Heatmap: Cluster_265 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.74 0.96 0.94 0.93 0.24 0.45 0.56 0.41 0.36 0.55 0.29 0.35 0.32 0.65 0.37 0.33 0.7 0.89 0.75
0.65 0.44 1.0 0.55 0.41 0.44 0.29 0.27 0.19 0.19 0.21 0.24 0.1 0.09 0.17 0.21 0.3 0.53 0.52 0.24
0.66 0.68 1.0 0.5 0.49 0.27 0.29 0.28 0.3 0.3 0.25 0.19 0.21 0.23 0.26 0.45 0.31 0.36 0.81 0.33
0.7 0.46 0.99 1.0 0.3 0.06 0.1 0.18 0.24 0.18 0.24 0.13 0.07 0.06 0.26 0.32 0.22 0.33 0.29 0.21
1.0 0.85 0.94 0.75 0.86 0.29 0.52 0.47 0.29 0.27 0.36 0.28 0.27 0.27 0.37 0.32 0.31 0.78 0.78 0.43
0.94 0.77 1.0 0.8 0.53 0.36 0.23 0.26 0.15 0.13 0.21 0.16 0.09 0.09 0.21 0.23 0.25 0.5 0.78 0.35
0.62 0.59 0.74 1.0 0.41 0.36 0.13 0.2 0.1 0.1 0.08 0.14 0.12 0.15 0.09 0.12 0.14 0.32 0.48 0.24
1.0 0.59 0.74 0.61 0.75 0.35 0.46 0.48 0.38 0.41 0.64 0.32 0.21 0.19 0.61 0.39 0.39 0.6 0.55 0.47
0.72 0.76 1.0 0.89 0.67 0.27 0.23 0.27 0.15 0.12 0.29 0.22 0.12 0.09 0.28 0.28 0.2 0.57 0.77 0.29
0.85 0.83 1.0 0.85 0.64 0.55 0.43 0.36 0.18 0.18 0.26 0.32 0.26 0.25 0.26 0.33 0.36 0.52 0.5 0.41
0.73 0.58 1.0 0.78 0.62 0.37 0.19 0.32 0.16 0.16 0.19 0.28 0.15 0.12 0.18 0.21 0.28 0.55 0.88 0.33
0.64 0.64 1.0 0.61 0.3 0.27 0.37 0.26 0.23 0.2 0.23 0.16 0.22 0.21 0.22 0.22 0.21 0.28 0.64 0.29
0.81 0.69 1.0 0.71 0.82 0.26 0.48 0.39 0.39 0.42 0.4 0.29 0.11 0.12 0.44 0.45 0.36 0.67 0.76 0.28
0.62 0.47 1.0 0.54 0.48 0.29 0.06 0.18 0.11 0.12 0.13 0.18 0.1 0.09 0.12 0.09 0.11 0.32 0.51 0.22
0.98 0.64 0.81 1.0 0.67 0.31 0.43 0.3 0.15 0.14 0.16 0.19 0.2 0.18 0.16 0.23 0.24 0.74 0.94 0.37
0.74 0.62 1.0 0.92 0.49 0.29 0.16 0.22 0.1 0.08 0.09 0.15 0.13 0.12 0.11 0.13 0.12 0.39 0.79 0.2
1.0 0.33 0.57 0.58 0.65 0.28 0.29 0.33 0.26 0.29 0.48 0.18 0.11 0.12 0.44 0.33 0.24 0.55 0.42 0.35
0.8 0.53 1.0 0.73 0.5 0.23 0.13 0.11 0.05 0.02 0.06 0.06 0.06 0.07 0.06 0.11 0.06 0.48 0.44 0.22
1.0 0.49 0.75 0.68 0.58 0.35 0.62 0.4 0.39 0.42 0.73 0.31 0.33 0.32 0.66 0.45 0.43 0.45 0.62 0.8
0.93 0.57 1.0 1.0 0.79 0.3 0.33 0.36 0.24 0.24 0.35 0.32 0.24 0.23 0.37 0.28 0.35 0.67 0.7 0.42
0.61 0.6 1.0 0.66 0.51 0.22 0.23 0.2 0.14 0.15 0.14 0.16 0.11 0.1 0.15 0.11 0.15 0.34 0.59 0.22
0.96 0.6 0.98 1.0 0.96 0.79 0.4 0.62 0.43 0.41 0.71 0.49 0.36 0.31 0.78 0.42 0.36 0.91 0.58 0.67
0.78 0.54 1.0 0.72 0.49 0.26 0.2 0.29 0.14 0.12 0.21 0.21 0.08 0.07 0.2 0.12 0.17 0.5 0.71 0.32
