1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_172 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.17 0.07 0.08 0.32 0.34 0.77 0.16 0.44 0.15 0.16 0.24 0.4 0.08 0.07 0.2 0.2 0.26 1.0 0.68 0.69
0.03 0.02 0.04 0.04 0.04 1.0 0.04 0.08 0.01 0.02 0.06 0.03 0.04 0.02 0.04 0.0 0.01 0.03 0.05 0.08
0.03 0.02 0.06 0.02 0.02 1.0 0.04 0.09 0.02 0.03 0.08 0.04 0.01 0.01 0.09 0.01 0.02 0.04 0.04 0.07
0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 1.0 0.01 0.06 0.01 0.02 0.03 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.36
0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.04 0.11
0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.04 0.0 0.03 0.0 0.03 1.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.07 0.04 0.05 0.1 0.04 1.0 0.03 0.15 0.05 0.04 0.06 0.06 0.04 0.04 0.06 0.08 0.07 0.03 0.04 0.15
0.06 0.06 0.06 0.05 0.03 1.0 0.03 0.12 0.03 0.03 0.02 0.05 0.04 0.05 0.03 0.08 0.06 0.02 0.02 0.15
0.51 0.38 0.46 0.54 0.42 1.0 0.16 0.26 0.09 0.08 0.11 0.1 0.1 0.07 0.16 0.08 0.08 0.29 0.31 0.33
0.14 0.08 0.08 0.19 0.16 1.0 0.08 0.23 0.09 0.12 0.39 0.12 0.17 0.1 0.42 0.06 0.08 0.27 0.04 0.24
0.31 0.12 0.17 0.1 0.15 1.0 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.16 0.02 0.46
0.02 0.04 0.01 0.07 0.04 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.04 0.0 0.01 0.01 0.1 0.0 0.06
0.05 0.06 0.36 0.07 0.11 1.0 0.08 0.06 0.04 0.03 0.02 0.05 0.01 0.01 0.05 0.08 0.1 0.11 0.02 0.09
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.12 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02
0.52 0.19 0.11 0.81 0.62 1.0 0.59 0.51 0.43 0.32 0.73 0.3 0.17 0.19 0.95 0.5 0.42 0.76 0.48 0.78
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.01
0.15 0.08 0.11 0.11 0.08 1.0 0.08 0.23 0.11 0.08 0.17 0.11 0.05 0.08 0.16 0.18 0.14 0.09 0.05 0.4
0.41 0.4 0.12 0.14 0.3 1.0 0.1 0.28 0.24 0.25 0.33 0.16 0.33 0.25 0.36 0.21 0.15 0.35 0.11 0.24
0.25 0.18 0.19 0.18 0.29 1.0 0.16 0.28 0.16 0.15 0.25 0.25 0.13 0.13 0.17 0.21 0.23 0.21 0.1 0.08
0.34 0.24 0.23 0.31 0.37 1.0 0.43 0.44 0.27 0.28 0.39 0.2 0.37 0.32 0.42 0.28 0.16 0.43 0.37 0.9
0.08 0.07 0.06 0.12 0.16 1.0 0.1 0.14 0.1 0.11 0.19 0.23 0.1 0.11 0.14 0.11 0.16 0.11 0.13 0.4
0.38 0.23 0.19 0.22 0.27 1.0 0.15 0.13 0.04 0.04 0.02 0.03 0.06 0.05 0.03 0.02 0.04 0.47 0.35 0.84
0.09 0.01 0.02 0.06 0.04 1.0 0.3 0.16 0.01 0.02 0.07 0.13 0.1 0.14 0.03 0.03 0.01 0.21 0.19 0.21
0.67 0.39 0.53 0.77 0.73 1.0 0.24 0.55 0.33 0.31 0.51 0.28 0.36 0.33 0.48 0.31 0.35 0.6 0.36 0.65
0.12 0.04 0.07 0.09 0.07 1.0 0.06 0.47 0.05 0.06 0.1 0.33 0.19 0.29 0.05 0.02 0.07 0.16 0.09 0.22
0.07 0.1 0.11 0.04 0.05 1.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.15
0.18 0.05 0.07 0.05 0.07 1.0 0.19 0.17 0.1 0.09 0.13 0.11 0.06 0.06 0.09 0.13 0.19 0.09 0.02 0.15
0.11 0.05 0.08 0.16 0.31 1.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.07 0.58
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.06 0.1 0.1 0.12 0.16 1.0 0.13 0.22 0.18 0.14 0.11 0.09 0.18 0.16 0.1 0.08 0.09 0.15 0.22 0.23
0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0 0.02 0.09 0.02 0.01 0.05 0.1 0.05 0.04 0.05 0.03 0.02 0.04 0.03 0.39
0.32 0.21 0.24 0.17 0.12 1.0 0.17 0.1 0.08 0.08 0.14 0.06 0.07 0.07 0.12 0.1 0.09 0.1 0.02 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.09 0.02 0.36
0.67 0.68 1.0 0.47 0.76 0.48 0.17 0.32 0.04 0.09 0.31 0.23 0.04 0.01 0.31 0.04 0.07 0.54 0.08 0.14
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.15 0.2 0.27 0.22 1.0 0.15 0.06 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.07 0.07 0.25 0.14 0.32
