Heatmap: Cluster_196 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00449	0.45	1.0	0.81	0.73	0.53	0.34	0.89	0.61	0.88	0.79	0.76	0.57	0.73	0.77	0.77	0.81	0.69	0.55	0.69	0.43
Gb_00616	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	1.0	0.05	0.09	0.05	0.37	0.11	0.05	0.08	0.4	0.02	0.02	0.1	0.46	0.39
Gb_00695	0.75	0.67	1.0	0.0	0.69	0.3	0.09	0.17	0.03	0.0	0.03	0.06	0.04	0.07	0.05	0.1	0.03	0.91	0.78	1.0
Gb_00697	0.64	0.65	0.52	0.34	0.65	0.08	0.13	0.18	0.09	0.07	0.1	0.07	0.06	0.13	0.06	0.13	0.06	0.96	1.0	0.99
Gb_01053	0.43	1.0	0.43	0.3	0.58	0.27	0.83	0.34	0.38	0.33	0.31	0.17	0.4	0.28	0.4	0.42	0.32	0.63	0.61	0.42
Gb_01054	0.55	1.0	0.31	0.43	0.56	0.28	0.73	0.4	0.35	0.36	0.54	0.15	0.69	0.56	0.58	0.36	0.22	0.64	0.91	0.37
Gb_01740	0.21	0.12	0.09	0.34	0.31	0.12	0.26	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.64	0.56	1.0
Gb_02133	0.36	0.52	0.29	0.34	0.22	0.38	1.0	0.26	0.23	0.28	0.34	0.23	0.32	0.24	0.36	0.25	0.08	0.49	0.33	0.85
Gb_04743	0.25	0.52	0.31	0.29	0.37	0.34	1.0	0.42	0.48	0.45	0.45	0.34	0.27	0.23	0.47	0.46	0.26	0.39	0.79	0.31
Gb_04966	0.44	0.6	0.43	0.39	0.6	0.53	0.67	0.66	0.65	0.6	0.98	0.4	0.84	0.64	1.0	0.61	0.44	0.43	0.95	0.58
Gb_05724	0.19	0.31	0.24	0.4	0.33	0.32	0.64	0.5	0.42	0.54	0.77	0.43	0.6	0.57	0.84	0.28	0.43	0.23	1.0	0.63
Gb_06251	0.09	0.06	0.04	0.0	0.08	0.02	1.0	0.03	0.03	0.05	0.08	0.03	0.02	0.04	0.07	0.04	0.03	0.05	0.15	0.24
Gb_07293	0.12	0.29	0.15	0.19	0.31	0.11	1.0	0.31	0.46	0.43	0.54	0.29	0.34	0.4	0.63	0.43	0.2	0.29	0.84	0.44
Gb_07676	0.32	0.64	0.61	0.63	0.7	0.45	0.86	0.39	0.3	0.36	0.44	0.45	0.42	0.45	0.45	0.3	0.4	0.62	1.0	0.5
Gb_09258	0.11	0.44	0.17	0.12	0.2	0.13	1.0	0.16	0.32	0.35	0.22	0.2	0.25	0.24	0.23	0.15	0.13	0.2	0.24	0.44
Gb_09808	0.49	1.0	0.56	0.32	0.62	0.3	0.67	0.47	0.33	0.35	0.51	0.32	0.24	0.23	0.62	0.26	0.27	0.57	0.72	0.63
Gb_11078	0.03	0.08	0.02	0.0	0.06	0.41	1.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.31	0.04	0.15
Gb_11991	0.46	0.65	0.29	0.28	0.32	0.34	1.0	0.32	0.57	0.49	0.34	0.14	0.46	0.37	0.41	0.65	0.29	0.49	0.6	0.61
