Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.03 0.06 0.09 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 1.0
1.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.37 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.3 0.64 0.28 0.0
0.68 0.21 0.41 0.82 0.83 0.42 0.6 0.53 0.41 0.42 0.86 0.49 0.5 0.51 0.72 0.76 1.0 0.78 0.89 0.88
0.12 0.08 0.2 0.42 0.57 0.34 0.41 0.2 0.04 0.03 0.2 0.41 0.04 0.05 0.19 0.04 0.16 0.98 1.0 0.18
0.17 0.11 0.11 0.21 0.22 0.24 0.26 0.64 0.43 0.47 0.68 0.23 1.0 0.72 0.6 0.29 0.19 0.2 0.1 0.84
0.1 0.09 0.04 0.43 0.1 0.06 0.02 0.33 0.42 0.34 0.17 0.11 0.13 0.1 0.18 0.09 0.09 0.25 0.43 1.0
0.17 0.98 0.31 0.3 1.0 0.14 0.01 0.11 0.04 0.04 0.1 0.11 0.02 0.02 0.09 0.12 0.04 0.57 0.24 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.11 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.38 0.41 0.07 0.4 0.73 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0
1.0 0.71 0.51 0.89 0.84 0.23 0.16 0.52 0.35 0.3 0.33 0.29 0.6 0.43 0.31 0.3 0.18 0.8 0.45 0.43
0.02 0.04 0.02 0.17 0.04 0.63 1.0 0.09 0.12 0.03 0.01 0.0 0.02 0.04 0.07 0.0 0.04 0.24 0.44 0.64
0.44 0.19 0.27 0.35 0.33 0.07 0.3 0.49 0.44 0.52 0.97 0.3 0.37 0.29 1.0 0.63 0.4 0.38 0.54 0.31
0.99 0.51 0.6 0.68 1.0 0.46 0.19 0.35 0.19 0.15 0.19 0.63 0.26 0.31 0.16 0.34 0.36 0.58 0.41 0.81
0.15 0.09 0.1 0.25 1.0 0.57 0.13 0.07 0.02 0.01 0.18 0.38 0.04 0.07 0.21 0.06 0.06 0.33 0.44 0.36
0.34 0.2 0.3 0.43 0.84 0.53 0.1 0.31 0.2 0.27 0.21 0.28 0.07 0.07 0.17 0.23 0.46 1.0 0.13 0.11
1.0 0.03 0.11 0.05 0.03 0.01 0.05 0.06 0.09 0.06 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.01 0.94 0.74 0.83
0.1 0.1 0.06 0.1 0.4 0.29 0.2 0.11 0.07 0.07 0.03 0.01 0.06 0.15 0.05 0.0 0.01 1.0 0.21 0.19
0.37 0.07 0.11 0.4 0.42 0.13 0.05 0.4 0.28 0.26 0.22 0.24 0.35 0.31 0.27 0.31 0.21 0.59 0.62 1.0
0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.09 1.0
0.11 0.36 0.11 0.56 1.0 0.39 0.0 0.18 0.08 0.11 0.53 0.28 0.03 0.1 0.25 0.01 0.07 0.56 0.12 0.29
0.14 0.12 0.06 0.16 0.12 0.23 0.05 0.25 0.21 0.2 0.31 0.15 0.25 0.19 0.32 0.11 0.11 0.24 0.21 1.0
0.24 0.03 0.03 0.14 0.11 0.03 0.02 0.17 0.17 0.16 0.22 0.13 0.12 0.11 0.26 0.17 0.17 0.24 0.31 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.87 0.37 0.32 0.0 0.52 0.2 0.3 0.48 1.0 0.0 0.04 0.0
1.0 0.37 0.4 0.79 0.75 0.11 0.22 0.39 0.38 0.46 0.18 0.48 0.51 0.56 0.2 0.52 0.19 0.82 0.08 0.48
0.75 0.78 0.33 1.0 0.7 0.09 0.06 0.31 0.15 0.16 0.11 0.29 0.47 0.37 0.31 0.34 0.14 0.6 0.21 0.28
0.96 0.61 0.49 1.0 0.73 0.09 0.22 0.42 0.34 0.28 0.28 0.39 0.77 0.6 0.13 0.31 0.15 0.64 0.25 0.46
0.28 0.17 0.12 0.18 0.38 0.06 0.03 0.4 0.15 0.23 0.36 0.23 0.29 0.31 0.3 0.06 0.1 0.41 0.29 1.0
0.1 0.1 0.15 0.32 1.0 0.59 0.15 0.08 0.02 0.01 0.19 0.35 0.01 0.02 0.24 0.04 0.05 0.41 0.66 0.3
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 0.15 0.28 0.16 0.12 0.0 0.1 0.14 0.0 0.0 0.34 0.03 1.0
0.08 0.0 0.04 0.12 0.0 0.0 0.07 0.18 0.13 0.17 0.26 0.13 0.08 0.06 0.37 0.0 0.16 0.0 0.34 1.0
0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 1.0 0.67 0.59
1.0 0.67 0.65 0.79 0.65 0.14 0.45 0.66 0.87 0.85 0.89 0.34 0.76 0.56 0.84 0.6 0.44 0.6 0.95 0.49
1.0 0.13 0.32 0.46 0.27 0.02 0.26 0.4 0.48 0.39 0.55 0.17 0.26 0.25 0.5 0.4 0.45 0.23 0.26 0.21