0.96 0.5 0.96 1.0 0.75 0.46 0.27 0.5 0.28 0.3 0.56 0.38 0.23 0.2 0.56 0.34 0.46 0.69 0.7 0.59
0.98 0.2 0.65 1.0 0.55 0.1 0.17 0.25 0.14 0.15 0.37 0.15 0.12 0.12 0.38 0.23 0.29 0.4 0.33 0.14
1.0 0.26 0.74 0.79 0.59 0.12 0.19 0.24 0.14 0.13 0.19 0.11 0.12 0.12 0.21 0.28 0.24 0.4 0.31 0.16
0.72 0.52 1.0 0.74 0.62 0.51 0.34 0.4 0.21 0.23 0.55 0.31 0.08 0.08 0.55 0.24 0.31 0.66 0.53 0.38
0.93 0.95 0.98 1.0 0.62 0.52 0.28 0.29 0.17 0.16 0.18 0.26 0.12 0.13 0.16 0.32 0.33 0.49 0.65 0.42
0.61 0.45 1.0 0.9 0.55 0.32 0.2 0.31 0.19 0.18 0.2 0.4 0.23 0.22 0.18 0.24 0.37 0.38 0.5 0.18
0.83 0.64 0.67 0.42 0.63 0.19 0.29 0.26 0.29 0.29 0.51 0.19 0.03 0.04 0.5 0.45 0.39 0.5 1.0 0.46
1.0 0.43 0.58 0.5 0.64 0.18 0.29 0.31 0.32 0.36 0.64 0.19 0.2 0.17 0.62 0.58 0.47 0.49 0.59 0.48
0.77 0.65 1.0 0.85 0.68 0.3 0.3 0.35 0.32 0.26 0.4 0.23 0.24 0.24 0.31 0.4 0.4 0.56 0.39 0.35
0.75 0.62 1.0 0.91 0.72 0.3 0.36 0.34 0.24 0.22 0.4 0.31 0.29 0.26 0.44 0.39 0.29 0.73 0.73 0.5
0.48 0.54 1.0 0.53 0.49 0.24 0.14 0.2 0.11 0.11 0.1 0.13 0.1 0.09 0.11 0.13 0.18 0.39 0.38 0.29
1.0 0.77 0.93 0.77 0.77 0.28 0.42 0.57 0.5 0.49 0.62 0.35 0.43 0.37 0.6 0.47 0.34 0.63 0.73 0.63
1.0 0.8 0.8 0.86 0.81 0.39 0.37 0.52 0.47 0.47 0.68 0.31 0.35 0.27 0.68 0.49 0.44 0.68 0.77 0.5
1.0 0.66 0.98 0.86 0.78 0.33 0.11 0.44 0.24 0.23 0.39 0.31 0.28 0.27 0.35 0.5 0.41 0.6 0.45 0.25
1.0 0.48 0.85 0.89 0.55 0.32 0.35 0.38 0.35 0.32 0.52 0.27 0.11 0.1 0.47 0.25 0.27 0.51 0.71 0.4
0.94 0.75 0.94 1.0 0.59 0.19 0.34 0.25 0.14 0.13 0.18 0.18 0.13 0.13 0.21 0.33 0.31 0.56 0.98 0.31
0.76 0.8 1.0 0.81 0.61 0.62 0.39 0.32 0.29 0.24 0.26 0.3 0.06 0.08 0.3 0.24 0.23 0.49 0.67 0.27
0.94 0.58 1.0 0.72 0.54 0.28 0.04 0.16 0.07 0.11 0.1 0.06 0.06 0.07 0.13 0.09 0.2 0.4 0.67 0.4
0.94 0.27 0.54 1.0 0.51 0.21 0.15 0.3 0.17 0.18 0.39 0.21 0.24 0.21 0.39 0.23 0.19 0.39 0.57 0.14
1.0 0.71 0.8 0.79 0.55 0.27 0.38 0.41 0.44 0.42 0.59 0.27 0.31 0.28 0.55 0.63 0.48 0.52 0.85 0.48
0.85 0.62 0.92 1.0 0.66 0.61 0.3 0.46 0.32 0.3 0.3 0.35 0.41 0.38 0.29 0.36 0.41 0.53 0.64 0.44
0.58 0.73 1.0 0.67 0.62 0.38 0.24 0.24 0.21 0.18 0.19 0.15 0.08 0.1 0.17 0.35 0.19 0.62 0.85 0.44
0.65 0.42 1.0 0.71 0.53 0.17 0.06 0.16 0.12 0.1 0.08 0.13 0.01 0.02 0.12 0.12 0.1 0.31 0.47 0.15
0.57 1.0 0.44 0.56 0.46 0.25 0.09 0.29 0.26 0.31 0.21 0.19 0.1 0.12 0.26 0.36 0.27 0.64 0.76 0.31
