Heatmap: Cluster_149 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.76 0.87 0.51 0.6 0.18 0.4 0.2 0.12 0.11 0.11 0.14 0.12 0.1 0.17 0.19 0.13 0.5 0.62 0.33
0.96 0.97 1.0 0.93 0.78 0.27 0.24 0.24 0.22 0.15 0.16 0.18 0.16 0.14 0.14 0.34 0.24 0.49 0.49 0.23
0.68 1.0 0.71 0.83 0.9 0.37 0.39 0.3 0.23 0.25 0.22 0.18 0.31 0.32 0.25 0.21 0.19 0.67 0.66 0.28
1.0 0.73 0.94 0.61 0.63 0.34 0.38 0.28 0.16 0.11 0.18 0.25 0.24 0.28 0.18 0.18 0.16 0.61 0.61 0.36
0.82 0.84 1.0 0.87 0.6 0.05 0.19 0.21 0.07 0.09 0.08 0.13 0.06 0.04 0.08 0.16 0.18 0.61 0.57 0.09
0.84 0.89 1.0 0.81 0.72 0.13 0.09 0.18 0.14 0.14 0.09 0.13 0.07 0.04 0.08 0.19 0.13 0.6 0.45 0.05
0.76 1.0 0.88 0.92 0.91 0.34 0.28 0.36 0.3 0.3 0.6 0.36 0.31 0.33 0.64 0.28 0.25 0.76 0.64 0.33
1.0 0.88 0.82 0.81 0.6 0.25 0.35 0.27 0.22 0.17 0.3 0.16 0.16 0.13 0.3 0.17 0.16 0.51 0.62 0.43
0.88 0.92 1.0 0.57 0.66 0.06 0.31 0.17 0.22 0.17 0.26 0.17 0.16 0.11 0.17 0.24 0.21 0.3 0.37 0.38
1.0 0.62 0.87 0.8 0.85 0.11 0.39 0.13 0.09 0.1 0.16 0.13 0.11 0.1 0.19 0.23 0.08 0.4 0.41 0.36
0.9 0.97 1.0 0.87 0.87 0.31 0.28 0.45 0.28 0.24 0.27 0.43 0.36 0.36 0.26 0.36 0.44 0.83 0.56 0.49
0.73 1.0 0.76 0.42 0.75 0.52 0.22 0.21 0.09 0.08 0.13 0.14 0.11 0.11 0.12 0.16 0.17 0.69 0.56 0.38
0.83 0.67 1.0 0.39 0.74 0.11 0.21 0.12 0.05 0.06 0.06 0.05 0.03 0.02 0.08 0.04 0.08 0.34 0.31 0.24
0.57 1.0 0.65 0.5 0.59 0.06 0.03 0.14 0.04 0.03 0.05 0.06 0.02 0.02 0.05 0.11 0.08 0.58 0.38 0.06
0.45 0.59 1.0 0.51 0.32 0.22 0.14 0.21 0.13 0.14 0.13 0.12 0.07 0.06 0.15 0.15 0.17 0.51 0.5 0.45
0.6 1.0 0.59 0.45 0.64 0.04 0.22 0.07 0.03 0.03 0.04 0.02 0.01 0.01 0.05 0.12 0.03 0.32 0.34 0.2
0.8 0.95 0.86 0.67 1.0 0.54 0.48 0.26 0.3 0.28 0.41 0.24 0.01 0.01 0.32 0.28 0.27 0.62 0.74 0.18
0.37 1.0 0.54 0.36 0.5 0.01 0.02 0.05 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 0.05 0.06 0.04 0.29 0.33 0.41
0.53 1.0 0.53 0.64 0.77 0.32 0.28 0.28 0.21 0.28 0.39 0.27 0.28 0.24 0.39 0.09 0.15 0.32 0.46 0.79
0.72 1.0 0.94 0.62 0.5 0.15 0.15 0.18 0.11 0.12 0.29 0.09 0.18 0.16 0.29 0.14 0.12 0.31 0.47 0.25
0.91 0.6 0.96 0.87 1.0 0.22 0.26 0.3 0.24 0.18 0.18 0.18 0.29 0.36 0.23 0.33 0.33 0.51 0.54 0.23
1.0 0.86 0.66 0.72 0.61 0.39 0.52 0.14 0.05 0.03 0.04 0.11 0.09 0.1 0.05 0.1 0.09 0.56 0.66 0.31
