Heatmap: Cluster_327 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00466	0.94	0.57	0.71	0.83	1.0	0.5	0.35	0.79	0.71	0.59	0.81	0.58	0.63	0.65	0.76	0.97	0.93	0.71	0.65	0.5
Gb_01670	0.5	0.15	0.32	0.32	0.29	0.21	0.58	0.51	0.6	0.77	1.0	0.37	0.4	0.31	0.92	0.68	0.69	0.24	0.09	0.24
Gb_04150	0.76	0.43	0.55	0.74	0.58	0.25	0.24	0.61	0.63	0.45	0.88	0.35	0.77	0.86	0.75	1.0	0.61	0.41	0.33	0.41
Gb_04151	1.0	0.69	0.69	0.69	0.71	0.3	0.3	0.81	0.67	0.49	0.93	0.51	0.46	0.48	0.96	0.97	0.88	0.55	0.64	0.49
Gb_04582	0.77	0.43	0.72	0.87	0.63	0.42	0.25	0.79	0.64	0.52	0.86	0.46	0.54	0.61	0.74	1.0	0.93	0.57	0.75	0.38
Gb_04620	1.0	0.96	0.75	0.88	0.82	0.31	0.59	0.67	0.68	0.56	0.72	0.46	0.7	0.68	0.68	0.81	0.58	0.5	0.56	0.31
Gb_06928	0.65	0.37	0.58	0.51	0.45	0.19	0.25	0.71	0.7	0.78	1.0	0.54	0.52	0.53	0.92	0.77	0.73	0.27	0.04	0.1
Gb_07020	1.0	0.34	0.49	0.93	0.78	0.42	0.69	0.91	0.87	0.74	0.86	0.61	0.73	0.66	0.9	0.89	1.0	0.99	0.77	0.61
Gb_07021	0.74	0.32	0.46	0.78	0.52	0.36	0.5	0.88	0.71	0.65	0.87	0.55	0.6	0.43	0.83	1.0	0.92	0.68	0.71	0.47
Gb_07022	0.72	0.37	0.46	0.7	0.57	0.44	0.49	0.82	0.79	0.71	0.74	0.52	0.85	0.67	0.73	0.9	1.0	0.77	0.72	0.54
Gb_07578	0.87	0.67	0.56	0.73	0.76	0.49	0.73	0.61	0.71	0.53	0.57	0.38	0.72	0.93	0.56	0.53	0.21	0.54	1.0	0.47
Gb_07579	0.81	0.44	0.53	0.8	0.66	0.49	0.74	0.56	0.88	0.76	0.67	0.29	0.8	1.0	0.53	0.83	0.39	0.42	0.82	0.44
Gb_07734	0.56	0.5	0.25	0.76	0.63	0.36	0.2	0.92	0.6	0.52	1.0	0.52	0.65	0.61	0.82	0.35	0.47	0.59	0.89	0.42
Gb_07861	0.68	0.43	0.39	0.64	0.42	0.06	0.26	0.45	0.62	0.53	1.0	0.32	0.25	0.21	0.91	0.82	0.51	0.34	0.38	0.2
Gb_08023	0.9	0.63	0.67	0.84	0.75	0.21	0.26	0.72	0.82	0.61	1.0	0.4	0.54	0.55	0.92	0.66	0.51	0.8	0.8	0.45
Gb_08429	1.0	0.49	0.81	0.67	0.82	0.46	0.42	0.64	0.71	0.62	0.86	0.51	0.43	0.45	0.82	0.7	0.73	0.57	0.47	0.72
Gb_09520	0.72	0.24	0.45	0.7	0.64	0.18	0.34	0.49	0.55	0.46	1.0	0.47	0.58	0.68	0.79	0.55	0.59	0.3	0.22	0.47
