0.27 0.12 0.26 0.72 0.71 1.0 0.31 0.71 0.67 0.94 0.2 0.14 0.25 0.01 0.15
1.0 0.0 0.06 0.22 0.69 0.28 0.4 0.48 0.6 0.62 0.79 0.39 0.53 0.41 0.69 0.41 0.56 0.84 0.26 0.9
0.15 0.22 0.2 0.08 0.11 0.01 0.52 0.21 0.36 0.27 0.88 0.22 0.57 0.49 1.0 0.17 0.1 0.24 0.08 0.06
0.45 0.32 0.25 0.41 0.81 1.0 0.45 0.86 0.53 0.43 0.76 0.6 0.55 0.53 0.57 0.47 0.67 0.98 0.25 0.5
0.32 0.26 0.18 0.71 0.63 1.0 0.41 0.8 0.36 0.35 0.84 0.35 0.54 0.65 0.72 0.37 0.39 0.78 0.41 0.43
0.27 0.29 0.33 0.46 0.65 1.0 0.3 0.74 0.32 0.28 0.64 0.32 0.28 0.3 0.56 0.27 0.36 0.8 0.38 0.34
0.54 0.15 0.2 0.19 0.51 0.21 0.55 0.52 0.74 0.64 0.9 0.27 0.54 0.58 1.0 0.73 0.72 0.58 0.17 0.27
0.55 0.17 0.08 0.59 0.33 0.25 0.09 0.25 0.23 0.25 0.45 0.01 0.55 0.35 0.28 1.0 0.41 0.21 0.28 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)