Heatmap: Cluster_294 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.47 0.1 1.0 0.11 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 1.0 0.58 0.5 0.27 0.07 0.2 0.15 0.11 0.1 0.18 0.06 0.29 0.22 0.19 0.08 0.05 0.17 0.21 0.03
0.55 1.0 0.61 0.39 0.55 0.01 0.06 0.06 0.05 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.23 0.15 0.08 0.03 0.27
0.48 1.0 0.97 0.27 0.56 0.0 0.08 0.05 0.04 0.05 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.24 0.16 0.13 0.07 0.25
0.32 1.0 0.78 0.42 0.66 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.8 1.0 0.48 0.63 0.05 0.28 0.07 0.02 0.02 0.03 0.05 0.01 0.02 0.04 0.09 0.07 0.19 0.04 0.08
0.65 0.89 1.0 0.52 0.45 0.21 0.07 0.09 0.01 0.01 0.05 0.04 0.01 0.0 0.07 0.07 0.12 0.34 0.44 0.05
0.38 1.0 0.5 0.21 0.28 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.2
0.72 1.0 0.87 0.41 0.8 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.02 0.23
0.96 0.59 1.0 0.84 0.68 0.12 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.19 0.37 0.15
0.7 1.0 0.79 0.55 0.47 0.14 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.19 0.6 0.11
0.39 1.0 0.91 0.34 0.44 0.06 0.07 0.07 0.08 0.06 0.06 0.04 0.03 0.02 0.02 0.1 0.07 0.26 0.33 0.11
0.55 0.26 1.0 0.37 0.56 0.02 0.0 0.05 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.36 0.06 0.15 0.0 0.0
0.73 1.0 0.93 0.26 0.17 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 1.0 0.86 0.65 0.77 0.18 0.23 0.22 0.17 0.15 0.14 0.17 0.09 0.12 0.13 0.32 0.25 0.44 0.32 0.29
0.76 0.81 1.0 0.89 0.66 0.21 0.18 0.24 0.15 0.13 0.19 0.2 0.21 0.2 0.2 0.18 0.2 0.25 0.5 0.12
1.0 0.56 0.73 0.76 0.55 0.44 0.18 0.37 0.25 0.24 0.26 0.25 0.27 0.27 0.25 0.25 0.2 0.44 0.44 0.43
0.88 0.79 1.0 0.72 0.95 0.32 0.26 0.14 0.08 0.07 0.09 0.15 0.04 0.11 0.1 0.3 0.25 0.31 0.13 0.13
0.48 1.0 0.96 0.31 0.54 0.24 0.14 0.08 0.04 0.03 0.06 0.06 0.02 0.05 0.05 0.13 0.11 0.18 0.07 0.06
0.64 0.65 1.0 0.57 0.42 0.09 0.09 0.07 0.07 0.04 0.04 0.01 0.05 0.08 0.04 0.07 0.09 0.04 0.26 0.06
0.54 1.0 0.56 0.66 0.47 0.14 0.01 0.1 0.07 0.08 0.05 0.11 0.04 0.05 0.05 0.09 0.13 0.17 0.0 0.02
0.92 0.91 1.0 0.62 0.23 0.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.03
0.77 0.4 1.0 0.31 0.24 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0
0.79 1.0 0.78 0.42 0.3 0.01 0.2 0.08 0.08 0.07 0.13 0.07 0.07 0.07 0.16 0.05 0.08 0.15 0.18 0.17
1.0 0.99 0.67 0.71 0.5 0.44 0.19 0.18 0.12 0.09 0.11 0.1 0.11 0.11 0.08 0.33 0.19 0.34 0.16 0.27
0.47 1.0 0.55 0.36 0.24 0.21 0.13 0.11 0.04 0.03 0.07 0.05 0.05 0.04 0.04 0.09 0.08 0.18 0.08 0.11
1.0 0.72 0.99 0.53 0.63 0.0 0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.24 0.07 0.0 0.01
0.8 1.0 0.95 0.91 0.78 0.01 0.01 0.07 0.04 0.06 0.01 0.01 0.14 0.1 0.01 0.34 0.06 0.11 0.02 0.13
0.55 0.4 1.0 0.22 0.27 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.01 0.02
0.06 1.0 0.09 0.38 0.44 0.01 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.04 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0
1.0 0.27 0.9 0.32 0.33 0.0 0.41 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01
0.16 1.0 0.25 0.49 0.44 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
1.0 0.71 0.79 0.83 0.58 0.23 0.1 0.08 0.02 0.02 0.07 0.04 0.01 0.01 0.08 0.02 0.02 0.32 0.06 0.16
0.64 1.0 0.61 0.66 0.54 0.26 0.13 0.2 0.19 0.17 0.24 0.16 0.1 0.1 0.21 0.26 0.14 0.41 0.24 0.19
0.27 1.0 0.47 0.52 0.34 0.07 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0
0.19 1.0 0.47 0.24 0.41 0.04 0.01 0.04 0.05 0.08 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.15 0.08 0.0 0.01 0.06
0.54 0.96 0.96 1.0 0.47 0.18 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0
0.49 1.0 0.51 0.41 0.44 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.11 0.03
0.58 0.67 0.98 1.0 0.52 0.05 0.33 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01
0.29 1.0 0.41 0.34 0.29 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01
0.08 1.0 0.91 0.03 0.11 0.04 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.15 0.06 0.05
1.0 0.99 0.99 0.61 0.61 0.24 0.14 0.3 0.17 0.16 0.26 0.17 0.11 0.09 0.26 0.19 0.15 0.35 0.48 0.31
1.0 0.57 0.65 0.47 0.53 0.18 0.15 0.3 0.17 0.13 0.33 0.17 0.17 0.12 0.29 0.16 0.2 0.27 0.26 0.37
0.26 0.52 1.0 0.35 0.2 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.01
0.35 1.0 0.73 0.24 0.37 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.1 0.04 0.05
1.0 0.52 0.88 0.72 0.82 0.27 0.41 0.37 0.34 0.25 0.36 0.2 0.22 0.27 0.34 0.51 0.36 0.35 0.21 0.24
0.61 1.0 0.7 0.86 0.76 0.06 0.16 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0
0.47 0.53 1.0 0.23 0.37 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.05 0.88 1.0 0.32 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.42 1.0 0.38 0.45 0.48 0.0 0.05 0.08 0.05 0.06 0.09 0.14 0.07 0.1 0.1 0.09 0.13 0.09 0.08 0.02
0.6 1.0 0.59 0.15 0.38 0.04 0.0 0.03 0.04 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.04 0.07 0.04 0.18 0.07 0.1
0.25 0.83 1.0 0.22 0.26 0.0 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.01 0.14 0.0 0.0
0.31 1.0 0.52 0.67 0.31 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.27 0.0 0.0
0.83 0.65 1.0 0.92 0.61 0.0 0.43 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.05 0.01
0.66 1.0 0.71 0.61 0.55 0.11 0.04 0.11 0.11 0.1 0.04 0.08 0.05 0.06 0.05 0.22 0.17 0.16 0.12 0.09
0.78 0.38 1.0 0.37 0.27 0.0 0.32 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0
0.61 1.0 0.67 0.6 0.37 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.19 0.09
0.42 0.38 1.0 0.43 0.4 0.01 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.06
0.37 0.6 1.0 0.08 0.3 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.0
0.67 0.76 1.0 0.47 0.42 0.14 0.17 0.19 0.13 0.14 0.26 0.11 0.14 0.12 0.3 0.12 0.14 0.23 0.39 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)