Gb_09958	0.8	0.34	0.52	0.62	0.26	0.23	0.18	0.4	0.46	0.57	1.0	0.22	0.5	0.41	0.94	0.47	0.39	0.38	0.17	0.23
Gb_10927	0.58	0.37	0.5	0.78	0.34	0.19	0.31	0.57	0.51	0.37	1.0	0.37	0.45	0.42	0.89	0.81	0.49	0.28	0.39	0.13
Gb_11124	0.41	0.13	0.32	0.4	0.25	0.08	0.08	0.74	0.37	0.39	1.0	0.36	0.35	0.32	0.96	0.37	0.46	0.34	0.02	0.05
Gb_12501	1.0	0.37	0.69	0.81	0.56	0.39	0.24	0.61	0.54	0.56	0.85	0.34	0.56	0.51	0.81	0.42	0.45	0.5	0.42	0.32
Gb_13648	0.41	0.12	0.29	0.42	0.29	0.13	0.22	0.54	0.54	0.42	0.93	0.22	0.5	0.38	1.0	0.6	0.54	0.41	0.27	0.09
Gb_14091	1.0	0.67	0.64	0.54	0.53	0.2	0.21	0.63	0.62	0.63	0.64	0.31	0.78	0.65	0.58	0.58	0.44	0.36	0.35	0.11
Gb_14300	0.74	0.49	0.58	0.79	0.63	0.21	0.78	0.69	0.83	0.62	0.82	0.34	0.39	0.44	0.81	0.92	1.0	0.47	0.87	0.44
Gb_15616	0.96	0.4	0.53	0.74	0.59	0.13	0.48	0.66	0.86	0.65	1.0	0.35	0.36	0.36	0.95	1.0	0.71	0.29	0.49	0.23
Gb_15639	0.74	0.53	0.52	0.59	0.65	0.14	0.28	0.54	0.62	0.61	1.0	0.46	0.43	0.41	0.95	0.75	0.7	0.72	0.58	0.4
Gb_15749	1.0	0.65	0.59	0.84	0.7	0.21	0.55	0.59	0.71	0.57	0.93	0.32	0.48	0.49	0.87	0.9	0.51	0.47	0.62	0.32
Gb_16506	1.0	0.15	0.37	0.58	0.22	0.13	0.17	0.36	0.31	0.29	0.57	0.18	0.28	0.18	0.46	0.52	0.41	0.14	0.18	0.13
Gb_16950	0.68	0.53	0.47	1.0	0.67	0.45	0.47	0.54	0.43	0.4	0.61	0.32	0.63	0.55	0.57	0.48	0.41	0.48	0.49	0.35
Gb_18634	0.86	0.68	0.92	0.8	0.63	0.52	0.68	0.65	0.5	0.46	0.66	0.54	0.28	0.32	0.59	1.0	0.73	0.44	0.8	0.32
Gb_20040	0.97	0.54	0.57	0.99	0.71	0.53	0.14	0.95	0.66	0.49	0.51	0.51	0.46	0.48	0.43	1.0	0.95	0.74	0.45	0.26
Gb_20152	0.81	0.34	0.53	0.74	0.46	0.37	0.16	0.54	0.53	0.52	1.0	0.3	0.59	0.47	0.89	0.83	0.72	0.33	0.23	0.35
Gb_20275	0.63	0.7	0.54	1.0	0.69	0.27	0.72	0.62	0.38	0.4	0.9	0.42	0.52	0.45	0.83	0.42	0.53	0.56	0.42	0.43
Gb_20809	0.75	0.56	0.72	1.0	0.45	0.26	0.14	0.53	0.57	0.33	0.62	0.25	0.26	0.22	0.69	0.86	0.46	0.38	0.13	0.13
Gb_21443	0.85	0.31	0.43	0.54	0.43	0.14	0.32	0.57	0.58	0.49	0.57	0.32	0.42	0.43	0.68	1.0	0.71	0.29	0.4	0.07
