Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.46 -0.15 -0.18 0.48 0.64 -1.0 0.79 -0.61 -0.97 -1.2 -0.23 -0.47 0.02 0.31 0.03 -0.16 -0.46 0.11 0.2 0.45
0.56 1.16 0.25 0.19 -0.12 -2.4 0.9 -0.7 0.3 -0.09 -0.09 -1.28 -2.29 -2.42 -0.07 0.42 -0.35 -0.33 0.84 -0.31
-0.29 0.64 -0.17 -0.28 -0.22 -0.81 1.25 -0.7 -0.2 -0.25 -0.22 -1.41 0.04 -0.19 0.1 -0.75 -1.7 -0.27 1.5 0.02
-0.11 0.63 -0.09 -0.2 0.1 -0.1 0.77 -0.48 -0.46 -0.55 -0.05 -0.44 -0.93 -0.91 0.19 -0.69 -0.67 0.38 1.16 0.26
0.13 0.75 -0.26 -0.34 0.64 0.28 0.33 -0.38 -0.73 -0.8 -0.72 -0.64 -0.25 -0.43 -0.36 -0.9 -1.5 0.3 1.02 0.91
-0.02 -0.07 -0.49 0.19 -0.31 -0.25 0.67 -0.17 -0.04 -0.21 -0.01 -1.31 0.53 -0.3 0.5 -0.99 -2.02 -0.16 1.39 -0.12
-0.02 -0.26 -0.48 -0.04 0.13 -0.1 0.65 -0.13 0.28 0.16 -0.23 -1.39 0.45 0.14 0.32 -0.81 -1.55 -0.66 1.07 0.07
0.34 1.06 0.29 0.2 0.38 0.25 0.9 -0.48 -0.87 -0.79 -0.24 -1.47 -1.15 -1.52 -0.09 -1.05 -1.51 0.33 1.01 0.03
-1.87 -2.33 -4.43 -1.79 -0.68 1.53 0.14 -4.49 -9.39 -9.41 -6.16 -6.13 - -7.55 -5.69 -4.84 -6.7 0.18 2.69 2.78
0.62 0.94 0.32 0.1 0.15 -0.59 0.85 -0.2 -0.41 -0.42 0.21 -0.74 -0.94 -1.15 -0.04 -0.8 -0.74 -0.19 0.65 -0.08
-0.48 1.06 -0.6 -0.9 -0.28 -0.49 1.23 -0.65 -0.56 -0.68 -0.38 -1.08 -0.94 -1.0 -0.14 -1.18 -1.89 -0.35 2.03 0.51
0.37 0.56 0.43 0.36 0.43 -0.28 0.3 -0.4 -0.83 -0.86 -0.16 -0.79 -0.27 -0.37 -0.09 -0.51 -0.64 0.4 0.43 0.38
-0.76 0.83 -0.38 -0.84 -0.08 -1.08 1.07 -0.43 -1.0 -0.83 -0.44 -1.13 0.62 0.11 -0.18 -1.43 -1.27 -0.11 1.61 0.6
-0.13 -0.2 -0.74 -0.1 -0.05 0.72 0.53 0.27 -0.86 -0.77 0.16 -0.94 0.43 0.27 0.25 -1.26 -1.44 0.61 0.44 0.31
-0.2 0.56 -0.22 0.06 0.36 0.1 0.27 0.1 -0.53 -0.44 -0.93 -0.63 0.05 -0.07 -0.64 -0.89 -1.03 0.35 0.92 0.77
0.37 0.6 0.07 0.47 0.14 0.29 0.43 -0.43 -0.51 -1.11 -0.18 -0.91 -1.6 -1.35 0.21 -0.21 -0.74 0.48 0.8 0.35
-0.97 0.5 -0.34 -0.03 0.26 -0.11 0.69 -0.28 -0.42 -0.46 0.2 -0.52 0.02 -0.34 0.42 -0.86 -0.6 -0.03 1.05 0.07
-0.3 0.13 -0.54 0.19 0.13 0.35 -0.3 0.09 -0.75 -0.86 0.1 -0.76 0.19 0.04 0.14 -0.69 -0.59 0.45 1.16 0.09