0.36 0.24 0.19 0.25 0.36 1.0 0.21 0.25 0.09 0.12 0.21 0.09 0.09 0.07 0.27 0.15 0.12 0.27 0.48 0.64
0.23 0.15 0.19 0.12 0.16 1.0 0.06 0.17 0.11 0.1 0.19 0.12 0.11 0.08 0.19 0.14 0.12 0.11 0.06 0.23
0.24 0.48 0.26 0.27 0.48 1.0 0.26 0.39 0.18 0.22 0.31 0.18 0.11 0.1 0.34 0.26 0.15 0.58 0.44 0.43
0.32 0.44 0.32 0.28 0.63 1.0 0.38 0.5 0.23 0.31 0.47 0.33 0.19 0.17 0.6 0.46 0.2 0.64 0.47 0.67
0.17 0.13 0.19 0.16 0.13 1.0 0.09 0.17 0.15 0.12 0.13 0.11 0.13 0.12 0.14 0.18 0.14 0.16 0.11 0.12
0.24 0.16 0.08 0.19 0.07 1.0 0.2 0.22 0.14 0.12 0.02 0.16 0.05 0.06 0.02 0.05 0.05 0.12 0.15 0.1
0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.19 0.14 0.25 0.29 0.25 1.0 0.28 0.09 0.02 0.03 0.12 0.04 0.05 0.06 0.19 0.04 0.08 0.39 0.41 0.37
0.38 0.3 0.52 0.5 0.31 1.0 0.12 0.32 0.13 0.11 0.24 0.17 0.15 0.14 0.23 0.17 0.18 0.36 0.18 0.17
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.63 0.01 0.31 0.07 0.05 0.07 0.11 0.2 0.39 0.06 0.02 0.06 0.13 0.01 1.0
0.3 0.13 0.27 0.23 0.33 1.0 0.46 0.35 0.18 0.18 0.39 0.32 0.14 0.13 0.39 0.28 0.5 0.51 0.14 0.85
0.69 0.95 0.49 1.0 0.74 0.84 0.71 0.36 0.05 0.06 0.06 0.26 0.04 0.03 0.04 0.1 0.15 0.73 0.02 0.26
0.23 0.12 0.14 0.21 0.17 1.0 0.04 0.29 0.07 0.08 0.21 0.16 0.05 0.04 0.25 0.08 0.1 0.5 0.41 0.65
0.27 0.08 0.14 0.27 0.18 1.0 0.03 0.27 0.09 0.09 0.2 0.16 0.16 0.12 0.2 0.08 0.15 0.5 0.21 0.65
0.03 0.01 0.01 0.1 0.12 1.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.03 0.05 0.12 0.04 0.13
0.3 0.13 0.26 0.15 0.2 1.0 0.16 0.24 0.18 0.18 0.32 0.09 0.35 0.22 0.3 0.05 0.09 0.07 0.02 0.02
0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 1.0 0.22 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0
0.09 0.12 0.2 0.12 0.22 1.0 0.06 0.12 0.04 0.05 0.06 0.07 0.02 0.03 0.07 0.05 0.04 0.18 0.03 0.12
0.05 0.07 0.03 0.02 0.04 1.0 0.13 0.04 0.03 0.02 0.05 0.02 0.03 0.02 0.04 0.03 0.04 0.04 0.05 0.1
0.04 0.05 0.03 0.02 0.03 1.0 0.09 0.04 0.03 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.03 0.04 0.04 0.05 0.06 0.08
0.11 0.07 0.08 0.18 0.15 1.0 0.07 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.08 0.11 0.07 0.02 0.16
0.13 0.1 0.09 0.14 0.13 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.1 0.02 0.03
0.06 0.17 0.29 0.08 0.11 1.0 0.16 0.06 0.01 0.02 0.06 0.01 0.05 0.03 0.11 0.04 0.03 0.02 0.01 0.21
0.19 0.06 0.1 0.13 0.13 1.0 0.07 0.15 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05 0.05 0.06 0.07 0.12 0.07 0.87
0.04 0.01 0.01 0.08 0.14 1.0 0.09 0.03 0.01 0.0 0.06 0.09 0.0 0.02 0.08 0.02 0.01 0.08 0.0 0.2
0.01 0.0 0.02 0.06 0.15 1.0 0.0 0.21 0.0 0.01 0.12 0.02 0.0 0.02 0.04 0.11 0.17 0.07 0.01 0.82
0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.25
0.07 0.11 0.08 0.05 0.07 1.0 0.19 0.14 0.09 0.1 0.22 0.08 0.17 0.14 0.21 0.04 0.06 0.13 0.06 0.16
0.08 0.06 0.05 0.07 0.17 1.0 0.17 0.18 0.04 0.06 0.26 0.15 0.04 0.03 0.3 0.04 0.1 0.12 0.07 0.36
0.09 0.01 0.04 0.01 0.03 1.0 0.09 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.04 0.68
0.3 0.11 0.11 0.07 0.06 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.05 0.6
0.06 0.22 0.18 0.16 0.18 1.0 0.04 0.26 0.1 0.11 0.14 0.18 0.06 0.06 0.07 0.09 0.11 0.17 0.18 0.35
0.03 0.07 0.12 0.12 0.02 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.1
0.1 0.08 0.08 0.07 0.15 1.0 0.06 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.06 0.15 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.21 0.16 0.21 0.21 1.0 0.03 0.78 0.32 0.35 0.8 0.5 0.61 0.56 0.78 0.36 0.43 0.26 0.82 0.29
0.12 0.04 0.12 0.02 0.06 1.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.02 0.03 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)