Gb_21512	0.59	0.29	0.24	0.69	0.55	0.18	0.15	0.65	0.56	0.56	1.0	0.34	0.3	0.25	0.93	0.67	0.63	0.62	0.63	0.35
Gb_22822	0.46	0.37	0.38	0.92	0.65	0.45	0.24	0.63	0.41	0.36	0.49	0.49	0.25	0.25	0.59	0.69	0.64	1.0	0.49	0.24
Gb_23529	0.47	0.43	0.45	0.49	0.59	0.27	0.28	0.64	0.56	0.5	0.92	0.41	0.54	0.47	1.0	0.63	0.57	0.44	0.5	0.41
Gb_23633	0.61	0.33	0.49	0.55	0.4	0.14	0.2	0.73	0.5	0.45	1.0	0.55	0.79	0.66	0.99	0.47	0.53	0.3	0.41	0.24
Gb_23802	0.99	0.51	0.66	0.79	0.79	0.29	0.35	0.62	0.59	0.5	0.72	0.2	1.0	0.85	0.65	0.43	0.33	0.49	0.67	0.41
Gb_23825	0.83	0.5	0.67	1.0	0.74	0.3	0.38	0.61	0.56	0.5	0.68	0.42	0.42	0.37	0.68	0.42	0.48	0.63	0.79	0.51
Gb_24241	1.0	0.44	0.53	0.77	0.79	0.11	0.26	0.42	0.5	0.43	0.28	0.25	0.36	0.3	0.33	0.42	0.25	0.47	0.68	0.25
Gb_24309	0.51	0.58	0.45	0.61	0.7	0.31	0.34	0.68	0.83	0.75	0.93	0.39	0.59	0.53	1.0	0.68	0.73	0.51	0.44	0.68
Gb_24362	0.56	0.3	0.37	0.53	0.42	0.71	0.62	0.66	0.5	0.58	0.9	0.61	0.34	0.27	1.0	0.32	0.49	0.56	0.86	0.37
Gb_24574	0.86	0.88	0.85	1.0	0.59	0.2	0.4	0.49	0.58	0.48	0.81	0.3	0.61	0.54	0.8	0.68	0.48	0.33	0.54	0.32
Gb_24817	0.75	0.3	0.55	1.0	0.48	0.11	0.27	0.61	0.66	0.55	0.81	0.4	0.47	0.46	0.73	0.91	0.82	0.42	0.51	0.25
Gb_24917	0.81	0.44	0.59	1.0	0.77	0.53	0.16	0.72	0.47	0.42	0.53	0.36	0.75	0.64	0.54	0.72	0.62	0.5	0.29	0.16
Gb_25423	0.5	0.56	0.47	0.34	0.28	0.02	0.13	0.21	0.47	0.32	0.29	0.19	0.12	0.08	0.2	1.0	0.52	0.0	0.0	0.0
Gb_25425	0.45	0.3	0.3	0.12	0.15	0.01	0.12	0.24	0.45	0.35	0.25	0.17	0.06	0.08	0.22	1.0	0.63	0.0	0.0	0.0
Gb_25765	0.96	0.4	0.78	0.79	0.75	0.72	0.23	0.75	0.42	0.5	1.0	0.49	0.32	0.26	0.98	0.6	0.66	0.81	0.34	0.6
Gb_25957	1.0	0.62	0.66	0.7	0.71	0.29	0.42	0.54	0.68	0.5	0.76	0.36	0.51	0.51	0.7	0.86	0.6	0.64	0.73	0.5
Gb_26577	0.62	0.61	0.61	0.89	0.63	0.3	0.25	0.57	0.66	0.5	0.47	0.49	0.21	0.31	0.34	0.98	1.0	0.46	0.46	0.21
Gb_26834	0.27	0.32	0.28	0.56	0.26	0.14	0.16	0.44	0.68	0.55	0.65	0.43	0.41	0.47	0.61	1.0	0.78	0.29	0.36	0.2
