1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.11 0.05 0.46 0.1 0.0 0.08 0.11 0.19 0.24 0.05 0.0 0.05 0.21 0.04 0.29 0.0 0.04 0.21 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.03 0.13 0.0 0.55 0.12 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.09 0.03 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
220.58 72.65 102.84 258.46 590.58 547.64 371.3 792.06 305.89 394.11 1532.0 280.58 725.65 689.42 1400.28 530.99 595.49 653.8 1094.22 2143.62
302.43 111.73 153.84 220.76 989.68 925.67 1061.88 1414.97 373.64 470.32 3932.13 272.55 1689.62 1360.92 3693.18 564.93 703.57 1259.29 6333.61 3846.8
0.14 0.16 0.34 24.86 1.17 0.11 2.95 1.8 0.72 0.25 1.12 0.41 0.35 0.32 0.75 1.97 0.54 0.46 120.44 1.12
0.28 0.35 0.07 0.44 0.19 0.05 0.13 0.21 0.56 1.05 0.49 0.04 0.36 0.34 0.73 0.75 0.66 0.1 1.67 0.37
154.57 78.93 146.48 323.37 394.62 331.1 603.12 1061.89 173.89 207.33 3502.2 211.6 876.75 771.4 2925.83 1697.1 296.53 471.39 3542.03 1408.44
2.68 3.22 1.98 6.29 15.97 14.68 21.12 21.85 4.45 5.06 115.45 3.98 38.9 32.83 100.36 48.36 12.79 18.6 178.17 72.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 3.39 4.18 5.09 3.24 4.36 3.5 6.06 2.0 5.9 17.45 0.01 9.01 0.99
0.03 0.0 0.03 0.28 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.35 0.04
1.56 0.14 0.07 2.21 1.35 1.37 3.75 3.58 5.48 9.32 9.56 4.13 2.19 2.52 8.08 0.34 5.33 0.98 7.54 5.99
0.04 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.01 0.0 0.01 0.12 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0
6.12 4.04 5.12 291.3 5.68 0.0 13.27 262.77 120.16 180.42 69.09 3.18 8.45 18.38 47.42 15.78 34.41 6.95 10047.11 84.94
220.58 72.65 102.84 258.46 590.58 547.64 371.3 792.06 305.89 394.11 1532.0 280.58 725.65 689.42 1400.28 530.99 595.49 653.8 1094.22 2143.62
133.41 38.66 48.13 129.07 342.64 302.6 378.8 502.55 117.6 148.59 1753.72 93.01 551.12 470.93 1780.45 300.28 291.32 425.43 1356.93 1327.27
0.22 0.06 0.0 0.23 0.12 0.0 0.1 0.17 0.1 0.07 0.12 0.02 0.27 0.21 0.09 0.23 0.03 0.18 1.62 0.09
78.53 137.22 123.62 54.36 273.67 227.86 30.96 361.89 49.57 65.24 12.91 89.32 44.71 43.59 8.84 674.11 280.94 224.55 937.82 1016.04
133.41 38.66 48.13 129.07 342.64 302.6 378.8 502.55 117.6 148.59 1753.72 93.01 551.12 470.93 1780.45 300.28 291.32 425.43 1356.93 1327.27
0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.04 0.13 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.04 0.48 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.08 3.42 3.86 56.76 17.59 10.18 7.97 23.77 7.14 8.27 22.66 4.03 7.96 6.62 24.0 10.52 17.29 13.88 442.89 32.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
19.86 1.43 2.7 53.27 7.11 3.05 4.28 11.42 1.6 1.2 17.33 1.17 2.62 1.98 14.72 7.02 6.6 3.75 264.86 6.89
18.92 10.61 28.03 10.43 4.39 2.32 0.23 5.12 3.18 2.55 1.71 2.31 6.38 5.56 2.6 0.52 4.87 3.72 18.42 1.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
55.64 19.98 28.17 88.73 111.4 95.55 141.97 227.46 37.64 51.56 1297.19 38.94 317.2 297.88 1190.22 187.94 105.44 136.51 1342.07 411.32
20.34 1.21 1.44 7.93 18.81 17.57 54.62 63.34 72.62 115.67 220.49 35.41 46.1 40.9 199.04 9.17 70.64 15.68 74.43 98.12
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.06 0.0 0.16 0.0 0.03 0.03 0.15 0.19 0.35 0.21 0.03 0.29 0.19 0.17 0.28 0.19 0.07 1.56 0.16
1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.4 0.0
0.08 0.18 0.09 0.0 0.18 0.0 0.05 0.32 0.68 0.6 0.16 0.0 0.36 0.45 0.59 0.1 0.09 0.15 0.63 0.46
9.05 7.51 12.82 87.43 29.1 8.96 6.39 41.17 8.9 13.84 54.87 5.56 12.06 10.0 51.53 40.29 22.6 18.09 731.44 42.36
