Heatmap: Cluster_324 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.54 0.65 0.82 0.83 0.18 0.36 0.42 0.49 0.47 0.48 0.29 0.52 0.43 0.47 0.48 0.36 0.54 0.61 0.39
1.0 0.46 0.57 0.85 0.52 0.11 0.22 0.34 0.37 0.37 0.56 0.22 0.25 0.2 0.62 0.65 0.26 0.55 0.6 0.29
0.74 0.5 0.5 0.86 0.71 0.09 0.22 0.32 0.46 0.24 0.82 0.26 0.62 0.31 0.59 1.0 0.24 0.36 0.6 0.33
0.97 0.23 0.41 0.79 0.58 0.06 0.26 0.33 0.44 0.39 0.71 0.22 0.42 0.36 0.85 1.0 0.46 0.46 0.31 0.41
1.0 0.67 0.62 0.73 0.78 0.21 0.38 0.49 0.6 0.53 0.91 0.31 0.37 0.26 0.94 0.54 0.37 0.55 0.74 0.49
1.0 0.28 0.5 0.72 0.55 0.07 0.37 0.36 0.44 0.39 0.64 0.24 0.35 0.28 0.58 0.59 0.41 0.28 0.5 0.29
0.88 0.65 0.65 0.74 0.99 0.52 0.66 0.77 0.7 0.68 0.96 0.61 0.69 0.6 1.0 0.75 0.62 0.84 0.88 0.75
0.78 0.59 0.36 0.68 0.69 0.31 0.6 0.48 0.48 0.45 1.0 0.32 0.55 0.42 0.97 0.52 0.37 0.45 0.75 0.63
1.0 0.57 0.75 0.44 0.63 0.21 0.41 0.38 0.42 0.38 0.63 0.17 0.42 0.38 0.55 0.45 0.34 0.44 0.45 0.66
1.0 0.43 0.59 0.69 0.79 0.34 0.42 0.32 0.25 0.24 0.49 0.18 0.36 0.29 0.53 0.34 0.36 0.49 0.35 0.46
0.99 0.5 0.59 0.7 0.58 0.31 0.45 0.42 0.35 0.36 0.92 0.16 0.37 0.3 1.0 0.35 0.33 0.4 0.58 0.79
0.73 0.61 0.5 0.53 0.56 0.35 0.39 0.56 0.66 0.55 1.0 0.39 0.57 0.5 0.95 0.54 0.41 0.46 0.65 0.53
0.78 1.0 0.53 0.47 0.7 0.28 0.39 0.34 0.33 0.31 0.56 0.27 0.14 0.13 0.53 0.54 0.49 0.58 0.61 0.19
1.0 0.6 0.69 0.83 0.82 0.29 0.37 0.48 0.36 0.36 0.4 0.46 0.28 0.34 0.36 0.28 0.36 0.6 0.66 0.44
0.66 0.34 0.46 0.53 0.5 0.03 0.5 0.39 0.53 0.54 1.0 0.34 0.41 0.33 0.97 0.78 0.57 0.34 0.74 0.16
0.87 0.62 0.62 0.72 0.65 0.57 0.53 0.63 0.59 0.59 1.0 0.43 0.6 0.52 0.9 0.72 0.56 0.62 0.8 0.62
0.74 0.51 0.55 0.58 0.68 0.41 0.27 0.49 0.4 0.4 0.45 0.37 0.32 0.33 0.46 0.36 0.46 0.6 1.0 0.51
0.96 0.66 0.68 0.93 0.67 0.46 0.61 0.58 0.51 0.45 1.0 0.44 0.71 0.55 0.91 0.43 0.43 0.67 0.95 0.5
1.0 0.68 0.61 0.73 0.82 0.42 0.46 0.52 0.48 0.49 0.79 0.31 0.42 0.32 0.78 0.52 0.42 0.69 0.81 0.72
1.0 0.69 0.52 0.62 0.81 0.21 0.38 0.51 0.67 0.6 0.91 0.35 0.58 0.49 0.93 0.83 0.63 0.73 0.81 0.51
1.0 0.38 0.58 0.77 0.55 0.2 0.23 0.31 0.23 0.2 0.28 0.13 0.37 0.33 0.3 0.18 0.11 0.28 0.41 0.25
1.0 0.44 0.5 0.69 0.73 0.34 0.65 0.49 0.53 0.46 0.71 0.37 0.59 0.51 0.6 0.49 0.46 0.68 0.67 0.46
1.0 0.48 0.68 0.74 0.77 0.27 0.39 0.52 0.53 0.46 0.79 0.34 0.4 0.32 0.76 0.51 0.49 0.47 0.53 0.56
1.0 0.82 0.57 0.85 0.86 0.55 0.56 0.68 0.74 0.67 0.77 0.41 0.58 0.49 0.71 0.81 0.43 0.5 0.87 0.71
0.97 0.52 0.64 0.52 0.72 0.1 0.71 0.45 0.45 0.47 0.82 0.27 0.4 0.3 1.0 0.92 0.51 0.46 0.94 0.41