0.29 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.12 0.6 1.0 0.14 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.04
0.15 0.11 0.06 0.14 0.13 0.11 0.35 0.22 0.18 0.16 0.45 0.1 0.32 0.18 0.45 0.04 0.05 0.13 0.48 1.0
1.0 0.26 0.71 0.76 0.47 0.01 0.41 0.48 0.67 0.62 0.91 0.31 0.27 0.25 0.82 0.55 0.52 0.31 0.31 0.34
0.65 0.13 0.26 0.4 0.22 0.04 0.53 0.38 0.76 0.58 0.81 0.17 0.27 0.24 0.82 1.0 0.67 0.13 0.58 0.39
0.25 0.01 0.02 0.21 0.3 0.2 0.02 0.65 0.5 0.57 0.45 0.65 0.19 0.18 0.4 0.33 0.47 0.51 1.0 0.49
0.51 0.29 0.32 0.19 0.35 0.75 0.13 0.79 0.49 0.6 0.76 0.21 0.61 0.3 0.82 0.13 0.21 1.0 0.8 0.98
0.44 0.07 0.27 0.19 0.2 0.06 0.11 0.41 0.58 0.52 0.81 0.18 0.28 0.26 0.68 1.0 0.87 0.2 0.28 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 1.0
0.06 0.02 0.08 0.02 0.04 0.01 0.0 0.2 0.27 0.45 0.31 0.02 1.0 0.54 0.33 0.13 0.05 0.5 0.23 0.46
0.08 0.06 0.07 0.1 0.1 0.11 0.05 0.39 0.41 0.44 0.44 0.09 1.0 0.53 0.67 0.36 0.11 0.38 0.47 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.11 0.0 0.33 0.0 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.08 0.03 0.02 0.22 0.2 0.5 0.02 0.56 0.47 0.55 0.61 0.38 0.29 0.23 0.78 0.62 1.0 0.1 0.5 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.07 1.0
0.43 0.31 0.35 0.53 0.45 0.54 0.06 0.43 0.35 0.36 0.36 0.24 0.35 0.25 0.4 0.18 0.21 0.51 0.23 1.0
0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.24 0.06 0.1 0.0 0.06 0.29 0.0 0.0 0.2 0.17 0.0 0.29 1.0
0.34 0.29 0.22 0.23 0.28 0.4 0.2 0.34 0.25 0.23 0.28 0.28 0.26 0.29 0.27 0.15 0.16 0.36 0.33 1.0
0.07 0.0 0.0 0.03 0.06 0.06 0.07 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.07 0.02 0.03 0.16 0.22 1.0
1.0 0.38 0.72 0.56 0.5 0.08 0.28 0.59 0.77 0.73 0.88 0.27 0.48 0.41 0.68 0.81 0.56 0.48 0.87 0.77
1.0 0.66 0.67 0.73 0.74 0.07 0.13 0.26 0.26 0.29 0.5 0.19 0.28 0.18 0.51 0.11 0.15 0.15 0.11 0.76
1.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.07 0.37 0.42 0.49 0.73 0.57 0.05 0.14 0.0 0.2 0.69 0.87 0.16 0.23
0.54 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 1.0 0.49 0.16 0.18 0.54 0.27 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09
0.53 0.81 0.8 0.4 1.0 0.8 0.03 0.04 0.1 0.08 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.22 0.07 0.29 0.02 0.45
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.17
0.29 0.44 0.69 0.22 1.0 0.6 0.0 0.07 0.16 0.13 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.21 0.08 0.46 0.51 1.0
0.02 0.49 0.16 0.0 1.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.19 0.08 0.02 0.0 0.19 0.03 0.03 0.02 0.65 0.17
0.31 0.26 0.31 0.25 0.27 0.19 0.12 0.23 0.18 0.17 0.29 0.13 0.22 0.23 0.27 0.15 0.16 0.29 0.4 1.0
0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.05 0.06 0.08 0.02 0.04 0.06 0.0 0.01 0.27 0.11 1.0
1.0 0.25 0.37 0.58 0.79 0.23 0.03 0.24 0.31 0.3 0.08 0.17 0.09 0.07 0.07 0.06 0.27 0.35 0.42 0.36
0.11 0.09 0.06 0.09 0.07 0.2 0.04 0.21 0.25 0.23 0.26 0.14 0.29 0.25 0.28 0.27 0.18 0.27 0.06 1.0
1.0 0.59 0.73 0.56 0.92 0.14 0.07 0.29 0.16 0.21 0.16 0.39 0.06 0.1 0.14 0.12 0.43 0.51 0.3 0.73
0.3 0.0 0.1 0.0 0.14 0.0 0.13 0.25 0.06 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0 0.75 0.0 1.0