-0.27 -0.2 -0.39 0.29 0.02 0.52 0.54 0.21 -0.28 -0.48 -0.03 -0.76 0.37 0.11 0.25 -0.67 -1.22 0.17 0.41 0.12
-0.64 0.99 -0.03 -0.86 0.31 -0.58 0.85 -0.13 -0.14 -0.2 0.4 -0.15 -1.82 -1.89 0.69 0.03 -1.29 0.18 0.21 0.4
0.11 -0.12 -0.54 0.17 0.4 0.17 -0.02 0.1 -0.69 -0.49 -0.03 -0.51 -0.38 -0.36 0.09 -0.75 -0.0 0.58 0.87 0.19
-3.07 -4.69 -2.63 -2.83 -1.63 -2.67 2.26 -1.6 -4.86 -5.69 -3.49 -4.45 -8.19 -4.82 -2.34 -2.73 -2.4 1.71 2.66 1.85
-0.77 -0.43 -0.74 -0.0 0.3 0.93 1.66 0.01 -1.28 -1.14 -0.89 -0.25 -2.01 -2.17 -0.91 -1.22 0.07 0.35 1.42 0.15
-0.43 -0.97 -0.94 -0.31 0.6 -0.17 0.4 0.23 -0.94 -0.89 0.05 -1.09 0.08 -0.46 0.04 -0.26 -0.55 0.48 1.69 0.02
-0.24 0.26 0.21 -0.51 0.59 -0.46 0.53 -0.12 -0.66 -0.56 -0.56 -0.75 -0.16 -0.35 0.13 -0.44 -0.34 0.51 0.97 0.29
-1.91 -1.55 -1.39 -1.54 -1.0 0.54 2.03 -1.59 -3.16 -2.93 -1.34 -2.01 -3.08 -3.57 -0.94 -3.16 -2.92 0.66 2.73 1.14
0.14 -0.24 0.01 0.25 0.15 1.06 0.26 0.17 -0.4 -0.51 -0.3 -0.61 0.27 0.04 -0.27 -0.78 -0.47 -0.27 0.39 -0.15
0.54 0.77 -0.14 -0.22 0.29 0.53 0.14 -0.48 -0.9 -0.79 -0.09 -1.04 -0.61 -0.7 0.01 -0.92 -0.8 0.0 0.89 0.86
-0.09 0.21 0.49 0.01 0.37 -0.36 0.61 -0.34 -0.47 -0.63 -0.62 -0.37 -0.61 -0.55 -0.74 -0.54 -0.06 0.14 1.16 0.47
0.27 -0.4 0.33 -0.51 -0.42 -0.13 0.76 -0.28 -0.81 -0.83 -0.07 -1.21 -0.12 -0.61 0.22 -1.22 -0.81 -0.26 1.71 0.62
-0.92 -0.52 -1.41 -0.67 -0.35 0.29 0.67 -0.31 0.06 0.23 0.83 -1.11 0.03 -0.33 0.97 -0.04 -1.29 -0.28 0.83 0.19
-0.23 -0.14 -0.07 0.23 0.51 -0.62 0.79 -0.08 -0.66 -0.55 -0.06 -0.86 -0.14 -0.31 0.01 -0.78 -0.72 0.41 1.14 0.12
0.21 0.59 -0.46 -0.41 0.21 0.4 0.19 -0.19 -0.23 -0.31 -0.39 -0.47 -0.48 -0.61 -0.17 -0.44 -0.85 0.03 1.05 0.66
-1.39 -0.38 -0.37 -1.06 -0.27 -0.87 0.63 -0.15 0.25 0.13 0.69 -0.75 -0.31 0.15 1.0 -0.96 -0.36 -0.93 1.45 -0.28
-0.17 0.45 0.1 -0.07 0.13 -0.43 0.92 -0.29 -0.28 -0.25 0.3 -0.8 -1.2 -1.35 0.42 -0.71 -0.51 -0.13 1.17 0.06