0.77 0.32 1.0 0.64 0.52 0.22 0.26 0.13 0.06 0.08 0.05 0.08 0.08 0.06 0.08 0.08 0.06 0.44 0.41 0.28
1.0 0.61 0.8 0.45 0.4 0.17 0.26 0.28 0.21 0.18 0.19 0.19 0.17 0.17 0.18 0.24 0.17 0.3 0.51 0.26
0.78 0.56 1.0 0.65 0.6 0.11 0.23 0.26 0.2 0.15 0.17 0.18 0.19 0.14 0.18 0.22 0.2 0.37 0.42 0.45
0.33 1.0 0.73 0.35 0.6 0.1 0.3 0.1 0.02 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.47 0.51 0.15
0.77 1.0 0.71 0.33 0.5 0.06 0.17 0.12 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.34 0.27 0.16
0.82 0.89 0.7 1.0 0.86 0.19 0.06 0.1 0.04 0.05 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.11 0.14 0.5 0.61 0.46
0.88 0.94 1.0 0.61 0.82 0.42 0.58 0.3 0.18 0.16 0.18 0.19 0.28 0.3 0.19 0.27 0.21 0.6 0.84 0.48
0.37 1.0 0.63 0.38 0.7 0.17 0.26 0.18 0.17 0.17 0.12 0.1 0.11 0.13 0.15 0.18 0.13 0.61 0.53 0.17
0.35 1.0 0.88 0.68 0.71 0.13 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.73 0.36 0.13
0.51 0.94 0.95 0.74 1.0 0.19 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.8 0.33 0.18
0.68 1.0 0.68 0.49 0.89 0.37 0.25 0.37 0.3 0.25 0.3 0.24 0.31 0.28 0.3 0.29 0.21 0.71 0.46 0.36
0.9 0.87 1.0 0.53 0.84 0.49 0.6 0.3 0.18 0.25 0.18 0.16 0.25 0.17 0.22 0.18 0.26 0.64 0.68 0.41
0.89 0.65 0.81 1.0 0.4 0.25 0.19 0.29 0.2 0.16 0.18 0.19 0.28 0.28 0.18 0.35 0.42 0.36 0.47 0.24
0.6 1.0 0.59 0.41 0.62 0.07 0.2 0.18 0.19 0.19 0.19 0.16 0.18 0.17 0.21 0.17 0.14 0.51 0.43 0.34
0.75 0.45 1.0 0.57 0.57 0.07 0.12 0.09 0.06 0.03 0.04 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0 0.01 0.35 0.37 0.27
0.46 0.96 1.0 0.37 0.57 0.09 0.09 0.14 0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.11 0.09 0.57 0.45 0.21
0.54 1.0 0.67 0.52 0.53 0.06 0.17 0.12 0.03 0.03 0.05 0.08 0.05 0.04 0.05 0.05 0.04 0.4 0.2 0.12
0.91 1.0 0.93 0.77 0.94 0.32 0.28 0.28 0.25 0.23 0.27 0.25 0.07 0.06 0.29 0.34 0.3 0.47 0.64 0.23
0.59 1.0 0.64 0.35 0.65 0.04 0.11 0.07 0.05 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.27 0.51 0.4
0.73 1.0 0.44 0.33 0.78 0.05 0.16 0.08 0.07 0.08 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.28 0.62 0.64
1.0 0.62 0.86 0.52 0.59 0.33 0.34 0.28 0.2 0.21 0.27 0.23 0.07 0.06 0.27 0.2 0.2 0.45 0.57 0.32