0.99 0.23 0.5 0.52 0.59 0.21 0.5 0.59 0.78 0.73 0.79 0.4 0.64 0.53 0.83 0.87 0.43 0.48 0.46 1.0
0.03 0.0 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.0 0.17
0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.08
0.23 0.02 0.09 0.05 0.04 0.05 0.03 0.12 0.1 0.11 0.09 0.13 0.06 0.07 0.09 0.01 0.03 0.06 0.0 1.0
0.23 0.05 0.13 0.07 0.06 0.08 0.04 0.12 0.11 0.13 0.08 0.14 0.05 0.06 0.08 0.01 0.04 0.07 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0
0.29 0.12 0.12 0.09 0.17 0.16 0.07 0.18 0.14 0.18 0.28 0.24 0.23 0.3 0.27 0.07 0.02 0.2 0.09 1.0
0.02 0.03 0.07 0.13 0.04 0.04 0.16 0.53 1.0 0.73 0.75 0.48 0.46 0.54 0.44 0.55 0.45 0.37 0.18 0.12
0.01 0.25 0.02 0.07 0.09 0.12 1.0 0.07 0.03 0.01 0.09 0.31 0.04 0.12 0.06 0.47 0.0 0.02 0.19 0.83
0.74 0.14 0.43 0.41 0.29 0.02 0.29 0.3 0.49 0.52 1.0 0.15 0.17 0.15 0.91 0.72 0.68 0.2 0.28 0.35
0.68 0.28 0.29 0.5 0.51 0.3 0.01 0.59 0.45 0.43 0.8 0.27 0.3 0.28 0.74 0.61 0.56 1.0 0.13 0.25
0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.07 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.02 0.06 0.16 1.0
0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.08 0.03 0.01 0.01 0.05 0.01 0.05 0.02 0.11 0.01 0.01 0.07 0.17 1.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.08 0.03 0.02 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.06 0.01 0.01 0.06 0.1 1.0
0.35 0.08 0.24 0.29 0.24 0.04 0.21 0.35 0.6 0.57 0.87 0.19 0.28 0.27 0.82 1.0 0.73 0.32 0.27 0.19
0.34 0.3 0.4 0.29 0.2 0.04 0.24 0.36 0.85 0.66 0.75 0.3 0.16 0.12 0.63 1.0 0.95 0.28 0.45 0.21
0.06 0.09 0.09 0.06 0.13 0.21 0.03 0.52 0.6 0.67 0.74 0.46 0.36 0.61 1.0 0.07 0.12 0.75 0.34 0.16
0.41 0.05 0.2 0.08 0.2 0.55 0.27 0.09 0.12 0.13 0.01 0.04 0.04 0.03 0.02 0.13 0.08 0.65 0.27 1.0
0.06 0.02 0.02 0.25 1.0 0.38 0.01 0.07 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 0.03 0.69 0.49 0.17
0.76 0.94 1.0 0.77 0.79 0.29 0.12 0.5 0.35 0.44 0.38 0.32 0.18 0.12 0.37 0.18 0.25 0.81 0.77 0.49
0.73 0.51 0.67 1.0 0.77 0.19 0.1 0.52 0.31 0.35 0.57 0.25 0.58 0.43 0.55 0.12 0.17 0.64 0.42 0.49
0.25 0.02 0.01 0.1 0.05 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 1.0 0.42
0.37 0.05 1.0 0.09 0.29 0.03 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.09 0.05 0.49 1.0 0.46
0.19 0.18 0.05 0.25 0.06 0.02 0.03 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.31 0.08 1.0
0.52 1.0 0.31 0.43 0.51 0.15 0.03 0.14 0.14 0.26 0.02 0.04 0.03 0.01 0.0 0.17 0.06 0.16 0.56 0.0
1.0 0.3 0.61 0.68 0.8 0.07 0.28 0.57 0.94 0.67 0.52 0.43 0.44 0.37 0.48 0.77 0.71 0.57 0.55 0.68
0.05 0.8 0.05 0.04 0.25 0.16 0.06 0.28 0.23 0.16 0.13 0.57 0.1 0.12 0.16 0.11 0.17 0.05 0.07 1.0
0.91 0.24 0.39 0.27 0.27 0.0 0.2 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.14 0.14 0.78 1.0 0.97
1.0 0.49 0.55 0.28 0.53 0.32 0.1 0.32 0.3 0.32 0.51 0.25 0.16 0.11 0.51 0.15 0.16 0.25 0.12 0.88
0.55 0.51 0.45 0.61 0.77 0.38 0.23 0.47 0.3 0.27 0.53 0.4 0.19 0.18 0.49 0.25 0.33 1.0 0.49 0.58
0.22 0.02 0.07 0.26 0.45 0.07 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.04 0.16 0.09 0.09 0.16 1.0
0.85 0.38 0.84 0.5 0.6 0.04 0.47 0.53 0.77 0.62 0.75 0.32 0.44 0.41 0.68 1.0 0.78 0.62 0.5 0.77

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)