Heatmap: Cluster_206 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01165	0.61	0.61	0.37	0.24	0.7	0.19	0.31	0.22	0.12	0.15	0.35	0.3	0.34	0.29	0.4	0.22	0.17	0.33	1.0	0.13
Gb_01547	0.58	0.52	0.68	0.63	0.74	0.33	0.34	0.46	0.39	0.37	0.53	0.36	0.37	0.33	0.51	0.36	0.71	0.51	1.0	0.61
Gb_02796	0.31	0.2	0.26	0.48	0.88	0.5	0.14	0.41	0.25	0.26	0.34	0.28	0.36	0.43	0.43	0.22	0.58	0.6	1.0	0.48
Gb_02861	0.75	0.54	0.41	0.67	1.0	0.34	0.35	0.33	0.2	0.22	0.44	0.28	0.24	0.19	0.43	0.2	0.3	0.63	0.94	0.91
Gb_02862	0.52	0.65	0.42	0.38	0.76	0.32	0.37	0.31	0.21	0.22	0.43	0.24	0.2	0.13	0.34	0.23	0.3	0.46	1.0	0.7
Gb_03378	0.29	0.42	0.33	0.27	0.57	0.72	0.67	0.52	0.34	0.34	0.57	0.36	0.43	0.33	0.65	0.24	0.29	0.66	1.0	0.69
Gb_04660	0.42	0.69	0.5	0.39	0.75	0.66	0.51	0.5	0.34	0.35	0.61	0.43	0.52	0.43	0.61	0.34	0.34	0.71	1.0	0.72
Gb_04762	0.33	0.41	0.33	0.32	0.61	0.41	0.41	0.51	0.51	0.49	0.54	0.44	0.45	0.42	0.59	0.47	0.57	0.46	1.0	0.72
Gb_04980	0.38	0.37	0.29	0.3	0.33	0.2	0.55	0.39	0.4	0.42	0.72	0.27	0.21	0.25	0.6	0.34	0.39	0.36	1.0	0.33
Gb_05170	0.06	0.0	0.01	0.26	0.6	0.24	0.02	0.15	0.14	0.12	0.13	0.15	0.1	0.11	0.17	0.12	0.14	0.49	1.0	0.29
Gb_09177	0.12	0.03	0.04	0.33	0.69	0.43	0.14	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.82	1.0	0.17
Gb_09680	0.29	0.15	0.3	0.27	0.69	0.17	0.21	0.29	0.23	0.22	0.81	0.39	0.36	0.42	0.74	0.42	0.38	0.4	1.0	0.77
Gb_09766	0.82	1.0	0.95	0.17	0.38	0.1	0.02	0.01	0.01	0.0	0.05	0.09	0.01	0.02	0.08	0.05	0.02	0.04	0.06	0.5
Gb_10508	0.04	0.07	0.01	0.22	0.58	0.22	0.01	0.19	0.03	0.03	0.13	0.1	0.11	0.29	0.18	0.09	0.1	0.38	1.0	0.12
Gb_10592	0.12	0.5	0.28	0.34	1.0	0.52	0.42	0.25	0.11	0.18	0.22	0.12	0.17	0.13	0.25	0.1	0.1	0.49	0.29	0.27
Gb_10595	0.09	0.23	0.2	0.3	1.0	0.32	0.24	0.31	0.14	0.22	0.28	0.17	0.31	0.29	0.47	0.11	0.12	0.33	0.24	0.34
Gb_11693	0.32	0.24	0.34	0.51	0.86	0.5	0.56	0.57	0.33	0.35	0.38	0.42	0.7	0.77	0.41	0.27	0.6	1.0	0.93	0.92
Gb_12311	0.22	0.11	0.17	0.38	0.81	0.56	0.09	0.56	0.24	0.33	0.34	0.23	0.2	0.18	0.38	0.13	0.27	0.76	1.0	0.28
Gb_12949	0.41	0.38	0.29	0.41	0.87	0.44	0.28	0.47	0.29	0.24	0.31	0.34	0.34	0.34	0.31	0.34	0.3	0.58	1.0	0.49