-1.01 -0.16 -0.72 -1.01 0.34 0.33 0.72 -0.06 -0.22 -0.3 0.29 -0.68 0.1 -0.1 0.26 -0.22 -0.64 0.23 0.65 0.5
-0.01 -0.32 -0.39 0.54 0.51 0.23 0.4 -0.12 -0.69 -0.74 -0.19 -0.92 -1.13 -1.09 0.2 -0.34 -0.38 0.83 0.7 0.58
-0.97 0.13 -1.16 -0.83 -0.26 0.13 0.76 -0.31 -0.1 -0.08 0.55 -0.79 -0.04 -0.37 0.72 -0.33 -0.7 -0.52 1.32 0.06
0.75 -0.36 -2.45 0.18 0.89 0.23 2.12 -1.4 -1.26 -3.38 -0.57 -3.79 -1.51 -1.18 -1.14 - - 0.53 1.81 0.01
0.17 0.77 0.45 0.73 0.25 -0.37 0.77 -0.43 -0.64 -1.23 -0.82 -1.11 -0.45 -0.58 -0.57 -1.76 -1.79 0.32 1.19 0.51
-0.21 0.5 -0.41 -0.29 0.11 0.24 0.27 -0.08 -0.42 -0.38 0.43 -0.77 -0.03 -0.34 0.48 -0.98 -0.7 -0.53 1.08 0.25
-0.15 0.1 -0.23 -0.05 0.19 0.4 0.84 -0.37 -0.42 -0.48 -0.13 -0.82 -0.94 -1.28 0.13 -0.29 -1.3 0.64 0.8 0.75
-1.72 0.12 -0.88 -1.58 -0.47 -0.92 0.62 -0.36 0.14 0.26 0.15 -0.04 0.2 -0.27 0.59 0.3 -1.17 0.43 0.73 0.71
-0.55 0.02 -0.16 -0.29 -0.33 -0.21 0.32 0.07 -0.12 -0.1 0.01 -0.18 -0.0 -0.37 0.09 -0.51 -0.22 0.35 0.81 0.56
1.17 0.69 0.03 0.5 0.88 -1.24 0.68 -1.03 -1.04 -1.03 -0.74 -1.32 -0.61 -0.89 -0.6 -0.83 -0.71 0.24 0.47 0.83
-0.29 0.44 0.08 0.23 -0.15 -0.63 0.55 -0.06 -0.36 -0.37 -0.02 -0.71 -0.24 -0.36 0.2 -0.61 -0.46 -0.06 1.18 0.15
1.11 1.78 -0.11 0.7 0.6 0.99 1.07 -0.97 -2.14 -2.51 -1.5 -1.1 -3.08 -3.28 -1.81 -1.01 -1.66 0.21 -0.05 0.12
-0.27 0.47 0.17 -0.23 0.28 -0.12 -0.07 -0.18 -0.51 -0.37 0.65 -0.71 -0.42 -0.7 0.75 -0.54 -0.29 -0.29 0.78 0.13
0.1 0.43 -0.22 -0.19 -0.02 -0.24 0.64 -0.35 -0.07 -0.02 0.07 -0.47 -0.57 -0.21 0.2 -0.28 -0.78 -0.08 0.7 0.37
-0.62 -0.03 -0.88 -0.51 -0.28 -0.67 1.35 -0.3 -0.53 -0.52 0.1 -0.73 -0.2 -0.48 0.31 -0.65 -0.86 -0.14 1.45 0.67
-0.55 -0.72 -0.92 -0.84 -0.15 -1.22 0.66 -0.24 -0.24 -0.23 0.83 -0.69 0.19 -0.26 1.01 0.49 -0.69 -0.06 1.09 -0.59
-0.9 0.72 -0.26 -0.32 0.26 0.66 1.49 -0.49 -1.13 -1.31 -1.13 -0.97 -0.59 -0.87 -0.83 -1.57 -1.25 0.49 1.31 0.72
-0.26 -0.42 -0.63 -0.41 0.2 -0.02 -0.42 -0.05 -0.43 -0.51 -0.05 -0.02 0.36 0.15 0.11 -0.91 -0.11 0.27 1.19 0.43