0.76 1.0 0.97 0.59 0.74 0.35 0.21 0.24 0.21 0.16 0.14 0.19 0.16 0.21 0.15 0.31 0.23 0.53 0.41 0.31
0.51 1.0 0.47 0.55 0.38 0.11 0.27 0.09 0.03 0.03 0.02 0.05 0.07 0.04 0.02 0.02 0.04 0.25 0.39 0.14
1.0 0.38 0.72 0.48 0.28 0.1 0.16 0.14 0.06 0.05 0.09 0.07 0.04 0.04 0.1 0.06 0.04 0.21 0.35 0.11
0.85 1.0 0.87 0.56 0.81 0.26 0.39 0.17 0.08 0.09 0.05 0.12 0.1 0.1 0.07 0.13 0.12 0.62 0.66 0.4
0.88 1.0 0.77 0.67 0.75 0.12 0.24 0.1 0.02 0.02 0.06 0.05 0.01 0.0 0.08 0.07 0.07 0.41 0.35 0.22
0.82 1.0 0.82 0.62 0.76 0.34 0.38 0.33 0.2 0.18 0.29 0.23 0.19 0.15 0.33 0.17 0.2 0.46 0.42 0.32
1.0 0.5 0.91 0.81 0.56 0.37 0.33 0.24 0.14 0.14 0.12 0.08 0.1 0.09 0.14 0.12 0.09 0.61 0.62 0.36
0.82 0.83 1.0 0.67 0.72 0.37 0.27 0.35 0.26 0.16 0.24 0.38 0.08 0.09 0.27 0.33 0.25 0.81 0.69 0.53
0.5 0.99 0.6 0.94 1.0 0.07 0.07 0.14 0.04 0.05 0.06 0.04 0.01 0.02 0.07 0.15 0.14 0.93 0.71 0.17
0.73 1.0 0.85 0.42 0.52 0.17 0.24 0.13 0.14 0.1 0.21 0.12 0.06 0.07 0.19 0.18 0.08 0.18 0.17 0.24
0.68 0.8 1.0 0.42 0.72 0.17 0.33 0.1 0.05 0.04 0.07 0.07 0.07 0.06 0.06 0.03 0.03 0.25 0.21 0.14
0.78 0.9 0.97 0.73 1.0 0.29 0.28 0.34 0.29 0.26 0.25 0.2 0.23 0.28 0.24 0.24 0.23 0.68 0.54 0.27
0.84 0.86 1.0 0.74 0.57 0.08 0.15 0.22 0.12 0.11 0.15 0.14 0.11 0.09 0.15 0.09 0.07 0.33 0.4 0.33
1.0 0.66 0.95 0.44 0.63 0.33 0.44 0.22 0.12 0.11 0.14 0.13 0.05 0.05 0.1 0.15 0.3 0.44 0.44 0.33
0.81 0.73 1.0 0.67 0.61 0.15 0.33 0.25 0.22 0.15 0.27 0.28 0.04 0.07 0.16 0.16 0.21 0.43 0.29 0.37
0.83 0.53 1.0 0.7 0.57 0.15 0.3 0.18 0.14 0.1 0.13 0.11 0.06 0.05 0.12 0.11 0.12 0.24 0.38 0.41
0.82 0.92 1.0 0.44 0.78 0.18 0.34 0.26 0.15 0.14 0.13 0.28 0.18 0.15 0.14 0.27 0.21 0.53 0.24 0.25
0.72 1.0 0.85 0.7 0.8 0.21 0.38 0.17 0.09 0.08 0.05 0.1 0.11 0.13 0.09 0.16 0.11 0.63 0.64 0.42
0.88 0.59 1.0 0.83 0.67 0.08 0.2 0.14 0.08 0.13 0.11 0.09 0.06 0.05 0.08 0.05 0.06 0.38 0.46 0.36
1.0 0.51 0.86 0.41 0.65 0.29 0.51 0.11 0.04 0.04 0.04 0.08 0.07 0.08 0.06 0.06 0.12 0.38 0.73 0.42
0.21 1.0 0.69 0.55 0.84 0.11 0.14 0.11 0.04 0.09 0.1 0.1 0.1 0.07 0.11 0.06 0.02 0.35 0.5 0.56
0.79 1.0 0.85 0.53 0.36 0.07 0.19 0.14 0.16 0.11 0.04 0.07 0.09 0.1 0.06 0.29 0.1 0.3 0.37 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)