Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.18 0.12 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
3.26 18.48 0.0 0.0 0.0 0.0 2.41 1.87 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.68 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.01 0.0 0.11 0.02 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.01 0.28 0.0 0.08 0.0 0.18 0.01 0.0 0.3 0.07 0.44 0.01 0.0 0.09 0.2 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 2.19 1.11 4.72 0.0 1.37 2.43 1.16 0.0 1.49 0.98 11.0 5.28 0.82 0.13 1.63 1.41 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.15 0.16 0.04 0.04 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.48 0.0 0.36 0.27 0.0 0.0 0.1 0.13 1.13 0.19 0.32 0.05 0.0 0.06 0.45 0.24 0.21 0.0 0.56 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
52.64 87.28 51.64 49.46 23.85 65.56 131.7 44.58 1.27 2.0 0.0 10.14 0.12 0.13 0.0 13.46 9.57 59.15 0.0 0.12
0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.04 0.17 0.3 0.32 0.11 0.31 0.05 0.0 0.24 0.38 0.4 0.08 0.32 0.1
0.69 0.4 0.26 0.0 0.48 0.11 0.62 0.34 0.57 0.71 0.17 0.11 1.44 0.8 0.16 0.72 0.0 0.82 0.22 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.08 0.0 0.09 0.1 0.43 0.1 0.03 0.0 0.08 0.02 0.14 0.12 0.31 0.13 0.09 0.07 0.23 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.19 0.18 0.04 0.18 0.05 0.08 0.08 0.0 0.23 0.16 0.26 0.45 0.1 0.0 0.02 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79
0.0 0.0 0.0 2.31 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 0.0 5.12 0.0 6.28 5.71 3.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.1 0.03 0.05 0.0 0.03 0.01 0.02 0.06 0.08 0.26 0.06 0.0 0.0
0.09 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.08 0.08 0.03 0.12 0.05 0.04 0.01 0.0 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.08 0.0 0.05 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.11 0.0 0.07 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.35 0.07 0.0 0.28 0.0 0.51 0.39 0.09 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.17 0.24 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.32 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.17 2.23 0.04 0.21 0.0 0.17 0.08 0.06 0.18 0.16 0.0 0.82 0.14
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.07 0.06 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.11 0.04 0.07 0.06 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.99 1.01 0.93 0.0 0.11 0.91 10.54 3.21 1.3 0.88 1.14 14.52 2.53 3.35 0.73 0.04 1.05 0.22 0.01 1.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.32 0.44 0.15 0.0 0.07 0.1 0.1 0.23 0.42 0.0 0.46 0.54 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.28 0.13 0.04 0.02 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.05 0.01 0.0
0.16 0.0 0.06 0.21 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.37 0.0 0.06 0.1 0.0 0.0 0.13 0.0
0.11 0.42 0.13 0.72 1.11 0.5 0.43 1.62 1.93 0.79 0.71 0.91 6.18 3.76 1.18 0.54 0.74 0.42 0.2 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.44 0.08 0.13 0.25 0.0 0.21 0.13 0.05 0.07 0.24 0.02 0.0 0.0 0.12 0.33 0.27 0.07 0.0 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.14 0.05 0.09 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.06 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.24 0.12 0.09 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.13 0.07 0.22 0.01 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.2 0.12 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.51 0.06 0.0 0.25 0.14 0.35 0.45 0.4 0.2 0.17 0.23 0.14 0.39 0.39 0.07 0.34 0.25 0.42 0.55
0.24 0.06 0.14 0.09 0.05 0.03 0.1 3.45 3.02 3.06 2.28 0.42 3.49 10.47 2.29 4.65 4.56 0.5 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.25 1.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.11 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.17 0.0 0.0 0.16 0.03 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.02 0.0 0.66 0.17 0.0 0.0 0.05 0.05 0.06 0.0 0.01 0.0 0.2 0.17 0.0 0.06 0.0 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.93 0.87 0.0 0.0 0.56 0.0 0.31 0.31 0.53 0.39 0.0 0.17 0.0 0.67 0.31 0.56 0.06 0.07 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.09 0.01 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.05 0.01 0.06 0.04 0.0 0.14 0.05 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.11 0.24 0.08 0.0 0.06 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.1 0.18
0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 0.05 0.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.05 1.08 2.24 0.0 0.91 0.0 1.34 0.42 0.01 0.08 1.05 0.75 0.07 1.81 0.66 0.0 0.22 3.0 0.69 0.92
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.06 0.02 0.0 0.03 0.03 0.04 0.17 0.0 0.0 0.06 0.04
0.02 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.02 0.03 0.07 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.04
0.07 0.14 0.0 0.0 0.06 0.0 0.23 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.29 0.09 0.0
0.2 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.0 1.79 0.0 0.13 0.85 0.0 5.06 2.39 0.51 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1
0.19 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.06 0.74 0.0 0.0 1.83 0.14 3.17 2.23 2.69 0.0 0.57 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.17 0.18 0.09 0.0 1.21 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.0 0.05 0.16 0.16 0.0 0.06 0.11 0.01 0.0 0.18 0.01 0.02 0.09 0.0 0.14 0.1 0.05 0.14 0.08
7.19 3.84 6.62 3.68 1.7 0.94 0.67 3.15 4.48 0.33 2.31 1.89 0.47 1.07 2.93 0.53 0.26 0.95 1.21 0.21
0.04 0.0 0.04 0.0 0.21 0.16 0.1 0.01 0.01 0.04 0.07 0.03 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)