1.0 0.55 0.55 0.83 0.88 0.28 0.36 0.47 0.52 0.5 0.67 0.27 0.47 0.4 0.7 0.6 0.55 0.75 0.59 0.39
0.69 0.43 0.42 0.6 0.66 0.39 0.34 0.46 0.47 0.46 1.0 0.31 0.4 0.33 0.99 0.55 0.38 0.49 0.32 0.43
0.88 0.64 0.58 0.66 1.0 0.55 0.57 0.63 0.52 0.55 0.91 0.44 0.74 0.57 0.96 0.48 0.44 0.67 0.59 0.63
0.6 0.5 0.4 0.62 1.0 0.41 0.48 0.65 0.57 0.54 0.94 0.47 0.54 0.5 0.89 0.46 0.43 0.64 0.64 0.78
0.5 0.75 0.39 0.46 0.84 0.27 0.91 0.57 0.58 0.61 1.0 0.38 0.55 0.45 0.97 0.42 0.52 0.61 0.62 0.75
0.88 0.61 0.54 0.68 0.84 0.47 0.64 0.6 0.64 0.59 0.97 0.46 0.62 0.57 1.0 0.7 0.57 0.65 0.91 0.56
0.97 0.36 0.41 1.0 0.6 0.16 0.67 0.4 0.41 0.32 0.29 0.21 0.34 0.24 0.34 0.32 0.37 0.38 0.71 0.4
0.67 0.72 0.6 0.65 0.58 0.46 0.34 0.6 0.6 0.56 0.96 0.52 0.48 0.41 1.0 0.58 0.68 0.53 0.56 0.64
0.99 0.57 0.59 1.0 0.68 0.25 0.37 0.56 0.67 0.54 0.83 0.34 0.55 0.46 0.77 0.67 0.46 0.45 0.54 0.35
1.0 0.47 0.59 0.61 0.59 0.12 0.25 0.37 0.34 0.3 0.47 0.27 0.27 0.26 0.42 0.5 0.35 0.34 0.57 0.46
0.69 0.31 0.4 0.68 0.53 0.12 0.53 0.35 0.51 0.48 0.89 0.25 0.47 0.5 0.88 1.0 0.55 0.32 0.22 0.71
1.0 0.62 0.65 0.64 0.67 0.33 0.43 0.37 0.52 0.44 0.53 0.19 0.54 0.48 0.51 0.48 0.26 0.44 0.51 0.5
1.0 0.43 0.46 0.84 0.62 0.24 0.34 0.4 0.43 0.37 0.55 0.27 0.35 0.28 0.55 0.57 0.39 0.44 0.6 0.45
0.73 0.52 0.68 0.78 0.78 0.18 0.48 0.49 0.43 0.47 1.0 0.31 0.33 0.34 0.96 0.64 0.55 0.53 0.74 0.25
1.0 0.59 0.67 0.88 0.87 0.32 0.6 0.63 0.58 0.52 0.85 0.43 0.7 0.65 0.83 0.45 0.3 0.5 0.52 0.55
1.0 0.62 0.47 0.57 0.56 0.34 0.47 0.46 0.52 0.45 0.9 0.31 0.51 0.4 0.93 0.65 0.44 0.49 0.57 0.44
1.0 0.35 0.72 0.67 0.39 0.03 0.34 0.36 0.37 0.31 0.56 0.23 0.26 0.24 0.65 0.43 0.4 0.32 0.49 0.4
0.92 0.59 0.58 1.0 0.97 0.33 0.7 0.58 0.63 0.59 0.99 0.34 0.81 0.68 0.92 0.47 0.42 0.66 0.98 0.64
0.51 0.14 0.26 0.39 0.44 0.06 0.21 0.45 0.52 0.54 1.0 0.25 0.52 0.29 1.0 0.6 0.43 0.21 0.31 0.42
1.0 0.65 0.62 0.64 0.79 0.35 0.45 0.48 0.57 0.49 0.67 0.28 0.56 0.45 0.62 0.54 0.26 0.56 0.53 0.48
0.8 0.67 0.69 0.65 0.65 0.39 0.43 0.64 0.61 0.53 1.0 0.45 0.47 0.4 0.97 0.67 0.6 0.54 0.79 0.63
1.0 0.34 0.51 0.68 0.49 0.19 0.22 0.3 0.33 0.28 0.58 0.18 0.35 0.34 0.53 0.61 0.44 0.38 0.25 0.46
1.0 0.64 0.65 0.69 0.65 0.25 0.7 0.5 0.6 0.48 0.9 0.34 0.39 0.34 0.8 0.6 0.67 0.46 0.69 0.88
1.0 0.71 0.72 0.92 0.74 0.26 0.57 0.54 0.68 0.6 0.83 0.28 0.54 0.41 0.81 0.68 0.48 0.56 0.86 0.5
1.0 0.53 0.52 0.81 0.63 0.28 0.48 0.4 0.51 0.45 0.84 0.32 0.33 0.3 0.92 0.85 0.59 0.48 0.73 0.46
1.0 0.78 0.78 0.93 0.59 0.22 0.64 0.51 0.65 0.59 0.82 0.23 0.7 0.6 0.82 0.6 0.41 0.37 0.37 0.21
