1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.77 0.7 0.33 0.84 0.0 0.38 0.58 0.46 0.4 0.77 1.0 0.06 0.02 0.11 0.94 0.88 0.61 0.44 0.67 0.39
0.25 0.49 0.28 0.06 0.28 1.0 0.04 0.25 0.11 0.12 0.14 0.19 0.11 0.12 0.14 0.15 0.32 0.32 0.34 0.41
0.2 0.65 0.0 0.27 0.23 0.0 0.26 0.25 0.48 0.4 0.28 0.02 0.1 0.02 0.39 1.0 0.66 0.12 0.39 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.42 0.0
0.25 0.59 0.35 1.0 0.11 0.04 0.24 0.17 0.09 0.1 0.14 0.02 0.03 0.08 0.21 0.53 0.11 0.07 0.3 0.13
0.33 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.08 0.1 0.0 0.0 0.21 0.07 0.16 0.36 0.0 0.09 0.15 0.0
0.17 0.9 0.36 0.64 0.25 0.0 0.06 0.17 0.03 0.03 0.0 0.0 0.29 0.14 0.04 1.0 0.72 0.0 0.36 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.77 0.33 0.52 0.0 0.0 0.24 0.14 0.04 0.03 0.0 0.02 0.06 0.05 0.04 1.0 0.31 0.0 0.22 0.1
0.53 0.59 0.16 1.0 0.09 0.03 0.19 0.29 0.11 0.14 0.17 0.04 0.32 0.18 0.17 0.92 0.27 0.04 0.79 0.26
0.02 0.53 0.28 1.0 0.01 0.0 0.18 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.22 0.14 0.01 0.04 0.01
0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.37 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0
0.01 1.0 0.81 0.06 0.06 0.01 0.1 0.02 0.08 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.49 0.93 0.22 0.8 0.13 0.05 0.27 0.29 0.11 0.15 0.22 0.02 0.1 0.09 0.19 1.0 0.37 0.13 0.32 0.37
0.03 1.0 0.0 0.14 0.08 0.0 0.04 0.14 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0
0.19 0.65 0.26 0.27 0.14 0.0 0.13 0.24 0.12 0.12 0.2 0.0 0.07 0.1 0.19 1.0 0.42 0.0 0.07 0.07
0.03 0.47 0.28 1.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.04 0.07 0.0 0.0 0.05 0.02 0.11 0.17 0.28 0.0 0.25 0.05
0.08 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.11 0.0 0.16 0.12 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.16 0.26
0.02 1.0 0.47 0.0 0.11 0.01 0.05 0.06 0.09 0.07 0.19 0.04 0.06 0.05 0.14 0.02 0.04 0.0 0.0 0.06
0.05 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.06 0.0 0.05 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.07 0.61
0.05 1.0 0.42 0.54 0.02 0.02 0.86 0.29 0.03 0.03 0.02 0.0 0.05 0.03 0.04 0.58 0.3 0.03 0.11 0.02
0.32 0.31 1.0 0.73 0.53 0.63 0.1 0.19 0.09 0.08 0.11 0.07 0.0 0.02 0.02 0.1 0.17 0.21 0.36 0.24
0.31 0.32 0.1 0.76 0.08 0.02 0.13 0.29 0.25 0.27 0.44 0.02 0.11 0.07 0.67 1.0 0.44 0.13 0.55 0.44
0.23 1.0 0.3 0.97 0.0 0.0 0.2 0.13 0.0 0.17 0.0 0.0 0.13 0.06 0.25 0.0 0.37 0.0 0.05 0.0
0.15 1.0 0.19 0.95 0.0 0.0 0.18 0.13 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.14 0.32 0.0 0.25 0.08
0.32 0.46 0.57 1.0 0.17 0.06 0.74 0.17 0.11 0.23 0.35 0.03 0.24 0.06 0.37 0.46 0.0 0.0 0.19 0.09
0.08 0.58 0.12 1.0 0.0 0.0 0.17 0.32 0.09 0.09 0.05 0.0 0.17 0.2 0.32 0.45 0.0 0.0 0.8 0.1
0.21 0.43 0.29 1.0 0.0 0.07 0.18 0.16 0.08 0.05 0.02 0.02 0.14 0.02 0.07 0.37 0.15 0.09 0.35 0.02
0.09 1.0 0.19 0.55 0.04 0.01 0.14 0.1 0.01 0.02 0.04 0.0 0.07 0.01 0.05 0.6 0.32 0.0 0.09 0.02