0.08 0.94 -0.58 -0.49 -0.29 0.11 0.46 -0.22 -0.06 -0.26 -0.1 -0.88 -0.2 -0.73 0.05 0.01 -0.75 -0.27 0.91 0.49
-0.74 0.97 -0.69 -0.98 -0.1 -0.06 0.94 -0.13 -0.92 -0.91 0.23 -0.3 -0.72 -1.07 0.28 -1.13 -0.75 0.26 1.29 0.65
0.39 -0.17 1.08 -1.0 0.01 -0.57 0.63 -0.38 0.01 0.01 0.08 -2.42 -0.38 -1.06 0.12 -0.06 -1.42 -0.83 1.45 -0.04
0.05 -0.09 -0.23 -0.07 0.25 0.15 0.41 -0.36 -0.96 -1.16 -0.11 -1.15 -0.73 -0.95 0.2 -0.84 -0.53 0.78 1.34 0.77
-1.22 -1.49 -2.47 -0.45 0.1 1.28 0.52 0.3 -0.71 -0.98 -0.09 -1.17 0.32 -0.13 -0.31 -0.68 -0.4 0.76 1.55 -0.57
0.19 0.53 0.02 0.34 0.26 0.34 0.38 -0.04 -0.46 -0.63 -0.41 -0.43 -0.65 -0.58 -0.21 -1.04 -0.3 0.01 1.06 -0.04
-3.54 - - - - -1.19 2.97 -0.72 -2.5 - - -2.4 - - - - -1.42 3.08 - 0.88
0.41 0.77 0.56 0.11 0.63 0.93 0.47 -0.73 -0.93 -1.06 -0.99 -0.93 -1.17 -1.18 -0.98 -0.92 -0.9 0.05 1.22 0.16
-0.2 0.72 -0.15 0.18 0.34 0.4 0.49 -0.45 -0.82 -0.98 0.15 -0.9 -1.05 -1.32 0.46 -0.76 -1.21 0.33 0.99 0.57
0.52 0.85 1.04 0.01 0.51 -3.23 0.91 -0.56 -0.45 -0.67 -0.42 -1.33 -0.43 -0.56 -0.3 -0.34 -0.45 -0.34 0.68 -0.06
0.49 0.55 0.37 0.53 0.37 -0.4 0.63 0.06 -0.4 -0.54 0.23 -0.72 -0.72 -1.01 0.1 -0.32 -0.65 0.02 0.21 -0.41
-0.01 -0.18 -0.48 -0.17 -0.57 -0.44 1.31 -0.39 -0.08 -0.06 0.47 -0.75 -0.62 -0.92 0.65 0.33 -0.11 -0.48 0.65 -0.42
0.8 1.19 0.95 0.57 0.45 -1.19 0.24 -0.32 -0.62 -0.78 -0.5 -0.94 -0.62 -0.74 -0.55 -0.85 -0.77 0.07 0.46 -0.32
-0.64 0.55 -0.79 -0.78 -0.57 -0.34 1.06 -0.23 -0.09 -0.3 0.19 -0.61 -0.53 -0.61 0.29 -0.27 -1.1 -0.01 1.35 0.45
-0.07 0.1 -0.54 0.09 0.6 0.87 1.54 -1.04 -1.5 -1.63 -0.39 -1.71 -2.24 -2.32 -0.11 -0.91 -1.67 0.4 1.34 0.77
-0.08 -0.08 -0.73 0.73 0.61 0.61 1.58 -1.07 -1.37 -1.66 0.14 -2.09 -3.65 -3.43 0.22 -0.98 -1.78 0.36 1.0 0.91
0.09 0.03 -0.32 0.07 0.57 0.64 1.78 -1.14 -1.18 -1.29 -0.57 -1.75 -2.08 -1.91 -0.42 -0.2 -1.32 0.34 0.39 1.13
-0.1 -0.4 -0.95 0.35 0.59 0.54 1.82 -1.16 -0.96 -1.09 -0.06 -1.9 -1.02 -0.86 -0.01 -0.54 -1.34 0.2 -0.03 1.09
-0.59 -0.66 -0.74 -0.57 -0.35 1.03 0.85 0.16 -0.84 -0.8 -0.07 -0.24 -0.63 -0.73 -0.21 -1.15 -0.59 0.36 1.28 0.85