Gb_13272	0.36	0.52	0.45	0.41	0.44	0.34	0.42	0.46	0.39	0.39	0.41	0.41	0.19	0.18	0.45	0.24	0.48	0.44	1.0	0.41
Gb_16350	0.55	0.81	0.72	0.52	0.74	0.53	0.39	0.46	0.35	0.3	0.48	0.43	0.29	0.24	0.49	0.45	0.47	0.53	1.0	0.39
Gb_16675	0.33	0.28	0.31	0.58	1.0	0.8	0.68	0.39	0.28	0.27	0.35	0.19	0.32	0.33	0.36	0.19	0.18	0.63	0.79	0.56
Gb_16958	0.87	0.32	1.0	0.83	0.53	0.06	0.53	0.27	0.16	0.18	0.2	0.14	0.15	0.21	0.17	0.2	0.13	0.46	0.5	0.76
Gb_17071	0.44	0.74	0.7	0.5	0.63	0.38	0.43	0.53	0.5	0.51	0.64	0.61	0.32	0.32	0.64	0.49	0.53	0.62	1.0	0.67
Gb_19602	0.23	0.36	0.42	0.25	0.48	0.39	0.42	0.43	0.38	0.38	0.71	0.35	0.33	0.29	0.75	0.29	0.38	0.47	1.0	0.55
Gb_20542	0.46	0.41	0.39	0.52	0.63	0.33	0.41	0.52	0.45	0.46	0.56	0.32	0.66	0.56	0.58	0.43	0.43	0.57	1.0	0.55
Gb_20683	0.4	0.19	0.44	0.54	0.67	0.03	0.09	0.15	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.49	1.0	0.08
Gb_23039	1.0	0.48	0.96	0.75	0.73	0.61	0.17	0.2	0.18	0.27	0.23	0.13	0.15	0.11	0.28	0.12	0.2	0.21	0.65	0.28
Gb_23887	0.39	0.47	0.52	0.37	0.79	0.44	0.26	0.54	0.4	0.41	0.55	0.45	0.36	0.31	0.61	0.35	0.49	0.57	1.0	0.61
Gb_24056	0.54	0.5	0.32	0.77	0.76	0.32	0.54	0.21	0.2	0.15	0.51	0.21	0.02	0.04	0.45	0.21	0.16	0.49	1.0	0.41
Gb_24057	0.75	0.35	0.59	0.77	1.0	0.47	0.69	0.35	0.37	0.35	0.66	0.27	0.04	0.07	0.67	0.4	0.35	0.6	0.96	0.81
Gb_24282	0.13	0.0	0.19	0.0	0.46	0.0	0.17	0.17	0.23	0.28	0.25	0.16	0.06	0.14	0.27	0.4	0.34	0.3	0.9	1.0
Gb_24286	1.0	0.87	0.69	0.65	0.22	0.26	0.11	0.02	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.36
Gb_24290	0.52	0.59	0.35	0.58	1.0	0.11	0.36	0.26	0.22	0.17	0.42	0.25	0.16	0.16	0.45	0.43	0.14	0.63	0.98	0.9
Gb_24291	0.32	0.13	0.16	0.68	0.69	0.04	0.28	0.19	0.14	0.15	0.32	0.21	0.12	0.07	0.42	0.16	0.07	0.54	0.74	1.0
Gb_24292	0.29	0.22	0.22	0.29	0.62	0.02	0.25	0.15	0.14	0.14	0.41	0.13	0.02	0.06	0.31	0.24	0.18	0.4	0.53	1.0
Gb_26238	0.54	0.32	0.42	0.55	0.81	0.48	0.26	0.29	0.2	0.18	0.29	0.27	0.21	0.21	0.28	0.19	0.29	0.58	1.0	0.39
Gb_27675	0.48	0.35	0.45	0.55	0.7	0.38	0.36	0.67	0.42	0.4	0.62	0.49	0.4	0.37	0.63	0.3	0.45	0.66	1.0	0.5