0.28 1.0 0.25 0.93 0.09 0.08 0.21 0.25 0.16 0.15 0.13 0.01 0.15 0.1 0.22 0.82 0.38 0.06 0.3 0.13
0.75 0.08 0.1 0.14 0.34 0.23 0.29 0.48 0.22 0.18 0.19 0.04 0.19 0.12 0.22 1.0 0.47 0.34 0.61 0.32
0.07 0.28 0.0 0.4 0.0 0.0 0.14 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.15 0.09 0.0 1.0 0.44 0.0 0.08 0.0
0.09 0.27 0.23 1.0 0.06 0.15 0.08 0.14 0.14 0.06 0.17 0.01 0.07 0.01 0.1 0.27 0.14 0.03 0.26 0.09
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.46 0.26 1.0 0.0 0.0 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.42 0.34 0.0 0.09 0.13
0.15 0.16 0.08 0.94 0.04 0.0 0.14 0.2 0.17 0.08 0.21 0.04 0.11 0.09 0.49 1.0 0.4 0.06 0.44 0.12
0.47 0.52 0.25 0.64 0.07 0.19 0.21 0.41 0.26 0.14 0.14 0.04 0.46 0.41 0.41 1.0 0.62 0.62 0.79 0.09
0.34 0.89 0.38 1.0 0.18 0.05 0.25 0.25 0.22 0.21 0.18 0.05 0.1 0.07 0.24 0.58 0.2 0.27 0.4 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.34 0.21 1.0 0.0 0.19 0.12 0.22 0.09 0.06 0.55 0.03 0.02 0.1 0.4 0.53 0.12 0.05 0.45 0.09
0.08 0.76 0.27 1.0 0.12 0.03 0.31 0.28 0.01 0.13 0.26 0.01 0.09 0.09 0.1 0.32 0.23 0.14 0.49 0.06
0.14 0.36 0.05 0.87 0.0 0.06 0.13 0.18 0.12 0.06 0.16 0.03 0.24 0.08 0.24 1.0 0.06 0.0 0.29 0.4
0.1 1.0 0.77 0.61 0.43 0.29 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.07
0.13 1.0 0.22 0.38 0.05 0.06 0.19 0.14 0.04 0.04 0.01 0.01 0.1 0.04 0.01 0.27 0.15 0.01 0.24 0.1
0.0 1.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.55 0.42 0.14 0.04 0.07 0.0 0.26 0.06 0.42 0.85 0.0 0.13 0.27 0.14
0.27 0.81 0.27 1.0 0.27 0.05 0.29 0.29 0.17 0.13 0.09 0.02 0.24 0.22 0.21 0.53 0.2 0.2 0.59 0.17
0.27 0.32 0.26 0.38 0.17 0.03 0.1 0.24 0.15 0.11 0.14 0.05 0.56 0.22 0.16 1.0 0.33 0.04 0.54 0.0
0.1 0.56 0.37 0.1 0.23 0.35 1.0 0.25 0.47 0.34 0.3 0.28 0.02 0.03 0.3 0.57 0.23 0.4 0.92 0.67
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.0 0.25 0.79 0.0 0.0 0.24 0.15 0.01 0.02 0.27 0.0 0.0 0.0 0.07 0.41 0.06 0.0 0.16 0.0
0.14 1.0 0.3 0.71 0.04 0.02 0.25 0.13 0.03 0.05 0.02 0.01 0.06 0.04 0.01 0.41 0.24 0.04 0.27 0.02
0.1 1.0 0.23 0.65 0.1 0.0 0.24 0.2 0.03 0.09 0.0 0.0 0.04 0.05 0.03 0.55 0.43 0.04 0.4 0.02
0.0 0.28 0.28 0.83 0.25 0.0 0.23 0.24 0.17 0.16 0.24 0.0 0.06 0.14 0.52 0.81 0.0 0.85 1.0 0.3
0.32 0.46 0.0 0.67 0.21 0.0 0.0 0.28 0.26 0.35 0.8 0.0 0.25 0.0 0.18 1.0 0.58 0.0 0.36 0.0
0.05 1.0 0.63 0.87 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.14 0.13 0.0 0.06 0.0
0.5 0.33 0.23 1.0 0.25 0.14 0.36 0.36 0.32 0.28 0.38 0.03 0.34 0.31 0.4 0.72 0.36 0.11 0.97 0.34
0.21 0.55 0.28 1.0 0.06 0.03 0.3 0.24 0.11 0.06 0.18 0.01 0.17 0.13 0.19 0.64 0.31 0.2 0.48 0.09
0.32 1.0 0.22 0.92 0.0 0.04 0.17 0.26 0.2 0.15 0.25 0.03 0.15 0.08 0.27 0.53 0.26 0.13 0.45 0.1
0.04 1.0 0.3 0.23 0.0 0.0 0.48 0.12 0.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.72 0.54 0.0 0.29 0.0
0.38 0.93 0.22 1.0 0.44 0.0 0.58 0.43 0.1 0.0 0.1 0.06 0.33 0.3 0.09 0.33 0.22 0.0 0.93 0.53
0.17 0.55 0.15 0.8 0.08 0.07 0.16 0.35 0.25 0.23 0.42 0.06 0.18 0.2 0.49 1.0 0.42 0.13 0.35 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.05 0.0