0.85 0.49 -0.0 0.22 -0.0 0.45 0.46 -0.01 -0.8 -0.8 -0.54 -0.81 -0.68 -0.67 -0.46 -0.1 -0.37 0.29 0.06 0.63
0.81 0.61 0.02 -0.37 0.05 0.21 0.65 0.09 -0.99 -1.01 0.04 -0.8 -0.94 -0.92 0.09 -0.46 -0.75 0.5 0.5 0.3
-0.89 -0.09 -0.71 -0.31 -0.33 -0.03 1.55 -0.24 -0.43 -0.32 0.1 -0.73 0.69 0.16 0.24 -1.27 -1.03 -0.36 0.75 0.08
0.12 0.3 0.1 0.36 0.26 -0.59 1.2 -0.06 -0.82 -0.95 -0.2 -0.5 -0.4 -0.78 -0.32 -1.05 -0.99 -0.23 1.26 0.23
0.53 1.03 0.25 -0.55 0.62 -1.99 1.35 -0.79 -1.35 -1.17 -1.24 -1.79 -1.59 -1.2 -0.84 -2.26 -2.04 0.53 1.64 0.88
0.07 0.5 -0.29 -0.49 0.44 0.66 0.4 -0.28 -0.24 -0.38 -0.79 -0.46 -0.06 -0.23 -0.65 -0.55 -0.67 0.4 1.01 -0.13
0.57 0.7 0.28 -0.11 0.44 -1.1 1.13 -0.79 -1.21 -0.79 -0.47 -2.04 -3.21 -2.68 -0.98 -0.93 -1.26 0.88 1.23 1.19
-0.55 0.23 0.18 -0.76 0.04 0.08 0.24 -0.23 0.12 -0.01 -0.01 -0.91 0.11 0.02 0.1 -0.79 -0.79 0.12 1.14 0.11
1.01 0.87 0.51 0.57 0.46 -0.72 0.26 -0.27 -0.48 -0.61 -0.18 -0.96 -0.64 -0.96 -0.13 -0.38 -1.09 -0.05 0.65 -0.69
-0.91 -0.75 -1.55 -0.69 0.3 0.33 0.96 0.16 -0.34 -0.26 0.45 -0.31 -0.26 -0.39 0.46 -0.77 -0.67 0.25 0.84 0.49
-1.54 0.14 -0.84 - -0.33 -0.94 1.8 -0.51 0.41 -0.03 -0.06 -1.21 -0.61 -1.25 0.69 -0.96 -2.75 -0.95 1.14 1.44
-0.36 -0.0 -0.59 -0.5 -0.25 0.09 0.85 -0.01 -0.26 -0.21 0.32 -0.71 0.05 -0.37 0.44 -0.59 -0.44 -0.34 0.92 0.42
-0.03 0.77 -0.12 -0.21 0.17 -0.28 0.92 -0.75 -0.39 -0.62 -0.46 -0.63 -1.01 -1.4 -0.34 -0.36 -0.97 0.53 1.54 0.01
-0.15 -0.73 -0.6 0.12 -0.11 0.46 0.48 -0.1 -0.22 -0.04 0.39 -0.75 0.64 0.19 0.51 -0.9 -0.53 -0.29 0.2 0.08
-1.36 0.19 -1.22 -0.69 -0.3 0.23 0.57 -0.05 -0.13 -0.18 0.76 -0.38 -0.14 -0.21 0.89 -0.39 -0.81 -0.3 0.89 0.15
0.65 1.25 1.06 - 1.3 -0.63 2.44 -2.65 -3.97 - - - - -3.63 - - - 0.84 1.74 -
0.53 0.44 0.36 -0.6 1.79 0.72 2.84 -2.79 - - - -3.25 - - - - - -0.41 1.0 -
0.06 0.34 -0.03 0.54 0.48 0.71 0.61 -0.38 -0.95 -0.99 -1.01 -0.81 -0.65 -0.73 -0.83 -0.91 -0.46 0.51 0.73 0.77