Gb_31131	0.68	0.43	0.59	0.56	0.48	0.29	0.33	0.69	0.78	0.6	0.95	0.46	0.87	1.0	0.84	0.74	0.73	0.43	0.3	0.46
Gb_32290	0.94	1.0	0.82	0.6	0.74	0.27	0.33	0.76	0.81	0.6	0.61	0.32	0.39	0.35	0.59	0.76	0.34	0.62	0.78	0.26
Gb_32896	0.98	0.56	0.43	0.81	1.0	0.29	0.52	0.68	0.84	0.63	0.8	0.52	0.46	0.44	0.76	0.68	0.59	0.68	0.6	0.39
Gb_32902	0.7	0.3	0.17	0.0	0.17	0.23	0.86	0.54	0.59	0.4	0.25	0.26	0.26	0.21	0.17	0.18	0.09	0.36	1.0	0.17
Gb_33035	0.63	0.31	0.39	0.79	0.54	0.08	0.24	0.7	0.89	0.8	0.8	0.39	0.34	0.29	1.0	0.83	0.68	0.35	0.2	0.09
Gb_33491	0.81	0.38	0.57	0.75	0.64	0.25	0.31	0.65	0.86	0.71	1.0	0.39	0.74	0.62	0.89	0.65	0.53	0.64	0.75	0.51
Gb_33665	0.35	0.36	0.31	0.29	0.33	0.18	0.21	0.37	0.49	0.39	0.66	0.29	0.41	0.31	0.69	1.0	0.7	0.23	0.3	0.05
Gb_34219	1.0	0.75	0.66	0.82	0.78	0.37	0.36	0.83	0.96	0.67	0.68	0.39	0.8	0.73	0.7	0.75	0.47	0.69	0.66	0.34
Gb_34911	0.7	0.84	0.68	0.65	0.58	0.63	0.51	0.78	0.75	0.65	0.76	0.53	0.62	0.44	0.71	0.78	0.68	0.56	1.0	0.34
Gb_36659	0.83	0.77	0.6	0.84	0.73	0.36	0.35	0.76	0.77	0.66	1.0	0.45	0.71	0.64	0.98	0.8	0.46	0.75	0.7	0.39
Gb_36805	0.59	0.32	0.6	0.83	0.53	0.33	0.33	0.64	0.69	0.61	1.0	0.41	0.64	0.6	0.93	0.64	0.58	0.44	0.45	0.54
Gb_37103	0.67	0.47	0.54	1.0	0.56	0.31	0.2	0.54	0.62	0.38	0.57	0.39	0.27	0.3	0.59	0.47	0.32	0.49	0.49	0.36
Gb_38481	0.98	0.55	0.56	0.8	0.52	0.05	0.22	0.51	1.0	0.77	0.99	0.41	0.46	0.43	0.94	0.99	0.65	0.26	0.35	0.29
Gb_39880	0.62	0.43	0.52	1.0	0.69	0.19	0.11	0.52	0.21	0.16	0.4	0.12	0.55	0.29	0.43	0.29	0.15	0.83	0.48	0.09
Gb_40218	0.59	0.32	0.45	0.49	0.44	0.4	0.44	0.56	0.57	0.48	1.0	0.4	0.33	0.33	0.88	0.64	0.57	0.54	0.4	0.46
Gb_40581	0.79	0.44	0.47	1.0	0.74	0.79	0.32	0.74	0.6	0.49	0.7	0.45	0.51	0.53	0.65	0.76	0.73	0.8	0.4	0.4
Gb_41003	0.59	0.45	0.53	0.78	0.76	0.43	0.83	0.93	0.95	0.56	0.92	0.45	0.34	0.34	0.89	0.83	1.0	0.62	0.74	0.28
Gb_41045	1.0	0.29	0.53	0.77	0.49	0.3	0.29	0.55	0.55	0.45	0.77	0.29	0.7	0.61	0.64	0.6	0.44	0.39	0.24	0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)