Heatmap: Cluster_207 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00131	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.49	1.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00198	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00383	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01282	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02026	0.1	0.0	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.1	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0
Gb_02330	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	1.0	0.0
Gb_03418	0.51	0.17	0.78	0.0	0.21	0.4	0.48	0.39	0.24	0.05	0.79	0.05	0.89	0.81	0.98	0.26	0.84	0.0	1.0	0.03
Gb_03575	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.46	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03721	0.0	0.0	0.23	0.2	0.14	0.0	0.0	0.04	0.23	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0
Gb_03730	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04096	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_04560	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04976	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.06	0.03	0.07	0.0	0.0	0.1	0.08	0.11	0.0	0.0	0.0	0.08	0.83
Gb_05419	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_05629	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	1.0	0.0	0.0	0.78	0.0
Gb_06290	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_06405	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07948	0.02	0.0	0.03	0.56	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_09183	0.07	0.35	0.21	1.0	0.28	0.03	0.09	0.24	0.12	0.16	0.12	0.11	0.55	0.45	0.03	0.24	0.28	0.06	0.2	0.03
Gb_09597	0.25	0.0	0.0	0.94	0.46	0.18	0.32	0.54	0.16	0.23	0.48	0.09	0.0	0.09	0.11	0.15	0.0	0.56	1.0	0.21
Gb_11309	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.4	1.0	0.94	0.85	0.64	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.51
Gb_11453	0.0	0.0	0.25	0.76	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_11755	0.07	0.0	0.0	0.0	0.3	0.16	0.0	0.13	0.04	0.15	0.26	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.2	0.12	0.05	0.12
Gb_11820	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11978	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.06	0.0	0.14	0.24	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	1.0	0.0
Gb_14042	0.34	0.0	0.23	0.0	0.38	0.45	0.14	0.07	0.05	0.0	0.0	0.08	0.06	0.17	0.14	0.0	0.11	0.0	0.08	1.0
Gb_16120	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16711	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_17511	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.11	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.27	0.0	0.27	0.24
Gb_17735	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18823	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_19168	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19213	0.07	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.0	0.0	0.0	0.2	0.15	0.0	0.22	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_19584	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.09	0.04	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.06	0.08
Gb_19620	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_21026	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_21746	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.05	0.22	0.37	0.52	0.0	0.25	0.0	0.0	1.0	0.34	0.13	0.35	0.0	0.0
Gb_23271	0.21	0.19	1.0	0.0	0.09	0.0	0.77	0.47	0.1	0.19	0.4	0.07	0.51	0.25	0.77	0.0	0.0	0.3	0.0	0.35
Gb_24075	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Gb_24100	0.2	0.0	0.06	0.0	0.22	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.06	1.0	0.18	0.0	0.35	0.0
Gb_24153	0.29	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.11	0.0	0.13	0.0	0.26	0.16	0.0	0.74	0.58	0.0	0.6	0.0
Gb_24162	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24212	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.88	0.07	0.0	0.0	0.36	0.0
Gb_24315	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.25	0.15	0.01	0.45	0.0	0.02	0.11	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.57	0.0
Gb_24853	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.2	0.13	0.21	0.18	0.29	0.08	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_25214	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_26439	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0
Gb_26821	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27284	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_27621	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_29116	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29902	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.25	0.0	0.76	0.0	1.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0
Gb_30021	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.71	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0
Gb_30576	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.35	0.0
Gb_31089	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31182	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32523	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_32569	0.33	0.0	0.0	1.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.31	0.12
Gb_33103	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_33278	0.05	0.3	0.19	0.15	0.23	0.0	0.53	0.09	0.05	0.05	0.13	0.08	0.02	0.06	0.08	0.07	0.11	0.21	0.74	1.0
Gb_34447	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34766	0.98	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.4	0.3	0.1	0.41	0.38	0.11	0.51	0.26	0.86	0.0	0.0	0.92	0.0	0.28
Gb_35267	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_35287	0.1	0.0	0.0	0.0	0.2	0.24	0.0	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0	0.87	0.0	0.07	0.0
Gb_35290	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.15	0.0	0.0	0.52	0.0
Gb_35480	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35892	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0
Gb_37310	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37683	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38889	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.19	0.0
Gb_39179	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.29
Gb_39289	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	1.0	0.99	0.08	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.11	0.0	0.08	0.14
Gb_39929	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40329	0.23	0.17	0.09	0.58	0.34	0.21	0.4	0.16	0.0	0.18	0.2	0.18	0.57	1.0	0.29	0.0	0.0	0.14	0.14	0.0
Gb_40963	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_41155	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.97	0.0	0.74	0.76	0.39
Gb_41474	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.2	0.09	0.07	0.13	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)