-0.95 0.49 -0.79 -1.02 -0.87 -1.16 1.53 -0.18 0.27 0.1 0.71 -0.87 -1.22 -1.78 0.9 0.31 -0.93 -0.67 0.99 -0.3
0.2 0.07 -0.25 -0.58 0.07 -0.67 0.68 -0.18 0.14 0.08 0.75 -0.8 -1.37 -1.45 0.85 0.12 -0.97 0.05 0.31 0.36
-0.2 - - 0.89 - - 3.9 -2.65 -0.78 - - - -1.15 - - - - - 0.2 -
-1.25 -0.67 -1.76 -1.88 -1.12 1.23 1.66 -1.35 -1.46 -2.25 -0.97 -1.57 -1.44 -1.83 -0.28 -1.83 -2.36 0.51 2.4 0.97
-0.31 -0.26 -0.42 -0.45 -0.21 -0.78 0.85 -0.34 0.1 0.06 0.51 -1.01 -0.0 -0.37 0.69 -0.14 -1.14 -0.23 1.02 0.23
0.47 0.27 0.22 0.28 0.56 -0.61 1.35 -0.52 -1.43 -1.54 -0.24 -1.15 -0.52 -0.85 -0.09 -1.23 -1.5 0.31 1.22 0.15
-1.74 -1.34 -1.27 0.52 0.46 -0.02 0.22 -0.44 -0.95 -1.4 -0.1 -0.98 -1.92 -2.12 0.57 1.15 -1.35 -0.86 2.44 -1.81
-0.94 0.12 -0.67 -0.25 0.09 -0.71 1.19 -0.54 -0.67 -0.63 -0.61 -0.68 -0.98 -0.89 -0.36 0.12 -0.39 0.43 1.77 0.36
1.02 1.62 1.77 0.3 -0.09 -3.26 1.29 -1.69 -0.96 -1.08 -0.72 -2.58 -1.31 -1.18 -1.26 -0.37 -2.09 -1.57 0.4 -0.39
0.47 -0.36 0.87 -0.56 0.45 0.68 2.05 -1.04 -2.26 -1.64 -1.62 -2.74 -0.82 -0.26 -1.48 -3.15 -1.63 -1.18 1.32 0.68
-0.63 0.51 0.24 -0.66 -0.13 -1.79 0.05 -0.17 -0.16 -0.35 0.88 -0.12 -1.23 -1.34 1.07 -0.51 -1.24 0.02 1.01 0.57
0.25 0.57 0.4 0.12 -0.21 -1.26 0.68 -0.22 -0.34 -0.4 0.05 -0.67 -0.3 -0.76 0.06 0.11 -0.59 -0.3 1.03 -0.11
0.29 -0.4 -0.09 0.37 0.3 -1.43 0.97 -0.34 -0.08 -0.1 0.54 -0.47 -1.32 -1.75 0.71 -0.31 -0.78 -0.3 0.8 0.15
0.26 0.89 0.66 0.09 0.35 -1.3 0.64 -0.25 -0.16 -0.21 0.11 -0.62 -0.23 -0.36 0.09 -0.93 -1.13 -0.14 0.45 -0.34
0.55 1.24 0.44 0.53 -0.11 -1.0 0.51 -0.62 -0.2 -0.66 -0.12 -1.33 -1.17 -1.29 -0.04 0.69 -0.55 -0.6 0.61 -0.45
0.42 -0.33 -1.44 -0.52 -0.64 0.98 0.49 -1.26 -1.44 -1.53 -0.28 -0.59 -1.86 -2.14 -0.45 -2.11 -0.71 0.32 1.95 1.57
0.11 0.82 -0.19 -0.2 0.41 -0.29 1.14 -0.53 -0.92 -0.64 -0.62 -1.11 -0.68 -1.04 -0.56 -0.32 -0.45 0.14 1.2 0.45
-0.83 0.2 -0.56 -0.34 0.1 -0.2 0.75 0.05 0.13 -0.02 0.66 -0.59 -0.38 -0.47 0.81 -0.57 -0.71 -0.05 0.23 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.