686.61 114.25 121.98 953.74 1383.86 1205.36 1430.84 3768.27 430.27 560.79 17500.33 502.6 4756.37 4112.75 16236.27 1053.67 1076.72 1684.14 8158.8 5499.94
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02
1611.34 242.62 442.42 291.3 4761.5 4543.95 2860.21 7717.09 1199.32 1514.18 35168.53 1103.78 16241.07 12648.77 36056.4 2767.07 3755.44 5978.18 7275.75 19118.36
133.41 38.66 48.13 129.07 342.64 302.6 378.8 502.55 117.6 148.59 1753.72 93.01 551.12 470.93 1780.45 300.28 291.32 425.43 1356.93 1327.27
0.03 0.48 0.04 4.45 0.0 2.46 0.48 0.88 1.23 0.68 0.0 0.05 0.34 0.06 0.0 0.76 1.16 0.0 4.34 1.97
0.09 0.13 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 0.03 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.09 0.0 0.16 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.33 0.0 0.09 0.49 0.1 0.0 0.11 0.14 0.19 0.23 0.0 0.0 0.24 0.35 0.3 0.21 0.15 0.0 3.15 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.76 0.17 0.19 0.17 0.49 2.49 0.14 0.81 0.62 0.47 0.35 0.46 0.46 0.83 0.68 0.48 0.62 2.94 1.86 1.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.46 0.16 0.27 0.22 2.37 1.4 0.19 1.75 0.19 0.24 2.03 0.43 0.8 0.89 2.02 3.32 1.81 3.35 11.5 4.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 3.24 1.44 0.0 0.0 0.0 3.3 0.8 1.24 0.82 0.0 0.0 11.3 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0 4.44 1.21
0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.09 0.06 0.03 0.03 0.04 0.01 0.06 0.02 0.06 0.05 0.04 0.01 0.1 0.06
0.0 0.05 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.17 0.16 0.2 0.18 0.09 0.08 0.16 0.25 0.07 0.35 0.09 1.57 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.08 0.34 0.0 0.49 0.16 0.0 0.0 0.06 0.05 0.13 0.07 0.0 0.15 0.03 0.13 0.19 0.21 0.0 0.19 0.06
73.53 119.95 183.5 51.6 111.62 107.6 10.24 444.29 48.43 57.15 1440.38 77.67 636.83 576.57 1451.35 477.11 80.47 146.34 405.29 402.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
21.4 10.36 14.6 77.07 43.25 20.6 20.71 40.74 8.82 9.52 35.36 5.84 19.59 16.86 32.12 20.65 36.64 37.84 692.63 58.32
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
78.53 137.22 123.62 54.36 273.67 227.86 30.96 361.89 49.57 65.24 12.91 89.32 44.71 43.59 8.84 674.11 280.94 224.55 937.82 1016.04
429.28 87.74 105.28 252.53 908.51 841.16 979.97 2214.18 293.59 367.14 9782.62 332.87 2873.22 2528.49 8381.63 576.03 746.67 1115.14 4691.83 3166.34
0.32 0.05 0.09 0.35 0.3 0.29 1.13 1.05 1.48 2.11 2.43 0.72 0.47 0.52 1.83 0.09 1.07 0.38 3.13 1.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.63 0.63 0.2 6.27 29.18 8.65 0.71 21.34 33.45 45.54 50.21 47.93 31.12 47.48 51.91 2.37 3.61 38.35 64.97 25.62
388.64 224.46 313.37 485.84 586.85 384.06 314.85 806.65 144.24 168.04 1843.11 120.7 607.53 529.74 1787.77 673.55 562.16 618.52 2983.66 1122.06
27.17 10.96 13.93 55.9 64.28 56.75 86.69 112.09 17.86 21.55 231.22 12.01 147.16 122.43 283.84 52.21 41.55 80.81 384.21 239.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
90.61 29.92 43.71 96.25 209.14 190.66 256.96 349.6 65.28 86.12 1137.43 67.81 422.98 394.5 1097.75 245.71 182.57 264.39 1497.85 786.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.71 0.34 0.72 27.08 4.68 1.41 1.07 10.26 7.6 7.89 52.61 0.66 3.6 2.44 42.28 2.62 2.05 2.3 344.66 6.7
0.4 0.46 0.83 5.1 0.61 0.23 0.16 2.25 0.42 0.29 1.33 0.27 0.11 0.06 0.86 1.17 0.89 0.22 201.17 1.83
0.11 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.24 0.21 0.16 0.32 0.07 0.03 0.39 0.93 0.41 0.16 0.35 0.22
0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
13.74 1.62 1.66 23.04 6.58 3.37 3.06 5.72 2.9 2.04 9.47 3.3 2.26 1.89 8.12 9.71 8.22 3.49 212.2 7.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)