Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00245	0.0	0.23	0.1	1.0	0.21	0.0	0.17	0.23	0.42	0.52	0.1	0.0	0.12	0.45	0.1	0.62	0.0	0.09	0.46	0.09
Gb_00920	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_01432	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01589	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_01655	0.05	0.23	0.0	1.0	0.22	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.09
Gb_02674	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.06	0.03	0.07	0.0	0.1	0.0	0.12	0.0	0.09	0.29	0.11	0.0	0.04	0.0
Gb_03398	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03819	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0
Gb_03961	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04274	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04509	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_04679	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_05045	0.1	0.03	0.05	0.12	0.28	0.26	0.17	0.37	0.14	0.18	0.71	0.13	0.34	0.32	0.65	0.25	0.28	0.31	0.51	1.0
Gb_05046	0.05	0.02	0.02	0.03	0.16	0.15	0.17	0.22	0.06	0.07	0.62	0.04	0.27	0.21	0.58	0.09	0.11	0.2	1.0	0.61
Gb_05555	0.0	0.0	0.0	0.21	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	1.0	0.01
Gb_05619	0.17	0.21	0.04	0.26	0.11	0.03	0.08	0.13	0.34	0.63	0.29	0.03	0.21	0.2	0.44	0.45	0.39	0.06	1.0	0.22
Gb_05927	0.04	0.02	0.04	0.09	0.11	0.09	0.17	0.3	0.05	0.06	0.99	0.06	0.25	0.22	0.83	0.48	0.08	0.13	1.0	0.4
Gb_06622	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.08	0.12	0.12	0.02	0.03	0.65	0.02	0.22	0.18	0.56	0.27	0.07	0.1	1.0	0.41
Gb_06678	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.24	0.29	0.19	0.25	0.2	0.35	0.11	0.34	1.0	0.0	0.52	0.06
Gb_06761	0.09	0.0	0.08	0.81	0.0	0.0	0.1	0.1	0.05	0.0	0.04	0.01	0.0	0.01	0.04	0.15	0.08	0.07	1.0	0.12
Gb_07151	0.16	0.01	0.01	0.23	0.14	0.14	0.39	0.37	0.57	0.97	1.0	0.43	0.23	0.26	0.85	0.04	0.56	0.1	0.79	0.63
Gb_07646	0.29	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.11	0.93	0.62	0.0	0.0	0.63	0.0
Gb_07841	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01
Gb_07842	0.1	0.03	0.05	0.12	0.28	0.26	0.17	0.37	0.14	0.18	0.71	0.13	0.34	0.32	0.65	0.25	0.28	0.31	0.51	1.0
Gb_07843	0.07	0.02	0.03	0.07	0.19	0.17	0.21	0.28	0.07	0.08	0.98	0.05	0.31	0.26	1.0	0.17	0.16	0.24	0.76	0.75
Gb_07994	0.14	0.04	0.0	0.14	0.07	0.0	0.06	0.1	0.06	0.05	0.08	0.01	0.17	0.13	0.06	0.14	0.02	0.11	1.0	0.06
Gb_09213	0.08	0.14	0.12	0.05	0.27	0.22	0.03	0.36	0.05	0.06	0.01	0.09	0.04	0.04	0.01	0.66	0.28	0.22	0.92	1.0
Gb_09281	0.07	0.02	0.03	0.07	0.19	0.17	0.21	0.28	0.07	0.08	0.98	0.05	0.31	0.26	1.0	0.17	0.16	0.24	0.76	0.75
Gb_09395	0.12	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.18	0.12	0.09	0.26	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.1	0.09	1.0	0.18
Gb_10142	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11283	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_11298	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.55	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_11761	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11900	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_12959	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.27	1.0	0.23
Gb_13011	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13147	0.02	0.01	0.01	0.13	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	1.0	0.07
Gb_14491	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_15379	0.07	0.01	0.01	0.2	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.0	0.07	0.0	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01	1.0	0.03
Gb_15453	0.68	0.38	1.0	0.37	0.16	0.08	0.01	0.18	0.11	0.09	0.06	0.08	0.23	0.2	0.09	0.02	0.17	0.13	0.66	0.04
Gb_15908	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.2	0.24	0.0	0.12	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_16133	0.04	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.11	0.17	0.03	0.04	0.97	0.03	0.24	0.22	0.89	0.14	0.08	0.1	1.0	0.31
Gb_16405	0.09	0.01	0.01	0.04	0.09	0.08	0.25	0.29	0.33	0.52	1.0	0.16	0.21	0.19	0.9	0.04	0.32	0.07	0.34	0.44
Gb_16495	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16817	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_17787	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18190	0.1	0.04	0.0	0.1	0.0	0.02	0.02	0.1	0.12	0.23	0.13	0.02	0.18	0.12	0.11	0.18	0.12	0.04	1.0	0.1
Gb_18651	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_18697	0.12	0.27	0.13	0.0	0.26	0.0	0.07	0.47	1.0	0.89	0.23	0.0	0.54	0.66	0.87	0.15	0.13	0.23	0.92	0.69
Gb_19262	0.01	0.01	0.02	0.12	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.07	0.06	0.03	0.02	1.0	0.06
Gb_19264	0.04	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.08	0.22	0.02	0.03	1.0	0.03	0.27	0.24	0.93	0.06	0.06	0.1	0.47	0.31