Gb_27676	0.44	0.62	0.71	0.52	0.65	0.51	0.27	0.59	0.36	0.36	0.49	0.3	0.25	0.24	0.55	0.26	0.36	0.67	1.0	0.47
Gb_28536	0.77	0.46	0.52	0.58	0.82	0.52	0.55	0.52	0.4	0.42	0.48	0.38	0.4	0.28	0.54	0.32	0.36	0.65	1.0	0.49
Gb_28797	0.06	0.06	0.09	0.3	0.88	0.27	1.0	0.31	0.16	0.19	0.24	0.31	0.21	0.17	0.23	0.04	0.18	0.35	0.37	0.53
Gb_29105	0.16	0.1	0.07	0.28	0.78	0.18	0.16	0.13	0.09	0.08	0.12	0.04	0.13	0.14	0.13	0.1	0.07	0.27	1.0	0.16
Gb_30951	0.41	0.55	0.58	0.48	0.85	0.6	0.28	0.46	0.23	0.2	0.2	0.31	0.35	0.26	0.21	0.23	0.29	0.54	1.0	0.67
Gb_31132	0.21	0.17	0.24	0.25	0.71	0.07	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.57	1.0	0.03
Gb_31468	0.47	0.67	0.62	0.59	0.96	0.33	0.24	0.49	0.43	0.44	0.49	0.44	0.36	0.41	0.51	0.62	0.69	0.8	1.0	0.45
Gb_31664	0.27	0.42	0.23	0.55	0.92	0.16	0.09	0.39	0.17	0.21	0.34	0.31	0.24	0.26	0.36	0.25	0.29	0.77	1.0	0.15
Gb_34193	0.29	0.31	0.44	0.34	0.61	0.22	0.24	0.44	0.37	0.4	0.45	0.4	0.12	0.13	0.4	0.49	0.43	0.74	1.0	0.23
Gb_34672	0.4	0.34	0.29	0.36	0.69	0.55	0.34	0.3	0.23	0.21	0.59	0.25	0.1	0.08	0.57	0.2	0.17	0.48	1.0	0.35
Gb_35128	0.21	0.34	0.27	0.26	0.9	0.57	0.45	0.44	0.27	0.29	0.47	0.29	0.45	0.38	0.52	0.2	0.26	0.58	1.0	0.58
Gb_35226	0.43	0.34	0.31	0.52	0.69	0.42	0.22	0.29	0.22	0.27	0.42	0.26	0.14	0.13	0.52	0.2	0.24	0.44	1.0	0.53
Gb_36209	0.45	0.55	0.52	0.39	0.47	0.47	0.37	0.48	0.35	0.3	0.6	0.36	0.12	0.13	0.61	0.34	0.32	0.78	1.0	0.41
Gb_37120	0.24	0.24	0.24	0.56	1.0	0.25	0.33	0.48	0.3	0.36	0.47	0.27	0.39	0.31	0.5	0.18	0.2	0.72	0.39	0.7
Gb_37193	0.5	0.91	0.56	0.48	1.0	0.63	0.33	0.46	0.39	0.45	0.76	0.45	0.32	0.3	0.83	0.29	0.24	0.64	0.97	0.42
Gb_39142	0.38	0.34	0.49	0.47	0.62	0.56	0.1	0.53	0.23	0.2	0.39	0.52	0.36	0.29	0.42	0.29	0.35	0.65	1.0	0.28
Gb_40001	0.49	0.56	0.47	0.42	0.75	0.46	0.39	0.15	0.1	0.11	0.25	0.09	0.05	0.04	0.33	0.06	0.08	0.35	1.0	0.3
Gb_40002	0.67	0.52	0.44	0.49	1.0	0.45	0.48	0.19	0.15	0.14	0.35	0.13	0.15	0.17	0.48	0.1	0.08	0.43	0.51	0.56
Gb_40755	0.23	0.23	0.26	0.2	0.51	0.17	0.14	0.2	0.16	0.16	0.4	0.28	0.22	0.21	0.39	0.25	0.24	0.3	1.0	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)