Gb_13150	0.15	0.29	0.09	0.19	0.26	0.04	1.0	0.13	0.02	0.04	0.06	0.06	0.07	0.07	0.05	0.04	0.05	0.24	0.46	0.16
Gb_14782	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.54	0.76	0.07	0.09	0.04	0.68	0.24	0.12	0.12	1.0	0.4	0.34	0.26	0.25	0.68
Gb_15685	0.28	0.94	0.41	0.35	0.14	0.47	1.0	0.29	0.42	0.43	0.26	0.41	0.33	0.34	0.25	0.39	0.26	0.56	0.32	0.77
Gb_15765	0.73	1.0	0.95	0.66	0.56	0.36	0.48	0.6	0.49	0.51	0.56	0.46	0.6	0.49	0.65	0.33	0.33	0.58	0.75	0.57
Gb_16430	0.28	0.88	0.24	0.08	0.2	0.22	1.0	0.13	0.2	0.24	0.2	0.13	0.13	0.15	0.15	0.2	0.12	0.31	0.09	0.39
Gb_16534	0.2	0.52	0.17	0.05	0.45	0.19	1.0	0.16	0.28	0.27	0.11	0.26	0.2	0.11	0.1	0.46	0.13	0.32	0.7	0.31
Gb_17236	0.52	0.49	0.48	0.5	0.83	0.74	0.86	0.62	0.41	0.41	0.65	0.57	0.31	0.3	0.62	0.32	0.43	0.82	1.0	0.61
Gb_17517	0.35	0.56	0.4	0.42	0.59	0.88	0.54	0.72	0.57	0.54	0.58	0.68	0.58	0.5	0.62	0.58	0.7	0.66	1.0	0.47
Gb_18251	0.53	0.68	0.57	0.52	0.57	0.62	1.0	0.66	0.74	0.77	0.9	0.56	0.75	0.73	0.87	0.48	0.57	0.57	0.93	0.41
Gb_19404	0.22	0.57	0.35	0.34	0.35	0.41	0.6	0.54	0.56	0.59	0.66	0.41	0.78	0.69	0.7	0.4	0.31	0.37	1.0	0.43
Gb_20424	0.93	0.88	1.0	1.0	0.59	0.63	0.47	0.57	0.42	0.45	0.91	0.48	0.84	0.79	0.9	0.41	0.46	0.61	0.64	0.51
Gb_20592	0.08	0.27	0.0	0.0	0.09	0.14	0.61	0.17	0.31	0.21	0.46	0.15	0.05	0.16	0.18	0.26	0.21	0.04	1.0	0.16
Gb_21664	0.26	0.5	0.3	0.29	0.47	0.58	0.97	0.53	0.72	0.77	0.87	0.5	0.98	0.87	1.0	0.6	0.43	0.51	0.86	0.6
Gb_22069	0.31	0.83	0.41	0.36	0.48	0.35	1.0	0.4	0.39	0.44	0.39	0.31	0.76	0.65	0.45	0.27	0.25	0.49	0.43	0.64
Gb_22576	0.35	1.0	0.41	0.36	0.47	0.31	0.62	0.4	0.4	0.36	0.73	0.29	0.61	0.44	0.72	0.51	0.25	0.51	0.55	0.32
Gb_22953	0.46	0.88	0.67	0.29	0.53	0.33	1.0	0.32	0.33	0.32	0.28	0.24	0.22	0.19	0.29	0.35	0.3	0.41	0.97	0.4
Gb_27002	0.07	0.18	0.08	0.05	0.02	0.18	1.0	0.1	0.2	0.21	0.16	0.09	0.03	0.05	0.13	0.07	0.02	0.01	0.28	0.11
Gb_27187	0.45	0.64	0.5	0.37	0.4	0.31	1.0	0.61	0.69	0.73	0.6	0.43	0.72	0.66	0.65	0.54	0.57	0.33	0.95	0.35
Gb_27892	0.18	0.34	0.12	0.0	0.08	0.27	1.0	0.06	0.07	0.07	0.04	0.09	0.0	0.06	0.1	0.06	0.0	0.11	0.24	0.16