0.24 0.61 0.64 0.59 0.1 0.0 0.12 0.27 0.29 0.1 0.62 0.0 0.04 0.03 0.41 1.0 0.61 0.08 0.41 0.23
0.17 0.24 0.09 1.0 0.09 0.02 0.06 0.12 0.11 0.09 0.09 0.02 0.08 0.1 0.17 0.31 0.09 0.06 0.29 0.07
0.24 0.87 0.21 1.0 0.15 0.0 0.33 0.13 0.17 0.09 0.02 0.03 0.0 0.15 0.0 0.42 0.41 0.43 0.4 0.21
0.13 0.28 0.0 0.4 0.26 0.0 0.67 0.55 0.33 0.28 0.84 0.0 0.14 0.23 0.44 1.0 0.48 0.12 0.78 0.0
0.32 0.73 0.21 1.0 0.03 0.07 0.16 0.19 0.21 0.2 0.16 0.03 0.12 0.1 0.37 0.34 0.28 0.06 0.27 0.2
0.75 0.66 0.59 0.34 0.64 1.0 0.09 0.34 0.28 0.31 0.4 0.46 0.57 0.53 0.43 0.26 0.22 0.43 0.41 0.51
0.0 1.0 0.27 0.29 0.0 0.0 0.36 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.64 0.46 0.0 0.11 0.0
0.04 0.31 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 1.0 0.0 0.14 0.13
0.21 0.23 0.05 0.86 0.0 0.06 0.16 0.21 0.09 0.06 0.14 0.01 0.03 0.08 0.2 1.0 0.11 0.0 0.6 0.1
0.0 0.35 0.05 1.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.07 0.0
0.21 0.57 0.16 1.0 0.07 0.01 0.16 0.15 0.07 0.05 0.03 0.0 0.1 0.05 0.07 0.33 0.17 0.04 0.25 0.08
0.45 0.25 0.22 0.1 0.14 0.1 0.27 0.39 0.24 0.33 0.49 0.03 0.16 0.11 0.89 1.0 0.1 0.12 0.54 0.11
0.08 1.0 0.67 0.85 0.0 0.06 0.31 0.23 0.09 0.14 0.1 0.04 0.0 0.07 0.17 0.85 0.39 0.0 0.38 0.04
0.07 0.68 0.33 1.0 0.0 0.09 0.48 0.22 0.02 0.08 0.0 0.0 0.09 0.02 0.05 0.47 0.28 0.02 0.25 0.0
0.32 1.0 0.26 0.77 0.19 0.02 0.31 0.19 0.05 0.04 0.09 0.03 0.39 0.12 0.12 0.24 0.27 0.11 0.29 0.05
0.26 0.8 0.21 1.0 0.19 0.1 0.2 0.21 0.21 0.13 0.1 0.06 0.2 0.18 0.1 0.25 0.14 0.06 0.31 0.12
0.46 0.86 0.18 0.96 0.0 0.1 0.27 0.29 0.16 0.14 0.29 0.05 0.33 0.2 0.04 1.0 0.26 0.04 0.46 0.28
0.05 1.0 0.09 0.29 0.0 0.0 0.23 0.07 0.0 0.05 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.54 0.13 0.0 0.09 0.08
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.11 1.0 0.38 0.69 0.02 0.0 0.27 0.17 0.02 0.06 0.02 0.0 0.05 0.03 0.07 0.6 0.34 0.0 0.06 0.0
0.25 0.69 0.25 1.0 0.0 0.0 0.34 0.25 0.0 0.18 0.59 0.0 0.06 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.77 0.0
0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.14 0.31 0.13 0.08 0.09 0.06 0.04 0.22 0.06 0.04 0.04 0.0
0.03 1.0 0.82 0.11 0.09 0.0 0.06 0.03 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.29
0.33 0.86 0.31 1.0 0.04 0.09 0.14 0.33 0.23 0.11 0.18 0.02 0.49 0.14 0.41 0.79 0.18 0.18 0.42 0.36
0.25 0.45 0.19 1.0 0.09 0.0 0.16 0.18 0.17 0.17 0.36 0.02 0.15 0.1 0.18 0.37 0.11 0.06 0.37 0.13
0.65 0.0 0.37 0.0 0.0 0.83 1.0 0.51 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.54 0.0 0.49 0.71 0.55
0.08 0.28 0.17 1.0 0.0 0.0 0.21 0.09 0.07 0.0 0.19 0.0 0.02 0.05 0.18 0.65 0.1 0.0 0.39 0.1
0.22 0.0 0.14 0.71 0.0 0.08 0.13 0.17 0.25 0.16 0.07 0.02 0.44 0.19 0.2 1.0 0.36 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.08 0.0
0.35 0.57 0.87 1.0 0.13 0.0 0.2 0.28 0.15 0.06 0.06 0.0 0.41 0.27 0.1 0.88 0.75 0.0 0.2 0.05
0.0 1.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)