Gb_19426	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_20141	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.04	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.43	1.0	0.46
Gb_20490	0.04	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.08	0.21	0.03	0.04	0.98	0.03	0.45	0.35	1.0	0.08	0.1	0.17	0.2	0.53
Gb_20491	0.07	0.02	0.03	0.07	0.19	0.17	0.21	0.28	0.07	0.08	0.98	0.05	0.31	0.26	1.0	0.17	0.16	0.24	0.76	0.75
Gb_20762	0.01	0.11	0.01	1.0	0.0	0.55	0.11	0.2	0.28	0.15	0.0	0.01	0.08	0.01	0.0	0.17	0.26	0.0	0.98	0.44
Gb_21112	0.54	0.79	0.0	0.0	0.0	0.45	0.66	0.21	0.22	0.6	0.0	0.0	0.0	0.52	0.3	0.57	0.0	1.0	0.95	0.0
Gb_21342	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_21432	0.1	0.0	0.03	0.16	0.03	0.0	0.03	0.04	0.06	0.07	0.0	0.0	0.07	0.11	0.1	0.07	0.05	0.0	1.0	0.08
Gb_22025	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_22178	0.26	0.06	0.07	0.06	0.17	0.85	0.05	0.27	0.21	0.16	0.12	0.16	0.16	0.28	0.23	0.16	0.21	1.0	0.63	0.67
Gb_22456	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_22596	0.04	0.01	0.02	0.02	0.21	0.12	0.02	0.15	0.02	0.02	0.18	0.04	0.07	0.08	0.18	0.29	0.16	0.29	1.0	0.36
Gb_23603	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_24468	0.0	0.69	0.0	1.0	0.0	0.0	0.54	0.08	0.2	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0
Gb_24667	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_26003	0.0	0.29	0.13	0.0	0.0	0.0	0.29	0.07	0.11	0.07	0.0	0.0	1.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.11
Gb_26218	0.15	0.0	0.0	0.46	0.0	0.18	0.87	0.6	0.3	0.25	0.4	0.11	0.56	0.15	0.63	0.46	0.36	0.13	1.0	0.62
Gb_26948	0.0	0.31	0.3	1.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.1	0.08	0.15	0.0	0.0	0.06	0.19	0.0	0.18	0.0	0.81	0.0
Gb_27125	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.42
Gb_27268	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.11	0.1	0.13	0.12	0.06	0.05	0.1	0.16	0.05	0.22	0.06	1.0	0.37
Gb_27384	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_27534	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29270	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_29952	0.16	0.69	0.0	1.0	0.32	0.0	0.0	0.13	0.1	0.26	0.15	0.0	0.3	0.06	0.26	0.37	0.43	0.0	0.38	0.13
Gb_30289	0.05	0.08	0.13	0.04	0.08	0.07	0.01	0.31	0.03	0.04	0.99	0.05	0.44	0.4	1.0	0.33	0.06	0.1	0.28	0.28
Gb_30460	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_30565	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_30648	0.03	0.01	0.02	0.11	0.06	0.03	0.03	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	1.0	0.08
Gb_30944	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.97	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0
Gb_31576	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31593	0.08	0.14	0.12	0.05	0.27	0.22	0.03	0.36	0.05	0.06	0.01	0.09	0.04	0.04	0.01	0.66	0.28	0.22	0.92	1.0
Gb_31594	0.04	0.01	0.01	0.03	0.09	0.09	0.1	0.23	0.03	0.04	1.0	0.03	0.29	0.26	0.86	0.06	0.08	0.11	0.48	0.32
Gb_31717	0.1	0.02	0.03	0.11	0.1	0.09	0.36	0.34	0.47	0.67	0.77	0.23	0.15	0.17	0.58	0.03	0.34	0.12	1.0	0.54
Gb_31870	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_32065	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.03	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0
Gb_32425	0.01	0.01	0.0	0.1	0.45	0.13	0.01	0.33	0.51	0.7	0.77	0.74	0.48	0.73	0.8	0.04	0.06	0.59	1.0	0.39
Gb_32799	0.13	0.08	0.11	0.16	0.2	0.13	0.11	0.27	0.05	0.06	0.62	0.04	0.2	0.18	0.6	0.23	0.19	0.21	1.0	0.38
Gb_32801	0.07	0.03	0.04	0.15	0.17	0.15	0.23	0.29	0.05	0.06	0.6	0.03	0.38	0.32	0.74	0.14	0.11	0.21	1.0	0.62
Gb_33583	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33650	0.06	0.02	0.03	0.06	0.14	0.13	0.17	0.23	0.04	0.06	0.76	0.05	0.28	0.26	0.73	0.16	0.12	0.18	1.0	0.52
Gb_33887	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_34922	0.0	0.0	0.0	0.08	0.01	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.15	0.0	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	1.0	0.02
Gb_34974	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.01
Gb_36813	0.11	0.2	0.09	0.0	0.0	0.0	0.11	0.21	0.26	0.23	0.17	0.34	0.07	0.03	0.42	1.0	0.44	0.17	0.38	0.24
Gb_37235	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37474	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38405	0.06	0.01	0.01	0.11	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	1.0	0.03
Gb_38514	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38694	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38731	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40093	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_41019	0.27	0.0	0.0	0.98	0.0	0.3	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)