Gb_28023	0.33	1.0	0.37	0.43	0.54	0.31	0.66	0.32	0.32	0.27	0.39	0.3	0.6	0.56	0.59	0.31	0.2	0.69	0.6	0.55
Gb_28071	0.38	0.49	0.58	0.33	0.46	0.37	1.0	0.33	0.36	0.38	0.38	0.34	0.28	0.23	0.41	0.27	0.35	0.45	0.49	0.37
Gb_29575	0.19	0.51	0.35	0.16	0.37	0.35	1.0	0.24	0.51	0.51	0.19	0.25	0.31	0.3	0.21	0.48	0.23	0.51	0.68	0.59
Gb_29671	0.19	0.3	0.14	0.23	0.35	0.22	1.0	0.33	0.39	0.42	0.45	0.23	0.47	0.5	0.45	0.35	0.17	0.35	0.39	0.47
Gb_29823	0.47	0.53	0.45	0.77	0.57	0.14	1.0	0.44	0.37	0.31	0.48	0.22	0.41	0.51	0.57	0.56	0.48	0.55	0.72	0.45
Gb_29824	0.52	0.82	0.66	0.59	0.65	0.17	1.0	0.44	0.39	0.35	0.46	0.25	0.13	0.16	0.52	0.57	0.5	0.59	0.75	0.48
Gb_30503	0.58	0.97	0.84	0.43	0.68	0.17	1.0	0.37	0.52	0.52	0.48	0.28	0.55	0.44	0.51	0.48	0.39	0.52	0.84	0.71
Gb_31194	0.04	0.13	0.12	0.02	0.1	0.17	1.0	0.05	0.04	0.02	0.11	0.04	0.01	0.02	0.16	0.03	0.03	0.19	0.27	0.41
Gb_32883	0.17	0.31	0.32	0.13	0.32	0.23	1.0	0.23	0.13	0.16	0.35	0.15	0.23	0.15	0.39	0.11	0.14	0.22	0.25	0.18
Gb_33094	0.41	0.66	0.58	0.58	0.63	0.43	0.56	0.39	0.44	0.51	0.44	0.35	0.57	0.49	0.48	0.37	0.3	0.53	1.0	0.54
Gb_34437	0.19	0.1	0.09	0.22	0.34	0.17	0.98	0.71	0.68	0.82	0.75	0.68	0.82	0.64	0.9	0.31	0.49	0.52	1.0	0.46
Gb_35458	0.24	1.0	0.28	0.12	0.47	0.14	0.77	0.11	0.06	0.08	0.12	0.11	0.08	0.08	0.1	0.04	0.14	0.44	0.87	0.49
Gb_35600	0.14	1.0	0.43	0.06	0.16	0.1	0.71	0.07	0.1	0.05	0.07	0.12	0.08	0.1	0.08	0.12	0.12	0.08	0.29	0.27
Gb_36830	0.33	0.51	0.3	0.37	0.49	0.98	0.84	0.71	0.81	0.69	0.62	0.84	0.73	0.66	0.59	0.97	1.0	0.45	1.0	0.51
Gb_38367	0.21	0.27	0.26	0.37	0.47	0.16	0.94	0.28	0.3	0.3	0.19	0.19	0.18	0.19	0.22	0.37	0.33	0.65	1.0	0.52
Gb_39711	0.54	0.77	1.0	0.5	0.61	0.27	0.85	0.43	0.3	0.39	0.53	0.53	0.27	0.33	0.41	0.2	0.26	0.77	0.88	0.66
Gb_40343	0.15	0.49	0.23	0.18	0.24	0.16	0.55	0.14	0.08	0.07	0.04	0.1	0.03	0.03	0.04	0.14	0.06	0.5	0.74	1.0
Gb_40892	0.24	1.0	0.25	0.32	0.32	0.23	0.68	0.26	0.15	0.21	0.32	0.19	0.27	0.22	0.41	0.23	0.13	0.59	0.39	0.56
Gb_41686	0.75	1.0	0.68	0.59	0.67	0.39	0.28	0.41	0.44	0.44	0.49	0.23	0.51	0.36	0.6	0.28	0.16	0.48	0.62	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)