1.0 0.35 0.53 0.7 0.46 0.02 0.36 0.39 0.45 0.39 0.82 0.2 0.25 0.22 0.81 0.24 0.19 0.43 0.65 0.51
0.78 0.68 0.54 0.58 0.75 0.45 1.0 0.63 0.64 0.58 0.91 0.34 0.66 0.64 0.91 0.4 0.29 0.56 0.55 0.55
1.0 0.37 0.37 0.88 0.96 0.32 0.65 0.53 0.48 0.45 0.96 0.33 0.5 0.44 0.86 0.55 0.45 0.52 0.93 0.66
0.85 0.89 0.88 0.68 0.82 0.29 0.64 0.61 0.59 0.55 1.0 0.46 0.43 0.33 0.97 0.64 0.46 0.59 0.78 0.7
1.0 0.31 0.56 0.76 0.64 0.14 0.44 0.37 0.47 0.41 0.73 0.24 0.37 0.38 0.71 0.53 0.42 0.35 0.51 0.32
1.0 0.6 0.64 0.9 0.76 0.38 0.51 0.47 0.48 0.39 0.67 0.26 0.23 0.22 0.64 0.56 0.46 0.62 0.65 0.44
1.0 0.52 0.54 0.84 0.79 0.16 0.52 0.41 0.37 0.37 0.62 0.23 0.24 0.25 0.59 0.32 0.23 0.55 0.64 0.38
0.93 0.77 0.68 0.76 0.84 0.3 0.54 0.54 0.55 0.65 1.0 0.33 0.52 0.48 0.89 0.88 0.55 0.62 0.78 0.43
0.85 0.49 0.54 0.79 0.8 0.45 0.32 0.51 0.49 0.43 0.64 0.37 0.52 0.47 0.6 0.57 0.49 0.53 1.0 0.44
1.0 0.41 0.55 0.75 0.63 0.49 0.41 0.39 0.34 0.34 0.72 0.24 0.18 0.16 0.74 0.47 0.34 0.51 0.79 0.45
1.0 0.38 0.73 0.81 0.79 0.03 0.58 0.55 0.65 0.7 0.95 0.31 0.34 0.34 0.97 0.87 0.86 0.56 0.86 0.35
0.97 0.64 0.49 0.45 1.0 0.66 0.47 0.56 0.56 0.53 0.77 0.45 0.6 0.56 0.67 0.55 0.7 0.43 0.43 0.52
1.0 0.6 0.52 0.79 0.81 0.76 0.41 0.54 0.52 0.52 0.84 0.43 0.43 0.39 0.76 0.46 0.58 0.6 0.59 0.41
0.8 0.63 0.47 0.71 0.67 0.3 0.64 0.49 0.46 0.45 1.0 0.28 0.44 0.39 0.94 0.64 0.44 0.47 0.82 0.33
0.73 0.37 0.41 0.61 0.73 0.41 0.55 0.47 0.46 0.43 0.93 0.34 0.23 0.19 1.0 0.6 0.48 0.6 0.84 0.53
0.59 0.72 0.61 0.61 0.6 0.29 0.31 0.39 0.29 0.25 0.41 0.26 0.23 0.16 0.47 0.22 0.26 0.49 1.0 0.49
1.0 0.4 0.74 0.73 0.71 0.32 0.6 0.42 0.37 0.35 0.64 0.26 0.39 0.33 0.62 0.34 0.29 0.54 0.64 0.42
0.77 0.34 0.4 0.63 0.49 0.25 0.34 0.45 0.56 0.48 1.0 0.32 0.43 0.33 0.96 0.66 0.47 0.41 0.52 0.62
0.83 0.39 0.34 0.7 0.71 0.33 0.43 0.55 0.56 0.57 0.9 0.34 0.39 0.33 0.94 0.64 0.45 0.74 1.0 0.56
0.99 0.95 0.56 0.91 1.0 0.46 0.88 0.58 0.59 0.53 1.0 0.33 0.59 0.48 0.98 0.95 0.56 0.93 0.92 0.6
0.85 0.48 0.52 0.78 0.55 0.41 0.43 0.48 0.48 0.43 0.98 0.29 0.54 0.45 1.0 0.55 0.63 0.59 0.64 0.79
0.92 0.82 0.65 0.87 0.87 0.55 0.51 0.73 0.71 0.61 1.0 0.52 0.6 0.51 0.99 0.67 0.48 0.66 0.51 0.57
0.64 0.25 0.32 0.68 0.38 0.47 0.53 0.49 0.44 0.42 1.0 0.36 0.63 0.57 0.82 0.36 0.27 0.27 0.7 0.54
1.0 0.54 0.6 0.7 0.49 0.07 0.31 0.38 0.44 0.45 0.76 0.15 0.24 0.25 0.65 0.39 0.33 0.57 0.52 0.09
0.62 0.67 0.44 0.8 0.73 0.92 0.82 0.51 0.5 0.49 1.0 0.3 0.33 0.27 0.97 0.85 0.63 0.8 0.96 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)