Heatmap: Cluster_299 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87
0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.12 0.04 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.17 0.37 0.17 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.67
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.2 0.15 0.0 0.03 0.0
0.14 0.0 0.0 0.6 0.09 0.32 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.59 0.0 0.0 0.1 0.08
0.05 0.16 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.08 0.03 0.01 0.03 0.01 0.12 0.37 0.0 0.0 0.06 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.06 0.0 0.08 0.0 0.06 0.01 0.21 0.44 0.76 0.03 0.03 0.04
0.04 0.0 0.0 0.12 0.12 0.07 3.89 0.32 0.23 0.21 0.47 0.14 0.05 0.11 0.5 0.82 0.61 0.05 0.64 7.82
0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.06 0.01 0.01 0.05
2.85 0.0 0.0 0.0 2.79 3.2 0.0 1.82 0.93 0.0 2.6 0.0 0.0 0.98 0.0 16.95 3.93 0.0 0.0 2.33
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.04 0.24 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.17 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.01 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.01 0.03 0.0 0.1 0.05 0.01 0.11 0.12 0.0 0.04 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.07 0.02 0.0 0.01 0.04
0.03 0.0 0.03 0.11 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.27 0.13 0.0 0.03 0.03
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.03 0.03 0.0 0.04 0.03 0.02 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0
0.12 0.0 0.08 0.52 0.09 0.0 0.05 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.07 0.48 0.2 0.0 0.13 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.48
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.02 0.0 0.04 0.07 0.05 0.0 0.1 0.12 0.64 0.17 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.01 0.0 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.05 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.27 0.2 0.14 0.24 0.47 0.34 0.22 0.24 0.23 0.0 0.12 0.08
0.03 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.16 0.11 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
1.44 7.34 5.23 2.55 1.59 3.64 1.13 5.03 1.81 0.48 2.75 3.06 3.41 2.41 3.37 54.09 44.84 3.28 1.88 0.27
0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.09 0.12 0.03 0.01 0.1
0.61 0.2 0.15 0.1 0.0 0.07 0.05 0.27 0.03 0.0 0.03 0.07 0.11 0.2 0.03 3.97 2.74 0.08 0.2 0.03
0.0 4.62 0.0 6.72 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.2 0.0 9.59 0.0 0.0 1.44 0.0
0.15 0.0 0.0 0.75 0.22 0.0 0.07 0.05 0.01 0.02 0.0 0.0 0.1 0.13 0.0 0.44 0.0 0.03 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.04 0.0 0.01 0.07 0.1 0.03 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.38 0.2 0.2 0.05 0.16 0.31 0.0 0.45 0.21 0.0 0.28 0.0
0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.55 0.48 0.33 0.02 0.14 0.06 0.37 0.27 0.09 0.15 0.4 0.0
0.06 0.0 0.04 0.6 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.29 0.05 0.0 0.03 0.0
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.1 0.46
0.18 0.28 0.09 0.29 0.0 0.0 0.0 0.13 0.09 0.21 0.0 0.03 0.29 0.03 0.25 0.71 0.32 0.08 0.03 0.0
0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.05 0.0 0.02 0.0
0.03 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
18.14 81.28 35.66 127.76 1.63 1.85 30.08 31.75 1.99 1.95 8.63 2.42 6.41 5.91 9.3 562.37 230.76 2.31 1.68 1.6
10.94 0.0 0.0 20.6 6.9 3.44 3.77 5.58 2.6 3.56 2.67 0.0 7.47 7.59 0.27 15.21 7.74 0.81 9.63 0.74
0.03 0.04 0.0 0.06 0.04 0.0 0.02 0.04 0.04 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02 0.15 0.14 0.02 0.07 0.15
4.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 3.6 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 56.47
0.03 0.02 0.01 0.0 0.07 0.03 0.04 0.04 0.02 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.64
0.01 0.0 0.0 0.17 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.2 0.07 0.02 0.02 0.0
0.01 0.11 0.0 0.0 0.08 0.08 0.04 0.05 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.06 0.07 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.4 0.39 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 2.9 0.31 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.63 3.46 0.76 1.88 0.0 0.0 0.0 0.34 1.22 2.27 0.0 7.8 1.57 2.33 0.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.06 0.06 0.26 0.03 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.17 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.09 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 1.58
0.1 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.05 0.07 0.03 0.06 0.28 0.0 0.0 0.0 0.25 0.95 0.27 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.79 0.0 0.0 0.0 2.91
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.03 0.11 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05
0.03 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.04 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.69 0.07 0.0 0.13 0.05
0.13 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.04 0.28 0.05 0.0 0.1 0.05
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0
0.02 0.0 0.02 0.05 0.08 0.0 0.01 0.05 0.04 0.05 0.02 0.06 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.11 0.05 0.03
0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.35 0.05 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.29 0.24 0.59 0.01 0.02 0.1 0.18 0.31 0.07 0.15 0.31 0.13
3.17 2719.92 2400.27 397.93 3.62 2.57 429.89 262.8 2.35 1.76 17.89 5.66 2.24 2.25 20.19 3727.51 2422.07 1.86 12.26 5.29
19.39 5.34 5.02 0.0 15.33 12.04 8.43 8.16 11.94 13.53 9.25 1.93 3.82 6.28 14.53 37.71 15.01 8.47 0.0 10.36

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)