0.87 0.69 1.0 0.95 0.48 0.6 0.11 0.24 0.12 0.09 0.23 0.13 0.14 0.13 0.23 0.14 0.12 0.35 0.45 0.19
0.63 0.63 1.0 0.8 0.59 0.22 0.21 0.28 0.15 0.14 0.26 0.23 0.09 0.08 0.26 0.24 0.26 0.55 0.49 0.27
1.0 0.52 0.8 0.79 0.76 0.41 0.47 0.43 0.29 0.31 0.71 0.28 0.23 0.22 0.61 0.44 0.48 0.59 0.63 0.47
1.0 0.23 0.57 0.84 0.66 0.21 0.33 0.43 0.21 0.23 0.6 0.27 0.29 0.21 0.53 0.21 0.29 0.61 0.38 0.33
1.0 0.61 0.83 0.84 0.63 0.55 0.3 0.33 0.19 0.16 0.27 0.22 0.08 0.08 0.32 0.22 0.25 0.63 0.71 0.35
0.79 0.64 1.0 0.83 0.67 0.45 0.21 0.3 0.19 0.15 0.13 0.22 0.21 0.23 0.16 0.18 0.23 0.53 0.58 0.41
0.88 0.87 1.0 0.79 0.95 0.39 0.45 0.49 0.33 0.31 0.44 0.35 0.19 0.17 0.47 0.33 0.33 0.88 0.81 0.59
0.67 0.62 1.0 0.6 0.76 0.27 0.45 0.4 0.33 0.33 0.38 0.49 0.2 0.17 0.37 0.31 0.39 0.65 0.91 0.37
0.93 0.86 1.0 1.0 0.79 0.41 0.46 0.52 0.38 0.4 0.38 0.44 0.31 0.25 0.39 0.29 0.44 0.86 0.92 0.31
0.76 0.56 1.0 0.73 0.6 0.57 0.29 0.25 0.18 0.2 0.19 0.27 0.16 0.12 0.17 0.24 0.29 0.38 0.56 0.28
1.0 0.4 0.55 0.78 0.71 0.41 0.26 0.4 0.24 0.22 0.43 0.23 0.15 0.16 0.4 0.21 0.23 0.84 0.39 0.47
0.88 0.91 1.0 0.83 0.66 0.37 0.43 0.4 0.23 0.21 0.22 0.24 0.29 0.26 0.24 0.27 0.35 0.52 0.82 0.44
0.96 0.51 1.0 0.71 0.55 0.22 0.25 0.22 0.17 0.15 0.14 0.21 0.14 0.14 0.13 0.35 0.27 0.42 0.69 0.23
0.54 0.25 1.0 0.85 0.35 0.21 0.18 0.27 0.15 0.15 0.21 0.26 0.1 0.08 0.17 0.21 0.26 0.41 0.35 0.24
0.75 0.85 0.98 0.69 0.84 0.22 0.32 0.39 0.22 0.21 0.28 0.44 0.16 0.18 0.3 0.2 0.28 0.91 1.0 0.42
0.93 0.56 1.0 0.99 0.79 0.41 0.43 0.46 0.35 0.35 0.58 0.42 0.16 0.15 0.57 0.33 0.43 0.7 0.93 0.45
0.56 0.53 0.96 1.0 0.54 0.22 0.24 0.27 0.17 0.16 0.2 0.2 0.29 0.26 0.22 0.22 0.25 0.5 0.6 0.3
0.62 0.6 0.88 1.0 0.44 0.19 0.16 0.27 0.18 0.17 0.33 0.24 0.2 0.22 0.3 0.21 0.26 0.37 0.54 0.34
1.0 0.45 0.66 0.64 0.64 0.44 0.28 0.39 0.26 0.21 0.47 0.18 0.28 0.23 0.39 0.23 0.25 0.74 0.36 0.49
1.0 0.18 0.58 0.81 0.72 0.07 0.3 0.27 0.31 0.3 0.5 0.2 0.07 0.06 0.51 0.21 0.29 0.36 0.31 0.35
0.82 0.64 0.89 1.0 0.59 0.35 0.33 0.39 0.28 0.24 0.41 0.25 0.1 0.11 0.35 0.43 0.46 0.68 0.69 0.47
0.85 0.33 0.55 1.0 0.64 0.18 0.38 0.36 0.22 0.24 0.35 0.24 0.12 0.13 0.37 0.25 0.3 0.46 0.52 0.2
0.73 0.29 0.58 1.0 0.6 0.15 0.18 0.33 0.21 0.2 0.23 0.23 0.23 0.25 0.2 0.27 0.35 0.51 0.34 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)